MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 2896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004552	AAGG	2	8	265	272	50 %	0 %	50 %	0 %	62184648
2	NC_004552	TTCT	2	8	725	732	0 %	75 %	0 %	25 %	62184648
3	NC_004552	TTAA	2	8	1352	1359	50 %	50 %	0 %	0 %	62184649
4	NC_004552	AGGT	2	8	1487	1494	25 %	25 %	50 %	0 %	62184649
5	NC_004552	AGAT	2	8	2542	2549	50 %	25 %	25 %	0 %	62184649
6	NC_004552	TGTT	2	8	2840	2847	0 %	75 %	25 %	0 %	62184650
7	NC_004552	GAAG	2	8	2951	2958	50 %	0 %	50 %	0 %	62184650
8	NC_004552	AGTA	2	8	2981	2988	50 %	25 %	25 %	0 %	62184650
9	NC_004552	TTTG	2	8	3299	3306	0 %	75 %	25 %	0 %	62184651
10	NC_004552	TCCT	2	8	3325	3332	0 %	50 %	0 %	50 %	62184651
11	NC_004552	GTTG	2	8	5091	5098	0 %	50 %	50 %	0 %	62184651
12	NC_004552	GAAA	2	8	5254	5261	75 %	0 %	25 %	0 %	62184651
13	NC_004552	AATC	2	8	5412	5419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_004552	CGAG	2	8	5524	5531	25 %	0 %	50 %	25 %	62184652
15	NC_004552	CACG	2	8	6408	6415	25 %	0 %	25 %	50 %	62184652
16	NC_004552	TTCA	2	8	6729	6736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_004552	TCTT	2	8	7863	7870	0 %	75 %	0 %	25 %	62184653
18	NC_004552	ATGA	2	8	8471	8478	50 %	25 %	25 %	0 %	62184654
19	NC_004552	GATC	2	8	8661	8668	25 %	25 %	25 %	25 %	62184654
20	NC_004552	TAGT	2	8	8769	8776	25 %	50 %	25 %	0 %	62184654
21	NC_004552	TACA	2	8	8852	8859	50 %	25 %	0 %	25 %	62184654
22	NC_004552	ATAG	2	8	9361	9368	50 %	25 %	25 %	0 %	62184654
23	NC_004552	ATTT	2	8	9391	9398	25 %	75 %	0 %	0 %	62184654
24	NC_004552	ATGT	2	8	10480	10487	25 %	50 %	25 %	0 %	62184654
25	NC_004552	AAGT	2	8	10514	10521	50 %	25 %	25 %	0 %	62184654
26	NC_004552	TAAG	2	8	10763	10770	50 %	25 %	25 %	0 %	62184654
27	NC_004552	AAAG	2	8	11056	11063	75 %	0 %	25 %	0 %	62184655
28	NC_004552	AAGG	2	8	11309	11316	50 %	0 %	50 %	0 %	62184655
29	NC_004552	GTAA	2	8	11549	11556	50 %	25 %	25 %	0 %	62184655
30	NC_004552	CAAA	2	8	12447	12454	75 %	0 %	0 %	25 %	62184655
31	NC_004552	ACTT	2	8	12690	12697	25 %	50 %	0 %	25 %	62184655
32	NC_004552	CACT	2	8	12787	12794	25 %	25 %	0 %	50 %	62184655
33	NC_004552	GCAA	2	8	13315	13322	50 %	0 %	25 %	25 %	62184655
34	NC_004552	AAAG	2	8	13491	13498	75 %	0 %	25 %	0 %	62184655
35	NC_004552	GAAA	2	8	13735	13742	75 %	0 %	25 %	0 %	62184655
36	NC_004552	TTGT	2	8	14354	14361	0 %	75 %	25 %	0 %	62184656
37	NC_004552	GGAT	2	8	14938	14945	25 %	25 %	50 %	0 %	62184656
38	NC_004552	CCCA	2	8	15409	15416	25 %	0 %	0 %	75 %	62184656
39	NC_004552	TAAA	2	8	17012	17019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004552	AGAA	2	8	17152	17159	75 %	0 %	25 %	0 %	62184658
41	NC_004552	TAGA	2	8	17411	17418	50 %	25 %	25 %	0 %	62184658
42	NC_004552	CAGT	2	8	17479	17486	25 %	25 %	25 %	25 %	62184658
43	NC_004552	TTTC	2	8	17669	17676	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_004552	GTCA	2	8	17825	17832	25 %	25 %	25 %	25 %	62184659
45	NC_004552	AAGC	2	8	18216	18223	50 %	0 %	25 %	25 %	62184659
46	NC_004552	ATTA	2	8	18356	18363	50 %	50 %	0 %	0 %	62184659
47	NC_004552	ATTA	2	8	18978	18985	50 %	50 %	0 %	0 %	62184660
48	NC_004552	CTGT	2	8	19228	19235	0 %	50 %	25 %	25 %	62184660
49	NC_004552	GTTT	2	8	19251	19258	0 %	75 %	25 %	0 %	62184660
