MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Pectobacterium atrosepticum SCRI1043 chromosome

Total Repeats: 62273

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004547	TTC	2	6	65	70	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118966
2	NC_004547	TCT	2	6	78	83	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118966
3	NC_004547	TGC	2	6	93	98	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118966
4	NC_004547	TAG	2	6	149	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118966
5	NC_004547	ACC	2	6	318	323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118966
6	NC_004547	TCA	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118967
7	NC_004547	TTG	2	6	647	652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118967
8	NC_004547	TAA	2	6	696	701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50118967
9	NC_004547	GTG	2	6	719	724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118967
10	NC_004547	TAG	2	6	725	730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118967
11	NC_004547	CTT	2	6	741	746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118967
12	NC_004547	ATG	2	6	800	805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118967
13	NC_004547	AGC	2	6	813	818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118967
14	NC_004547	ATG	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118967
15	NC_004547	AGC	2	6	1249	1254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118968
16	NC_004547	GTG	2	6	1383	1388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118968
17	NC_004547	GGA	2	6	1547	1552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50118968
18	NC_004547	ATG	2	6	1831	1836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118968
19	NC_004547	GAC	2	6	1841	1846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118968
20	NC_004547	TCG	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118968
21	NC_004547	GCT	2	6	2021	2026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118968
22	NC_004547	CTG	2	6	2088	2093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118968
23	NC_004547	TAA	2	6	2169	2174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50118968
24	NC_004547	TGC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118969
25	NC_004547	GCG	2	6	2192	2197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118969
26	NC_004547	ATG	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118969
27	NC_004547	GCT	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118969
28	NC_004547	CAC	2	6	2336	2341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118969
29	NC_004547	CAC	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118969
30	NC_004547	CAA	2	6	2423	2428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50118969
31	NC_004547	CAC	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118969
32	NC_004547	ATG	2	6	2550	2555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118969
33	NC_004547	CGG	2	6	2562	2567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118969
34	NC_004547	TTG	2	6	2693	2698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118969
35	NC_004547	CAG	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
36	NC_004547	CGA	2	6	2781	2786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
37	NC_004547	TCG	2	6	2853	2858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118969
38	NC_004547	CGC	2	6	2869	2874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118969
39	NC_004547	CTT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118969
40	NC_004547	GCG	2	6	3066	3071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118969
41	NC_004547	TGT	2	6	3150	3155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118969
42	NC_004547	CAG	2	6	3164	3169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
43	NC_004547	TCA	2	6	3187	3192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118969
44	NC_004547	GCC	2	6	3232	3237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118969
45	NC_004547	GAA	2	6	3244	3249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118969
46	NC_004547	GTT	2	6	3344	3349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118969
47	NC_004547	AGC	2	6	3418	3423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
48	NC_004547	GTG	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118969
49	NC_004547	GCT	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118969
50	NC_004547	AGA	2	6	3541	3546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118969
51	NC_004547	GCG	2	6	3556	3561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118969
52	NC_004547	GAC	2	6	3575	3580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
53	NC_004547	CAG	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
54	NC_004547	CAG	2	6	3614	3619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
55	NC_004547	ATC	2	6	3642	3647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118969
56	NC_004547	CCA	2	6	3909	3914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118970
57	NC_004547	TTC	2	6	3998	4003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118970
58	NC_004547	GCA	2	6	4053	4058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
59	NC_004547	GCG	2	6	4076	4081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118970
60	NC_004547	TTG	2	6	4177	4182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118970
61	NC_004547	CTG	2	6	4198	4203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118970
62	NC_004547	CAG	2	6	4213	4218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
63	NC_004547	CAG	2	6	4249	4254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
64	NC_004547	AAT	2	6	4318	4323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50118970
65	NC_004547	GCA	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
66	NC_004547	AGC	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
67	NC_004547	CAG	2	6	4702	4707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
68	NC_004547	CGT	2	6	4748	4753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118970
69	NC_004547	CAG	2	6	4768	4773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
70	NC_004547	TCA	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118970
71	NC_004547	TGG	2	6	5008	5013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118970
72	NC_004547	CAG	2	6	5017	5022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
73	NC_004547	CAG	2	6	5050	5055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
74	NC_004547	GGC	2	6	5670	5675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118971
75	NC_004547	GGT	2	6	5682	5687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118971
76	NC_004547	GTT	2	6	5815	5820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118971
77	NC_004547	CGG	2	6	5952	5957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118971
78	NC_004547	CTT	2	6	5961	5966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118971
79	NC_004547	TCA	2	6	5981	5986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118971
80	NC_004547	CGC	2	6	6030	6035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118971
81	NC_004547	CTT	2	6	6243	6248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118971
82	NC_004547	GTG	2	6	6289	6294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118971
83	NC_004547	GGT	2	6	6375	6380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118971
84	NC_004547	CTG	2	6	6421	6426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118971
85	NC_004547	GAA	2	6	6429	6434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118971
86	NC_004547	TTC	2	6	6457	6462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118971
87	NC_004547	CTG	2	6	6463	6468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118971
88	NC_004547	GCC	2	6	6591	6596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118971
89	NC_004547	GAA	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118971
90	NC_004547	TGG	2	6	6830	6835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118971
91	NC_004547	CTG	2	6	6838	6843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118971
92	NC_004547	CGG	2	6	6891	6896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118971
93	NC_004547	TAT	3	9	6930	6938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50118971
94	NC_004547	GAC	2	6	6939	6944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118971
95	NC_004547	GCT	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118971
