MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 19684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004463	GCCC	2	8	840	847	0 %	0 %	25 %	75 %	27375113
2	NC_004463	GAAT	2	8	882	889	50 %	25 %	25 %	0 %	27375113
3	NC_004463	GGGC	2	8	3462	3469	0 %	0 %	75 %	25 %	27375114
4	NC_004463	GATC	2	8	3681	3688	25 %	25 %	25 %	25 %	27375114
5	NC_004463	GATC	2	8	6030	6037	25 %	25 %	25 %	25 %	27375117
6	NC_004463	CGGC	2	8	6227	6234	0 %	0 %	50 %	50 %	27375118
7	NC_004463	CGAG	2	8	6640	6647	25 %	0 %	50 %	25 %	27375118
8	NC_004463	TCCG	2	8	6822	6829	0 %	25 %	25 %	50 %	27375118
9	NC_004463	GGCG	2	8	7139	7146	0 %	0 %	75 %	25 %	27375118
10	NC_004463	CCGT	2	8	7390	7397	0 %	25 %	25 %	50 %	27375118
11	NC_004463	AAGC	2	8	7499	7506	50 %	0 %	25 %	25 %	27375118
12	NC_004463	CGAG	2	8	7541	7548	25 %	0 %	50 %	25 %	27375118
13	NC_004463	CGGT	2	8	7744	7751	0 %	25 %	50 %	25 %	27375118
14	NC_004463	CCCG	2	8	8074	8081	0 %	0 %	25 %	75 %	27375118
15	NC_004463	ATCG	2	8	8618	8625	25 %	25 %	25 %	25 %	27375119
16	NC_004463	ATTG	2	8	10388	10395	25 %	50 %	25 %	0 %	27375121
17	NC_004463	TCGC	2	8	10413	10420	0 %	25 %	25 %	50 %	27375121
18	NC_004463	ACTC	2	8	10612	10619	25 %	25 %	0 %	50 %	27375121
19	NC_004463	GAGC	2	8	11177	11184	25 %	0 %	50 %	25 %	27375122
20	NC_004463	CGCT	2	8	11527	11534	0 %	25 %	25 %	50 %	27375123
21	NC_004463	GGCC	2	8	11878	11885	0 %	0 %	50 %	50 %	27375123
22	NC_004463	GAAC	2	8	12434	12441	50 %	0 %	25 %	25 %	27375124
23	NC_004463	ATCG	2	8	12516	12523	25 %	25 %	25 %	25 %	27375124
24	NC_004463	TCGT	2	8	12749	12756	0 %	50 %	25 %	25 %	27375124
25	NC_004463	CTCC	2	8	13428	13435	0 %	25 %	0 %	75 %	27375125
26	NC_004463	CGCT	2	8	13670	13677	0 %	25 %	25 %	50 %	27375125
27	NC_004463	TACG	2	8	13847	13854	25 %	25 %	25 %	25 %	27375126
28	NC_004463	ACCG	2	8	14056	14063	25 %	0 %	25 %	50 %	27375126
29	NC_004463	GACG	2	8	17213	17220	25 %	0 %	50 %	25 %	27375131
30	NC_004463	CCGG	2	8	17327	17334	0 %	0 %	50 %	50 %	27375131
31	NC_004463	CCGA	2	8	18151	18158	25 %	0 %	25 %	50 %	27375131
32	NC_004463	CCGT	2	8	18673	18680	0 %	25 %	25 %	50 %	27375132
33	NC_004463	GCCC	2	8	19061	19068	0 %	0 %	25 %	75 %	27375132
34	NC_004463	GATC	2	8	19756	19763	25 %	25 %	25 %	25 %	27375132
35	NC_004463	ATCG	2	8	20281	20288	25 %	25 %	25 %	25 %	27375132
36	NC_004463	GCTC	2	8	20326	20333	0 %	25 %	25 %	50 %	27375132
37	NC_004463	GGCC	2	8	21993	22000	0 %	0 %	50 %	50 %	27375134
38	NC_004463	CAAG	2	8	22126	22133	50 %	0 %	25 %	25 %	27375134
39	NC_004463	GCCC	2	8	22227	22234	0 %	0 %	25 %	75 %	27375134
40	NC_004463	CGCA	2	8	22590	22597	25 %	0 %	25 %	50 %	27375134
41	NC_004463	GCTC	2	8	22805	22812	0 %	25 %	25 %	50 %	27375134
42	NC_004463	GCCG	2	8	22813	22820	0 %	0 %	50 %	50 %	27375134
43	NC_004463	ATCA	2	8	22860	22867	50 %	25 %	0 %	25 %	27375134
44	NC_004463	GCAA	2	8	23859	23866	50 %	0 %	25 %	25 %	27375135
45	NC_004463	CGCC	2	8	25055	25062	0 %	0 %	25 %	75 %	27375136
46	NC_004463	TTGC	2	8	25459	25466	0 %	50 %	25 %	25 %	27375136
