MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 6198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004463	GGTGG	2	10	3651	3660	0 %	20 %	80 %	0 %	27375114
2	NC_004463	CGCGG	2	10	6270	6279	0 %	0 %	60 %	40 %	27375118
3	NC_004463	GCCGC	2	10	7350	7359	0 %	0 %	40 %	60 %	27375118
4	NC_004463	CATCG	2	10	9156	9165	20 %	20 %	20 %	40 %	27375120
5	NC_004463	GACGG	2	10	10923	10932	20 %	0 %	60 %	20 %	27375122
6	NC_004463	GCTGG	2	10	11219	11228	0 %	20 %	60 %	20 %	27375122
7	NC_004463	GATCG	2	10	11611	11620	20 %	20 %	40 %	20 %	27375123
8	NC_004463	CCTTG	2	10	15145	15154	0 %	40 %	20 %	40 %	27375129
9	NC_004463	AGCGC	2	10	17504	17513	20 %	0 %	40 %	40 %	27375131
10	NC_004463	GGGCG	2	10	19499	19508	0 %	0 %	80 %	20 %	27375132
11	NC_004463	TCGCC	2	10	19537	19546	0 %	20 %	20 %	60 %	27375132
12	NC_004463	AGCGC	2	10	19905	19914	20 %	0 %	40 %	40 %	27375132
13	NC_004463	AGTCG	2	10	21707	21716	20 %	20 %	40 %	20 %	27375133
14	NC_004463	ACGCA	2	10	22309	22318	40 %	0 %	20 %	40 %	27375134
15	NC_004463	CCGCA	2	10	22401	22410	20 %	0 %	20 %	60 %	27375134
16	NC_004463	CAACC	2	10	23749	23758	40 %	0 %	0 %	60 %	27375135
17	NC_004463	GCTGG	2	10	25278	25287	0 %	20 %	60 %	20 %	27375136
18	NC_004463	TAAGA	2	10	26612	26621	60 %	20 %	20 %	0 %	27375137
19	NC_004463	CGGCT	2	10	26667	26676	0 %	20 %	40 %	40 %	27375137
20	NC_004463	GCGAC	2	10	29111	29120	20 %	0 %	40 %	40 %	27375139
21	NC_004463	GCGCG	2	10	36339	36348	0 %	0 %	60 %	40 %	27375152
22	NC_004463	GTCTT	2	10	38485	38494	0 %	60 %	20 %	20 %	27375154
23	NC_004463	GGCCG	2	10	41032	41041	0 %	0 %	60 %	40 %	27375155
24	NC_004463	ATTCC	2	10	45373	45382	20 %	40 %	0 %	40 %	27375162
25	NC_004463	GCGAC	2	10	45866	45875	20 %	0 %	40 %	40 %	27375162
26	NC_004463	GGCGC	2	10	48275	48284	0 %	0 %	60 %	40 %	27375167
27	NC_004463	TCGTC	2	10	48461	48470	0 %	40 %	20 %	40 %	27375167
28	NC_004463	TCGGC	2	10	49898	49907	0 %	20 %	40 %	40 %	27375169
29	NC_004463	ATCGC	2	10	50996	51005	20 %	20 %	20 %	40 %	27375171
30	NC_004463	GCCGA	2	10	52400	52409	20 %	0 %	40 %	40 %	27375173
31	NC_004463	GCATC	2	10	53119	53128	20 %	20 %	20 %	40 %	27375174
32	NC_004463	GGCGT	2	10	53486	53495	0 %	20 %	60 %	20 %	27375174
33	NC_004463	GATTT	2	10	53592	53601	20 %	60 %	20 %	0 %	27375174
34	NC_004463	CGATC	2	10	55607	55616	20 %	20 %	20 %	40 %	27375176
35	NC_004463	GCTCG	2	10	58431	58440	0 %	20 %	40 %	40 %	27375177
36	NC_004463	TCGGT	2	10	61812	61821	0 %	40 %	40 %	20 %	27375180
37	NC_004463	CGATC	2	10	64862	64871	20 %	20 %	20 %	40 %	27375185
38	NC_004463	CGAAG	2	10	65243	65252	40 %	0 %	40 %	20 %	27375185
39	NC_004463	GACCG	2	10	68128	68137	20 %	0 %	40 %	40 %	27375187
40	NC_004463	TTTTC	2	10	70994	71003	0 %	80 %	0 %	20 %	27375190
41	NC_004463	GATCG	2	10	73108	73117	20 %	20 %	40 %	20 %	27375191
42	NC_004463	GCCGG	2	10	76944	76953	0 %	0 %	60 %	40 %	27375194
43	NC_004463	CGCGG	2	10	79759	79768	0 %	0 %	60 %	40 %	27375196
44	NC_004463	CGCAT	2	10	80616	80625	20 %	20 %	20 %	40 %	27375198
45	NC_004463	GCCGA	2	10	81264	81273	20 %	0 %	40 %	40 %	27375199
46	NC_004463	TGGCC	2	10	81637	81646	0 %	20 %	40 %	40 %	27375199
