MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 23131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004463	TTAA	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004463	GCCC	2	8	840	847	0 %	0 %	25 %	75 %	27375113
3	NC_004463	GAAT	2	8	882	889	50 %	25 %	25 %	0 %	27375113
4	NC_004463	TGCA	2	8	1067	1074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_004463	GGCA	2	8	1222	1229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_004463	GCCT	2	8	1384	1391	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_004463	CGAA	2	8	1448	1455	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_004463	CTCC	2	8	1639	1646	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_004463	CTCC	2	8	1931	1938	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_004463	CGTT	2	8	2056	2063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_004463	CGTC	2	8	2548	2555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004463	CGAC	2	8	2776	2783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_004463	GCTG	2	8	2975	2982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_004463	GGGC	2	8	3462	3469	0 %	0 %	75 %	25 %	27375114
15	NC_004463	GATC	2	8	3681	3688	25 %	25 %	25 %	25 %	27375114
16	NC_004463	TGGC	2	8	3918	3925	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_004463	GATC	2	8	6030	6037	25 %	25 %	25 %	25 %	27375117
18	NC_004463	CGGC	2	8	6227	6234	0 %	0 %	50 %	50 %	27375118
19	NC_004463	CGAG	2	8	6640	6647	25 %	0 %	50 %	25 %	27375118
20	NC_004463	TCCG	2	8	6822	6829	0 %	25 %	25 %	50 %	27375118
21	NC_004463	GGCG	2	8	7139	7146	0 %	0 %	75 %	25 %	27375118
22	NC_004463	CCGT	2	8	7390	7397	0 %	25 %	25 %	50 %	27375118
23	NC_004463	AAGC	2	8	7499	7506	50 %	0 %	25 %	25 %	27375118
24	NC_004463	CGAG	2	8	7541	7548	25 %	0 %	50 %	25 %	27375118
25	NC_004463	CGGT	2	8	7744	7751	0 %	25 %	50 %	25 %	27375118
26	NC_004463	CCCG	2	8	8074	8081	0 %	0 %	25 %	75 %	27375118
27	NC_004463	CTCA	2	8	8357	8364	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_004463	ATCG	2	8	8618	8625	25 %	25 %	25 %	25 %	27375119
29	NC_004463	CAAT	2	8	8934	8941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_004463	CAGC	2	8	10030	10037	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004463	ATTG	2	8	10388	10395	25 %	50 %	25 %	0 %	27375121
32	NC_004463	TCGC	2	8	10413	10420	0 %	25 %	25 %	50 %	27375121
33	NC_004463	ACTC	2	8	10612	10619	25 %	25 %	0 %	50 %	27375121
34	NC_004463	TAGG	2	8	10778	10785	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004463	GAGC	2	8	11177	11184	25 %	0 %	50 %	25 %	27375122
36	NC_004463	CGCT	2	8	11527	11534	0 %	25 %	25 %	50 %	27375123
37	NC_004463	GGCC	2	8	11878	11885	0 %	0 %	50 %	50 %	27375123
38	NC_004463	GAAC	2	8	12434	12441	50 %	0 %	25 %	25 %	27375124
39	NC_004463	ATCG	2	8	12516	12523	25 %	25 %	25 %	25 %	27375124
40	NC_004463	TCGT	2	8	12749	12756	0 %	50 %	25 %	25 %	27375124
41	NC_004463	CAAC	2	8	12873	12880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_004463	AGTC	2	8	12929	12936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_004463	TCGA	2	8	13217	13224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_004463	CTCC	2	8	13428	13435	0 %	25 %	0 %	75 %	27375125
45	NC_004463	CGCT	2	8	13670	13677	0 %	25 %	25 %	50 %	27375125
46	NC_004463	TACG	2	8	13847	13854	25 %	25 %	25 %	25 %	27375126
47	NC_004463	ACCG	2	8	14056	14063	25 %	0 %	25 %	50 %	27375126
48	NC_004463	CAGC	2	8	14432	14439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_004463	CACC	2	8	14487	14494	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_004463	GATT	2	8	17002	17009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004463	GACG	2	8	17213	17220	25 %	0 %	50 %	25 %	27375131
52	NC_004463	CCGG	2	8	17327	17334	0 %	0 %	50 %	50 %	27375131
