MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 13357

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004552	CGA	2	6	169	174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184648
2	NC_004552	AGA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184648
3	NC_004552	TTA	2	6	229	234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184648
4	NC_004552	TCT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184648
5	NC_004552	ACC	2	6	532	537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184648
6	NC_004552	ATG	2	6	545	550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184648
7	NC_004552	TTG	2	6	554	559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184648
8	NC_004552	TGT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184648
9	NC_004552	ATG	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184648
10	NC_004552	ATC	2	6	761	766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184648
11	NC_004552	AGC	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184648
12	NC_004552	GTG	2	6	980	985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184648
13	NC_004552	GGT	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184648
14	NC_004552	CTT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184648
15	NC_004552	CGG	2	6	1170	1175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184649
16	NC_004552	ATT	2	6	1232	1237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184649
17	NC_004552	TAA	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184649
18	NC_004552	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184649
19	NC_004552	ATG	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184649
20	NC_004552	TTA	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184649
21	NC_004552	TCT	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184649
22	NC_004552	TTG	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184649
23	NC_004552	TAG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184649
24	NC_004552	AGG	2	6	1737	1742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184649
25	NC_004552	ACT	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184649
26	NC_004552	TTC	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184649
27	NC_004552	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184649
28	NC_004552	CTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184649
29	NC_004552	GAA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184649
30	NC_004552	TGA	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184649
31	NC_004552	GAT	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184649
32	NC_004552	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184649
33	NC_004552	CTT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184649
34	NC_004552	TAA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184649
35	NC_004552	GAA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184649
36	NC_004552	TTA	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184650
37	NC_004552	TCC	2	6	2684	2689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184650
38	NC_004552	TTC	2	6	2777	2782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184650
39	NC_004552	ATT	2	6	2801	2806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184650
40	NC_004552	AGA	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184650
41	NC_004552	TAT	2	6	2971	2976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184650
42	NC_004552	TAT	2	6	3005	3010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184650
43	NC_004552	GAA	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
44	NC_004552	ATG	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184651
45	NC_004552	GTT	2	6	3489	3494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184651
46	NC_004552	CTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184651
47	NC_004552	TGA	2	6	3607	3612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184651
48	NC_004552	TTC	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184651
49	NC_004552	TGA	2	6	3658	3663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184651
50	NC_004552	ATC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184651
51	NC_004552	TGG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184651
52	NC_004552	TTA	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184651
53	NC_004552	AGA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
54	NC_004552	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184651
55	NC_004552	GAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
56	NC_004552	GCC	2	6	4284	4289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184651
57	NC_004552	AAG	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
58	NC_004552	CTT	2	6	4449	4454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184651
59	NC_004552	ATG	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184651
60	NC_004552	GGC	2	6	4577	4582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184651
61	NC_004552	CGC	2	6	4612	4617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184651
62	NC_004552	GAA	2	6	4808	4813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
63	NC_004552	AGA	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
64	NC_004552	ACA	2	6	4848	4853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184651
65	NC_004552	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184651
66	NC_004552	AAG	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
67	NC_004552	GAA	2	6	5031	5036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
68	NC_004552	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
69	NC_004552	AGA	2	6	5518	5523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184652
70	NC_004552	TGG	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184652
71	NC_004552	TGA	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184652
72	NC_004552	TGT	2	6	5728	5733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184652
73	NC_004552	CTG	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184652
74	NC_004552	CAA	2	6	5861	5866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184652
75	NC_004552	TTA	2	6	5890	5895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184652
76	NC_004552	TGA	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184652
77	NC_004552	GAT	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184652
78	NC_004552	TGT	3	9	5981	5989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184652
79	NC_004552	TGA	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184652
80	NC_004552	CTT	2	6	6062	6067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184652
81	NC_004552	GAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184652
82	NC_004552	TGC	2	6	6220	6225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184652
83	NC_004552	GTT	2	6	6236	6241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184652
84	NC_004552	GAT	2	6	6242	6247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184652
85	NC_004552	GAA	2	6	6272	6277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184652
86	NC_004552	GAG	2	6	6285	6290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184652
87	NC_004552	TTC	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184652
88	NC_004552	ACC	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184652
89	NC_004552	GTT	2	6	6390	6395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184652
90	NC_004552	ATA	2	6	6588	6593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184652
91	NC_004552	CAA	2	6	6632	6637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184652
92	NC_004552	GAA	2	6	6901	6906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184653
93	NC_004552	GAC	2	6	6921	6926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184653
94	NC_004552	GTG	2	6	6976	6981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184653
95	NC_004552	CAC	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184653
96	NC_004552	GTT	2	6	7103	7108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184653
97	NC_004552	CAT	2	6	7128	7133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184653
98	NC_004552	AGA	2	6	7158	7163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184653
99	NC_004552	CCT	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184653
100	NC_004552	TTG	2	6	7290	7295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184653
101	NC_004552	CTC	2	6	7332	7337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184653
102	NC_004552	TAA	2	6	7469	7474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184653
103	NC_004552	AGA	2	6	7566	7571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184653
104	NC_004552	TGA	2	6	7596	7601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184653
105	NC_004552	TTG	2	6	7768	7773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184653
106	NC_004552	TGC	2	6	7845	7850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184653
107	NC_004552	TTC	2	6	7880	7885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184653
108	NC_004552	GAA	2	6	7983	7988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184654
109	NC_004552	TTG	2	6	8042	8047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184654
110	NC_004552	AAG	2	6	8157	8162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184654
111	NC_004552	TTA	2	6	8241	8246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184654
112	NC_004552	CTT	2	6	8260	8265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184654
113	NC_004552	GAG	2	6	8331	8336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184654
114	NC_004552	TTC	2	6	8491	8496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184654
115	NC_004552	AGA	2	6	8510	8515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184654
116	NC_004552	GAA	2	6	8577	8582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184654
117	NC_004552	AGG	2	6	8608	8613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184654
118	NC_004552	AAG	2	6	8803	8808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184654
119	NC_004552	GTT	2	6	8827	8832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184654
120	NC_004552	GAA	2	6	8877	8882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184654
121	NC_004552	AAG	2	6	8992	8997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184654
122	NC_004552	TTC	2	6	9011	9016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184654
123	NC_004552	GAA	2	6	9072	9077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184654
124	NC_004552	GAG	2	6	9133	9138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184654
125	NC_004552	AGT	2	6	9238	9243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184654
126	NC_004552	CAT	2	6	9262	9267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184654
127	NC_004552	GCT	2	6	9287	9292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184654
128	NC_004552	AGA	2	6	9331	9336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184654
129	NC_004552	AGC	2	6	9533	9538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184654
130	NC_004552	AGA	2	6	9679	9684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184654
131	NC_004552	GTT	2	6	9725	9730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184654
132	NC_004552	CTT	2	6	9964	9969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184654
133	NC_004552	TCT	2	6	9993	9998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184654
134	NC_004552	CCA	2	6	10028	10033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184654
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388	NC_004552	CCG	2	6	30447	30452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184667
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