MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004552	TCACT	2	10	2701	2710	20 %	40 %	0 %	40 %	62184650
2	NC_004552	AGGAG	2	10	4412	4421	40 %	0 %	60 %	0 %	62184651
3	NC_004552	GTTCG	2	10	4511	4520	0 %	40 %	40 %	20 %	62184651
4	NC_004552	AACAT	2	10	7313	7322	60 %	20 %	0 %	20 %	62184653
5	NC_004552	AAGAG	2	10	8113	8122	60 %	0 %	40 %	0 %	62184654
6	NC_004552	TTTGT	2	10	8593	8602	0 %	80 %	20 %	0 %	62184654
7	NC_004552	AAGAA	2	10	9559	9568	80 %	0 %	20 %	0 %	62184654
8	NC_004552	ATAAA	2	10	12548	12557	80 %	20 %	0 %	0 %	62184655
9	NC_004552	ATAAA	2	10	13034	13043	80 %	20 %	0 %	0 %	62184655
10	NC_004552	GAAAC	2	10	14316	14325	60 %	0 %	20 %	20 %	62184656
11	NC_004552	GGCCT	2	10	14998	15007	0 %	20 %	40 %	40 %	62184656
12	NC_004552	AATAG	2	10	17056	17065	60 %	20 %	20 %	0 %	62184658
13	NC_004552	AGTGT	2	10	21105	21114	20 %	40 %	40 %	0 %	62184661
14	NC_004552	CGCAG	2	10	21896	21905	20 %	0 %	40 %	40 %	62184662
15	NC_004552	TTTGT	2	10	25053	25062	0 %	80 %	20 %	0 %	62184663
16	NC_004552	ATCAG	2	10	29155	29164	40 %	20 %	20 %	20 %	62184664
17	NC_004552	ATTGC	2	10	33367	33376	20 %	40 %	20 %	20 %	62184670
18	NC_004552	TTTTG	2	10	34322	34331	0 %	80 %	20 %	0 %	62184673
19	NC_004552	GAATC	2	10	34962	34971	40 %	20 %	20 %	20 %	62184673
20	NC_004552	CAACA	2	10	35491	35500	60 %	0 %	0 %	40 %	62184673
21	NC_004552	CCAGG	2	10	36960	36969	20 %	0 %	40 %	40 %	62184674
22	NC_004552	AAGGA	2	10	38542	38551	60 %	0 %	40 %	0 %	62184675
23	NC_004552	CCATA	2	10	38749	38758	40 %	20 %	0 %	40 %	62184675
24	NC_004552	GGATT	2	10	39735	39744	20 %	40 %	40 %	0 %	62184677
25	NC_004552	TATGG	2	10	44204	44213	20 %	40 %	40 %	0 %	62184683
26	NC_004552	TTGTC	2	10	45063	45072	0 %	60 %	20 %	20 %	62184683
27	NC_004552	TCTTT	2	10	46012	46021	0 %	80 %	0 %	20 %	62184685
28	NC_004552	GTCAT	2	10	50558	50567	20 %	40 %	20 %	20 %	62184688
29	NC_004552	TTTGG	2	10	51397	51406	0 %	60 %	40 %	0 %	62184688
30	NC_004552	GTAAG	2	10	57314	57323	40 %	20 %	40 %	0 %	62184694
31	NC_004552	GGGTT	2	10	58307	58316	0 %	40 %	60 %	0 %	62184695
32	NC_004552	GCTGG	2	10	58579	58588	0 %	20 %	60 %	20 %	62184695
33	NC_004552	AAAAT	2	10	60098	60107	80 %	20 %	0 %	0 %	62184696
34	NC_004552	GTTAT	2	10	61131	61140	20 %	60 %	20 %	0 %	62184696
35	NC_004552	ATTTT	2	10	61178	61187	20 %	80 %	0 %	0 %	62184696
36	NC_004552	TAGTT	2	10	62700	62709	20 %	60 %	20 %	0 %	62184696
37	NC_004552	TCCTA	2	10	64768	64777	20 %	40 %	0 %	40 %	62184698
38	NC_004552	AGAAA	2	10	70024	70033	80 %	0 %	20 %	0 %	62184702
39	NC_004552	ATTTT	2	10	73551	73560	20 %	80 %	0 %	0 %	62184706