47	NC_004463	GGCG	2	8	25542	25549	0 %	0 %	75 %	25 %	27375136
48	NC_004463	CCAG	2	8	25676	25683	25 %	0 %	25 %	50 %	27375136
49	NC_004463	GCTT	2	8	25696	25703	0 %	50 %	25 %	25 %	27375136
50	NC_004463	ATTG	2	8	25811	25818	25 %	50 %	25 %	0 %	27375136
51	NC_004463	CGCC	2	8	26109	26116	0 %	0 %	25 %	75 %	27375136
52	NC_004463	CGAA	2	8	26199	26206	50 %	0 %	25 %	25 %	27375136
53	NC_004463	GGAT	2	8	26746	26753	25 %	25 %	50 %	0 %	27375137
54	NC_004463	CGAC	2	8	26870	26877	25 %	0 %	25 %	50 %	27375137
55	NC_004463	CCGC	2	8	26899	26906	0 %	0 %	25 %	75 %	27375137
56	NC_004463	CGCC	2	8	29646	29653	0 %	0 %	25 %	75 %	27375140
57	NC_004463	GGGC	2	8	30141	30148	0 %	0 %	75 %	25 %	27375141
58	NC_004463	TTCT	2	8	32371	32378	0 %	75 %	0 %	25 %	27375144
59	NC_004463	TGAC	2	8	32886	32893	25 %	25 %	25 %	25 %	27375145
60	NC_004463	TCGA	2	8	34117	34124	25 %	25 %	25 %	25 %	27375148
61	NC_004463	CGAT	2	8	34284	34291	25 %	25 %	25 %	25 %	27375148
62	NC_004463	AAGG	2	8	35357	35364	50 %	0 %	50 %	0 %	27375150
63	NC_004463	CGAG	2	8	35454	35461	25 %	0 %	50 %	25 %	27375150
64	NC_004463	GGCT	2	8	35966	35973	0 %	25 %	50 %	25 %	27375151
65	NC_004463	AGAT	2	8	36252	36259	50 %	25 %	25 %	0 %	27375152
66	NC_004463	CTCG	2	8	36368	36375	0 %	25 %	25 %	50 %	27375152
67	NC_004463	AGTC	2	8	36874	36881	25 %	25 %	25 %	25 %	27375153
68	NC_004463	TTGA	2	8	36923	36930	25 %	50 %	25 %	0 %	27375153
69	NC_004463	GAGG	2	8	37332	37339	25 %	0 %	75 %	0 %	27375154
70	NC_004463	TCGA	2	8	37464	37471	25 %	25 %	25 %	25 %	27375154
71	NC_004463	GGGC	2	8	37756	37763	0 %	0 %	75 %	25 %	27375154
72	NC_004463	GCCG	2	8	38045	38052	0 %	0 %	50 %	50 %	27375154
73	NC_004463	TCGC	2	8	38210	38217	0 %	25 %	25 %	50 %	27375154
74	NC_004463	CGTT	2	8	38329	38336	0 %	50 %	25 %	25 %	27375154
75	NC_004463	AGGC	2	8	39119	39126	25 %	0 %	50 %	25 %	27375154
76	NC_004463	TCAC	2	8	39325	39332	25 %	25 %	0 %	50 %	27375154
77	NC_004463	GCCG	2	8	39403	39410	0 %	0 %	50 %	50 %	27375155
78	NC_004463	TGCC	2	8	39514	39521	0 %	25 %	25 %	50 %	27375155
79	NC_004463	TCGA	2	8	39807	39814	25 %	25 %	25 %	25 %	27375155
80	NC_004463	CGAG	2	8	40366	40373	25 %	0 %	50 %	25 %	27375155
81	NC_004463	CCTT	2	8	40443	40450	0 %	50 %	0 %	50 %	27375155
82	NC_004463	CCCA	2	8	40548	40555	25 %	0 %	0 %	75 %	27375155
83	NC_004463	ACAA	2	8	41177	41184	75 %	0 %	0 %	25 %	27375155
84	NC_004463	ACCG	2	8	41188	41195	25 %	0 %	25 %	50 %	27375155
85	NC_004463	CTCC	2	8	41758	41765	0 %	25 %	0 %	75 %	27375156
86	NC_004463	TCGC	2	8	42150	42157	0 %	25 %	25 %	50 %	27375156
87	NC_004463	TGCA	2	8	42441	42448	25 %	25 %	25 %	25 %	27375156
88	NC_004463	CGTC	2	8	42864	42871	0 %	25 %	25 %	50 %	27375158
89	NC_004463	AGGT	2	8	43331	43338	25 %	25 %	50 %	0 %	27375158
90	NC_004463	GCAC	2	8	43624	43631	25 %	0 %	25 %	50 %	27375159
91	NC_004463	GAGC	2	8	44396	44403	25 %	0 %	50 %	25 %	27375161
92	NC_004463	TGCG	2	8	44534	44541	0 %	25 %	50 %	25 %	27375161
93	NC_004463	GATC	2	8	45310	45317	25 %	25 %	25 %	25 %	27375162
94	NC_004463	CGAT	2	8	45333	45340	25 %	25 %	25 %	25 %	27375162