50	NC_004552	TTTG	2	8	19491	19498	0 %	75 %	25 %	0 %	62184660
51	NC_004552	TGGT	2	8	20435	20442	0 %	50 %	50 %	0 %	62184661
52	NC_004552	GAAC	2	8	20505	20512	50 %	0 %	25 %	25 %	62184661
53	NC_004552	TGTA	2	8	20724	20731	25 %	50 %	25 %	0 %	62184661
54	NC_004552	ATAG	2	8	20819	20826	50 %	25 %	25 %	0 %	62184661
55	NC_004552	TATG	2	8	21574	21581	25 %	50 %	25 %	0 %	62184661
56	NC_004552	CAAT	2	8	22266	22273	50 %	25 %	0 %	25 %	62184662
57	NC_004552	AGAA	2	8	22683	22690	75 %	0 %	25 %	0 %	62184662
58	NC_004552	TGAT	2	8	22890	22897	25 %	50 %	25 %	0 %	62184662
59	NC_004552	GCAA	2	8	23476	23483	50 %	0 %	25 %	25 %	62184662
60	NC_004552	TGTC	2	8	24039	24046	0 %	50 %	25 %	25 %	62184663
61	NC_004552	AGCT	2	8	24152	24159	25 %	25 %	25 %	25 %	62184663
62	NC_004552	AATT	2	8	24614	24621	50 %	50 %	0 %	0 %	62184663
63	NC_004552	GATA	2	8	24680	24687	50 %	25 %	25 %	0 %	62184663
64	NC_004552	TAGT	2	8	24970	24977	25 %	50 %	25 %	0 %	62184663
65	NC_004552	AACT	2	8	25010	25017	50 %	25 %	0 %	25 %	62184663
66	NC_004552	GCTG	2	8	26407	26414	0 %	25 %	50 %	25 %	62184663
67	NC_004552	TAAA	2	8	26459	26466	75 %	25 %	0 %	0 %	62184663
68	NC_004552	ATTT	2	8	26627	26634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004552	ATTA	2	8	26638	26645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004552	CTGG	2	8	27158	27165	0 %	25 %	50 %	25 %	62184664
71	NC_004552	CAAT	2	8	27930	27937	50 %	25 %	0 %	25 %	62184664
72	NC_004552	AGAT	2	8	28428	28435	50 %	25 %	25 %	0 %	62184664
73	NC_004552	ATCG	2	8	28559	28566	25 %	25 %	25 %	25 %	62184664
74	NC_004552	AAAT	2	8	28780	28787	75 %	25 %	0 %	0 %	62184664
75	NC_004552	GTGA	2	8	29003	29010	25 %	25 %	50 %	0 %	62184664
76	NC_004552	GGCA	2	8	29058	29065	25 %	0 %	50 %	25 %	62184664
77	NC_004552	AGGG	2	8	29390	29397	25 %	0 %	75 %	0 %	62184665
78	NC_004552	GAAT	2	8	29584	29591	50 %	25 %	25 %	0 %	62184666
79	NC_004552	ACCA	2	8	30199	30206	50 %	0 %	0 %	50 %	62184666
80	NC_004552	AACG	2	8	30806	30813	50 %	0 %	25 %	25 %	62184668
81	NC_004552	CGCA	2	8	31081	31088	25 %	0 %	25 %	50 %	62184668
82	NC_004552	GTTT	2	8	31370	31377	0 %	75 %	25 %	0 %	62184668
83	NC_004552	TTTC	2	8	31610	31617	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_004552	CTTA	2	8	31768	31775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_004552	TCTA	2	8	32013	32020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_004552	TTAA	2	8	32379	32386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004552	ATTT	2	8	32394	32401	25 %	75 %	0 %	0 %	62184670
88	NC_004552	TGAT	2	8	32404	32411	25 %	50 %	25 %	0 %	62184670
89	NC_004552	TTGT	2	8	32420	32427	0 %	75 %	25 %	0 %	62184670
90	NC_004552	TTTA	2	8	33080	33087	25 %	75 %	0 %	0 %	62184670
91	NC_004552	TGAA	2	8	33976	33983	50 %	25 %	25 %	0 %	62184672
92	NC_004552	TCTT	2	8	34350	34357	0 %	75 %	0 %	25 %	62184673
93	NC_004552	CATC	2	8	35133	35140	25 %	25 %	0 %	50 %	62184673
94	NC_004552	AGGA	2	8	35302	35309	50 %	0 %	50 %	0 %	62184673
95	NC_004552	TAAT	2	8	36090	36097	50 %	50 %	0 %	0 %	62184674
96	NC_004552	ATGC	2	8	36109	36116	25 %	25 %	25 %	25 %	62184674
97	NC_004552	GAAA	2	8	37018	37025	75 %	0 %	25 %	0 %	62184674
