MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium tetani E88 plasmid pE88

Total Repeats: 735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004565	TGA	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373132
2	NC_004565	ATA	2	6	610	615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
3	NC_004565	CAT	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28373132
4	NC_004565	AAG	2	6	731	736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373132
5	NC_004565	ACT	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28373132
6	NC_004565	GCA	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28373132
7	NC_004565	TTA	2	6	1083	1088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373132
8	NC_004565	ATA	2	6	1099	1104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
9	NC_004565	TAA	2	6	1409	1414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
10	NC_004565	TAG	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373132
11	NC_004565	TAA	2	6	1552	1557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
12	NC_004565	TTA	2	6	1560	1565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373132
13	NC_004565	AGA	2	6	1574	1579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373132
14	NC_004565	ATA	2	6	1609	1614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
15	NC_004565	AAG	2	6	1615	1620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373132
16	NC_004565	ACA	2	6	2925	2930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28373133
17	NC_004565	AGG	2	6	2942	2947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28373133
18	NC_004565	ATA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373133
19	NC_004565	TCC	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28373133
20	NC_004565	CAT	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28373134
21	NC_004565	AAG	2	6	3673	3678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373135
22	NC_004565	TCT	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373135
23	NC_004565	TCT	2	6	3792	3797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373135
24	NC_004565	GAT	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373135
25	NC_004565	TAG	2	6	4970	4975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373136
26	NC_004565	AGT	2	6	5017	5022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373136
27	NC_004565	GAA	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373136
28	NC_004565	AGA	2	6	5067	5072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373136
29	NC_004565	TAA	2	6	5133	5138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373136
30	NC_004565	TAT	2	6	5177	5182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373136
31	NC_004565	AAT	2	6	5219	5224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373136
32	NC_004565	GTT	2	6	5376	5381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28373137
33	NC_004565	ATT	2	6	5438	5443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373137
34	NC_004565	TGG	2	6	5447	5452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28373137
35	NC_004565	TTA	2	6	5461	5466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373137
36	NC_004565	AAT	2	6	5504	5509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
37	NC_004565	ATA	2	6	5518	5523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
38	NC_004565	GAA	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373137
39	NC_004565	AAT	2	6	5592	5597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
40	NC_004565	ATA	2	6	5649	5654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
41	NC_004565	ATA	2	6	5668	5673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
42	NC_004565	ATT	2	6	6539	6544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373138
43	NC_004565	AAG	2	6	6635	6640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373138
44	NC_004565	TAA	2	6	6725	6730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373138
45	NC_004565	TTC	2	6	6761	6766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373138
46	NC_004565	AGA	2	6	6806	6811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373138
47	NC_004565	TAA	2	6	6814	6819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373138
48	NC_004565	AGA	2	6	6827	6832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373138
49	NC_004565	AAT	2	6	6846	6851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373138
50	NC_004565	TGT	2	6	7944	7949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28373139
51	NC_004565	TAA	2	6	8064	8069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373139
52	NC_004565	TGG	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28373139
53	NC_004565	TAT	2	6	8467	8472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373140
54	NC_004565	TAG	2	6	8549	8554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373140
55	NC_004565	TAT	2	6	8601	8606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373140
56	NC_004565	AGA	2	6	8619	8624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373140
57	NC_004565	TCT	2	6	8680	8685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373140
58	NC_004565	ATG	2	6	8742	8747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373140
59	NC_004565	ATT	2	6	8778	8783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373140
60	NC_004565	TTG	2	6	8836	8841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28373140
61	NC_004565	CTT	2	6	8918	8923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373140
62	NC_004565	TAT	2	6	8949	8954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373140
63	NC_004565	ACC	2	6	9014	9019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28373141
64	NC_004565	TAG	2	6	9077	9082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373141
65	NC_004565	ATT	2	6	9088	9093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373141
66	NC_004565	ATA	2	6	9130	9135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373141
67	NC_004565	TCT	2	6	9209	9214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373141
