MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 chromosome

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004461	TTTAAA	2	12	3406	3417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004461	GTATGT	2	12	22372	22383	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004461	AAAATT	2	12	32952	32963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004461	TATAAA	2	12	36184	36195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004461	TATAAA	2	12	53820	53831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004461	TCACAT	2	12	80452	80463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_004461	TTATTT	2	12	106716	106727	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004461	AGATAT	2	12	109522	109533	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004461	TGCTAA	2	12	119955	119966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_004461	TTTATT	2	12	139118	139129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004461	AGTGAT	2	12	139143	139154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004461	TAATTA	2	12	139377	139388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004461	AATTGT	2	12	141317	141328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004461	AATGTA	2	12	183064	183075	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004461	TTAATT	2	12	202485	202496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004461	AATATA	2	12	224469	224480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004461	AGGGGT	2	12	265569	265580	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004461	TTTAAT	2	12	287610	287621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004461	TATAAA	2	12	292092	292103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004461	ATTTTT	2	12	316641	316652	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004461	ACGTCT	2	12	325676	325687	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004461	TAATTA	2	12	348314	348325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004461	AATATG	2	12	350439	350450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004461	TTTAAA	2	12	386732	386743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004461	AATTTA	2	12	386856	386867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004461	AGTTTA	2	12	390383	390394	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004461	AAAATA	2	12	410763	410774	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004461	ATTCAA	2	12	420370	420381	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_004461	CTTTTT	2	12	431238	431249	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_004461	TGACAT	2	12	438128	438139	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_004461	TAGTGT	2	12	461351	461362	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004461	TAAACC	2	12	473285	473296	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_004461	ATTAAC	2	12	475758	475769	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_004461	ATCATT	3	18	508747	508764	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_004461	TATAAA	2	12	514131	514142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004461	TTAGAA	2	12	546718	546729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004461	ATTAAG	2	12	558171	558182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004461	TTTAGT	2	12	566434	566445	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004461	TAAAAT	2	12	568944	568955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004461	AATTTA	2	12	572953	572964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004461	ATAAAT	2	12	596946	596957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004461	ATAAAT	2	12	600926	600937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004461	TAAAAT	2	12	608730	608741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004461	TAGAGT	2	12	621494	621505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004461	CAGCTT	2	12	635745	635756	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_004461	ATTTAT	2	12	656138	656149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004461	AATATC	2	12	677963	677974	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_004461	TTTAAT	2	12	678049	678060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004461	TTATAA	2	12	707825	707836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004461	TCCGTT	2	12	720799	720810	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_004461	TGAAAA	2	12	739859	739870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004461	TATTTT	2	12	750302	750313	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004461	ACTGAA	2	12	750424	750435	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_004461	ATTTTT	2	12	774517	774528	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004461	TTTTTA	2	12	778225	778236	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004461	GATAAA	2	12	794438	794449	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004461	CAGCTT	2	12	801159	801170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_004461	ATTCAT	2	12	864491	864502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_004461	TTTAGT	2	12	904452	904463	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004461	AAAATA	2	12	912302	912313	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004461	AAATAT	2	12	924807	924818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004461	ATTTGA	2	12	925101	925112	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004461	TTAAAA	2	12	1010380	1010391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004461	AATGAA	2	12	1011712	1011723	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004461	ATATAA	2	12	1018445	1018456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004461	TAACAC	2	12	1026289	1026300	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_004461	TCATTT	2	12	1059430	1059441	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_004461	ATTTAT	2	12	1070800	1070811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004461	ATGACT	2	12	1071981	1071992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_004461	AATACT	2	12	1086078	1086089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_004461	GATTTA	2	12	1100841	1100852	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004461	TAGTCT	2	12	1105170	1105181	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_004461	TATTTA	2	12	1133643	1133654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004461	ATATTT	2	12	1166181	1166192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004461	AAAAAG	2	12	1198433	1198444	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004461	TAAAGA	2	12	1210698	1210709	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004461	ATTAAA	2	12	1253361	