MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 2093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004552	TA	3	6	92	97	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004552	GT	3	6	308	313	0 %	50 %	50 %	0 %	62184648
3	NC_004552	TG	3	6	497	502	0 %	50 %	50 %	0 %	62184648
4	NC_004552	AC	3	6	1294	1299	50 %	0 %	0 %	50 %	62184649
5	NC_004552	AT	3	6	1454	1459	50 %	50 %	0 %	0 %	62184649
6	NC_004552	TC	3	6	1583	1588	0 %	50 %	0 %	50 %	62184649
7	NC_004552	TG	3	6	1887	1892	0 %	50 %	50 %	0 %	62184649
8	NC_004552	AG	3	6	2312	2317	50 %	0 %	50 %	0 %	62184649
9	NC_004552	GA	3	6	2785	2790	50 %	0 %	50 %	0 %	62184650
10	NC_004552	AG	3	6	4386	4391	50 %	0 %	50 %	0 %	62184651
11	NC_004552	GA	3	6	4655	4660	50 %	0 %	50 %	0 %	62184651
12	NC_004552	TG	3	6	7712	7717	0 %	50 %	50 %	0 %	62184653
13	NC_004552	AT	3	6	8452	8457	50 %	50 %	0 %	0 %	62184654
14	NC_004552	TA	3	6	8646	8651	50 %	50 %	0 %	0 %	62184654
15	NC_004552	CA	3	6	9094	9099	50 %	0 %	0 %	50 %	62184654
16	NC_004552	TG	3	6	11172	11177	0 %	50 %	50 %	0 %	62184655
17	NC_004552	TC	3	6	11251	11256	0 %	50 %	0 %	50 %	62184655
18	NC_004552	AC	3	6	11267	11272	50 %	0 %	0 %	50 %	62184655
19	NC_004552	GA	3	6	11339	11344	50 %	0 %	50 %	0 %	62184655
20	NC_004552	TA	3	6	11512	11517	50 %	50 %	0 %	0 %	62184655
21	NC_004552	GA	3	6	11590	11595	50 %	0 %	50 %	0 %	62184655
22	NC_004552	AG	3	6	11778	11783	50 %	0 %	50 %	0 %	62184655
23	NC_004552	TC	3	6	11831	11836	0 %	50 %	0 %	50 %	62184655
24	NC_004552	GA	3	6	11903	11908	50 %	0 %	50 %	0 %	62184655
25	NC_004552	GT	3	6	12046	12051	0 %	50 %	50 %	0 %	62184655
26	NC_004552	TA	3	6	12081	12086	50 %	50 %	0 %	0 %	62184655
27	NC_004552	AG	3	6	12795	12800	50 %	0 %	50 %	0 %	62184655
28	NC_004552	GT	3	6	12855	12860	0 %	50 %	50 %	0 %	62184655
29	NC_004552	CT	3	6	13107	13112	0 %	50 %	0 %	50 %	62184655
30	NC_004552	TA	3	6	13815	13820	50 %	50 %	0 %	0 %	62184655
31	NC_004552	AT	3	6	14099	14104	50 %	50 %	0 %	0 %	62184656
32	NC_004552	TA	3	6	14410	14415	50 %	50 %	0 %	0 %	62184656
33	NC_004552	TA	3	6	15109	15114	50 %	50 %	0 %	0 %	62184656
34	NC_004552	AG	3	6	17685	17690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004552	GT	3	6	19382	19387	0 %	50 %	50 %	0 %	62184660
36	NC_004552	TA	3	6	19426	19431	50 %	50 %	0 %	0 %	62184660
37	NC_004552	TG	3	6	19540	19545	0 %	50 %	50 %	0 %	62184660
38	NC_004552	GT	3	6	19661	19666	0 %	50 %	50 %	0 %	62184660
39	NC_004552	AC	3	6	20102	20107	50 %	0 %	0 %	50 %	62184660
40	NC_004552	GA	3	6	24295	24300	50 %	0 %	50 %	0 %	62184663
41	NC_004552	AG	3	6	25596	25601	50 %	0 %	50 %	0 %	62184663
42	NC_004552	TA	3	6	26499	26504	50 %	50 %	0 %	0 %	62184663
43	NC_004552	AC	3	6	27598	27603	50 %	0 %	0 %	50 %	62184664
44	NC_004552	TA	3	6	27723	27728	50 %	50 %	0 %	0 %	62184664
45	NC_004552	TA	3	6	28022	28027	50 %	50 %	0 %	0 %	62184664
46	NC_004552	AG	3	6	29884	29889	50 %	0 %	50 %	0 %	62184666
47	NC_004552	GC	3	6	30351	30356	0 %	0 %	50 %	50 %	62184667
48	NC_004552	GA	3	6	31067	31072	50 %	0 %	50 %	0 %	62184668
49	NC_004552	AG	3	6	31159	31164	50 %	0 %	50 %	0 %	62184668
