MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium tetani E88 plasmid pE88

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004565	TAAA	2	8	221	228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004565	TTTA	2	8	346	353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004565	TATT	2	8	2517	2524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004565	TTTA	2	8	3330	3337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004565	TCTA	2	8	4224	4231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_004565	TTCA	2	8	4293	4300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_004565	ATAA	2	8	4340	4347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004565	TGTT	2	8	4412	4419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004565	TTTA	2	8	4431	4438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004565	GTTA	2	8	4840	4847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004565	GATT	2	8	5784	5791	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004565	CTTT	2	8	5795	5802	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_004565	ATGA	2	8	5943	5950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004565	TATT	2	8	6062	6069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004565	AATT	2	8	6224	6231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004565	TATT	2	8	6919	6926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004565	AAAT	2	8	6962	6969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004565	ATAC	2	8	7193	7200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_004565	TGAA	2	8	7443	7450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004565	TACT	2	8	7631	7638	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_004565	TTTA	2	8	7639	7646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004565	AGTA	2	8	7658	7665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004565	TTAT	2	8	7805	7812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004565	ATTA	2	8	8376	8383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004565	ACTT	2	8	9584	9591	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_004565	ATTA	2	8	10578	10585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004565	AATT	2	8	10642	10649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004565	TAAA	2	8	10725	10732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004565	ATTA	2	8	12278	12285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004565	ATTT	2	8	12523	12530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004565	AAAT	2	8	12720	12727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004565	ATAA	2	8	18127	18134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004565	AAAT	2	8	18365	18372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004565	GAAG	2	8	18633	18640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004565	TCTA	2	8	19628	19635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_004565	CTTT	2	8	20181	20188	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_004565	ACTT	2	8	23409	23416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_004565	ATCT	2	8	23659	23666	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_004565	AATG	2	8	25583	25590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004565	CTAT	2	8	29046	29053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_004565	ACTT	2	8	29176	29183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_004565	TAAA	2	8	29210	29217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004565	TACT	2	8	29351	29358	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_004565	ACTT	2	8	29395	29402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_004565	AGTA	2	8	31854	31861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004565	ATTT	2	8	32095	32102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004565	AGGA	2	8	32206	32213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004565	TTAT	2	8	32804	32811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004565	TGTT	2	8	32812	32819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004565	TAAA	2	8	32942	32949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004565	ACTA	2	8	33065	33072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_004565	AATA	2	8	35224	35231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004565	CATA	2	8	35306	35313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_004565	ATGC	2	8	35314	35321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_004565	ATTA	2	8	35360	35367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004565	TAAT	2	8	35398	35405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004565	TAAA	2	8	35437	35444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004565	TCCT	2	8	35491	35498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_004565	ATTT	2	8	36233	36240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004565	TTAA	2	8	36545	36552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004565	TTTA	2	8	36595	36602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004565	ATTT	2	8	37286	37293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004565	AATA	2	8	37518	37525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004565	AAAC	2	8	37741	37748	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_004565	TAAA	2	8	38472	38479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004565	TAAT	2	8	38489	38496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004565	ATTT	2	8	39071	39078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004565	AATA	2	8	39138	39145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004565	TATT	2	8	39146	39153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004565	TTTA	2	8	39246	39253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004565	TTTA	2	8	39273	39280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004565	TTAA	2	8	42467	42474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004565	TTTA	2	8	42599	42606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004565	TGAA	2	8	42631	42638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004565	ATTT	2	8	46081	46088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004565	TAAA	2	8	46930	46937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004565	ATTA	2	8	47343	47350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004565	TTAG	2	8	47596	47603	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004565	AGTT	2	8	48222	48229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004565	TAGG	2	8	50299	50306	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004565	TTTG	2	8	50314	50321	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004565	TTAT	2	8	50870	50877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004565	TAAA	2	8	50925	50932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004565	TTTA	2	8	52249	52256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004565	TCAA	3	12	54171	54182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_004565	AAGA	2	8	54213	54220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004565	AACA	2	8	54386	54393	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_004565	TCAC	2	8	54417	54424	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_004565	TAAT	2	8	55221	55228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004565	CAAC	2	8	55338	55345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_004565	ATTA	2	8	56367	56374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004565	AAAT	2	8	57216	57223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004565	AAAT	2	8	62691	62698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004565	TAAA	2	8	62839	62846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004565	ATAA	2	8	62872	62879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004565	TTTA	2	8	63959	63966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004565	AATC	2	8	65834	65841	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_004565	ATTA	2	8	65890	65897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004565	TTAA	2	8	65922	65929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004565	AAAC	2	8	66053	66060	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_004565	TAAA	2	8	66156	66163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004565	TTCT	2	8	66218	66225	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_004565	TATT	2	8	66454	66461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004565	TTCT	2	8	66567	66574	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_004565	TTTA	2	8	66668	66675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004565	TAAT	2	8	66954	66961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004565	TAAC	2	8	66965	66972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_004565	TTAT	2	8	67066	67073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004565	TAAA	2	8	67122	67129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004565	TAAT	2	8	67312	67319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004565	AAAT	2	8	73504	73511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004565	CCTT	2	8	73979	73986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.