MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1

Total Repeats: 1612

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004567	GAAAC	2	10	346	355	60 %	0 %	20 %	20 %	380031103
2	NC_004567	CACCG	2	10	3597	3606	20 %	0 %	20 %	60 %	380031106
3	NC_004567	GTTGC	2	10	5366	5375	0 %	40 %	40 %	20 %	380031107
4	NC_004567	TTAAC	2	10	10056	10065	40 %	40 %	0 %	20 %	380031109
5	NC_004567	TCGTA	2	10	11485	11494	20 %	40 %	20 %	20 %	380031112
6	NC_004567	GACCA	2	10	11557	11566	40 %	0 %	20 %	40 %	380031112
7	NC_004567	GCTGA	2	10	11773	11782	20 %	20 %	40 %	20 %	380031112
8	NC_004567	CCTTG	2	10	12141	12150	0 %	40 %	20 %	40 %	380031112
9	NC_004567	AAAAC	2	10	17027	17036	80 %	0 %	0 %	20 %	380031116
10	NC_004567	TTCAC	2	10	20717	20726	20 %	40 %	0 %	40 %	380031118
11	NC_004567	GGCGT	2	10	25870	25879	0 %	20 %	60 %	20 %	380031122
12	NC_004567	TCAAA	2	10	28339	28348	60 %	20 %	0 %	20 %	380031123
13	NC_004567	TCCGC	2	10	30378	30387	0 %	20 %	20 %	60 %	380031124
14	NC_004567	CGCAC	2	10	31709	31718	20 %	0 %	20 %	60 %	380031125
15	NC_004567	TGATT	2	10	32072	32081	20 %	60 %	20 %	0 %	380031125
16	NC_004567	TTAGT	2	10	32236	32245	20 %	60 %	20 %	0 %	380031126
17	NC_004567	GAAAC	2	10	34339	34348	60 %	0 %	20 %	20 %	380031127
18	NC_004567	ACTGG	2	10	34467	34476	20 %	20 %	40 %	20 %	380031127
19	NC_004567	GGTTT	2	10	36720	36729	0 %	60 %	40 %	0 %	380031129
20	NC_004567	TGATT	2	10	37907	37916	20 %	60 %	20 %	0 %	380031131
21	NC_004567	TGATT	2	10	39468	39477	20 %	60 %	20 %	0 %	380031132
22	NC_004567	ATGTC	2	10	43212	43221	20 %	40 %	20 %	20 %	380031135
23	NC_004567	TTGTT	2	10	47072	47081	0 %	80 %	20 %	0 %	380031138
24	NC_004567	GAAAT	2	10	48278	48287	60 %	20 %	20 %	0 %	380031139
25	NC_004567	TGCGG	2	10	50577	50586	0 %	20 %	60 %	20 %	380031142
26	NC_004567	GATTG	2	10	51446	51455	20 %	40 %	40 %	0 %	380031143
27	NC_004567	AATTC	2	10	51962	51971	40 %	40 %	0 %	20 %	380031144
28	NC_004567	GCACG	2	10	54808	54817	20 %	0 %	40 %	40 %	380031145
29	NC_004567	TTACA	2	10	56744	56753	40 %	40 %	0 %	20 %	380031146
30	NC_004567	GGCAA	2	10	57556	57565	40 %	0 %	40 %	20 %	380031147
31	NC_004567	GACCT	2	10	59063	59072	20 %	20 %	20 %	40 %	380031149
32	NC_004567	GATCA	2	10	59234	59243	40 %	20 %	20 %	20 %	380031149
33	NC_004567	GCTTG	2	10	64554	64563	0 %	40 %	40 %	20 %	380031154
34	NC_004567	ACTTC	2	10	64682	64691	20 %	40 %	0 %	40 %	380031154
35	NC_004567	AACGG	2	10	64899	64908	40 %	0 %	40 %	20 %	380031155
36	NC_004567	GTTAA	2	10	64932	64941	40 %	40 %	20 %	0 %	380031155
37	NC_004567	GCTTA	2	10	66909	66918	20 %	40 %	20 %	20 %	380031156
38	NC_004567	TTGAC	2	10	67158	67167	20 %	40 %	20 %	20 %	380031156
39	NC_004567	ATGCC	2	10	71689	71698	20 %	20 %	20 %	40 %	380031162
40	NC_004567	GTTAG	2	10	80538	80547	20 %	40 %	40 %	0 %	380031171
41	NC_004567	CTAAG	2	10	80968	80977	40 %	20 %	20 %	20 %	380031171
42	NC_004567	GGGGC	2	10	87583	87592	0 %	0 %	80 %	20 %	380031176
43	NC_004567	GCACG	2	10	88832	88841	20 %	0 %	40 %	40 %	380031177
44	NC_004567	TGATT	2	10	94158	94167	20 %	60 %	20 %	0 %	380031183
45	NC_004567	TGGGA	2	10	96844	96853	20 %	20 %	60 %	0 %	380031187
