MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Clostridium tetani E88 plasmid pE88

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004565	A	6	6	95	100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004565	T	6	6	126	131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004565	A	6	6	166	171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004565	A	6	6	188	193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004565	A	7	7	251	257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004565	A	6	6	488	493	100 %	0 %	0 %	0 %	28373132
7	NC_004565	A	6	6	1009	1014	100 %	0 %	0 %	0 %	28373132
8	NC_004565	T	6	6	1337	1342	0 %	100 %	0 %	0 %	28373132
9	NC_004565	A	6	6	1818	1823	100 %	0 %	0 %	0 %	28373132
10	NC_004565	T	7	7	1875	1881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004565	A	6	6	2042	2047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004565	A	6	6	2122	2127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004565	A	8	8	2467	2474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004565	A	6	6	2741	2746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004565	T	6	6	3191	3196	0 %	100 %	0 %	0 %	28373133
16	NC_004565	T	6	6	3305	3310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004565	T	7	7	3318	3324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004565	A	7	7	3417	3423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004565	T	8	8	3487	3494	0 %	100 %	0 %	0 %	28373134
20	NC_004565	T	6	6	3518	3523	0 %	100 %	0 %	0 %	28373134
21	NC_004565	T	8	8	3681	3688	0 %	100 %	0 %	0 %	28373135
22	NC_004565	T	6	6	3719	3724	0 %	100 %	0 %	0 %	28373135
23	NC_004565	T	7	7	3780	3786	0 %	100 %	0 %	0 %	28373135
24	NC_004565	T	6	6	3997	4002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004565	T	7	7	4086	4092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004565	T	6	6	4202	4207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004565	T	7	7	4332	4338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004565	T	7	7	4487	4493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004565	A	7	7	4722	4728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004565	A	6	6	4816	4821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004565	A	7	7	5423	5429	100 %	0 %	0 %	0 %	28373137
32	NC_004565	A	8	8	5492	5499	100 %	0 %	0 %	0 %	28373137
33	NC_004565	A	7	7	5537	5543	100 %	0 %	0 %	0 %	28373137
34	NC_004565	A	6	6	5774	5779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004565	T	6	6	5882	5887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004565	A	7	7	6013	6019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004565	T	6	6	6155	6160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004565	T	8	8	6244	6251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004565	A	6	6	6402	6407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004565	A	6	6	6595	6600	100 %	0 %	0 %	0 %	28373138
41	NC_004565	T	7	7	6609	6615	0 %	100 %	0 %	0 %	28373138
42	NC_004565	A	7	7	6642	6648	100 %	0 %	0 %	0 %	28373138
43	NC_004565	A	7	7	7436	7442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004565	T	8	8	7505	7512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004565	T	8	8	7550	7557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004565	T	7	7	7692	7698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004565	T	6	6	7846	7851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004565	T	8	8	8087	8094	0 %	100 %	0 %	0 %	28373139
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50	NC_004565	A	7	7	8321	8327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004565	T	6	6	8478	8483	0 %	100 %	0 %	0 %	28373140
52	NC_004565	T	6	6	8500	8505	0 %	100 %	0 %	0 %	28373140
53	NC_004565	T	6	6	8954	8959	0 %	100 %	0 %	0 %	28373140
54	NC_004565	T	6	6	9092	9097	0 %	100 %	0 %	0 %	28373141
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67	NC_004565	A	6	6	11636	11641	100 %	0 %	0 %	0 %	28373143
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70	NC_004565	A	6	6	12193	12198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004565	T	6	6	12224	12229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004565	T	6	6	12322	12327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004565	T	7	7	12374	12380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004565	T	6	6	12386	12391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004565	T	6	6	12406	12411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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79	NC_004565	A	6	6	13436	13441	100 %	0 %	0 %	0 %	28373145
80	NC_004565	A	6	6	13532	13537	100 %	0 %	0 %	0 %	28373145
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82	NC_004565	A	6	6	13757	13762	100 %	0 %	0 %	0 %	28373146
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100	NC_004565	A	7	7	18868	18874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_004565	T	6	6	19259	19264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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110	NC_004565	A	6	6	20860	20865	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
111	NC_004565	A	6	6	21141	21146	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
112	NC_004565	A	6	6	21162	21167	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
113	NC_004565	T	6	6	21189	21194	0 %	100 %	0 %	0 %	28373149
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115	NC_004565	A	6	6	21577	21582	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
116	NC_004565	A	6	6	21672	21677	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
117	NC_004565	A	7	7	21772	21778	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
118	NC_004565	A	7	7	21814	21820	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
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120	NC_004565	T	7	7	22157	22163	0 %	100 %	0 %	0 %	28373150
121	NC_004565	T	6	6	22219	22224	0 %	100 %	0 %	0 %	28373150
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123	NC_004565	T	6	6	22534	22539	0 %	100 %	0 %	0 %	28373150
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128	NC_004565	A	6	6	24494	24499	100 %	0 %	0 %	0 %	28373151
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132	NC_004565	T	7	7	24759	24765	0 %	100 %	0 %	0 %	28373152
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135	NC_004565	A	8	8	25204	25211	100 %	0 %	0 %	0 %	28373152
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152	NC_004565	T	6	6	27327	27332	0 %	100 %	0 %	0 %	28373155
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.