MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1

Total Repeats: 7268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004567	GAAT	2	8	582	589	50 %	25 %	25 %	0 %	380031103
2	NC_004567	TAAT	2	8	590	597	50 %	50 %	0 %	0 %	380031103
3	NC_004567	CGAA	2	8	776	783	50 %	0 %	25 %	25 %	380031103
4	NC_004567	GAAA	2	8	1151	1158	75 %	0 %	25 %	0 %	380031103
5	NC_004567	ACTG	2	8	1212	1219	25 %	25 %	25 %	25 %	380031103
6	NC_004567	CGTT	2	8	2563	2570	0 %	50 %	25 %	25 %	380031104
7	NC_004567	GTTA	2	8	3326	3333	25 %	50 %	25 %	0 %	380031105
8	NC_004567	AATT	2	8	3619	3626	50 %	50 %	0 %	0 %	380031106
9	NC_004567	AGCG	2	8	3718	3725	25 %	0 %	50 %	25 %	380031106
10	NC_004567	GTCG	2	8	4148	4155	0 %	25 %	50 %	25 %	380031106
11	NC_004567	ATTA	2	8	4502	4509	50 %	50 %	0 %	0 %	380031106
12	NC_004567	TACG	2	8	5428	5435	25 %	25 %	25 %	25 %	380031107
13	NC_004567	ATTA	2	8	6079	6086	50 %	50 %	0 %	0 %	380031107
14	NC_004567	TGAG	2	8	6258	6265	25 %	25 %	50 %	0 %	380031107
15	NC_004567	ACGT	2	8	6791	6798	25 %	25 %	25 %	25 %	380031108
16	NC_004567	TAGC	2	8	8054	8061	25 %	25 %	25 %	25 %	380031108
17	NC_004567	AAAC	2	8	8848	8855	75 %	0 %	0 %	25 %	380031108
18	NC_004567	TTAC	2	8	9885	9892	25 %	50 %	0 %	25 %	380031109
19	NC_004567	TTGA	2	8	11440	11447	25 %	50 %	25 %	0 %	380031112
20	NC_004567	AACC	2	8	12216	12223	50 %	0 %	0 %	50 %	380031112
21	NC_004567	AATC	2	8	12286	12293	50 %	25 %	0 %	25 %	380031112
22	NC_004567	AATG	2	8	12375	12382	50 %	25 %	25 %	0 %	380031112
23	NC_004567	CAAT	2	8	12737	12744	50 %	25 %	0 %	25 %	380031112
24	NC_004567	CAGT	2	8	13189	13196	25 %	25 %	25 %	25 %	380031112
25	NC_004567	TTGA	2	8	13216	13223	25 %	50 %	25 %	0 %	380031112
26	NC_004567	TTAA	2	8	13366	13373	50 %	50 %	0 %	0 %	380031113
27	NC_004567	CAAT	2	8	13406	13413	50 %	25 %	0 %	25 %	380031113
28	NC_004567	CAAA	2	8	13569	13576	75 %	0 %	0 %	25 %	380031113
29	NC_004567	ACGG	2	8	14535	14542	25 %	0 %	50 %	25 %	380031114
30	NC_004567	ATGG	2	8	15673	15680	25 %	25 %	50 %	0 %	380031115
31	NC_004567	TGGC	2	8	15722	15729	0 %	25 %	50 %	25 %	380031115
32	NC_004567	TGGT	2	8	15841	15848	0 %	50 %	50 %	0 %	380031115
33	NC_004567	TTTA	2	8	16037	16044	25 %	75 %	0 %	0 %	380031115
34	NC_004567	GACG	2	8	16577	16584	25 %	0 %	50 %	25 %	380031115
35	NC_004567	GATC	2	8	16714	16721	25 %	25 %	25 %	25 %	380031116
36	NC_004567	AGCT	2	8	17263	17270	25 %	25 %	25 %	25 %	380031116
37	NC_004567	GCTA	2	8	17493	17500	25 %	25 %	25 %	25 %	380031117
38	NC_004567	AAAC	2	8	19704	19711	75 %	0 %	0 %	25 %	380031118
39	NC_004567	ACGA	2	8	20311	20318	50 %	0 %	25 %	25 %	380031118
40	NC_004567	AAAC	2	8	21105	21112	75 %	0 %	0 %	25 %	380031119
41	NC_004567	ATGA	2	8	21120	21127	50 %	25 %	25 %	0 %	380031119
42	NC_004567	CGAA	2	8	21419	21426	50 %	0 %	25 %	25 %	380031119
43	NC_004567	GCGG	2	8	23023	23030	0 %	0 %	75 %	25 %	380031120
44	NC_004567	ATTG	2	8	24024	24031	25 %	50 %	25 %	0 %	380031120
45	NC_004567	AGTG	2	8	24143	24150	25 %	25 %	50 %	0 %	380031121