40	NC_004552	GCACA	2	10	77109	77118	40 %	0 %	20 %	40 %	62184709
41	NC_004552	ATCGT	2	10	79893	79902	20 %	40 %	20 %	20 %	62184711
42	NC_004552	TATCA	2	10	81430	81439	40 %	40 %	0 %	20 %	62184712
43	NC_004552	AGGAA	2	10	84627	84636	60 %	0 %	40 %	0 %	62184714
44	NC_004552	CTTTT	2	10	85514	85523	0 %	80 %	0 %	20 %	62184715
45	NC_004552	CAAAG	2	10	86985	86994	60 %	0 %	20 %	20 %	62184717
46	NC_004552	AAAGA	2	10	89058	89067	80 %	0 %	20 %	0 %	62184719
47	NC_004552	TTTTC	2	10	90073	90082	0 %	80 %	0 %	20 %	62184719
48	NC_004552	AGGAT	2	10	90596	90605	40 %	20 %	40 %	0 %	62184719
49	NC_004552	ATAAC	2	10	90682	90691	60 %	20 %	0 %	20 %	62184719
50	NC_004552	TTTGC	2	10	91183	91192	0 %	60 %	20 %	20 %	62184719
51	NC_004552	TGTTT	2	10	94892	94901	0 %	80 %	20 %	0 %	62184722
52	NC_004552	GCGGA	2	10	96106	96115	20 %	0 %	60 %	20 %	62184723
53	NC_004552	TCACC	2	10	96466	96475	20 %	20 %	0 %	60 %	62184723
54	NC_004552	AAAAT	2	10	96601	96610	80 %	20 %	0 %	0 %	62184723
55	NC_004552	AAAAG	2	10	96644	96653	80 %	0 %	20 %	0 %	62184723
56	NC_004552	TTAAT	2	10	97645	97654	40 %	60 %	0 %	0 %	62184724
57	NC_004552	AAGAT	2	10	97923	97932	60 %	20 %	20 %	0 %	62184725
58	NC_004552	TGGCG	2	10	102894	102903	0 %	20 %	60 %	20 %	62184731
59	NC_004552	AATTA	2	10	104699	104708	60 %	40 %	0 %	0 %	62184733
60	NC_004552	CAAAG	2	10	104972	104981	60 %	0 %	20 %	20 %	62184733
61	NC_004552	CTTAA	2	10	106933	106942	40 %	40 %	0 %	20 %	62184735
62	NC_004552	AGCTT	2	10	108338	108347	20 %	40 %	20 %	20 %	62184737
63	NC_004552	TGAGA	2	10	110522	110531	40 %	20 %	40 %	0 %	62184740
64	NC_004552	AGTTA	2	10	115450	115459	40 %	40 %	20 %	0 %	62184752
65	NC_004552	AGTTT	2	10	115940	115949	20 %	60 %	20 %	0 %	62184753
66	NC_004552	TTTGC	2	10	116855	116864	0 %	60 %	20 %	20 %	62184755
67	NC_004552	TGAAA	2	10	117859	117868	60 %	20 %	20 %	0 %	62184755
68	NC_004552	TTTAC	2	10	119052	119061	20 %	60 %	0 %	20 %	62184758
69	NC_004552	TGAGA	2	10	123301	123310	40 %	20 %	40 %	0 %	62184762
70	NC_004552	CGATT	2	10	124100	124109	20 %	40 %	20 %	20 %	161501898
71	NC_004552	GTCAA	2	10	124616	124625	40 %	20 %	20 %	20 %	161501897
72	NC_004552	CTTCT	2	10	126725	126734	0 %	60 %	0 %	40 %	62184767
73	NC_004552	AACTT	2	10	128017	128026	40 %	40 %	0 %	20 %	62184767
74	NC_004552	CATTT	2	10	129121	129130	20 %	60 %	0 %	20 %	62184768
75	NC_004552	AAAAG	2	10	135310	135319	80 %	0 %	20 %	0 %	62184772
76	NC_004552	TCGCG	2	10	136241	136250	0 %	20 %	40 %	40 %	62184772
77	NC_004552	GATTT	2	10	137850	137859	20 %	60 %	20 %	0 %	62184774