96	NC_004547	CGC	2	6	7031	7036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118971
97	NC_004547	CGG	2	6	7055	7060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118971
98	NC_004547	GCT	2	6	7098	7103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118971
99	NC_004547	GTG	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118971
100	NC_004547	GGA	2	6	7164	7169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50118971
101	NC_004547	CCG	2	6	7191	7196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118971
102	NC_004547	AGA	2	6	7272	7277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118971
103	NC_004547	ATG	2	6	7318	7323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118971
104	NC_004547	ATG	2	6	7405	7410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118971
105	NC_004547	CCG	2	6	7453	7458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118971
106	NC_004547	GCA	2	6	7733	7738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118972
107	NC_004547	TGG	2	6	7794	7799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118972
108	NC_004547	CAG	2	6	7950	7955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118972
109	NC_004547	CAG	2	6	7959	7964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118972
110	NC_004547	CCA	2	6	8147	8152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118972
111	NC_004547	CTT	2	6	8372	8377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118972
112	NC_004547	GCA	2	6	8437	8442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118972
113	NC_004547	GCG	2	6	8453	8458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118972
114	NC_004547	CAG	2	6	8484	8489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118972
115	NC_004547	TCC	2	6	8605	8610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50118972
116	NC_004547	GTC	2	6	8611	8616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118972
117	NC_004547	CGT	2	6	8636	8641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118972
118	NC_004547	ATC	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118972
119	NC_004547	CAT	3	9	8765	8773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118972
120	NC_004547	CAG	2	6	8967	8972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118972
121	NC_004547	GGT	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118973
122	NC_004547	CAT	3	9	9124	9132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118973
123	NC_004547	CGA	2	6	9324	9329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118973
124	NC_004547	TGC	2	6	9399	9404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118973
125	NC_004547	CAC	2	6	9530	9535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118973
126	NC_004547	CAT	2	6	9538	9543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118973
127	NC_004547	GGC	2	6	9548	9553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118973
128	NC_004547	GGT	3	9	9990	9998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118974
129	NC_004547	ACG	2	6	10068	10073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118974
130	NC_004547	TGA	2	6	10145	10150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118974
131	NC_004547	GCA	2	6	10530	10535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118975
132	NC_004547	TTC	2	6	10553	10558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118975
133	NC_004547	ACG	2	6	10626	10631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118975
134	NC_004547	GGT	2	6	10679	10684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118975
135	NC_004547	TGT	2	6	10688	10693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118975
136	NC_004547	GAT	2	6	10736	10741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118975
137	NC_004547	GAA	2	6	10839	10844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118975
138	NC_004547	CAT	2	6	10874	10879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118975
139	NC_004547	TGG	2	6	11051	11056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118976
140	NC_004547	CCA	2	6	11078	11083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118976
141	NC_004547	TGA	2	6	11084	11089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118976
142	NC_004547	GCA	2	6	11123	11128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118976
143	NC_004547	TCA	2	6	11199	11204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118976
144	NC_004547	CTG	2	6	11320	11325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118976
145	NC_004547	GCC	2	6	11351	11356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118976
146	NC_004547	TGG	2	6	11393	11398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118976
147	NC_004547	TCA	3	9	11432	11440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118976
148	NC_004547	ATG	2	6	11653	11658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118976
149	NC_004547	TGA	2	6	11828	11833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118976
150	NC_004547	GGC	2	6	11863	11868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118976
151	NC_004547	GTG	2	6	11893	11898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118976
152	NC_004547	AGC	2	6	12116	12121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118976
153	NC_004547	TGA	2	6	12176	12181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118976
154	NC_004547	AGA	2	6	12273	12278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118976
155	NC_004547	CAT	2	6	12288	12293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118976
156	NC_004547	CAT	2	6	12339	12344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118976
157	NC_004547	GTT	2	6	12554	12559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118977
158	NC_004547	TTC	2	6	12606	12611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118977
159	NC_004547	CTG	2	6	12695	12700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118977
160	NC_004547	TGG	2	6	12753	12758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118977
161	NC_004547	ATG	2	6	12857	12862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118977
162	NC_004547	GCG	2	6	12873	12878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118977
163	NC_004547	GTC	2	6	12960	12965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118977
164	NC_004547	TGC	2	6	13026	13031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118977
165	NC_004547	ATT	2	6	13121	13126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50118977
166	NC_004547	GCT	2	6	13144	13149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118977
167	NC_004547	ATT	2	6	13166	13171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50118977
168	NC_004547	CGG	2	6	13203	13208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118977
169	NC_004547	GGC	2	6	13250	13255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118977
170	NC_004547	CAA	2	6	13324	13329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50118977
171	NC_004547	TTA	2	6	13340	13345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50118977
172	NC_004547	TCT	2	6	13352	13357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118977
173	NC_004547	TAC	2	6	13358	13363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118977
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244	NC_004547	CAG	2	6	25287	25292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118985
245	NC_004547	GTG	2	6	25321	25326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118985
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248	NC_004547	TGC	2	6	25974	25979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118986
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250	NC_004547	GTT	2	6	26003	26008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118986
251	NC_004547	CGA	2	6	26035	26040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118986
252	NC_004547	GGA	2	6	26080	26085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50118986
253	NC_004547	AAC	2	6	26291	26296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50118986
254	NC_004547	AGG	2	6	26313	26318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50118986
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498	NC_004547	GCT	3	9	47328	47336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119000
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500	NC_004547	ATG	2	6	47465	47470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119000

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