47	NC_004463	TTTCC	2	10	82143	82152	0 %	60 %	0 %	40 %	27375200
48	NC_004463	CGCCA	2	10	83409	83418	20 %	0 %	20 %	60 %	27375201
49	NC_004463	CGGCT	2	10	88117	88126	0 %	20 %	40 %	40 %	27375206
50	NC_004463	CAACT	2	10	89530	89539	40 %	20 %	0 %	40 %	27375206
51	NC_004463	CGCGC	2	10	90013	90022	0 %	0 %	40 %	60 %	27375207
52	NC_004463	GCGGG	2	10	91246	91255	0 %	0 %	80 %	20 %	27375207
53	NC_004463	CGTCC	2	10	92297	92306	0 %	20 %	20 %	60 %	27375208
54	NC_004463	GTCCG	2	10	95261	95270	0 %	20 %	40 %	40 %	27375210
55	NC_004463	TCGCC	2	10	97534	97543	0 %	20 %	20 %	60 %	27375212
56	NC_004463	ACGCG	2	10	99039	99048	20 %	0 %	40 %	40 %	27375213
57	NC_004463	GCACC	2	10	107490	107499	20 %	0 %	20 %	60 %	27375220
58	NC_004463	GCGCT	2	10	108211	108220	0 %	20 %	40 %	40 %	27375221
59	NC_004463	GCCGC	2	10	110158	110167	0 %	0 %	40 %	60 %	27375223
60	NC_004463	GGCGA	2	10	111186	111195	20 %	0 %	60 %	20 %	27375224
61	NC_004463	CCCAG	2	10	111232	111241	20 %	0 %	20 %	60 %	27375224
62	NC_004463	GCGCC	2	10	111796	111805	0 %	0 %	40 %	60 %	27375224
63	NC_004463	GCACG	2	10	113902	113911	20 %	0 %	40 %	40 %	27375226
64	NC_004463	GCCCC	2	10	116365	116374	0 %	0 %	20 %	80 %	27375228
65	NC_004463	GCCGC	2	10	116947	116956	0 %	0 %	40 %	60 %	27375229
66	NC_004463	AGGAA	2	10	119414	119423	60 %	0 %	40 %	0 %	27375233
67	NC_004463	GGCCG	2	10	120633	120642	0 %	0 %	60 %	40 %	27375235
68	NC_004463	GGCTC	2	10	121818	121827	0 %	20 %	40 %	40 %	27375236
69	NC_004463	TGCGC	2	10	122438	122447	0 %	20 %	40 %	40 %	27375237
70	NC_004463	CACCG	2	10	123860	123869	20 %	0 %	20 %	60 %	27375239
71	NC_004463	CATCG	2	10	124178	124187	20 %	20 %	20 %	40 %	27375239
72	NC_004463	ACCCG	2	10	124365	124374	20 %	0 %	20 %	60 %	27375240
73	NC_004463	GCCGG	2	10	125200	125209	0 %	0 %	60 %	40 %	27375241
74	NC_004463	TCGGC	2	10	125873	125882	0 %	20 %	40 %	40 %	27375242
75	NC_004463	CGGCG	2	10	126426	126435	0 %	0 %	60 %	40 %	27375242
76	NC_004463	GCGTC	2	10	127325	127334	0 %	20 %	40 %	40 %	27375243
77	NC_004463	CAGCG	2	10	127690	127699	20 %	0 %	40 %	40 %	27375243
78	NC_004463	CGCTT	2	10	128973	128982	0 %	40 %	20 %	40 %	27375244
79	NC_004463	TGCTC	2	10	129352	129361	0 %	40 %	20 %	40 %	27375245
80	NC_004463	CGCGA	2	10	130157	130166	20 %	0 %	40 %	40 %	27375245
81	NC_004463	TCGCC	2	10	132771	132780	0 %	20 %	20 %	60 %	27375249
82	NC_004463	CTGGC	2	10	133439	133448	0 %	20 %	40 %	40 %	27375249
83	NC_004463	TTCGG	2	10	133457	133466	0 %	40 %	40 %	20 %	27375249
84	NC_004463	GGCGC	2	10	133506	133515	0 %	0 %	60 %	40 %	27375249
85	NC_004463	CGATC	2	10	133586	133595	20 %	20 %	20 %	40 %	27375250
86	NC_004463	CGACG	2	10	133840	133849	20 %	0 %	40 %	40 %	27375250
87	NC_004463	GCCCT	2	10	135756	135765	0 %	20 %	20 %	60 %	27375252
88	NC_004463	CACGG	2	10	137589	137598	20 %	0 %	40 %	40 %	27375252
89	NC_004463	ACGAA	2	10	138216	138225	60 %	0 %	20 %	20 %	27375253
90	NC_004463	TCGCC	2	10	138915	138924	0 %	20 %	20 %	60 %	27375254
91	NC_004463	ATCGA	2	10	140187	140196	40 %	20 %	20 %	20 %	27375255
92	NC_004463	TGGCC	2	10	140521	140530	0 %	20 %	40 %	40 %	27375255