78	NC_004552	TTGTT	2	10	138192	138201	0 %	80 %	20 %	0 %	62184774
79	NC_004552	AAGAA	2	10	138673	138682	80 %	0 %	20 %	0 %	62184774
80	NC_004552	CTTTG	2	10	141172	141181	0 %	60 %	20 %	20 %	62184777
81	NC_004552	TCTGT	2	10	142467	142476	0 %	60 %	20 %	20 %	62184779
82	NC_004552	AGAAA	2	10	143208	143217	80 %	0 %	20 %	0 %	62184780
83	NC_004552	AAAGA	2	10	145873	145882	80 %	0 %	20 %	0 %	62184782
84	NC_004552	TGTTT	2	10	147526	147535	0 %	80 %	20 %	0 %	62184784
85	NC_004552	CGTTT	2	10	149532	149541	0 %	60 %	20 %	20 %	62184785
86	NC_004552	ATTTT	2	10	149672	149681	20 %	80 %	0 %	0 %	62184785
87	NC_004552	TGCTT	2	10	150389	150398	0 %	60 %	20 %	20 %	62184785
88	NC_004552	TGGTT	2	10	150730	150739	0 %	60 %	40 %	0 %	62184785
89	NC_004552	ATGCT	2	10	151272	151281	20 %	40 %	20 %	20 %	62184786
90	NC_004552	AAGAG	2	10	152511	152520	60 %	0 %	40 %	0 %	62184787
91	NC_004552	CAGAA	2	10	152666	152675	60 %	0 %	20 %	20 %	62184787
92	NC_004552	AAAAG	2	10	154065	154074	80 %	0 %	20 %	0 %	62184788
93	NC_004552	GCTTG	2	10	163551	163560	0 %	40 %	40 %	20 %	62184798
94	NC_004552	TTACT	2	10	164693	164702	20 %	60 %	0 %	20 %	62184799
95	NC_004552	CTACG	2	10	166141	166150	20 %	20 %	20 %	40 %	62184799
96	NC_004552	AAATG	2	10	166278	166287	60 %	20 %	20 %	0 %	62184799
97	NC_004552	CTGTT	2	10	169580	169589	0 %	60 %	20 %	20 %	62184802
98	NC_004552	AATGA	2	10	169615	169624	60 %	20 %	20 %	0 %	62184802
99	NC_004552	ATATC	2	10	172261	172270	40 %	40 %	0 %	20 %	62184806
100	NC_004552	GAGAG	2	10	173091	173100	40 %	0 %	60 %	0 %	62184807
101	NC_004552	CTAAG	2	10	181034	181043	40 %	20 %	20 %	20 %	62184813
102	NC_004552	TTTTC	2	10	181634	181643	0 %	80 %	0 %	20 %	62184813
103	NC_004552	GCTCC	2	10	182748	182757	0 %	20 %	20 %	60 %	62184814
104	NC_004552	CACGC	2	10	186085	186094	20 %	0 %	20 %	60 %	62184818
105	NC_004552	TTCTT	2	10	188210	188219	0 %	80 %	0 %	20 %	62184819
106	NC_004552	CCAGT	2	10	188971	188980	20 %	20 %	20 %	40 %	62184819
107	NC_004552	CTCTG	2	10	189364	189373	0 %	40 %	20 %	40 %	62184819
108	NC_004552	GATAA	2	10	190853	190862	60 %	20 %	20 %	0 %	62184819
109	NC_004552	CCCTT	2	10	193058	193067	0 %	40 %	0 %	60 %	62184820
110	NC_004552	TTATT	2	10	194066	194075	20 %	80 %	0 %	0 %	62184821
111	NC_004552	AGGGT	2	10	196982	196991	20 %	20 %	60 %	0 %	62184823
112	NC_004552	CTAAA	2	10	197480	197489	60 %	20 %	0 %	20 %	62184823
113	NC_004552	CTTTA	2	10	197783	197792	20 %	60 %	0 %	20 %	62184823
114	NC_004552	TTGGT	2	10	201269	201278	0 %	60 %	40 %	0 %	62184826
115	NC_004552	CCAAT	2	10	201393	201402	40 %	20 %	0 %	40 %	62184826
