MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 9036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004557	TA	5	10	13	22	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
2	NC_004557	AT	4	8	31	38	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
3	NC_004557	AT	3	6	104	109	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
4	NC_004557	AT	3	6	671	676	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
5	NC_004557	TA	3	6	1231	1236	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
6	NC_004557	TA	3	6	1405	1410	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
7	NC_004557	AT	3	6	1479	1484	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
8	NC_004557	AT	3	6	1660	1665	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
9	NC_004557	CT	3	6	1808	1813	0 %	50 %	0 %	50 %	28209835
10	NC_004557	AT	4	8	3447	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	28209836
11	NC_004557	AT	3	6	3466	3471	50 %	50 %	0 %	0 %	28209836
12	NC_004557	AT	3	6	3771	3776	50 %	50 %	0 %	0 %	28209836
13	NC_004557	AT	3	6	4433	4438	50 %	50 %	0 %	0 %	28209837
14	NC_004557	AT	3	6	4465	4470	50 %	50 %	0 %	0 %	28209837
15	NC_004557	AT	3	6	4526	4531	50 %	50 %	0 %	0 %	28209837
16	NC_004557	AT	3	6	4751	4756	50 %	50 %	0 %	0 %	28209838
17	NC_004557	TC	3	6	4937	4942	0 %	50 %	0 %	50 %	28209838
18	NC_004557	TA	3	6	4943	4948	50 %	50 %	0 %	0 %	28209838
19	NC_004557	CG	3	6	6139	6144	0 %	0 %	50 %	50 %	28209839
20	NC_004557	TC	3	6	6795	6800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004557	AC	3	6	6957	6962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_004557	CA	3	6	7867	7872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_004557	CT	3	6	8118	8123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_004557	TC	3	6	8670	8675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_004557	GT	3	6	8860	8865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004557	TC	3	6	9002	9007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_004557	GT	3	6	9028	9033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004557	TA	4	8	10250	10257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004557	TC	3	6	10450	10455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_004557	TA	4	8	10642	10649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004557	TA	4	8	10680	10687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004557	TA	4	8	10703	10710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004557	AT	3	6	10838	10843	50 %	50 %	0 %	0 %	28209840
34	NC_004557	AT	3	6	11000	11005	50 %	50 %	0 %	0 %	28209840
35	NC_004557	AT	3	6	11044	11049	50 %	50 %	0 %	0 %	28209840
36	NC_004557	AT	3	6	11712	11717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004557	TA	3	6	11750	11755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004557	AT	3	6	11945	11950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004557	CT	3	6	12045	12050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_004557	TA	3	6	12226	12231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004557	AT	4	8	12517	12524	50 %	50 %	0 %	0 %	28209841
42	NC_004557	TA	3	6	12735	12740	50 %	50 %	0 %	0 %	28209841
43	NC_004557	AT	3	6	13035	13040	50 %	50 %	0 %	0 %	28209841
44	NC_004557	TA	3	6	13230	13235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004557	TA	4	8	13274	13281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004557	TA	3	6	13477	13482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004557	AT	4	8	13931	13938	50 %	50 %	0 %	0 %	28209842
48	NC_004557	TA	3	6	14110	14115	50 %	50 %	0 %	0 %	28209842
49	NC_004557	AT	3	6	14355	14360	50 %	50 %	0 %	0 %	28209842
50	NC_004557	TA	3	6	14716	14721	50 %	50 %	0 %	0 %	28209842
51	NC_004557	TG	3	6	15532	15537	0 %	50 %	50 %	0 %	28209844
52	NC_004557	CT	3	6	15972	15977	0 %	50 %	0 %	50 %	28209844
53	NC_004557	TC	4	8	16458	16465	0 %	50 %	0 %	50 %	28209845
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55	NC_004557	AT	3	6	17103	17108	50 %	50 %	0 %	0 %	28209845
56	NC_004557	AT	3	6	17248	17253	50 %	50 %	0 %	0 %	28209845
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58	NC_004557	AT	3	6	17494	17499	50 %	50 %	0 %	0 %	28209845
59	NC_004557	TA	3	6	17522	17527	50 %	50 %	0 %	0 %	28209845
60	NC_004557	TC	3	6	17551	17556	0 %	50 %	0 %	50 %	28209845
61	NC_004557	AT	4	8	17568	17575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004557	TA	3	6	17856	17861	50 %	50 %	0 %	0 %	28209846
63	NC_004557	AT	3	6	17925	17930	50 %	50 %	0 %	0 %	28209846
64	NC_004557	AT	3	6	17941	17946	50 %	50 %	0 %	0 %	28209846
65	NC_004557	TA	3	6	18931	18936	50 %	50 %	0 %	0 %	28209846
66	NC_004557	AT	3	6	19005	19010	50 %	50 %	0 %	0 %	28209846
67	NC_004557	TA	3	6	19407	19412	50 %	50 %	0 %	0 %	28209846
