MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae) chromosome

Total Repeats: 320

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004545	TTTTAT	2	12	3435	3446	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904515
2	NC_004545	AAATTA	2	12	4099	4110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904517
3	NC_004545	GAAAAA	2	12	4191	4202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	27904517
4	NC_004545	AATTGT	2	12	5604	5615	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904519
5	NC_004545	TGCTTC	2	12	5616	5627	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	27904519
6	NC_004545	AAAACA	2	12	6234	6245	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	27904519
7	NC_004545	TTTAGA	2	12	9092	9103	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904522
8	NC_004545	AACTCC	2	12	11452	11463	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	27904523
9	NC_004545	AAGTAT	2	12	11793	11804	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904523
10	NC_004545	TCTTGA	2	12	12100	12111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	27904524
11	NC_004545	ATTTTA	2	12	12154	12165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904524
12	NC_004545	AAGTTA	2	12	12974	12985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904524
13	NC_004545	TTTAAT	2	12	15422	15433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904528
14	NC_004545	TAAAAG	2	12	15626	15637	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27904528
15	NC_004545	TAAATT	2	12	22529	22540	50 %	50 %	0 %	0 %	27904534
16	NC_004545	TTAACT	2	12	25598	25609	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904538
17	NC_004545	ATTTAA	2	12	25797	25808	50 %	50 %	0 %	0 %	27904538
18	NC_004545	GAATTA	2	12	27128	27139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904539
19	NC_004545	TTTTAA	2	12	27990	28001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904540
20	NC_004545	ATGTTA	2	12	31700	31711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904542
21	NC_004545	ATTTAG	2	12	32970	32981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904543
22	NC_004545	AAACAA	2	12	33431	33442	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	27904543
23	NC_004545	CTCTTC	2	12	41450	41461	0 %	50 %	0 %	50 %	27904546
24	NC_004545	TTTAAC	2	12	42803	42814	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904547
25	NC_004545	ACTTTA	2	12	43505	43516	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904547
26	NC_004545	TGAATA	2	12	44009	44020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904547
27	NC_004545	TAATAT	2	12	45546	45557	50 %	50 %	0 %	0 %	27904547
28	NC_004545	TATTAA	2	12	51512	51523	50 %	50 %	0 %	0 %	27904554
29	NC_004545	CTGATG	2	12	54905	54916	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	27904556
30	NC_004545	CTTTTT	2	12	55597	55608	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	27904557
31	NC_004545	ATAGTT	2	12	56964	56975	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904558
32	NC_004545	TTCTTT	2	12	57654	57665	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	27904559
33	NC_004545	GTTTAG	2	12	61345	61356	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27904561
34	NC_004545	AAATTA	2	12	63573	63584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904563
35	NC_004545	AAATAT	2	12	63615	63626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904563
36	NC_004545	AGATAT	2	12	65454	65465	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904565
37	NC_004545	TTAATA	2	12	66383	66394	50 %	50 %	0 %	0 %	27904566
38	NC_004545	TTTTTA	2	12	67377	67388	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904567
39	NC_004545	TAAAAT	2	12	72092	72103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904570
40	NC_004545	TTTAGA	2	12	74682	74693	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904571
41	NC_004545	AATAGA	2	12	75259	75270	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27904572
42	NC_004545	TAAAAA	2	12	77184	77195	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27904573
43	NC_004545	ATCATT	2	12	78658	78669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904575
44	NC_004545	TAAGAA	2	12	80978	80989	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27904578
45	NC_004545	TATAAT	2	12	81906	81917	50 %	50 %	0 %	0 %	27904578
46	NC_004545	TTTAAT	2	12	84983	84994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904583
47	NC_004545	TAGAAT	2	12	87290	87301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904586
48	NC_004545	ATTAAT	2	12	87769	87780	50 %	50 %	0 %	0 %	27904586
49	NC_004545	AGATTT	2	12	90896	90907	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904588
50	NC_004545	GATTGG	2	12	90915	90926	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	27904588
51	NC_004545	TTTTTC	2	12	91142	91153	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	27904588
52	NC_004545	TGTTAA	2	12	94572	94583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904590
53	NC_004545	GTTTTG	2	12	94698	94709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27904590
54	NC_004545	TAAATC	2	12	95928	95939	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	27904591
55	NC_004545	AATCTA	2	12	99301	99312	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	27904593
56	NC_004545	TAATTG	2	12	101573	101584	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904595
57	NC_004545	ATTAAA	2	12	103099	103110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904596
58	NC_004545	TCATTA	2	12	103134	103145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904596
59	NC_004545	ATCAAG	2	12	103286	103297	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	27904596
60	NC_004545	CATGGA	2	12	103366	103377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	27904596
61	NC_004545	TTAGTT	2	12	103503	103514	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27904596
62	NC_004545	GAAGTT	2	12	104545	104556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27904597
63	NC_004545	ATTTAA	2	12	106607	106618	50 %	50 %	0 %	0 %	27904599
64	NC_004545	TCTAAT	2	12	106882	106893	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904599
65	NC_004545	TAAAAA	2	12	112971	112982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27904606
66	NC_004545	AAAATA	2	12	117342	117353	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27904609
67	NC_004545	ATTTTT	2	12	117539	117550	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904609
68	NC_004545	TTGTTT	2	12	119615	119626	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	27904611
69	NC_004545	AATTTT	2	12	121667	121678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904613
70	NC_004545	GGTTTA	2	12	124083	124094	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27904616
71	NC_004545	TAGGTT	2	12	124366	124377	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27904616
72	NC_004545	TTTTTA	2	12	127851	127862	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904620
73	NC_004545	ATAGTT	2	12	132563	132574	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904622
