MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 chromosome

Total Repeats: 1344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004461	GATATT	2	12	2686	2697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27466920
2	NC_004461	AAGTAG	2	12	3059	3070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27466920
3	NC_004461	TTTAAA	2	12	3406	3417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004461	GACACT	2	12	4478	4489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27466921
5	NC_004461	GTTATC	2	12	7208	7219	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	27466923
6	NC_004461	TCAAGC	2	12	8175	8186	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27466923
7	NC_004461	TGAAGA	2	12	8403	8414	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27466923
8	NC_004461	TTTGAA	2	12	12044	12055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27466925
9	NC_004461	TTGTAT	2	12	13511	13522	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27466926
10	NC_004461	TAGAAA	2	12	18705	18716	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27466931
11	NC_004461	ACTGAA	2	12	18782	18793	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	27466931
12	NC_004461	GGTGGC	2	12	20156	20167	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	27466931
13	NC_004461	TAAAGG	2	12	20298	20309	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27466932
14	NC_004461	AATTAG	2	12	21286	21297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27466933
15	NC_004461	TGCCTT	2	12	21539	21550	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	27466933
16	NC_004461	TGATTG	2	12	21838	21849	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27466933
17	NC_004461	TGAAAT	2	12	22169	22180	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27466933
18	NC_004461	GTATGT	2	12	22372	22383	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004461	AAGGTA	2	12	22607	22618	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27466934
20	NC_004461	AAGATA	2	12	25808	25819	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27466937
21	NC_004461	GAACGT	2	12	26737	26748	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	27466937
22	NC_004461	CACGTA	2	12	27281	27292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27466937
23	NC_004461	AAAGAA	2	12	32196	32207	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	27466941
24	NC_004461	AAAATT	2	12	32952	32963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004461	TATAAA	2	12	36184	36195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004461	ATGTGT	2	12	37098	37109	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27466946
27	NC_004461	TCACTT	2	12	37805	37816	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	27466948
28	NC_004461	ATAAAG	2	12	49533	49544	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27466959
29	NC_004461	ATTTTA	2	12	53218	53229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466963
30	NC_004461	TATAAA	2	12	53820	53831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004461	ATGTGT	2	12	54738	54749	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27466966
32	NC_004461	TGAGAA	2	12	57153	57164	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27466970
33	NC_004461	TATCAA	2	12	60861	60872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	27466975
34	NC_004461	TCATGA	2	12	64128	64139	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27466980
35	NC_004461	GTTTTT	2	12	67363	67374	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	27466982
36	NC_004461	CTATTT	2	12	68679	68690	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27466986
37	NC_004461	TTAAAC	2	12	70842	70853	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	27466989
38	NC_004461	TCATTT	2	12	72617	72628	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27466992
39	NC_004461	ATGAAA	2	12	74930	74941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27466993
40	NC_004461	GTTTTT	2	12	76068	76079	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	27466994
41	NC_004461	AAAAAT	2	12	78241	78252	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27466995
42	NC_004461	TCACAT	2	12	80452	80463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_004461	GTTTAA	2	12	80898	80909	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27466997
44	NC_004461	GTTTAA	2	12	89388	89399	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27467008
45	NC_004461	ATCATT	2	12	94289	94300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27467014
46	NC_004461	TTTATC	2	12	98310	98321	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27467020
47	NC_004461	AACTTG	2	12	98604	98615	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467020
48	NC_004461	AAAGGA	2	12	98728	98739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27467020
49	NC_004461	ATCTTT	2	12	102869	102880	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27467024
50	NC_004461	TTATTT	2	12	106716	106727	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004461	TTCCAT	2	12	108828	108839	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	27467030
52	NC_004461	AGATAT	2	12	109522	109533	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004461	GATTTT	2	12	112295	112306	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27467035
54	NC_004461	TAAAAA	2	12	112426	112437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27467035
55	NC_004461	GAGTAA	2	12	113360	113371	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27467036
56	NC_004461	ATTTGG	2	12	117725	117736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27467041