68	NC_004557	TC	3	6	19590	19595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_004557	TA	3	6	19846	19851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004557	AT	3	6	19988	19993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004557	AT	3	6	20017	20022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004557	AT	3	6	20451	20456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004557	AT	3	6	20568	20573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004557	AT	3	6	20669	20674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004557	AT	3	6	20781	20786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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80	NC_004557	AT	3	6	22930	22935	50 %	50 %	0 %	0 %	28209849
81	NC_004557	TA	3	6	24089	24094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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85	NC_004557	AT	3	6	24445	24450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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87	NC_004557	AT	3	6	25101	25106	50 %	50 %	0 %	0 %	28209850
88	NC_004557	TA	3	6	25235	25240	50 %	50 %	0 %	0 %	28209850
89	NC_004557	AT	3	6	25273	25278	50 %	50 %	0 %	0 %	28209850
90	NC_004557	TA	3	6	25331	25336	50 %	50 %	0 %	0 %	28209850
91	NC_004557	AT	4	8	25415	25422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004557	AT	3	6	25452	25457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004557	GA	4	8	25520	25527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004557	TC	3	6	25600	25605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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100	NC_004557	TA	3	6	26639	26644	50 %	50 %	0 %	0 %	28209852
101	NC_004557	TA	3	6	26660	26665	50 %	50 %	0 %	0 %	28209852
102	NC_004557	AT	3	6	26821	26826	50 %	50 %	0 %	0 %	28209852
103	NC_004557	TA	3	6	27074	27079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004557	TA	3	6	27086	27091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004557	TA	3	6	27119	27124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_004557	AT	3	6	27818	27823	50 %	50 %	0 %	0 %	28209853
109	NC_004557	TA	3	6	27824	27829	50 %	50 %	0 %	0 %	28209853
110	NC_004557	TA	3	6	28111	28116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004557	TA	3	6	28129	28134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004557	TA	4	8	28300	28307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004557	AT	3	6	28452	28457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004557	AT	4	8	28601	28608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004557	TA	3	6	29237	29242	50 %	50 %	0 %	0 %	28209854
116	NC_004557	AT	3	6	29510	29515	50 %	50 %	0 %	0 %	28209854
117	NC_004557	TA	3	6	29658	29663	50 %	50 %	0 %	0 %	28209854
118	NC_004557	AT	3	6	29834	29839	50 %	50 %	0 %	0 %	28209854
119	NC_004557	AT	3	6	29962	29967	50 %	50 %	0 %	0 %	28209854
120	NC_004557	AT	3	6	30237	30242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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122	NC_004557	AT	4	8	30579	30586	50 %	50 %	0 %	0 %	28209855
123	NC_004557	TA	3	6	31105	31110	50 %	50 %	0 %	0 %	28209856
124	NC_004557	AT	3	6	31173	31178	50 %	50 %	0 %	0 %	28209856
125	NC_004557	TA	4	8	31731	31738	50 %	50 %	0 %	0 %	28209856
126	NC_004557	CT	3	6	31880	31885	0 %	50 %	0 %	50 %	28209856
127	NC_004557	AT	4	8	32075	32082	50 %	50 %	0 %	0 %	28209856
128	NC_004557	AT	3	6	32126	32131	50 %	50 %	0 %	0 %	28209857
129	NC_004557	AT	3	6	32234	32239	50 %	50 %	0 %	0 %	28209857
130	NC_004557	AT	3	6	32444	32449	50 %	50 %	0 %	0 %	28209857
131	NC_004557	TA	3	6	32499	32504	50 %	50 %	0 %	0 %	28209857
132	NC_004557	CT	3	6	32545	32550	0 %	50 %	0 %	50 %	28209857
133	NC_004557	CT	3	6	32660	32665	0 %	50 %	0 %	50 %	28209857
134	NC_004557	CT	3	6	32673	32678	0 %	50 %	0 %	50 %	28209857
135	NC_004557	TA	3	6	32748	32753	50 %	50 %	0 %	0 %	28209857
136	NC_004557	CT	3	6	32890	32895	0 %	50 %	0 %	50 %	28209857
137	NC_004557	CA	3	6	33032	33037	50 %	0 %	0 %	50 %	28209857
138	NC_004557	CT	3	6	33085	33090	0 %	50 %	0 %	50 %	28209857
139	NC_004557	CT	3	6	33187	33192	0 %	50 %	0 %	50 %	28209857
140	NC_004557	AT	3	6	33418	33423	50 %	50 %	0 %	0 %	28209857
141	NC_004557	AT	3	6	33443	33448	50 %	50 %	0 %	0 %	28209857
142	NC_004557	TA	4	8	34251	34258	50 %	50 %	0 %	0 %	28209857
143	NC_004557	AT	4	8	34323	34330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004557	AT	3	6	34415	34420	50 %	50 %	0 %	0 %	28209858
145	NC_004557	AT	3	6	34425	34430	50 %	50 %	0 %	0 %	28209858
146	NC_004557	AT	3	6	34445	34450	50 %	50 %	0 %	0 %	28209858
147	NC_004557	AT	3	6	34501	34506	50 %	50 %	0 %	0 %	28209858
148	NC_004557	TA	3	6	34845	34850	50 %	50 %	0 %	0 %	28209858
149	NC_004557	TA	3	6	35266	35271	50 %	50 %	0 %	0 %	28209858
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