98	NC_004552	TCAA	2	8	37739	37746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_004552	TCAA	2	8	37886	37893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_004552	TGTT	2	8	37955	37962	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004552	ATAG	2	8	38007	38014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004552	AAAG	2	8	38166	38173	75 %	0 %	25 %	0 %	62184675
103	NC_004552	TAAT	2	8	38182	38189	50 %	50 %	0 %	0 %	62184675
104	NC_004552	TCAA	2	8	38318	38325	50 %	25 %	0 %	25 %	62184675
105	NC_004552	ATTT	2	8	38395	38402	25 %	75 %	0 %	0 %	62184675
106	NC_004552	TTTA	2	8	38651	38658	25 %	75 %	0 %	0 %	62184675
107	NC_004552	CTTT	2	8	38781	38788	0 %	75 %	0 %	25 %	62184675
108	NC_004552	AGCG	2	8	38970	38977	25 %	0 %	50 %	25 %	62184675
109	NC_004552	GAAA	2	8	41159	41166	75 %	0 %	25 %	0 %	62184678
110	NC_004552	AGCA	2	8	41330	41337	50 %	0 %	25 %	25 %	62184678
111	NC_004552	CTGT	2	8	41798	41805	0 %	50 %	25 %	25 %	62184678
112	NC_004552	GAAG	2	8	42249	42256	50 %	0 %	50 %	0 %	62184678
113	NC_004552	AATA	2	8	42280	42287	75 %	25 %	0 %	0 %	62184678
114	NC_004552	GAAA	2	8	43419	43426	75 %	0 %	25 %	0 %	62184682
115	NC_004552	GTCG	2	8	44117	44124	0 %	25 %	50 %	25 %	62184683
116	NC_004552	TTAA	2	8	44147	44154	50 %	50 %	0 %	0 %	62184683
117	NC_004552	GGGT	2	8	44568	44575	0 %	25 %	75 %	0 %	62184683
118	NC_004552	ATGA	2	8	45014	45021	50 %	25 %	25 %	0 %	62184683
119	NC_004552	AGAA	2	8	45683	45690	75 %	0 %	25 %	0 %	62184684
120	NC_004552	TAAA	2	8	45913	45920	75 %	25 %	0 %	0 %	62184684
121	NC_004552	GCTG	2	8	46523	46530	0 %	25 %	50 %	25 %	62184685
122	NC_004552	GAAA	2	8	46892	46899	75 %	0 %	25 %	0 %	62184686
123	NC_004552	TCTT	2	8	46998	47005	0 %	75 %	0 %	25 %	62184686
124	NC_004552	AAGA	2	8	47969	47976	75 %	0 %	25 %	0 %	62184687
125	NC_004552	ATAA	2	8	49447	49454	75 %	25 %	0 %	0 %	62184688
126	NC_004552	TTAT	2	8	50369	50376	25 %	75 %	0 %	0 %	62184688
127	NC_004552	AACA	2	8	50796	50803	75 %	0 %	0 %	25 %	62184688
128	NC_004552	CAAG	2	8	51144	51151	50 %	0 %	25 %	25 %	62184688
129	NC_004552	TCTT	2	8	51544	51551	0 %	75 %	0 %	25 %	62184688
130	NC_004552	AAAG	2	8	52529	52536	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004552	TTTA	2	8	52539	52546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004552	TACG	2	8	52592	52599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_004552	GAAG	2	8	52642	52649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004552	ATTT	2	8	52673	52680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004552	TGCC	2	8	52900	52907	0 %	25 %	25 %	50 %	62184689
136	NC_004552	ATCC	2	8	52949	52956	25 %	25 %	0 %	50 %	62184689
137	NC_004552	TTCA	2	8	53401	53408	25 %	50 %	0 %	25 %	62184689
138	NC_004552	CAGG	2	8	53609	53616	25 %	0 %	50 %	25 %	62184689
139	NC_004552	TCTT	2	8	53801	53808	0 %	75 %	0 %	25 %	62184689
140	NC_004552	ATTA	2	8	55769	55776	50 %	50 %	0 %	0 %	62184692
141	NC_004552	CTGT	2	8	55959	55966	0 %	50 %	25 %	25 %	62184692
142	NC_004552	CTTT	2	8	56286	56293	0 %	75 %	0 %	25 %	62184693
143	NC_004552	AGAA	2	8	56369	56376	75 %	0 %	25 %	0 %	62184693
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145	NC_004552	TTAG	2	8	56884	56891	25 %	50 %	25 %	0 %	62184693
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