53	NC_004463	CCGA	2	8	18151	18158	25 %	0 %	25 %	50 %	27375131
54	NC_004463	GGTC	2	8	18406	18413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_004463	CAAT	2	8	18488	18495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_004463	CCGT	2	8	18673	18680	0 %	25 %	25 %	50 %	27375132
57	NC_004463	GCCC	2	8	19061	19068	0 %	0 %	25 %	75 %	27375132
58	NC_004463	GATC	2	8	19756	19763	25 %	25 %	25 %	25 %	27375132
59	NC_004463	ATCG	2	8	20281	20288	25 %	25 %	25 %	25 %	27375132
60	NC_004463	GCTC	2	8	20326	20333	0 %	25 %	25 %	50 %	27375132
61	NC_004463	TTCT	2	8	20614	20621	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004463	GAAG	2	8	21301	21308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004463	GGCC	2	8	21993	22000	0 %	0 %	50 %	50 %	27375134
64	NC_004463	CAAG	2	8	22126	22133	50 %	0 %	25 %	25 %	27375134
65	NC_004463	GCCC	2	8	22227	22234	0 %	0 %	25 %	75 %	27375134
66	NC_004463	CGCA	2	8	22590	22597	25 %	0 %	25 %	50 %	27375134
67	NC_004463	GCTC	2	8	22805	22812	0 %	25 %	25 %	50 %	27375134
68	NC_004463	GCCG	2	8	22813	22820	0 %	0 %	50 %	50 %	27375134
69	NC_004463	ATCA	2	8	22860	22867	50 %	25 %	0 %	25 %	27375134
70	NC_004463	AGGC	2	8	23252	23259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_004463	ACGA	2	8	23378	23385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_004463	TCAA	2	8	23389	23396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_004463	GCAA	2	8	23859	23866	50 %	0 %	25 %	25 %	27375135
74	NC_004463	CGTC	2	8	24087	24094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_004463	CTAG	2	8	24510	24517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_004463	CGCC	2	8	25055	25062	0 %	0 %	25 %	75 %	27375136
77	NC_004463	TTGC	2	8	25459	25466	0 %	50 %	25 %	25 %	27375136
78	NC_004463	GGCG	2	8	25542	25549	0 %	0 %	75 %	25 %	27375136
79	NC_004463	CCAG	2	8	25676	25683	25 %	0 %	25 %	50 %	27375136
80	NC_004463	GCTT	2	8	25696	25703	0 %	50 %	25 %	25 %	27375136
81	NC_004463	ATTG	2	8	25811	25818	25 %	50 %	25 %	0 %	27375136
82	NC_004463	CGCC	2	8	26109	26116	0 %	0 %	25 %	75 %	27375136
83	NC_004463	CGAA	2	8	26199	26206	50 %	0 %	25 %	25 %	27375136
84	NC_004463	TCCG	2	8	26517	26524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_004463	GGAT	2	8	26746	26753	25 %	25 %	50 %	0 %	27375137
86	NC_004463	CGAC	2	8	26870	26877	25 %	0 %	25 %	50 %	27375137
87	NC_004463	CCGC	2	8	26899	26906	0 %	0 %	25 %	75 %	27375137
88	NC_004463	CGCC	2	8	29646	29653	0 %	0 %	25 %	75 %	27375140
89	NC_004463	GGGC	2	8	30141	30148	0 %	0 %	75 %	25 %	27375141
90	NC_004463	GCCG	2	8	31997	32004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_004463	ATTA	2	8	32193	32200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004463	TTCT	2	8	32371	32378	0 %	75 %	0 %	25 %	27375144
93	NC_004463	TGAC	2	8	32886	32893	25 %	25 %	25 %	25 %	27375145
94	NC_004463	TCGA	2	8	34117	34124	25 %	25 %	25 %	25 %	27375148
95	NC_004463	CGAT	2	8	34284	34291	25 %	25 %	25 %	25 %	27375148
96	NC_004463	GCCG	2	8	34932	34939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_004463	GAGT	2	8	34981	34988	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004463	GGCG	2	8	35027	35034	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_004463	AAGG	2	8	35357	35364	50 %	0 %	50 %	0 %	27375150
100	NC_004463	CGAG	2	8	35454	35461	25 %	0 %	50 %	25 %	27375150
101	NC_004463	GGCC	2	8	35601	35608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_004463	GGCT	2	8	35966	35973	0 %	25 %	50 %	25 %	27375151
103	NC_004463	ACGG	2	8	36178	36185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_004463	AGAT	2	8	36252	36259	50 %	25 %	25 %	0 %	27375152
105	NC_004463	CTCG	2	8	36368	36375	0 %	25 %	25 %	50 %	27375152