57	NC_004461	TGCTAA	2	12	119955	119966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_004461	TTAATT	2	12	120640	120651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27467044
59	NC_004461	ATAAAC	2	12	121598	121609	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	27467044
60	NC_004461	ATTAAA	2	12	122241	122252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27467044
61	NC_004461	CACCCC	2	12	122799	122810	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	27467045
62	NC_004461	TGATAA	2	12	123257	123268	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27467045
63	NC_004461	TTTGTA	2	12	125192	125203	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27467047
64	NC_004461	TTTTTC	2	12	126209	126220	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	27467048
65	NC_004461	TATTTT	2	12	126513	126524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27467048
66	NC_004461	GCCCAT	2	12	129037	129048	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	27467053
67	NC_004461	GAAAAA	2	12	130207	130218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	27467054
68	NC_004461	TTGTTC	2	12	133668	133679	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	27467058
69	NC_004461	TTTATT	2	12	139118	139129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004461	AGTGAT	2	12	139143	139154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004461	TAATTA	2	12	139377	139388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004461	AATTGT	2	12	141317	141328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004461	ATGCAA	2	12	143282	143293	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	27467070
74	NC_004461	TTATTG	2	12	143308	143319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27467070
75	NC_004461	ATACTT	2	12	144771	144782	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27467074
76	NC_004461	GTATTG	2	12	152366	152377	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27467082
77	NC_004461	GTTTGA	2	12	155152	155163	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27467084
78	NC_004461	TCATTT	2	12	158301	158312	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27467086
79	NC_004461	CATTTA	2	12	158581	158592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27467086
80	NC_004461	TTTTAA	2	12	160921	160932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27467088
81	NC_004461	TTAAAT	2	12	161307	161318	50 %	50 %	0 %	0 %	27467088
82	NC_004461	ACACAA	2	12	164407	164418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27467093
83	NC_004461	AGCACA	2	12	172202	172213	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	27467099
84	NC_004461	TTCTAC	2	12	173380	173391	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	27467101
85	NC_004461	CAGCCA	2	12	173651	173662	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	27467102
86	NC_004461	GAGATA	2	12	175778	175789	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27467103
87	NC_004461	GATAAA	2	12	182092	182103	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467111
88	NC_004461	GAACAT	2	12	182218	182229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	27467111
89	NC_004461	AATGTA	2	12	183064	183075	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004461	AACATC	2	12	183220	183231	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	27467112
91	NC_004461	GTTATG	2	12	183382	183393	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27467112
92	NC_004461	TTTAAA	2	12	184192	184203	50 %	50 %	0 %	0 %	27467113
93	NC_004461	CTTTAT	2	12	188299	188310	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27467114
94	NC_004461	TAGGAT	2	12	188316	188327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27467114
95	NC_004461	TATAGA	2	12	192277	192288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27467120
96	NC_004461	TAGCAT	2	12	197880	197891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467127
97	NC_004461	AGTGGA	2	12	198330	198341	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	27467128
98	NC_004461	TATGAT	2	12	199612	199623	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27467129
99	NC_004461	AGACAA	2	12	200120	200131	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	27467129
100	NC_004461	AATCGC	2	12	201259	201270	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27467130
101	NC_004461	TTAATT	2	12	202485	202496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004461	CAGAAA	2	12	203191	203202	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	27467132
103	NC_004461	GGACGT	2	12	203316	203327	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	27467132
104	NC_004461	TGATAA	2	12	205481	205492	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27467133
105	NC_004461	ATAAGA	2	12	217752	217763	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467145
106	NC_004461	ATTTTT	2	12	220584	220595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27467147
107	NC_004461	AATATA	2	12	224469	224480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004461	TTTTAA	2	12	226580	226591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27467154
109	NC_004461	AAAGAA	2	12	226691	226702	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	27467155
110	NC_004461	AGTCAT	2	12	227240	227251	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467156
111	NC_004461	AGAAAT	2	12	228212	228223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467157
112	NC_004461	TCTAAT	2	12	228652	228663	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27467157
113	NC_004461	GAAAGC	2	12	238005	238016	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	27467161
114	NC_004461	TGAAAA	2	12	242707	242718	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467163
115	NC_004461	ATGTTG	2	12	243438	243449	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27467163
