MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium tetani E88 plasmid pE88

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004565	TACAT	2	10	2018	2027	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_004565	AATTT	2	10	4468	4477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004565	GAAAT	2	10	5844	5853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004565	AATTA	2	10	6325	6334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004565	TAAAG	2	10	7162	7171	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004565	TATAA	2	10	7762	7771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004565	ATATA	2	10	12659	12668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004565	CTTCA	2	10	18329	18338	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_004565	ATTAA	2	10	18378	18387	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004565	ACCTT	2	10	19474	19483	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_004565	TTATA	2	10	23775	23784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004565	TTCTT	2	10	28811	28820	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_004565	ATATA	2	10	30192	30201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004565	AAAAT	2	10	32025	32034	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004565	AATAG	2	10	32061	32070	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004565	TTATA	2	10	33097	33106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004565	TAATT	2	10	36098	36107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004565	TGTAC	2	10	36858	36867	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_004565	ATTAT	2	10	37310	37319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004565	ATAAA	2	10	37673	37682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004565	AAAAT	2	10	37943	37952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004565	TATCT	2	10	38742	38751	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_004565	ATATA	2	10	39303	39312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004565	ATATT	2	10	42434	42443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004565	ATTTA	2	10	42453	42462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004565	TCTAA	2	10	47608	47617	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_004565	ATTTT	2	10	47714	47723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004565	TAAGA	2	10	50349	50358	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004565	AAAGA	2	10	50882	50891	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004565	TATGA	2	10	52007	52016	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004565	TTAAA	2	10	54582	54591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004565	CTTTT	2	10	59415	59424	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_004565	AAATA	2	10	62520	62529	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004565	TTTTG	2	10	62585	62594	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004565	ACAAA	2	10	66067	66076	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_004565	TTTAT	2	10	66425	66434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004565	TAAAA	2	10	66723	66732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004565	AATTA	2	10	72802	72811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004565	TGTAT	2	10	73455	73464	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.