MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 7192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004556	CTCG	2	8	503	510	0 %	25 %	25 %	50 %	28197946
2	NC_004556	TTCG	2	8	663	670	0 %	50 %	25 %	25 %	28197946
3	NC_004556	ATTG	2	8	757	764	25 %	50 %	25 %	0 %	28197946
4	NC_004556	CGAT	2	8	939	946	25 %	25 %	25 %	25 %	28197946
5	NC_004556	CTGA	2	8	1310	1317	25 %	25 %	25 %	25 %	28197946
6	NC_004556	AAAT	2	8	1508	1515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004556	ATTG	2	8	2451	2458	25 %	50 %	25 %	0 %	28197947
8	NC_004556	TTTA	2	8	2998	3005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004556	TTTC	2	8	3206	3213	0 %	75 %	0 %	25 %	28197948
10	NC_004556	TAAT	2	8	3388	3395	50 %	50 %	0 %	0 %	28197948
11	NC_004556	AGAA	2	8	3661	3668	75 %	0 %	25 %	0 %	28197948
12	NC_004556	ATGG	2	8	3829	3836	25 %	25 %	50 %	0 %	28197948
13	NC_004556	TTGA	2	8	3855	3862	25 %	50 %	25 %	0 %	28197948
14	NC_004556	TTTA	2	8	3866	3873	25 %	75 %	0 %	0 %	28197948
15	NC_004556	AGAA	2	8	4517	4524	75 %	0 %	25 %	0 %	28197949
16	NC_004556	GATA	2	8	4654	4661	50 %	25 %	25 %	0 %	28197949
17	NC_004556	GTCT	2	8	4976	4983	0 %	50 %	25 %	25 %	28197950
18	NC_004556	TCCT	2	8	5355	5362	0 %	50 %	0 %	50 %	28197950
19	NC_004556	AGTT	2	8	5378	5385	25 %	50 %	25 %	0 %	28197950
20	NC_004556	TGAT	2	8	5386	5393	25 %	50 %	25 %	0 %	28197950
21	NC_004556	ATTG	2	8	6335	6342	25 %	50 %	25 %	0 %	28197950
22	NC_004556	CAAT	2	8	6912	6919	50 %	25 %	0 %	25 %	28197950
23	NC_004556	CAGT	2	8	7436	7443	25 %	25 %	25 %	25 %	28197951
24	NC_004556	ATTG	2	8	7492	7499	25 %	50 %	25 %	0 %	28197951
25	NC_004556	TTTG	2	8	7732	7739	0 %	75 %	25 %	0 %	28197951
26	NC_004556	GACT	2	8	8650	8657	25 %	25 %	25 %	25 %	28197952
27	NC_004556	TTTC	2	8	9012	9019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_004556	TGGC	2	8	9245	9252	0 %	25 %	50 %	25 %	28197953
29	NC_004556	ATCA	2	8	9476	9483	50 %	25 %	0 %	25 %	28197953
30	NC_004556	AGCA	2	8	9653	9660	50 %	0 %	25 %	25 %	28197953
31	NC_004556	AAAG	2	8	9682	9689	75 %	0 %	25 %	0 %	28197953
32	NC_004556	TTTA	2	8	10364	10371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004556	CAAT	2	8	10500	10507	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_004556	TGTC	2	8	11206	11213	0 %	50 %	25 %	25 %	28197954
35	NC_004556	GAAA	2	8	11299	11306	75 %	0 %	25 %	0 %	28197954
36	NC_004556	CGGA	2	8	11798	11805	25 %	0 %	50 %	25 %	28197955
37	NC_004556	TGGC	2	8	12033	12040	0 %	25 %	50 %	25 %	28197955
38	NC_004556	CCAA	3	12	12982	12993	50 %	0 %	0 %	50 %	28197957
39	NC_004556	AATC	2	8	13105	13112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_004556	ATAC	2	8	13247	13254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_004556	AAAG	2	8	13419	13426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004556	TCTA	2	8	14489	14496	25 %	50 %	0 %	25 %	28197958
43	NC_004556	GTAC	2	8	14644	14651	25 %	25 %	25 %	25 %	28197958
44	NC_004556	TGTA	2	8	15177	15184	25 %	50 %	25 %	0 %	28197958
45	NC_004556	CAAC	2	8	15356	15363	50 %	0 %	0 %	50 %	28197958
46	NC_004556	GGTG	2	8	15879	15886	0 %	25 %	75 %	0 %	28197958
47	NC_004556	CACC	2	8	16134	16141	25 %	0 %	0 %	75 %	28197958
48	NC_004556	CTGG	2	8	17273	17280	0 %	25 %	50 %	25 %	28197960
49	NC_004556	GCGT	2	8	17716	17723	0 %	25 %	50 %	25 %	28197960
50	NC_004556	GGCG	2	8	17801	17808	0 %	0 %	75 %	25 %	28197960