68	NC_004565	TAT	2	6	9273	9278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373141
69	NC_004565	CTT	2	6	9417	9422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373141
70	NC_004565	AAG	2	6	9444	9449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373141
71	NC_004565	TAG	2	6	9480	9485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373141
72	NC_004565	AAT	2	6	9980	9985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373142
73	NC_004565	ATC	2	6	10022	10027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28373142
74	NC_004565	ATT	2	6	10034	10039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373142
75	NC_004565	CAA	2	6	10099	10104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28373142
76	NC_004565	TAA	2	6	10176	10181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373142
77	NC_004565	AGC	2	6	10187	10192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28373142
78	NC_004565	ACA	2	6	10912	10917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28373143
79	NC_004565	AGA	2	6	10962	10967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373143
80	NC_004565	TTC	2	6	11052	11057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373143
81	NC_004565	AGC	2	6	11091	11096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28373143
82	NC_004565	ATA	2	6	11135	11140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373143
83	NC_004565	GAA	2	6	11197	11202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373143
84	NC_004565	GAT	2	6	11248	11253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373143
85	NC_004565	GTG	2	6	11303	11308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28373143
86	NC_004565	TGG	2	6	11364	11369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28373143
87	NC_004565	GTA	2	6	11404	11409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373143
88	NC_004565	AGA	2	6	11430	11435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373143
89	NC_004565	TAA	2	6	11453	11458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373143
90	NC_004565	AAC	2	6	11488	11493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28373143
91	NC_004565	TGG	2	6	11682	11687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28373143
92	NC_004565	GAA	2	6	11842	11847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373144
93	NC_004565	ATA	2	6	11998	12003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373144
94	NC_004565	TAA	2	6	12110	12115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373144
95	NC_004565	GAT	2	6	12165	12170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373144
96	NC_004565	AAG	2	6	13118	13123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373145
97	NC_004565	ACA	2	6	13277	13282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28373145
98	NC_004565	AGG	2	6	13301	13306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28373145
99	NC_004565	CTT	2	6	13486	13491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373145
100	NC_004565	TAA	2	6	13528	13533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373145
101	NC_004565	AAT	2	6	13617	13622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
102	NC_004565	TAT	2	6	13629	13634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
103	NC_004565	TTA	2	6	13648	13653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
104	NC_004565	ATT	2	6	13724	13729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
105	NC_004565	CTT	2	6	13847	13852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373146
106	NC_004565	TGA	2	6	13947	13952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373146
107	NC_004565	TAG	2	6	14081	14086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373146
108	NC_004565	GAT	2	6	14158	14163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373146
109	NC_004565	TAA	2	6	14195	14200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
110	NC_004565	AGA	2	6	14223	14228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373146
111	NC_004565	GAT	2	6	14278	14283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373146
112	NC_004565	TAA	2	6	14589	14594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
113	NC_004565	TAT	2	6	14781	14786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
114	NC_004565	ATA	2	6	14981	14986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
115	NC_004565	ATA	2	6	14993	14998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
116	NC_004565	ATA	2	6	15011	15016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
117	NC_004565	AAT	2	6	15142	15147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
118	NC_004565	TAA	2	6	15254	15259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
119	NC_004565	AAT	2	6	15277	15282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
120	NC_004565	TAT	2	6	15303	15308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
121	NC_004565	AGA	2	6	15316	15321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373146
122	NC_004565	ATA	2	6	15332	15337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
123	NC_004565	ATG	2	6	15443	15448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373146
124	NC_004565	AAT	2	6	15529	15534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
125	NC_004565	ATT	2	6	15573	15578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
126	NC_004565	TTA	2	6	15582	15587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
127	NC_004565	TTA	2	6	15623	15628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
128	NC_004565	ATA	2	6	15682	15687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
129	NC_004565	TAA	2	6	15753	15758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
130	NC_004565	TTA	2	6	15776	15781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
131	NC_004565	ATT	2	6	15792	15797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
132	NC_004565	GTA	2	6	15841	15846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373146
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