50	NC_004552	GA	4	8	31197	31204	50 %	0 %	50 %	0 %	62184668
51	NC_004552	CA	3	6	31302	31307	50 %	0 %	0 %	50 %	62184668
52	NC_004552	GA	3	6	31672	31677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004552	TG	3	6	33204	33209	0 %	50 %	50 %	0 %	62184670
54	NC_004552	TG	3	6	33600	33605	0 %	50 %	50 %	0 %	62184671
55	NC_004552	GA	3	6	33767	33772	50 %	0 %	50 %	0 %	62184671
56	NC_004552	AG	3	6	34570	34575	50 %	0 %	50 %	0 %	62184673
57	NC_004552	AG	3	6	34642	34647	50 %	0 %	50 %	0 %	62184673
58	NC_004552	TG	3	6	34777	34782	0 %	50 %	50 %	0 %	62184673
59	NC_004552	GC	3	6	35090	35095	0 %	0 %	50 %	50 %	62184673
60	NC_004552	AT	3	6	35408	35413	50 %	50 %	0 %	0 %	62184673
61	NC_004552	GA	3	6	35889	35894	50 %	0 %	50 %	0 %	62184674
62	NC_004552	TA	3	6	37462	37467	50 %	50 %	0 %	0 %	62184674
63	NC_004552	TC	3	6	37700	37705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004552	AG	4	8	37904	37911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004552	GA	3	6	38437	38442	50 %	0 %	50 %	0 %	62184675
66	NC_004552	CG	3	6	38466	38471	0 %	0 %	50 %	50 %	62184675
67	NC_004552	TA	3	6	38472	38477	50 %	50 %	0 %	0 %	62184675
68	NC_004552	GC	3	6	39804	39809	0 %	0 %	50 %	50 %	62184677
69	NC_004552	AG	3	6	39815	39820	50 %	0 %	50 %	0 %	62184677
70	NC_004552	GC	3	6	40310	40315	0 %	0 %	50 %	50 %	62184678
71	NC_004552	GC	3	6	41364	41369	0 %	0 %	50 %	50 %	62184678
72	NC_004552	AT	3	6	41696	41701	50 %	50 %	0 %	0 %	62184678
73	NC_004552	GA	3	6	41987	41992	50 %	0 %	50 %	0 %	62184678
74	NC_004552	CA	3	6	44031	44036	50 %	0 %	0 %	50 %	62184682
75	NC_004552	CA	3	6	44242	44247	50 %	0 %	0 %	50 %	62184683
76	NC_004552	TC	3	6	44582	44587	0 %	50 %	0 %	50 %	62184683
77	NC_004552	AC	3	6	44907	44912	50 %	0 %	0 %	50 %	62184683
78	NC_004552	GA	3	6	45512	45517	50 %	0 %	50 %	0 %	62184684
79	NC_004552	AG	3	6	45574	45579	50 %	0 %	50 %	0 %	62184684
80	NC_004552	TC	3	6	46442	46447	0 %	50 %	0 %	50 %	62184685
81	NC_004552	AG	3	6	46670	46675	50 %	0 %	50 %	0 %	62184685
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84	NC_004552	TA	3	6	48167	48172	50 %	50 %	0 %	0 %	62184687
85	NC_004552	AT	3	6	48181	48186	50 %	50 %	0 %	0 %	62184687
86	NC_004552	AT	3	6	48433	48438	50 %	50 %	0 %	0 %	62184687
87	NC_004552	AG	3	6	49321	49326	50 %	0 %	50 %	0 %	62184687
88	NC_004552	CT	3	6	49819	49824	0 %	50 %	0 %	50 %	62184688
89	NC_004552	TC	3	6	50298	50303	0 %	50 %	0 %	50 %	62184688
90	NC_004552	TA	3	6	52133	52138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004552	GT	3	6	53023	53028	0 %	50 %	50 %	0 %	62184689
92	NC_004552	AT	3	6	53210	53215	50 %	50 %	0 %	0 %	62184689
93	NC_004552	CA	4	8	54247	54254	50 %	0 %	0 %	50 %	62184690
94	NC_004552	AG	3	6	55353	55358	50 %	0 %	50 %	0 %	62184692
95	NC_004552	GC	3	6	55905	55910	0 %	0 %	50 %	50 %	62184692
96	NC_004552	AG	4	8	55967	55974	50 %	0 %	50 %	0 %	62184692
97	NC_004552	GA	3	6	57000	57005	50 %	0 %	50 %	0 %	62184694
98	NC_004552	AG	3	6	58440	58445	50 %	0 %	50 %	0 %	62184695
99	NC_004552	GA	3	6	59209	59214	50 %	0 %	50 %	0 %	62184695