51	NC_004556	CTAT	2	8	17902	17909	25 %	50 %	0 %	25 %	28197960
52	NC_004556	CTGG	2	8	17920	17927	0 %	25 %	50 %	25 %	28197960
53	NC_004556	GCAG	2	8	18145	18152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_004556	TCCT	2	8	18255	18262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_004556	CTGC	2	8	18417	18424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_004556	CAAT	2	8	18794	18801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_004556	GTGG	2	8	19715	19722	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004556	TCAG	2	8	19998	20005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_004556	GTCA	2	8	20588	20595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_004556	CAAC	2	8	20755	20762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_004556	ATTG	2	8	21020	21027	25 %	50 %	25 %	0 %	28197961
62	NC_004556	AGTT	2	8	21549	21556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004556	GTCT	2	8	21639	21646	0 %	50 %	25 %	25 %	77747623
64	NC_004556	GAGC	2	8	21661	21668	25 %	0 %	50 %	25 %	77747623
65	NC_004556	ATCA	2	8	21893	21900	50 %	25 %	0 %	25 %	77747623
66	NC_004556	TGGC	2	8	21936	21943	0 %	25 %	50 %	25 %	77747623
67	NC_004556	ATTG	2	8	21953	21960	25 %	50 %	25 %	0 %	77747623
68	NC_004556	CCAA	2	8	22376	22383	50 %	0 %	0 %	50 %	77747623
69	NC_004556	AGTT	2	8	24015	24022	25 %	50 %	25 %	0 %	28197963
70	NC_004556	TATG	2	8	24303	24310	25 %	50 %	25 %	0 %	28197963
71	NC_004556	GCAA	2	8	24440	24447	50 %	0 %	25 %	25 %	28197964
72	NC_004556	TATT	2	8	24492	24499	25 %	75 %	0 %	0 %	28197964
73	NC_004556	TCTG	2	8	25269	25276	0 %	50 %	25 %	25 %	28197965
74	NC_004556	CACT	2	8	25467	25474	25 %	25 %	0 %	50 %	28197965
75	NC_004556	ACAG	2	8	25879	25886	50 %	0 %	25 %	25 %	28197966
76	NC_004556	TTAA	2	8	26434	26441	50 %	50 %	0 %	0 %	28197966
77	NC_004556	TTGA	2	8	27332	27339	25 %	50 %	25 %	0 %	28197967
78	NC_004556	TGAA	2	8	27672	27679	50 %	25 %	25 %	0 %	28197967
79	NC_004556	TGCC	2	8	27739	27746	0 %	25 %	25 %	50 %	28197967
80	NC_004556	CAAC	2	8	28104	28111	50 %	0 %	0 %	50 %	28197967
81	NC_004556	TGCC	2	8	28149	28156	0 %	25 %	25 %	50 %	28197967
82	NC_004556	GCGG	2	8	28252	28259	0 %	0 %	75 %	25 %	28197967
83	NC_004556	AGCC	2	8	28297	28304	25 %	0 %	25 %	50 %	28197967
84	NC_004556	TACC	2	8	28396	28403	25 %	25 %	0 %	50 %	28197967
85	NC_004556	ATTA	2	8	28610	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	28197967
86	NC_004556	GACC	2	8	29062	29069	25 %	0 %	25 %	50 %	28197967
87	NC_004556	CCAG	2	8	29313	29320	25 %	0 %	25 %	50 %	28197967
88	NC_004556	GCGT	2	8	29518	29525	0 %	25 %	50 %	25 %	28197967
89	NC_004556	AGTG	2	8	30977	30984	25 %	25 %	50 %	0 %	28197969
90	NC_004556	GCCA	2	8	31396	31403	25 %	0 %	25 %	50 %	28197969
91	NC_004556	AATA	3	12	31895	31906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004556	TCGA	2	8	32118	32125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_004556	GGGC	2	8	32687	32694	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_004556	TGTT	2	8	32704	32711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004556	TATT	2	8	32927	32934	25 %	75 %	0 %	0 %	28197970
96	NC_004556	ACGC	2	8	33737	33744	25 %	0 %	25 %	50 %	28197970
97	NC_004556	TGCG	2	8	33790	33797	0 %	25 %	50 %	25 %	28197970
98	NC_004556	TGCG	2	8	34365	34372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_004556	GTTT	2	8	35717	35724	0 %	75 %	25 %	0 %	28197972
