MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium tetani E88 plasmid pE88

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004565	A	6	6	95	100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004565	T	6	6	126	131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004565	A	6	6	166	171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004565	A	6	6	188	193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004565	A	7	7	251	257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004565	T	7	7	1875	1881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004565	A	6	6	2042	2047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004565	A	6	6	2122	2127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004565	A	8	8	2467	2474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004565	A	6	6	2741	2746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004565	T	6	6	3305	3310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004565	T	7	7	3318	3324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004565	A	7	7	3417	3423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004565	T	6	6	3997	4002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004565	T	7	7	4086	4092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004565	T	6	6	4202	4207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004565	T	7	7	4332	4338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004565	T	7	7	4487	4493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004565	A	7	7	4722	4728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004565	A	6	6	4816	4821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004565	A	6	6	5774	5779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004565	T	6	6	5882	5887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004565	A	7	7	6013	6019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004565	T	6	6	6155	6160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004565	T	8	8	6244	6251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004565	A	6	6	6402	6407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004565	A	7	7	7436	7442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004565	T	8	8	7505	7512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004565	T	8	8	7550	7557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004565	T	7	7	7692	7698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004565	T	6	6	7846	7851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004565	A	7	7	8321	8327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004565	T	7	7	9706	9712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004565	T	7	7	10446	10452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004565	A	6	6	12193	12198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004565	T	6	6	12224	12229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004565	T	6	6	12322	12327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004565	T	7	7	12374	12380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004565	T	6	6	12386	12391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004565	T	6	6	12406	12411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004565	A	6	6	12684	12689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004565	A	6	6	16019	16024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004565	T	6	6	16120	16125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004565	A	6	6	17941	17946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004565	T	6	6	18117	18122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004565	A	6	6	18200	18205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004565	A	7	7	18868	18874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004565	A	7	7	18982	18988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004565	A	6	6	19158	19163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004565	T	6	6	19259	19264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004565	T	7	7	19563	19569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004565	A	8	8	19670	19677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004565	T	7	7	23195	23201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004565	A	8	8	23471	23478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004565	T	7	7	25485	25491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004565	T	7	7	25531	25537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004565	A	6	6	25557	25562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004565	T	7	7	28977	28983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004565	T	6	6	29182	29187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004565	T	6	6	29197	29202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004565	A	6	6	29461	29466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004565	T	7	7	31270	31276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004565	A	6	6	31769	31774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004565	A	6	6	31889	31894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004565	G	6	6	32054	32059	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004565	T	7	7	32100	32106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004565	A	6	6	32127	32132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004565	A	6	6	32213	32218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004565	A	7	7	32690	32696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004565	A	7	7	35109	35115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004565	A	6	6	35160	35165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004565	A	6	6	35384	35389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004565	T	7	7	36070	36076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004565	T	6	6	36089	36094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004565	A	6	6	36426	36431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004565	A	6	6	36566	36571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004565	T	6	6	36977	36982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004565	A	6	6	37167	37172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004565	A	6	6	37650	37655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004565	T	8	8	37904	37911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004565	A	6	6	38630	38635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004565	T	7	7	38637	38643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004565	T	7	7	38690	38696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004565	A	6	6	45920	45925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004565	T	6	6	46322	46327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004565	T	8	8	46334	46341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004565	A	6	6	46995	47000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004565	A	6	6	47086	47091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004565	T	6	6	47108	47113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004565	A	6	6	47134	47139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004565	T	7	7	47729	47735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004565	T	6	6	47749	47754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004565	T	6	6	47817	47822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004565	T	6	6	47940	47945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004565	T	6	6	48108	48113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004565	T	7	7	51958	51964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004565	A	7	7	52065	52071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004565	A	6	6	52088	52093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004565	A	7	7	52128	52134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004565	A	6	6	52212	52217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004565	T	6	6	53784	53789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004565	T	6	6	54057	54062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004565	A	7	7	54260	54266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004565	A	7	7	54649	54655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004565	T	6	6	55309	55314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004565	T	7	7	55387	55393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004565	A	6	6	55494	55499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004565	A	6	6	55767	55772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004565	T	6	6	55880	55885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004565	A	7	7	55901	55907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004565	A	7	7	56032	56038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004565	T	6	6	56050	56055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004565	T	6	6	56324	56329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_004565	T	8	8	58879	58886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004565	A	6	6	59394	59399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004565	T	8	8	62537	62544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004565	A	7	7	62607	62613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004565	T	6	6	62854	62859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004565	T	6	6	63623	63628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004565	A	6	6	63645	63650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004565	T	6	6	63809	63814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004565	T	6	6	63830	63835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004565	T	6	6	65412	65417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004565	T	6	6	65967	65972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004565	A	6	6	65989	65994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004565	T	6	6	66279	66284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004565	T	6	6	66574	66579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004565	A	6	6	66729	66734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004565	T	6	6	66766	66771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004565	T	6	6	66935	66940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004565	T	6	6	67106	67111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004565	T	6	6	68603	68608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004565	A	6	6	72644	72649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004565	T	6	6	72694	72699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004565	T	6	6	72705	72710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004565	T	6	6	72738	72743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004565	A	6	6	73435	73440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004565	T	6	6	73524	73529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004565	T	6	6	73551	73556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004565	A	6	6	73717	73722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.