46	NC_004567	GGTT	2	8	24241	24248	0 %	50 %	50 %	0 %	380031121
47	NC_004567	GGAA	2	8	25392	25399	50 %	0 %	50 %	0 %	380031122
48	NC_004567	CCGA	2	8	25441	25448	25 %	0 %	25 %	50 %	380031122
49	NC_004567	AGCT	2	8	26375	26382	25 %	25 %	25 %	25 %	380031122
50	NC_004567	TCTT	2	8	26408	26415	0 %	75 %	0 %	25 %	380031122
51	NC_004567	CGGT	2	8	26492	26499	0 %	25 %	50 %	25 %	380031122
52	NC_004567	CCAG	2	8	26571	26578	25 %	0 %	25 %	50 %	380031122
53	NC_004567	TCAG	2	8	27060	27067	25 %	25 %	25 %	25 %	380031123
54	NC_004567	ATGG	2	8	27206	27213	25 %	25 %	50 %	0 %	380031123
55	NC_004567	CGTG	2	8	27604	27611	0 %	25 %	50 %	25 %	380031123
56	NC_004567	CCTA	2	8	27969	27976	25 %	25 %	0 %	50 %	380031123
57	NC_004567	AACC	2	8	28130	28137	50 %	0 %	0 %	50 %	380031123
58	NC_004567	ATTG	2	8	28147	28154	25 %	50 %	25 %	0 %	380031123
59	NC_004567	CAAG	2	8	28267	28274	50 %	0 %	25 %	25 %	380031123
60	NC_004567	TGAT	2	8	28881	28888	25 %	50 %	25 %	0 %	380031123
61	NC_004567	ACGA	2	8	29133	29140	50 %	0 %	25 %	25 %	380031123
62	NC_004567	GATT	2	8	29283	29290	25 %	50 %	25 %	0 %	380031124
63	NC_004567	TTTA	2	8	29647	29654	25 %	75 %	0 %	0 %	380031124
64	NC_004567	CGTG	2	8	29682	29689	0 %	25 %	50 %	25 %	380031124
65	NC_004567	CATT	3	12	30047	30058	25 %	50 %	0 %	25 %	380031124
66	NC_004567	TGGC	2	8	30192	30199	0 %	25 %	50 %	25 %	380031124
67	NC_004567	TGGA	2	8	31345	31352	25 %	25 %	50 %	0 %	380031125
68	NC_004567	CAGA	2	8	31691	31698	50 %	0 %	25 %	25 %	380031125
69	NC_004567	AGCC	2	8	32568	32575	25 %	0 %	25 %	50 %	380031126
70	NC_004567	TAGC	2	8	32670	32677	25 %	25 %	25 %	25 %	380031126
71	NC_004567	ATCC	2	8	32743	32750	25 %	25 %	0 %	50 %	380031126
72	NC_004567	CGAT	2	8	33914	33921	25 %	25 %	25 %	25 %	380031127
73	NC_004567	AGTG	2	8	34067	34074	25 %	25 %	50 %	0 %	380031127
74	NC_004567	CGGT	2	8	34209	34216	0 %	25 %	50 %	25 %	380031127
75	NC_004567	TAGT	2	8	34655	34662	25 %	50 %	25 %	0 %	380031127
76	NC_004567	TTGA	2	8	36109	36116	25 %	50 %	25 %	0 %	380031128
77	NC_004567	AACG	2	8	36859	36866	50 %	0 %	25 %	25 %	380031129
78	NC_004567	CAAC	2	8	37104	37111	50 %	0 %	0 %	50 %	380031130
79	NC_004567	GATG	2	8	37940	37947	25 %	25 %	50 %	0 %	380031131
80	NC_004567	AATT	2	8	38526	38533	50 %	50 %	0 %	0 %	380031132
81	NC_004567	TCAG	2	8	38820	38827	25 %	25 %	25 %	25 %	380031132
82	NC_004567	CAGT	2	8	38976	38983	25 %	25 %	25 %	25 %	380031132
83	NC_004567	TGTA	2	8	38996	39003	25 %	50 %	25 %	0 %	380031132
84	NC_004567	GTCT	2	8	39018	39025	0 %	50 %	25 %	25 %	380031132
85	NC_004567	ATTT	2	8	40520	40527	25 %	75 %	0 %	0 %	380031133
86	NC_004567	AATT	2	8	40536	40543	50 %	50 %	0 %	0 %	380031133
87	NC_004567	AGTC	2	8	40597	40604	25 %	25 %	25 %	25 %	380031133
88	NC_004567	CGTA	2	8	40704	40711	25 %	25 %	25 %	25 %	380031133
89	NC_004567	AAGC	2	8	41462	41469	50 %	0 %	25 %	25 %	380031133
90	NC_004567	ACAG	2	8	41934	41941	50 %	0 %	25 %	25 %	380031134
91	NC_004567	ACGT	2	8	42208	42215	25 %	25 %	25 %	25 %	380031134
92	NC_004567	TCGA	2	8	43042	43049	25 %	25 %	25 %	25 %	380031135