106	NC_004463	GCAT	2	8	36707	36714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_004463	TCGT	2	8	36788	36795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_004463	AGTC	2	8	36874	36881	25 %	25 %	25 %	25 %	27375153
109	NC_004463	TTGA	2	8	36923	36930	25 %	50 %	25 %	0 %	27375153
110	NC_004463	GAGG	2	8	37332	37339	25 %	0 %	75 %	0 %	27375154
111	NC_004463	TCGA	2	8	37464	37471	25 %	25 %	25 %	25 %	27375154
112	NC_004463	GGGC	2	8	37756	37763	0 %	0 %	75 %	25 %	27375154
113	NC_004463	GCCG	2	8	38045	38052	0 %	0 %	50 %	50 %	27375154
114	NC_004463	TCGC	2	8	38210	38217	0 %	25 %	25 %	50 %	27375154
115	NC_004463	CGTT	2	8	38329	38336	0 %	50 %	25 %	25 %	27375154
116	NC_004463	AGGC	2	8	39119	39126	25 %	0 %	50 %	25 %	27375154
117	NC_004463	TCAC	2	8	39325	39332	25 %	25 %	0 %	50 %	27375154
118	NC_004463	GCCG	2	8	39403	39410	0 %	0 %	50 %	50 %	27375155
119	NC_004463	TGCC	2	8	39514	39521	0 %	25 %	25 %	50 %	27375155
120	NC_004463	TCGA	2	8	39807	39814	25 %	25 %	25 %	25 %	27375155
121	NC_004463	CGAG	2	8	40366	40373	25 %	0 %	50 %	25 %	27375155
122	NC_004463	CCTT	2	8	40443	40450	0 %	50 %	0 %	50 %	27375155
123	NC_004463	CCCA	2	8	40548	40555	25 %	0 %	0 %	75 %	27375155
124	NC_004463	ACAA	2	8	41177	41184	75 %	0 %	0 %	25 %	27375155
125	NC_004463	ACCG	2	8	41188	41195	25 %	0 %	25 %	50 %	27375155
126	NC_004463	TCGG	2	8	41230	41237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_004463	CTCC	2	8	41758	41765	0 %	25 %	0 %	75 %	27375156
128	NC_004463	TCGC	2	8	42150	42157	0 %	25 %	25 %	50 %	27375156
129	NC_004463	TGCA	2	8	42441	42448	25 %	25 %	25 %	25 %	27375156
130	NC_004463	CGTC	2	8	42864	42871	0 %	25 %	25 %	50 %	27375158
131	NC_004463	AGGT	2	8	43331	43338	25 %	25 %	50 %	0 %	27375158
132	NC_004463	GCAC	2	8	43624	43631	25 %	0 %	25 %	50 %	27375159
133	NC_004463	GAGC	2	8	44396	44403	25 %	0 %	50 %	25 %	27375161
134	NC_004463	TGCG	2	8	44534	44541	0 %	25 %	50 %	25 %	27375161
135	NC_004463	GATC	2	8	45310	45317	25 %	25 %	25 %	25 %	27375162
136	NC_004463	CGAT	2	8	45333	45340	25 %	25 %	25 %	25 %	27375162
137	NC_004463	GCCG	2	8	45544	45551	0 %	0 %	50 %	50 %	27375162
138	NC_004463	AACG	2	8	45824	45831	50 %	0 %	25 %	25 %	27375162
139	NC_004463	GCTT	2	8	45838	45845	0 %	50 %	25 %	25 %	27375162
140	NC_004463	CGCT	2	8	45846	45853	0 %	25 %	25 %	50 %	27375162
141	NC_004463	ACGT	2	8	46244	46251	25 %	25 %	25 %	25 %	27375163
142	NC_004463	AACT	2	8	46305	46312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_004463	GTCT	2	8	47137	47144	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_004463	CCAA	2	8	48517	48524	50 %	0 %	0 %	50 %	27375167
145	NC_004463	CCCG	2	8	48636	48643	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_004463	CGGG	2	8	48651	48658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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149	NC_004463	CCCG	2	8	50386	50393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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263	NC_004463	GATA	2	8	98398	98405	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_004463	GCGT	2	8	101072	101079	0 %	25 %	50 %	25 %	27375215
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278	NC_004463	CGGC	2	8	102787	102794	0 %	0 %	50 %	50 %	27375216
279	NC_004463	GAAT	2	8	103114	103121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
280	NC_004463	AGTA	2	8	103565	103572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
281	NC_004463	GACC	2	8	104133	104140	25 %	0 %	25 %	50 %	27375217
282	NC_004463	CGTG	2	8	105041	105048	0 %	25 %	50 %	25 %	27375218
283	NC_004463	CCGG	2	8	105349	105356	0 %	0 %	50 %	50 %	27375218
284	NC_004463	TCGG	2	8	105510	105517	0 %	25 %	50 %	25 %	27375218
285	NC_004463	ATCT	2	8	105783	105790	25 %	50 %	0 %	25 %	27375218
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