74	NC_004545	TAAAGT	2	12	132969	132980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904623
75	NC_004545	ATAGCT	2	12	135250	135261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27904627
76	NC_004545	ATATTA	2	12	135566	135577	50 %	50 %	0 %	0 %	27904627
77	NC_004545	AAAAAC	2	12	136301	136312	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	27904627
78	NC_004545	TGCTAA	2	12	138864	138875	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27904629
79	NC_004545	GCTATA	2	12	138943	138954	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27904629
80	NC_004545	TTTTTA	2	12	139499	139510	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904629
81	NC_004545	TTTCTA	2	12	140198	140209	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27904629
82	NC_004545	TGTTTT	2	12	152603	152614	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	27904640
83	NC_004545	TTTTAA	2	12	152784	152795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904640
84	NC_004545	ATATTG	2	12	155179	155190	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904642
85	NC_004545	ATTTGT	2	12	157936	157947	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27904644
86	NC_004545	CTACTG	2	12	159387	159398	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	27904645
87	NC_004545	TCATTA	2	12	160367	160378	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904645
88	NC_004545	TTGTAT	2	12	161020	161031	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27904646
89	NC_004545	ATTTTG	2	12	163313	163324	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27904648
90	NC_004545	TTAAAT	2	12	163800	163811	50 %	50 %	0 %	0 %	27904649
91	NC_004545	CAATTC	2	12	165546	165557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27904650
92	NC_004545	TTTTAG	2	12	167777	167788	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27904651
93	NC_004545	AATATA	2	12	167889	167900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904651
94	NC_004545	TTTTCT	2	12	167937	167948	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	27904651
95	NC_004545	GTCATC	2	12	169071	169082	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	27904652
96	NC_004545	ACCTAG	2	12	169318	169329	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27904652
97	NC_004545	CATTAA	2	12	169371	169382	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	27904652
98	NC_004545	ATTTTA	2	12	171076	171087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904656
99	NC_004545	TTAATA	2	12	172233	172244	50 %	50 %	0 %	0 %	27904656
100	NC_004545	TAGTAT	2	12	173400	173411	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904657
101	NC_004545	CAGGAA	2	12	174027	174038	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	27904657
102	NC_004545	TTCTAT	2	12	176260	176271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27904659
103	NC_004545	ATATAG	2	12	177493	177504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904660
104	NC_004545	CAATGG	2	12	184184	184195	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	27904665
105	NC_004545	TATTAA	2	12	186233	186244	50 %	50 %	0 %	0 %	27904666
106	NC_004545	AAATAT	2	12	186865	186876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904667
107	NC_004545	TGCAAA	2	12	189350	189361	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	27904669
108	NC_004545	ATTTTT	2	12	189456	189467	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904669
109	NC_004545	CTTTTT	2	12	192681	192692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	27904671
110	NC_004545	ATAGTA	2	12	205142	205153	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904682
111	NC_004545	TCCAGA	2	12	205681	205692	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27904683
112	NC_004545	AATAGA	2	12	207614	207625	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27904684
113	NC_004545	TATATT	2	12	211609	211620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904687
114	NC_004545	TAAAAA	2	12	212968	212979	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27904687
115	NC_004545	TAAAAA	2	12	215209	215220	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27904688
116	NC_004545	TAGAAT	2	12	216345	216356	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904688
117	NC_004545	GGATCT	2	12	221352	221363	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	27904690
118	NC_004545	TACTGG	2	12	222249	222260	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	27904691
119	NC_004545	ATTTTT	3	18	225701	225718	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904694
120	NC_004545	AAATTT	2	12	225722	225733	50 %	50 %	0 %	0 %	27904694
121	NC_004545	TATTGT	2	12	226162	226173	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27904695
122	NC_004545	GCTCCT	2	12	226926	226937	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	27904695
123	NC_004545	ATTTTT	2	12	227663	227674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904696
124	NC_004545	TACGTA	2	12	228072	228083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27904696
125	NC_004545	CCTATA	2	12	228323	228334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27904696
126	NC_004545	AATTGT	2	12	229121	229132	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904697
127	NC_004545	TAACAT	2	12	231394	231405	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	27904699
128	NC_004545	TAATAT	2	12	232156	232167	50 %	50 %	0 %	0 %	27904699
129	NC_004545	TTGTAC	2	12	233635	233646	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	27904701
130	NC_004545	TAAATT	2	12	233779	233790	50 %	50 %	0 %	0 %	27904701
131	NC_004545	ATTTAA	2	12	236850	236861	50 %	50 %	0 %	0 %	27904703
132	NC_004545	TATCTC	2	12	237633	237644	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	27904704
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134	NC_004545	TATCAT	2	12	238988	238999	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904705
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136	NC_004545	TCAATG	2	12	243262	243273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27904709
137	NC_004545	CATTTT	2	12	244170	244181	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27904709
138	NC_004545	TCTGTT	2	12	244800	244811	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	27904710
139	NC_004545	TATTTA	2	12	249568	249579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904714
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142	NC_004545	ATTATA	2	12	256590	256601	50 %	50 %	0 %	0 %	27904720
143	NC_004545	AATTCC	2	12	259640	259651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27904721
144	NC_004545	TAATTT	2	12	261735	261746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904722
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149	NC_004545	TCAATT	2	12	270610	270621	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904727
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154	NC_004545	TACTGA	2	12	292995	293006	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27904750
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.