100	NC_004552	GT	4	8	59773	59780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004552	AG	3	6	60187	60192	50 %	0 %	50 %	0 %	62184696
102	NC_004552	AG	3	6	62020	62025	50 %	0 %	50 %	0 %	62184696
103	NC_004552	TC	3	6	62472	62477	0 %	50 %	0 %	50 %	62184696
104	NC_004552	TG	3	6	63188	63193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004552	TC	3	6	64670	64675	0 %	50 %	0 %	50 %	62184698
106	NC_004552	TG	3	6	65435	65440	0 %	50 %	50 %	0 %	62184698
107	NC_004552	CA	4	8	65722	65729	50 %	0 %	0 %	50 %	62184698
108	NC_004552	GA	4	8	66461	66468	50 %	0 %	50 %	0 %	62184699
109	NC_004552	AT	3	6	67240	67245	50 %	50 %	0 %	0 %	62184700
110	NC_004552	GA	4	8	67347	67354	50 %	0 %	50 %	0 %	62184700
111	NC_004552	CT	3	6	67425	67430	0 %	50 %	0 %	50 %	62184700
112	NC_004552	AG	3	6	67460	67465	50 %	0 %	50 %	0 %	62184700
113	NC_004552	GT	3	6	68053	68058	0 %	50 %	50 %	0 %	62184701
114	NC_004552	AT	3	6	68493	68498	50 %	50 %	0 %	0 %	62184701
115	NC_004552	TA	3	6	69197	69202	50 %	50 %	0 %	0 %	62184701
116	NC_004552	AG	3	6	70120	70125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004552	GA	3	6	71700	71705	50 %	0 %	50 %	0 %	62184704
118	NC_004552	CT	3	6	72584	72589	0 %	50 %	0 %	50 %	62184705
119	NC_004552	GT	3	6	73586	73591	0 %	50 %	50 %	0 %	62184706
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122	NC_004552	TC	3	6	75921	75926	0 %	50 %	0 %	50 %	62184708
123	NC_004552	GC	3	6	76153	76158	0 %	0 %	50 %	50 %	62184709
124	NC_004552	TC	3	6	76220	76225	0 %	50 %	0 %	50 %	62184709
125	NC_004552	CA	3	6	76458	76463	50 %	0 %	0 %	50 %	62184709
126	NC_004552	CT	3	6	76646	76651	0 %	50 %	0 %	50 %	62184709
127	NC_004552	CT	3	6	77370	77375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_004552	GA	3	6	78738	78743	50 %	0 %	50 %	0 %	62184710
129	NC_004552	AG	3	6	78938	78943	50 %	0 %	50 %	0 %	62184710
130	NC_004552	GT	3	6	79170	79175	0 %	50 %	50 %	0 %	62184710
131	NC_004552	AC	3	6	80053	80058	50 %	0 %	0 %	50 %	62184711
132	NC_004552	AG	3	6	81097	81102	50 %	0 %	50 %	0 %	62184712
133	NC_004552	CT	3	6	81277	81282	0 %	50 %	0 %	50 %	62184712
134	NC_004552	AC	3	6	81826	81831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_004552	AC	3	6	82201	82206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_004552	TC	3	6	83993	83998	0 %	50 %	0 %	50 %	62184714
137	NC_004552	AG	3	6	84909	84914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004552	CT	3	6	85981	85986	0 %	50 %	0 %	50 %	62184716
139	NC_004552	GA	3	6	86001	86006	50 %	0 %	50 %	0 %	62184716
140	NC_004552	AG	3	6	86050	86055	50 %	0 %	50 %	0 %	62184716
141	NC_004552	AG	3	6	86088	86093	50 %	0 %	50 %	0 %	62184716
142	NC_004552	CA	3	6	86394	86399	50 %	0 %	0 %	50 %	62184717
143	NC_004552	GA	3	6	87522	87527	50 %	0 %	50 %	0 %	62184718
144	NC_004552	AG	3	6	87750	87755	50 %	0 %	50 %	0 %	62184718
145	NC_004552	GA	3	6	88309	88314	50 %	0 %	50 %	0 %	62184719
146	NC_004552	AG	5	10	88350	88359	50 %	0 %	50 %	0 %	62184719
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