93	NC_004567	TTTA	2	8	43074	43081	25 %	75 %	0 %	0 %	380031135
94	NC_004567	TATT	2	8	43402	43409	25 %	75 %	0 %	0 %	380031135
95	NC_004567	GATG	2	8	43524	43531	25 %	25 %	50 %	0 %	380031135
96	NC_004567	ATTA	2	8	43902	43909	50 %	50 %	0 %	0 %	380031136
97	NC_004567	TGAC	2	8	44329	44336	25 %	25 %	25 %	25 %	380031136
98	NC_004567	CGGC	2	8	44748	44755	0 %	0 %	50 %	50 %	380031136
99	NC_004567	ACCA	2	8	44822	44829	50 %	0 %	0 %	50 %	380031136
100	NC_004567	AAGT	2	8	46643	46650	50 %	25 %	25 %	0 %	380031138
101	NC_004567	TATG	2	8	46863	46870	25 %	50 %	25 %	0 %	380031138
102	NC_004567	GATC	2	8	47127	47134	25 %	25 %	25 %	25 %	380031138
103	NC_004567	TTTG	2	8	47984	47991	0 %	75 %	25 %	0 %	380031139
104	NC_004567	CAAG	2	8	48573	48580	50 %	0 %	25 %	25 %	380031139
105	NC_004567	CATC	2	8	49408	49415	25 %	25 %	0 %	50 %	380031140
106	NC_004567	TGGC	2	8	49428	49435	0 %	25 %	50 %	25 %	380031140
107	NC_004567	GCAC	2	8	49913	49920	25 %	0 %	25 %	50 %	380031141
108	NC_004567	CAGT	2	8	50226	50233	25 %	25 %	25 %	25 %	380031141
109	NC_004567	AACG	2	8	50537	50544	50 %	0 %	25 %	25 %	380031142
110	NC_004567	TTGT	2	8	50630	50637	0 %	75 %	25 %	0 %	380031142
111	NC_004567	TATT	2	8	50782	50789	25 %	75 %	0 %	0 %	380031142
112	NC_004567	GGAC	2	8	50970	50977	25 %	0 %	50 %	25 %	380031143
113	NC_004567	AGTG	2	8	52038	52045	25 %	25 %	50 %	0 %	380031144
114	NC_004567	ACCC	2	8	53975	53982	25 %	0 %	0 %	75 %	380031145
115	NC_004567	CCAA	2	8	54101	54108	50 %	0 %	0 %	50 %	380031145
116	NC_004567	AAAC	2	8	56360	56367	75 %	0 %	0 %	25 %	380031146
117	NC_004567	AAGT	2	8	56508	56515	50 %	25 %	25 %	0 %	380031146
118	NC_004567	TCAA	2	8	56867	56874	50 %	25 %	0 %	25 %	380031146
119	NC_004567	TGAA	2	8	57151	57158	50 %	25 %	25 %	0 %	380031147
120	NC_004567	TTTG	2	8	58319	58326	0 %	75 %	25 %	0 %	380031148
121	NC_004567	TGAT	2	8	59253	59260	25 %	50 %	25 %	0 %	380031149
122	NC_004567	ATGA	2	8	60562	60569	50 %	25 %	25 %	0 %	380031151
123	NC_004567	GTTA	2	8	60729	60736	25 %	50 %	25 %	0 %	380031151
124	NC_004567	ACTT	2	8	62367	62374	25 %	50 %	0 %	25 %	380031153
125	NC_004567	GTCG	2	8	62397	62404	0 %	25 %	50 %	25 %	380031153
126	NC_004567	ATCA	2	8	62521	62528	50 %	25 %	0 %	25 %	380031153
127	NC_004567	GCTG	2	8	62705	62712	0 %	25 %	50 %	25 %	380031153
128	NC_004567	GTTA	2	8	62922	62929	25 %	50 %	25 %	0 %	380031153
129	NC_004567	AAGC	2	8	63250	63257	50 %	0 %	25 %	25 %	380031153
130	NC_004567	GAAC	2	8	63328	63335	50 %	0 %	25 %	25 %	380031153
131	NC_004567	TCAC	2	8	64137	64144	25 %	25 %	0 %	50 %	380031154
132	NC_004567	AAGT	2	8	65093	65100	50 %	25 %	25 %	0 %	380031155
133	NC_004567	ATTT	2	8	65245	65252	25 %	75 %	0 %	0 %	380031155
134	NC_004567	TACT	2	8	65283	65290	25 %	50 %	0 %	25 %	380031155
135	NC_004567	TTAA	2	8	65439	65446	50 %	50 %	0 %	0 %	380031155
136	NC_004567	CCGT	2	8	65640	65647	0 %	25 %	25 %	50 %	380031155
137	NC_004567	TGCA	2	8	66513	66520	25 %	25 %	25 %	25 %	380031156
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