46	NC_004567	TAAGC	2	10	98386	98395	40 %	20 %	20 %	20 %	380031189
47	NC_004567	GATCA	2	10	98433	98442	40 %	20 %	20 %	20 %	380031189
48	NC_004567	TTGAT	2	10	100157	100166	20 %	60 %	20 %	0 %	380031190
49	NC_004567	CACGT	2	10	100338	100347	20 %	20 %	20 %	40 %	380031191
50	NC_004567	GGCGG	2	10	100586	100595	0 %	0 %	80 %	20 %	380031191
51	NC_004567	CACGG	2	10	100880	100889	20 %	0 %	40 %	40 %	380031191
52	NC_004567	TTCAT	2	10	103537	103546	20 %	60 %	0 %	20 %	380031194
53	NC_004567	GGTTA	2	10	105682	105691	20 %	40 %	40 %	0 %	380031196
54	NC_004567	ATTGA	2	10	107016	107025	40 %	40 %	20 %	0 %	380031197
55	NC_004567	GCTGG	2	10	108480	108489	0 %	20 %	60 %	20 %	380031198
56	NC_004567	ACCGT	2	10	109185	109194	20 %	20 %	20 %	40 %	380031199
57	NC_004567	TCATT	2	10	111224	111233	20 %	60 %	0 %	20 %	380031200
58	NC_004567	AGCTA	2	10	112675	112684	40 %	20 %	20 %	20 %	380031201
59	NC_004567	TTCGA	2	10	117122	117131	20 %	40 %	20 %	20 %	380031208
60	NC_004567	ATGTT	2	10	117288	117297	20 %	60 %	20 %	0 %	380031208
61	NC_004567	CGGCG	2	10	119125	119134	0 %	0 %	60 %	40 %	380031210
62	NC_004567	CATGC	2	10	120310	120319	20 %	20 %	20 %	40 %	380031211
63	NC_004567	CAACC	2	10	120573	120582	40 %	0 %	0 %	60 %	380031211
64	NC_004567	ATCAA	2	10	121176	121185	60 %	20 %	0 %	20 %	380031212
65	NC_004567	CTTGG	2	10	121393	121402	0 %	40 %	40 %	20 %	380031212
66	NC_004567	ACGAT	2	10	124073	124082	40 %	20 %	20 %	20 %	380031214
67	NC_004567	TAATC	2	10	127312	127321	40 %	40 %	0 %	20 %	380031217
68	NC_004567	TCGAT	2	10	128510	128519	20 %	40 %	20 %	20 %	380031218
69	NC_004567	AAATT	2	10	128801	128810	60 %	40 %	0 %	0 %	380031218
70	NC_004567	GTACC	2	10	130594	130603	20 %	20 %	20 %	40 %	380031219
71	NC_004567	GAATT	2	10	131405	131414	40 %	40 %	20 %	0 %	380031220
72	NC_004567	AATCA	2	10	134585	134594	60 %	20 %	0 %	20 %	380031224
73	NC_004567	TAAAC	2	10	137241	137250	60 %	20 %	0 %	20 %	380031227
74	NC_004567	ATGAA	2	10	139804	139813	60 %	20 %	20 %	0 %	380031229
75	NC_004567	GGAAT	2	10	140315	140324	40 %	20 %	40 %	0 %	380031230
76	NC_004567	ATTAA	2	10	141850	141859	60 %	40 %	0 %	0 %	380031230
77	NC_004567	TGACG	2	10	143076	143085	20 %	20 %	40 %	20 %	380031232
78	NC_004567	TCACC	2	10	144678	144687	20 %	20 %	0 %	60 %	380031234
79	NC_004567	AACTA	2	10	145628	145637	60 %	20 %	0 %	20 %	380031235
80	NC_004567	GCAAA	2	10	145719	145728	60 %	0 %	20 %	20 %	380031235
81	NC_004567	ACCGA	2	10	145902	145911	40 %	0 %	20 %	40 %	380031235
82	NC_004567	TTTTA	2	10	147639	147648	20 %	80 %	0 %	0 %	380031238
83	NC_004567	TATCT	2	10	149572	149581	20 %	60 %	0 %	20 %	380031240
84	NC_004567	CAACG	2	10	151578	151587	40 %	0 %	20 %	40 %	380031241
85	NC_004567	ATTGG	3	15	153076	153090	20 %	40 %	40 %	0 %	380031242
86	NC_004567	AAAAC	2	10	154804	154813	80 %	0 %	0 %	20 %	380031244
87	NC_004567	TCCGG	2	10	154823	154832	0 %	20 %	40 %	40 %	380031244
88	NC_004567	TTAAC	2	10	155440	155449	40 %	40 %	0 %	20 %	380031244
89	NC_004567	GTTGT	2	10	155553	155562	0 %	60 %	40 %	0 %	380031244
90	NC_004567	AGGTC	2	10	156806	156815	20 %	20 %	40 %	20 %	380031245
91	NC_004567	GATCG	2	10	157691	157700	20 %	20 %	40 %	20 %	380031246
