MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae) chromosome

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004545	ATTTTT	2	12	2511	2522	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004545	TAAGTA	2	12	17322	17333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004545	TTTAAG	2	12	20185	20196	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004545	ATATAA	2	12	26562	26573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004545	TTTATT	2	12	46600	46611	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004545	TTAATT	2	12	52543	52554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004545	TTTTTA	2	12	62206	62217	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004545	TAAAAA	2	12	69807	69818	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004545	ATTTAT	2	12	73418	73429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004545	TAAATT	2	12	75106	75117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004545	TTTTTA	2	12	82003	82014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004545	ATTTTA	2	12	86116	86127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004545	AAATTT	2	12	89680	89691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004545	CTAATT	2	12	92202	92213	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_004545	TAAGAT	2	12	99788	99799	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004545	AATTAT	2	12	101070	101081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004545	ATTTTT	3	18	112639	112656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004545	TTAAAT	2	12	113602	113613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004545	TAAAAT	2	12	119342	119353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004545	ATATTT	2	12	137440	137451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004545	AAATAA	2	12	144114	144125	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004545	TTTTTA	2	12	156770	156781	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004545	CTTGTT	2	12	160645	160656	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_004545	TAAACA	2	12	160665	160676	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_004545	TAAATT	2	12	180204	180215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004545	ATGTCT	2	12	180782	180793	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_004545	GTAAAT	2	12	184708	184719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004545	TATTTT	2	12	184847	184858	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004545	TTTAAT	2	12	195335	195346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004545	TATGTA	2	12	209313	209324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004545	TTTTTA	2	12	213913	213924	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004545	GTATAT	2	12	217409	217420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004545	TTGTAT	2	12	218864	218875	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004545	ATATTT	2	12	244333	244344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004545	TTTTTA	2	12	245906	245917	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004545	TGAAAT	2	12	253486	253497	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004545	ATTTTA	2	12	254895	254906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004545	TTTTAA	2	12	254931	254942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004545	ATTATA	2	12	282489	282500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004545	TTTATA	2	12	286171	286182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004545	TCGTTT	2	12	286354	286365	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_004545	TTATTT	2	12	300302	300313	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004545	ATTTAA	2	12	301455	301466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004545	AAATAA	2	12	304731	304742	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004545	ATTAAT	2	12	307130	307141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004545	TGTATA	2	12	322049	322060	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004545	ATTAAT	2	12	322237	322248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004545	ATTTAT	2	12	329649	329660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004545	AAATAT	2	12	332179	332190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004545	AATATT	2	12	333830	333841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004545	TTTATA	2	12	349067	349078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004545	AAAAAT	2	12	350796	350807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004545	TTTAAA	2	12	352218	352229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004545	ACGTTA	2	12	356813	356824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_004545	TAAAAT	2	12	358531	358542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004545	ATATTA	2	12	361611	361622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004545	AATTAA	2	12	361630	361641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004545	TAAAAT	2	12	361878	361889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004545	AATATA	2	12	365856	365867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004545	AAATTA	2	12	369844	369855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004545	CATAAT	2	12	373524	373535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_004545	ACTATT	2	12	380955	380966	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_004545	ATTAAT	2	12	381835	381846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004545	AATATT	2	12	385887	385898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004545	AAATTT	2	12	387644	387655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004545	TAATTT	2	12	389155	389166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004545	TAAAAT	2	12	389694	389705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004545	TTTAAA	2	12	389734	389745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004545	GATATA	2	12	395368	395379	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004545	AGATAT	2	12	401406	401417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004545	TTAATT	2	12	411899	411910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004545	TAAAAA	2	12	426095	426106	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004545	TTAATT	2	12	426972	426983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004545	CAAATT	2	12	428954	428965	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_004545	ATTCAA	2	12	429410	429421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_004545	TTTTAA	2	12	431416	431427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004545	AAATTA	2	12	434763	434774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004545	ATATTT	2	12	436529	436540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004545	TCTAAA	2	12	437401	437412	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_004545	TTAATA	2	12	448773	448784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004545	TTAATT	2	12	460477	460488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004545	AAAACA	2	12	478855	478866	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_004545	CTTTTA	2	12	480278	480289	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_004545	AATATT	2	12	495551	495562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004545	TAAAAA	2	12	500859	500870	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004545	AAACAT	2	12	500882	500893	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_004545	AATTAA	2	12	506676	506687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004545	ATTTCA	2	12	508992	509003	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_004545	AGTTAT	2	12	511404	511415	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004545	TCAATT	2	12	515456	515467	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_004545	TTTATT	2	12	515479	515490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004545	TAATTT	2	12	524435	524446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004545	ATCATT	2	12	535189	535200	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_004545	AAAAAT	2	12	539193	539204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004545	TAATTA	2	12	542136	542147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004545	ATTATC	2	12	544715	544726	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_004545	ATTTTT	2	12	547072	547083	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004545	AATTAA	2	12	548253	548264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004545	AAATTA	2	12	552206	552217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004545	ATACTT	2	12	567538	567549	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_004545	ATAAAT	2	12	570212	570223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004545	TAAACT	2	12	572101	572112	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_004545	TAAAAA	2	12	581186	581197	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004545	TAAATA	2	12	583131	583142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004545	AAATTA	2	12	584301	584312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004545	CATTAA	2	12	585860	585871	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_004545	ATTTTT	2	12	586019	586030	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004545	TATTAA	2	12	593691	593702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004545	TTAAAT	2	12	595552	595563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004545	TTATTT	2	12	595655	595666	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004545	AAATTA	2	12	599360	599371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004545	ATTAAA	2	12	601307	601318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.