93	NC_004463	GGATC	2	10	141276	141285	20 %	20 %	40 %	20 %	27375256
94	NC_004463	CGGCA	2	10	143385	143394	20 %	0 %	40 %	40 %	27375257
95	NC_004463	AGCGT	2	10	143733	143742	20 %	20 %	40 %	20 %	27375257
96	NC_004463	CAGCG	2	10	148908	148917	20 %	0 %	40 %	40 %	27375262
97	NC_004463	GCTTG	2	10	151915	151924	0 %	40 %	40 %	20 %	27375266
98	NC_004463	CTTCG	2	10	152810	152819	0 %	40 %	20 %	40 %	27375267
99	NC_004463	GCGCG	2	10	152829	152838	0 %	0 %	60 %	40 %	27375267
100	NC_004463	CAGCG	2	10	154417	154426	20 %	0 %	40 %	40 %	27375270
101	NC_004463	GCCGC	2	10	157154	157163	0 %	0 %	40 %	60 %	27375270
102	NC_004463	CAAAA	2	10	158289	158298	80 %	0 %	0 %	20 %	27375271
103	NC_004463	CTTGC	2	10	159283	159292	0 %	40 %	20 %	40 %	27375272
104	NC_004463	TGCGT	2	10	161675	161684	0 %	40 %	40 %	20 %	27375276
105	NC_004463	CGCCC	2	10	161829	161838	0 %	0 %	20 %	80 %	27375276
106	NC_004463	TTCCG	2	10	161904	161913	0 %	40 %	20 %	40 %	27375276
107	NC_004463	TCGCC	2	10	162091	162100	0 %	20 %	20 %	60 %	27375276
108	NC_004463	GGCGA	2	10	162200	162209	20 %	0 %	60 %	20 %	27375276
109	NC_004463	ATGAA	2	10	162401	162410	60 %	20 %	20 %	0 %	27375277
110	NC_004463	GCGCC	2	10	163620	163629	0 %	0 %	40 %	60 %	27375277
111	NC_004463	CTTTT	2	10	164255	164264	0 %	80 %	0 %	20 %	27375278
112	NC_004463	CGCGG	2	10	164792	164801	0 %	0 %	60 %	40 %	27375279
113	NC_004463	GAACC	2	10	166867	166876	40 %	0 %	20 %	40 %	27375283
114	NC_004463	CCAGG	2	10	168901	168910	20 %	0 %	40 %	40 %	27375285
115	NC_004463	TCCGC	2	10	170005	170014	0 %	20 %	20 %	60 %	27375286
116	NC_004463	GTCGC	2	10	170940	170949	0 %	20 %	40 %	40 %	27375287
117	NC_004463	TGCGG	2	10	172512	172521	0 %	20 %	60 %	20 %	27375289
118	NC_004463	TCGCC	2	10	173485	173494	0 %	20 %	20 %	60 %	27375289
119	NC_004463	CTGGT	2	10	173772	173781	0 %	40 %	40 %	20 %	27375289
120	NC_004463	GCGCG	2	10	177147	177156	0 %	0 %	60 %	40 %	27375293
121	NC_004463	GTTCA	2	10	177429	177438	20 %	40 %	20 %	20 %	27375293
122	NC_004463	GCGCG	2	10	177685	177694	0 %	0 %	60 %	40 %	27375293
123	NC_004463	TGGGC	2	10	179753	179762	0 %	20 %	60 %	20 %	27375295
124	NC_004463	GGCTT	2	10	180661	180670	0 %	40 %	40 %	20 %	27375297
125	NC_004463	CCGCG	2	10	181424	181433	0 %	0 %	40 %	60 %	27375297
126	NC_004463	ACGGT	2	10	183018	183027	20 %	20 %	40 %	20 %	27375298
127	NC_004463	CGGCG	2	10	183393	183402	0 %	0 %	60 %	40 %	27375299
128	NC_004463	GTCGT	2	10	188193	188202	0 %	40 %	40 %	20 %	27375303
129	NC_004463	GCCGA	2	10	190648	190657	20 %	0 %	40 %	40 %	27375306
130	NC_004463	CCAGA	2	10	190698	190707	40 %	0 %	20 %	40 %	27375306
131	NC_004463	CATCG	2	10	190875	190884	20 %	20 %	20 %	40 %	27375306
132	NC_004463	GCGCC	2	10	192438	192447	0 %	0 %	40 %	60 %	27375308
133	NC_004463	CGGCG	2	10	192754	192763	0 %	0 %	60 %	40 %	27375308
134	NC_004463	GCGCG	2	10	193098	193107	0 %	0 %	60 %	40 %	27375309
135	NC_004463	GGCGG	2	10	195408	195417	0 %	0 %	80 %	20 %	27375310
136	NC_004463	CCGGC	2	10	200742	200751	0 %	0 %	40 %	60 %	27375315
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