95	NC_004463	GCCG	2	8	45544	45551	0 %	0 %	50 %	50 %	27375162
96	NC_004463	AACG	2	8	45824	45831	50 %	0 %	25 %	25 %	27375162
97	NC_004463	GCTT	2	8	45838	45845	0 %	50 %	25 %	25 %	27375162
98	NC_004463	CGCT	2	8	45846	45853	0 %	25 %	25 %	50 %	27375162
99	NC_004463	ACGT	2	8	46244	46251	25 %	25 %	25 %	25 %	27375163
100	NC_004463	CCAA	2	8	48517	48524	50 %	0 %	0 %	50 %	27375167
101	NC_004463	CGGA	2	8	51253	51260	25 %	0 %	50 %	25 %	27375171
102	NC_004463	ATCG	2	8	51447	51454	25 %	25 %	25 %	25 %	27375171
103	NC_004463	CCGG	2	8	51483	51490	0 %	0 %	50 %	50 %	27375171
104	NC_004463	TTCA	2	8	52622	52629	25 %	50 %	0 %	25 %	27375173
105	NC_004463	GGTC	2	8	53878	53885	0 %	25 %	50 %	25 %	27375174
106	NC_004463	GCCA	2	8	54739	54746	25 %	0 %	25 %	50 %	27375175
107	NC_004463	TCGG	2	8	54794	54801	0 %	25 %	50 %	25 %	27375175
108	NC_004463	GCCG	2	8	55272	55279	0 %	0 %	50 %	50 %	27375175
109	NC_004463	GTTT	2	8	55445	55452	0 %	75 %	25 %	0 %	27375176
110	NC_004463	CGGT	2	8	55694	55701	0 %	25 %	50 %	25 %	27375176
111	NC_004463	GAGC	2	8	55757	55764	25 %	0 %	50 %	25 %	27375176
112	NC_004463	CGAC	2	8	56195	56202	25 %	0 %	25 %	50 %	27375176
113	NC_004463	CCGG	2	8	56399	56406	0 %	0 %	50 %	50 %	27375176
114	NC_004463	GCGA	2	8	57136	57143	25 %	0 %	50 %	25 %	27375176
115	NC_004463	GCCG	2	8	57242	57249	0 %	0 %	50 %	50 %	27375176
116	NC_004463	GACT	2	8	57394	57401	25 %	25 %	25 %	25 %	27375176
117	NC_004463	GCCG	2	8	58146	58153	0 %	0 %	50 %	50 %	27375177
118	NC_004463	AGCG	2	8	58474	58481	25 %	0 %	50 %	25 %	27375177
119	NC_004463	GCTC	2	8	58665	58672	0 %	25 %	25 %	50 %	27375177
120	NC_004463	AGCT	2	8	59952	59959	25 %	25 %	25 %	25 %	27375178
121	NC_004463	GCCG	2	8	62387	62394	0 %	0 %	50 %	50 %	27375181
122	NC_004463	GCAT	2	8	63390	63397	25 %	25 %	25 %	25 %	27375183
123	NC_004463	ACCG	2	8	63905	63912	25 %	0 %	25 %	50 %	27375183
124	NC_004463	GTTC	2	8	64141	64148	0 %	50 %	25 %	25 %	27375183
125	NC_004463	ATGC	2	8	64525	64532	25 %	25 %	25 %	25 %	27375184
126	NC_004463	AGCG	2	8	64648	64655	25 %	0 %	50 %	25 %	27375184
127	NC_004463	GATC	2	8	64937	64944	25 %	25 %	25 %	25 %	27375185
128	NC_004463	CAGC	2	8	65140	65147	25 %	0 %	25 %	50 %	27375185
129	NC_004463	GCCT	2	8	65198	65205	0 %	25 %	25 %	50 %	27375185
130	NC_004463	ATCG	2	8	65770	65777	25 %	25 %	25 %	25 %	27375185
131	NC_004463	CAAC	2	8	66187	66194	50 %	0 %	0 %	50 %	27375186
132	NC_004463	CCGT	2	8	66218	66225	0 %	25 %	25 %	50 %	27375186
133	NC_004463	GCTT	2	8	66468	66475	0 %	50 %	25 %	25 %	27375186
134	NC_004463	CGAT	2	8	67588	67595	25 %	25 %	25 %	25 %	27375187
135	NC_004463	ATCC	2	8	67752	67759	25 %	25 %	0 %	50 %	27375187
136	NC_004463	TGAG	2	8	67834	67841	25 %	25 %	50 %	0 %	27375187
137	NC_004463	AGGA	2	8	68470	68477	50 %	0 %	50 %	0 %	27375187
138	NC_004463	GGCT	2	8	68545	68552	0 %	25 %	50 %	25 %	27375187
139	NC_004463	GGAA	2	8	69362	69369	50 %	0 %	50 %	0 %	27375188
140	NC_004463	TGGA	2	8	69728	69735	25 %	25 %	50 %	0 %	27375188
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