92	NC_004567	CAACG	2	10	165521	165530	40 %	0 %	20 %	40 %	380031251
93	NC_004567	TTCGT	2	10	168181	168190	0 %	60 %	20 %	20 %	380031252
94	NC_004567	TCTGG	2	10	168364	168373	0 %	40 %	40 %	20 %	380031252
95	NC_004567	GGTTA	2	10	172805	172814	20 %	40 %	40 %	0 %	380031255
96	NC_004567	AACTG	2	10	174511	174520	40 %	20 %	20 %	20 %	380031256
97	NC_004567	GGCGT	2	10	182485	182494	0 %	20 %	60 %	20 %	380031260
98	NC_004567	TGTGA	2	10	182584	182593	20 %	40 %	40 %	0 %	380031260
99	NC_004567	TTTGG	2	10	183644	183653	0 %	60 %	40 %	0 %	380031261
100	NC_004567	ATCTG	2	10	185515	185524	20 %	40 %	20 %	20 %	380031262
101	NC_004567	AACCC	2	10	195811	195820	40 %	0 %	0 %	60 %	380031273
102	NC_004567	TACGA	2	10	198618	198627	40 %	20 %	20 %	20 %	380031275
103	NC_004567	TCCAA	2	10	199906	199915	40 %	20 %	0 %	40 %	380031276
104	NC_004567	AGGAC	2	10	200053	200062	40 %	0 %	40 %	20 %	380031276
105	NC_004567	AGTTG	2	10	200790	200799	20 %	40 %	40 %	0 %	380031277
106	NC_004567	TTGTG	2	10	201068	201077	0 %	60 %	40 %	0 %	380031277
107	NC_004567	ACTTG	2	10	202895	202904	20 %	40 %	20 %	20 %	380031279
108	NC_004567	TACGT	2	10	203392	203401	20 %	40 %	20 %	20 %	380031280
109	NC_004567	AAAAT	2	10	205585	205594	80 %	20 %	0 %	0 %	380031282
110	NC_004567	ACCAT	2	10	207799	207808	40 %	20 %	0 %	40 %	380031285
111	NC_004567	ATGCA	2	10	212999	213008	40 %	20 %	20 %	20 %	380031288
112	NC_004567	GGCGC	2	10	218546	218555	0 %	0 %	60 %	40 %	380031296
113	NC_004567	AGCTT	2	10	223282	223291	20 %	40 %	20 %	20 %	380031299
114	NC_004567	TGAAC	2	10	224123	224132	40 %	20 %	20 %	20 %	380031301
115	NC_004567	ACTGA	2	10	224941	224950	40 %	20 %	20 %	20 %	380031302
116	NC_004567	TGATG	2	10	226392	226401	20 %	40 %	40 %	0 %	380031303
117	NC_004567	TTGGT	2	10	226787	226796	0 %	60 %	40 %	0 %	380031303
118	NC_004567	AGCGC	2	10	230877	230886	20 %	0 %	40 %	40 %	380031308
119	NC_004567	TCTAT	2	10	233513	233522	20 %	60 %	0 %	20 %	380031310
120	NC_004567	GGTCA	2	10	237863	237872	20 %	20 %	40 %	20 %	380031315
121	NC_004567	GTGAC	2	10	238152	238161	20 %	20 %	40 %	20 %	380031315
122	NC_004567	TAATT	2	10	238573	238582	40 %	60 %	0 %	0 %	380031315
123	NC_004567	GTGCA	2	10	245984	245993	20 %	20 %	40 %	20 %	380031320
124	NC_004567	AATAT	2	10	246185	246194	60 %	40 %	0 %	0 %	380031320
125	NC_004567	GTGAC	2	10	248565	248574	20 %	20 %	40 %	20 %	380031322
126	NC_004567	ACAAT	2	10	249299	249308	60 %	20 %	0 %	20 %	380031323
127	NC_004567	TAAAG	2	10	254933	254942	60 %	20 %	20 %	0 %	380031329
128	NC_004567	TAAGA	2	10	256775	256784	60 %	20 %	20 %	0 %	380031331
129	NC_004567	CTGGC	2	10	258773	258782	0 %	20 %	40 %	40 %	380031334
130	NC_004567	CCGTT	2	10	260475	260484	0 %	40 %	20 %	40 %	380031335
131	NC_004567	AACGG	2	10	261498	261507	40 %	0 %	40 %	20 %	380031337
132	NC_004567	AGTGA	2	10	262191	262200	40 %	20 %	40 %	0 %	380031338
133	NC_004567	GCCTT	2	10	263309	263318	0 %	40 %	20 %	40 %	380031339
134	NC_004567	AAGTT	2	10	263720	263729	40 %	40 %	20 %	0 %	380031339
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167	NC_004567	CGGGG	2	10	317394	317403	0 %	0 %	80 %	20 %	380031390
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