MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 15669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004463	GCG	2	6	56	61	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004463	CTT	2	6	71	76	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004463	TCC	2	6	440	445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_004463	TGC	2	6	1049	1054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_004463	GGC	2	6	1089	1094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004463	GGA	2	6	1150	1155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004463	CGG	2	6	1170	1175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_004463	TTC	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004463	GGT	2	6	1372	1377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004463	GCT	3	9	1406	1414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_004463	ATG	2	6	1419	1424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004463	CGG	2	6	1428	1433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_004463	ATG	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004463	GTG	2	6	1672	1677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004463	CGT	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_004463	GCA	2	6	1943	1948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004463	GGC	2	6	1956	1961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_004463	CAG	2	6	2012	2017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_004463	ATC	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004463	GAC	2	6	2206	2211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004463	GCA	2	6	2425	2430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004463	GCG	2	6	2456	2461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_004463	CGA	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_004463	AGC	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004463	CGG	2	6	2760	2765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004463	GGC	2	6	2818	2823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_004463	TCG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004463	AGA	2	6	2931	2936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004463	CGG	2	6	3034	3039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_004463	CTT	2	6	3783	3788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_004463	TGC	2	6	3888	3893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_004463	ATG	2	6	3989	3994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004463	CGT	2	6	4018	4023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_004463	GCA	2	6	4085	4090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_004463	CGA	2	6	4207	4212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_004463	GCG	2	6	4222	4227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_004463	GCC	2	6	4783	4788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_004463	CAA	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_004463	GAG	2	6	4875	4880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004463	CGA	2	6	4919	4924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_004463	CCA	2	6	8212	8217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_004463	AGC	2	6	8306	8311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_004463	GCC	2	6	8749	8754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_004463	GCC	2	6	8859	8864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_004463	GAA	2	6	9965	9970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004463	ATC	2	6	10074	10079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004463	CGT	2	6	10156	10161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_004463	GTA	2	6	10210	10215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004463	TGT	2	6	10238	10243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004463	CAT	2	6	10273	10278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_004463	CGC	2	6	10279	10284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_004463	ACG	2	6	10325	10330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_004463	GCC	2	6	10333	10338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_004463	GAA	2	6	11983	11988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004463	GCG	2	6	12051	12056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_004463	TTC	2	6	12073	12078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_004463	TGG	2	6	12173	12178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004463	GGC	2	6	12275	12280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_004463	GAA	2	6	12960	12965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004463	GCA	2	6	12980	12985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_004463	GCG	2	6	13050	13055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_004463	CGG	2	6	13060	13065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_004463	GCA	2	6	13124	13129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004463	AGC	3	9	13151	13159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_004463	CGG	2	6	13189	13194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_004463	TCG	2	6	13312	13317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_004463	CTT	2	6	13404	13409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_004463	TCA	2	6	14603	14608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_004463	CGA	2	6	15876	15881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_004463	GTC	2	6	15886	15891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004463	AAC	2	6	15996	16001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004463	AGG	2	6	16050	16055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004463	TGT	2	6	16119	16124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004463	GAA	2	6	16653	16658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004463	AGC	2	6	16740	16745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_004463	GTC	2	6	16770	16775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_004463	CGT	2	6	16778	16783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_004463	GTA	2	6	16929	16934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004463	CGA	2	6	17053	17058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_004463	GCC	2	6	17082	17087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_004463	TGC	2	6	18372	18377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_004463	CAG	2	6	20525	20530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_004463	TAC	2	6	20550	20555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_004463	CTG	2	6	20582	20587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_004463	GGT	2	6	20634	20639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004463	GCC	2	6	20707	20712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_004463	GAT	2	6	20898	20903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004463	AGC	2	6	20991	20996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_004463	CGG	2	6	21073	21078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_004463	GCT	2	6	21174	21179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_004463	CGA	2	6	21188	21193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004463	TGG	2	6	21230	21235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004463	CCT	2	6	21331	21336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_004463	CGG	2	6	21370	21375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_004463	TAG	2	6	21870	21875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004463	CGT	2	6	21896	21901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_004463	GCT	2	6	23095	23100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_004463	GTT	2	6	23101	23106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004463	CCG	2	6	23121	23126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_004463	TGT	2	6	23162	23167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004463	TCG	2	6	23263	23268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_004463	GCG	2	6	23298	23303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_004463	GAG	2	6	23418	23423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004463	CAT	2	6	23500	23505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_004463	ACG	2	6	23561	23566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_004463	CAG	3	9	23574	23582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_004463	TGA	2	6	24048	24053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004463	CTT	2	6	24103	24108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_004463	CTC	2	6	24121	24126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_004463	CGC	2	6	24228	24233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_004463	AAC	2	6	24242	24247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_004463	TTC	2	6	24272	24277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_004463	GAC	2	6	24281	24286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_004463	AGG	2	6	24289	24294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004463	CCG	2	6	24403	24408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_004463	GCC	2	6	24443	24448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_004463	CAC	2	6	27416	27421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_004463	ATC	2	6	27457	27462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_004463	CCG	2	6	27547	27552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_004463	ATT	2	6	27576	27581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004463	TCC	2	6	27639	27644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_004463	CGT	2	6	28015	28020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_004463	TCA	2	6	28186	28191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_004463	CCG	2	6	28206	28211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_004463	GCA	2	6	28239	28244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_004463	CGG	2	6	28312	28317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_004463	CAA	2	6	28449	28454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_004463	TGC	2	6	29337	29342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_004463	TGA	2	6	29724	29729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004463	CTG	2	6	31750	31755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_004463	TTA	2	6	31948	31953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004463	CGA	2	6	32122	32127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_004463	CAA	2	6	32512	32517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_004463	CAA	2	6	32542	32547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_004463	ATG	2	6	32593	32598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004463	TCC	2	6	32661	32666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_004463	CTG	2	6	32771	32776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_004463	TGC	2	6	32791	32796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_004463	GTC	2	6	32800	32805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_004463	GAC	2	6	32821	32826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_004463	GGA	2	6	32839	32844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004463	GGA	2	6	32864	32869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004463	GAC	2	6	33689	33694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_004463	GTC	2	6	33743	33748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_004463	GCC	2	6	33750	33755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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409	NC_004463	CAC	2	6	181942	181947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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