100	NC_004556	CGTG	2	8	35730	35737	0 %	25 %	50 %	25 %	28197972
101	NC_004556	GTGA	2	8	35976	35983	25 %	25 %	50 %	0 %	28197972
102	NC_004556	GCAG	2	8	36483	36490	25 %	0 %	50 %	25 %	28197974
103	NC_004556	GGTG	2	8	36611	36618	0 %	25 %	75 %	0 %	28197974
104	NC_004556	CAGG	2	8	36626	36633	25 %	0 %	50 %	25 %	28197974
105	NC_004556	TTCT	2	8	37102	37109	0 %	75 %	0 %	25 %	28197974
106	NC_004556	GTTG	2	8	37362	37369	0 %	50 %	50 %	0 %	28197974
107	NC_004556	GGGT	2	8	37386	37393	0 %	25 %	75 %	0 %	28197974
108	NC_004556	GTGC	2	8	38184	38191	0 %	25 %	50 %	25 %	28197975
109	NC_004556	AGTG	2	8	38599	38606	25 %	25 %	50 %	0 %	28197975
110	NC_004556	GATT	2	8	38996	39003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004556	ATCA	2	8	39055	39062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_004556	TGTC	2	8	39201	39208	0 %	50 %	25 %	25 %	28197976
113	NC_004556	TTGA	2	8	39736	39743	25 %	50 %	25 %	0 %	28197976
114	NC_004556	GTGA	2	8	39747	39754	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004556	AGGC	2	8	39776	39783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_004556	GCTT	2	8	39893	39900	0 %	50 %	25 %	25 %	28197977
117	NC_004556	CAGC	2	8	40091	40098	25 %	0 %	25 %	50 %	28197977
118	NC_004556	GCGG	2	8	40265	40272	0 %	0 %	75 %	25 %	28197977
119	NC_004556	CGTT	2	8	40428	40435	0 %	50 %	25 %	25 %	28197977
120	NC_004556	TCAT	2	8	40450	40457	25 %	50 %	0 %	25 %	28197977
121	NC_004556	AGTG	2	8	41108	41115	25 %	25 %	50 %	0 %	28197977
122	NC_004556	GGGT	2	8	41204	41211	0 %	25 %	75 %	0 %	28197977
123	NC_004556	GTCG	2	8	41424	41431	0 %	25 %	50 %	25 %	28197977
124	NC_004556	GTGC	2	8	41871	41878	0 %	25 %	50 %	25 %	28197977
125	NC_004556	GTCG	2	8	42663	42670	0 %	25 %	50 %	25 %	28197977
126	NC_004556	CAAG	2	8	42914	42921	50 %	0 %	25 %	25 %	28197977
127	NC_004556	TTGC	2	8	43371	43378	0 %	50 %	25 %	25 %	28197977
128	NC_004556	TGCA	2	8	43729	43736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_004556	GATA	2	8	43823	43830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004556	CTTT	2	8	43840	43847	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_004556	ACAT	2	8	43917	43924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_004556	TTGA	2	8	44184	44191	25 %	50 %	25 %	0 %	77747624
133	NC_004556	GGAG	2	8	44426	44433	25 %	0 %	75 %	0 %	77747624
134	NC_004556	TCCA	2	8	46137	46144	25 %	25 %	0 %	50 %	28197980
135	NC_004556	GAAT	2	8	46496	46503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004556	ACCA	2	8	46644	46651	50 %	0 %	0 %	50 %	28197981
137	NC_004556	TTCG	2	8	47356	47363	0 %	50 %	25 %	25 %	28197981
138	NC_004556	TGGT	2	8	47376	47383	0 %	50 %	50 %	0 %	28197981
139	NC_004556	GGCG	2	8	47782	47789	0 %	0 %	75 %	25 %	28197981
140	NC_004556	GGGA	2	8	48383	48390	25 %	0 %	75 %	0 %	28197981
141	NC_004556	TGGG	2	8	48636	48643	0 %	25 %	75 %	0 %	28197981
142	NC_004556	ATTC	2	8	48829	48836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_004556	AATT	2	8	49207	49214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004556	GTGA	2	8	49345	49352	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004556	AAGC	2	8	49359	49366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_004556	GATA	2	8	49660	49667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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