1253372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004461	TTATAA	2	12	1253462	1253473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004461	TTAAAT	2	12	1271181	1271192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004461	TTATTT	2	12	1273453	1273464	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004461	ATTTAG	2	12	1291123	1291134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004461	ATAAAA	2	12	1291175	1291186	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004461	AGTCAA	2	12	1296352	1296363	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_004461	TTGACT	2	12	1296371	1296382	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_004461	ACAAAA	2	12	1325027	1325038	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_004461	AATTAC	2	12	1370237	1370248	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_004461	TAAAAT	2	12	1449856	1449867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004461	ATTAAA	2	12	1487888	1487899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004461	ATATCT	2	12	1493869	1493880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_004461	ATTTAA	2	12	1494170	1494181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004461	TTAATT	2	12	1496024	1496035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004461	TTTAAA	2	12	1500063	1500074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004461	GTTTAA	2	12	1500171	1500182	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004461	CTATTT	2	12	1508682	1508693	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_004461	ATTTAT	2	12	1554482	1554493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004461	ATTTTT	2	12	1554700	1554711	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004461	TTTATA	2	12	1569156	1569167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004461	AATAAA	2	12	1578352	1578363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004461	CATTAA	2	12	1581271	1581282	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_004461	CAGCTT	2	12	1581521	1581532	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_004461	ATATTT	2	12	1586957	1586968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004461	TTATAT	2	12	1599976	1599987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004461	TTAATA	2	12	1600700	1600711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004461	TTGAAT	2	12	1626990	1627001	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004461	TTATTT	2	12	1630222	1630233	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004461	ATTAAT	2	12	1688001	1688012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004461	GCATCA	2	12	1695597	1695608	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_004461	CTTTTT	2	12	1703014	1703025	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_004461	ACTAAT	2	12	1727655	1727666	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_004461	AAATAT	2	12	1727688	1727699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004461	ATTACA	2	12	1740017	1740028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_004461	AAATAA	2	12	1750014	1750025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004461	AACTTG	2	12	1753601	1753612	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_004461	TAAAAA	2	12	1779635	1779646	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004461	TAAAAT	2	12	1791271	1791282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004461	CTTAAA	2	12	1795376	1795387	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_004461	TAAATA	2	12	1798102	1798113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004461	AATTTA	2	12	1800378	1800389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004461	AATAGT	2	12	1804287	1804298	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004461	TTATAA	2	12	1822179	1822190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004461	ATTATC	2	12	1831203	1831214	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_004461	TTAATT	2	12	1834838	1834849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004461	ACTTTT	2	12	1847582	1847593	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_004461	ATTTAT	2	12	1880578	1880589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004461	ATTAAT	2	12	1931512	1931523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004461	AATGAC	2	12	1935087	1935098	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_004461	TTTTTG	2	12	1947409	1947420	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004461	GATGTC	2	12	1977144	1977155	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_004461	TAAAAA	2	12	1986433	1986444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004461	TATTCA	2	12	1988664	1988675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_004461	TTACTA	2	12	1995174	1995185	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_004461	AAATAC	2	12	2001891	2001902	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_004461	TAATAG	2	12	2001939	2001950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004461	TAAAAT	2	12	2016619	2016630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004461	TATTTA	2	12	2017809	2017820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004461	TATCTA	2	12	2025438	2025449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_004461	CTTATT	2	12	2029921	2029932	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_004461	AATCAG	2	12	2055217	2055228	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_004461	TTAGTT	2	12	2071617	2071628	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_004461	ATTTTA	2	12	2084177	2084188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004461	ATTAAC	2	12	2087033	2087044	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_004461	ATATTT	2	12	2101667	2101678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004461	TTAATT	2	12	2106092	2106103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004461	AATTTA	2	12	2111783	2111794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004461	ATCTTC	2	12	2116279	2116290	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_004461	TATTTT	2	12	2169404	2169415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004461	TAAAAA	2	12	2181533	2181544	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_004461	TTAAAA	2	12	2225350	2225361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_004461	TAAAAA	2	12	2253495	2253506	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_004461	AAATTT	2	12	2274338	2274349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_004461	AATATG	2	12	2295536	2295547	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_004461	ATTACC	2	12	2297774	2297785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_004461	GATGTT	2	12	2311802	2311813	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.