116	NC_004461	GGGTAT	2	12	246481	246492	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	27467166
117	NC_004461	ATGAAG	2	12	247560	247571	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27467167
118	NC_004461	TAAAAC	2	12	250755	250766	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	27467170
119	NC_004461	GAGTTA	2	12	252751	252762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27467171
120	NC_004461	AGATGA	2	12	255906	255917	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27467174
121	NC_004461	TTATGC	2	12	260488	260499	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	27467178
122	NC_004461	AGGGGT	2	12	265569	265580	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004461	TACTGA	2	12	265878	265889	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467184
124	NC_004461	TAACTT	2	12	266531	266542	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27467184
125	NC_004461	TGAAAA	2	12	272167	272178	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467190
126	NC_004461	TCCAGT	2	12	274662	274673	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	27467194
127	NC_004461	TGTATT	2	12	274970	274981	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27467194
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130	NC_004461	AATCTG	2	12	277613	277624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467199
131	NC_004461	AGATAA	2	12	278055	278066	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467199
132	NC_004461	CGGTCA	2	12	284942	284953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	27467205
133	NC_004461	TTTAAT	2	12	287610	287621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004461	GATAAA	2	12	290800	290811	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467208
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136	NC_004461	ACAAAA	2	12	295083	295094	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	27467212
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149	NC_004461	CATAAT	2	12	321895	321906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	27467238
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151	NC_004461	AATTTT	2	12	326222	326233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27467241
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153	NC_004461	GTAATC	2	12	328903	328914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467244
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159	NC_004461	GATTCA	2	12	334816	334827	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467249
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171	NC_004461	TAATTA	2	12	348314	348325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_004461	AATATG	2	12	350439	350450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_004461	AAAATA	2	12	352010	352021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27467272
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233	NC_004461	CTAAAA	2	12	461428	461439	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	27467386
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235	NC_004461	TAAACC	2	12	473285	473296	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
236	NC_004461	ATTAAC	2	12	475758	475769	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
237	NC_004461	ACCTGG	2	12	478075	478086	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	27467406
238	NC_004461	AGAACA	2	12	478634	478645	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	27467407
239	NC_004461	GAAAAA	2	12	483541	483552	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	27467412
240	NC_004461	ATAAAA	2	12	484596	484607	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27467412
241	NC_004461	AAATGA	2	12	491464	491475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467419
242	NC_004461	AATTGT	2	12	493635	493646	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27467421
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245	NC_004461	TCAGTA	2	12	501718	501729	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467427
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249	NC_004461	TATTTT	2	12	510039	510050	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27467434
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343	NC_004461	TTTAAT	2	12	678049	678060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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351	NC_004461	TGCAAG	2	12	705082	705093	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	27467634
352	NC_004461	TTATAA	2	12	707825	707836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
353	NC_004461	AAACAA	2	12	708328	708339	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	27467636
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475	NC_004461	CAACTG	2	12	954739	954750	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27467869
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494	NC_004461	AATTAT	2	12	1006861	1006872	50 %	50 %	0 %	0 %	27467917
495	NC_004461	CATGCG	2	12	1008143	1008154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	27467919
496	NC_004461	TTAAAA	2	12	1010380	1010391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_004461	AATGAA	2	12	1011712	1011723	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
498	NC_004461	ATCTTT	2	12	1012206	1012217	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27467925
499	NC_004461	CAGTTA	2	12	1013564	1013575	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467926
500	NC_004461	TAAAAA	2	12	1014487	1014498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27467927

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