MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Clostridium tetani E88 plasmid pE88

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004565	A	6	6	488	493	100 %	0 %	0 %	0 %	28373132
2	NC_004565	A	6	6	1009	1014	100 %	0 %	0 %	0 %	28373132
3	NC_004565	T	6	6	1337	1342	0 %	100 %	0 %	0 %	28373132
4	NC_004565	A	6	6	1818	1823	100 %	0 %	0 %	0 %	28373132
5	NC_004565	T	6	6	3191	3196	0 %	100 %	0 %	0 %	28373133
6	NC_004565	T	8	8	3487	3494	0 %	100 %	0 %	0 %	28373134
7	NC_004565	T	6	6	3518	3523	0 %	100 %	0 %	0 %	28373134
8	NC_004565	T	8	8	3681	3688	0 %	100 %	0 %	0 %	28373135
9	NC_004565	T	6	6	3719	3724	0 %	100 %	0 %	0 %	28373135
10	NC_004565	T	7	7	3780	3786	0 %	100 %	0 %	0 %	28373135
11	NC_004565	A	7	7	5423	5429	100 %	0 %	0 %	0 %	28373137
12	NC_004565	A	8	8	5492	5499	100 %	0 %	0 %	0 %	28373137
13	NC_004565	A	7	7	5537	5543	100 %	0 %	0 %	0 %	28373137
14	NC_004565	A	6	6	6595	6600	100 %	0 %	0 %	0 %	28373138
15	NC_004565	T	7	7	6609	6615	0 %	100 %	0 %	0 %	28373138
16	NC_004565	A	7	7	6642	6648	100 %	0 %	0 %	0 %	28373138
17	NC_004565	T	8	8	8087	8094	0 %	100 %	0 %	0 %	28373139
18	NC_004565	T	6	6	8147	8152	0 %	100 %	0 %	0 %	28373139
19	NC_004565	T	6	6	8478	8483	0 %	100 %	0 %	0 %	28373140
20	NC_004565	T	6	6	8500	8505	0 %	100 %	0 %	0 %	28373140
21	NC_004565	T	6	6	8954	8959	0 %	100 %	0 %	0 %	28373140
22	NC_004565	T	6	6	9092	9097	0 %	100 %	0 %	0 %	28373141
23	NC_004565	T	6	6	9193	9198	0 %	100 %	0 %	0 %	28373141
24	NC_004565	A	6	6	9233	9238	100 %	0 %	0 %	0 %	28373141
25	NC_004565	T	7	7	9369	9375	0 %	100 %	0 %	0 %	28373141
26	NC_004565	T	7	7	9385	9391	0 %	100 %	0 %	0 %	28373141
27	NC_004565	T	7	7	9968	9974	0 %	100 %	0 %	0 %	28373142
28	NC_004565	T	7	7	10240	10246	0 %	100 %	0 %	0 %	28373142
29	NC_004565	T	6	6	10255	10260	0 %	100 %	0 %	0 %	28373142
30	NC_004565	A	6	6	10896	10901	100 %	0 %	0 %	0 %	28373143
31	NC_004565	A	6	6	10903	10908	100 %	0 %	0 %	0 %	28373143
32	NC_004565	A	6	6	11589	11594	100 %	0 %	0 %	0 %	28373143
33	NC_004565	A	6	6	11636	11641	100 %	0 %	0 %	0 %	28373143
34	NC_004565	A	6	6	11913	11918	100 %	0 %	0 %	0 %	28373144
35	NC_004565	T	6	6	11970	11975	0 %	100 %	0 %	0 %	28373144
36	NC_004565	A	6	6	12890	12895	100 %	0 %	0 %	0 %	28373145
37	NC_004565	A	6	6	13076	13081	100 %	0 %	0 %	0 %	28373145
38	NC_004565	A	6	6	13436	13441	100 %	0 %	0 %	0 %	28373145
39	NC_004565	A	6	6	13532	13537	100 %	0 %	0 %	0 %	28373145
40	NC_004565	A	6	6	13708	13713	100 %	0 %	0 %	0 %	28373146
41	NC_004565	A	6	6	13757	13762	100 %	0 %	0 %	0 %	28373146
42	NC_004565	A	6	6	13981	13986	100 %	0 %	0 %	0 %	28373146
43	NC_004565	A	6	6	14067	14072	100 %	0 %	0 %	0 %	28373146
44	NC_004565	A	7	7	14467	14473	100 %	0 %	0 %	0 %	28373146
45	NC_004565	T	6	6	14547	14552	0 %	100 %	0 %	0 %	28373146
46	NC_004565	A	6	6	14787	14792	100 %	0 %	0 %	0 %	28373146
47	NC_004565	A	7	7	14842	14848	100 %	0 %	0 %	0 %	28373146
48	NC_004565	T	7	7	16791	16797	0 %	100 %	0 %	0 %	28373167
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50	NC_004565	T	6	6	16879	16884	0 %	100 %	0 %	0 %	28373167
51	NC_004565	T	6	6	17002	17007	0 %	100 %	0 %	0 %	28373167
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56	NC_004565	A	6	6	20430	20435	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
57	NC_004565	A	8	8	20787	20794	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
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60	NC_004565	A	6	6	21162	21167	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
61	NC_004565	T	6	6	21189	21194	0 %	100 %	0 %	0 %	28373149
62	NC_004565	A	6	6	21485	21490	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
63	NC_004565	A	6	6	21577	21582	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
64	NC_004565	A	6	6	21672	21677	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
65	NC_004565	A	7	7	21772	21778	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
66	NC_004565	A	7	7	21814	21820	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
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69	NC_004565	T	6	6	22219	22224	0 %	100 %	0 %	0 %	28373150
70	NC_004565	T	6	6	22280	22285	0 %	100 %	0 %	0 %	28373150
71	NC_004565	T	6	6	22534	22539	0 %	100 %	0 %	0 %	28373150
72	NC_004565	A	6	6	24204	24209	100 %	0 %	0 %	0 %	28373151
73	NC_004565	A	6	6	24276	24281	100 %	0 %	0 %	0 %	28373151
74	NC_004565	A	6	6	24494	24499	100 %	0 %	0 %	0 %	28373151
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77	NC_004565	T	6	6	24631	24636	0 %	100 %	0 %	0 %	28373152
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80	NC_004565	A	6	6	25147	25152	100 %	0 %	0 %	0 %	28373152
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86	NC_004565	A	6	6	25833	25838	100 %	0 %	0 %	0 %	28373153
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106	NC_004565	A	6	6	28731	28736	100 %	0 %	0 %	0 %	28373155
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111	NC_004565	A	7	7	29915	29921	100 %	0 %	0 %	0 %	28373156
112	NC_004565	A	6	6	30103	30108	100 %	0 %	0 %	0 %	28373156
113	NC_004565	A	6	6	30341	30346	100 %	0 %	0 %	0 %	28373157
114	NC_004565	A	6	6	30348	30353	100 %	0 %	0 %	0 %	28373157
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116	NC_004565	A	8	8	31018	31025	100 %	0 %	0 %	0 %	28373157
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125	NC_004565	A	7	7	34415	34421	100 %	0 %	0 %	0 %	28373159
126	NC_004565	A	6	6	34952	34957	100 %	0 %	0 %	0 %	28373159
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.