116	NC_004552	TTCTT	2	10	202299	202308	0 %	80 %	0 %	20 %	62184827
117	NC_004552	ATGTG	2	10	204132	204141	20 %	40 %	40 %	0 %	62184829
118	NC_004552	AAAAT	2	10	206807	206816	80 %	20 %	0 %	0 %	62184832
119	NC_004552	GAAAT	2	10	207617	207626	60 %	20 %	20 %	0 %	62184832
120	NC_004552	TCTCT	2	10	208504	208513	0 %	60 %	0 %	40 %	62184834
121	NC_004552	AAGTA	2	10	209409	209418	60 %	20 %	20 %	0 %	62184834
122	NC_004552	TCGCA	2	10	209655	209664	20 %	20 %	20 %	40 %	62184835
123	NC_004552	GAAAA	2	10	214028	214037	80 %	0 %	20 %	0 %	62184840
124	NC_004552	TAGCA	2	10	214394	214403	40 %	20 %	20 %	20 %	62184841
125	NC_004552	AAGAA	2	10	215092	215101	80 %	0 %	20 %	0 %	62184841
126	NC_004552	GAAAG	2	10	216394	216403	60 %	0 %	40 %	0 %	62184843
127	NC_004552	ATATT	2	10	217524	217533	40 %	60 %	0 %	0 %	62184844
128	NC_004552	TGGAT	2	10	218528	218537	20 %	40 %	40 %	0 %	62184844
129	NC_004552	TGGAT	2	10	219080	219089	20 %	40 %	40 %	0 %	62184844
130	NC_004552	TAAGG	2	10	220634	220643	40 %	20 %	40 %	0 %	62184844
131	NC_004552	TTGTA	2	10	221174	221183	20 %	60 %	20 %	0 %	62184844
132	NC_004552	GGCTT	2	10	222304	222313	0 %	40 %	40 %	20 %	62184844
133	NC_004552	GCTGA	2	10	227177	227186	20 %	20 %	40 %	20 %	62184848
134	NC_004552	TACCT	2	10	231656	231665	20 %	40 %	0 %	40 %	62184854
135	NC_004552	TGCTG	2	10	233977	233986	0 %	40 %	40 %	20 %	62184856
136	NC_004552	TGCGT	2	10	234111	234120	0 %	40 %	40 %	20 %	62184856
137	NC_004552	GTTTT	2	10	234156	234165	0 %	80 %	20 %	0 %	62184856
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140	NC_004552	CTGGT	2	10	241710	241719	0 %	40 %	40 %	20 %	62184863
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144	NC_004552	TTATC	2	10	245517	245526	20 %	60 %	0 %	20 %	62184867
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150	NC_004552	TGGGG	2	10	254559	254568	0 %	20 %	80 %	0 %	62184878
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154	NC_004552	TCTCG	2	10	260892	260901	0 %	40 %	20 %	40 %	62184882
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168	NC_004552	TCCCT	2	10	273349	273358	0 %	40 %	0 %	60 %	62184893
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172	NC_004552	TTGTG	2	10	280578	280587	0 %	60 %	40 %	0 %	62184896
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260	NC_004552	TGGAT	2	10	464613	464622	20 %	40 %	40 %	0 %	62185035
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266	NC_004552	ACCTG	2	10	482892	482901	20 %	20 %	20 %	40 %	62185048
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