MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 chromosome

Total Repeats: 1167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004461	GATATT	2	12	2686	2697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27466920
2	NC_004461	AAGTAG	2	12	3059	3070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27466920
3	NC_004461	GACACT	2	12	4478	4489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27466921
4	NC_004461	GTTATC	2	12	7208	7219	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	27466923
5	NC_004461	TCAAGC	2	12	8175	8186	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27466923
6	NC_004461	TGAAGA	2	12	8403	8414	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27466923
7	NC_004461	TTTGAA	2	12	12044	12055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27466925
8	NC_004461	TTGTAT	2	12	13511	13522	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27466926
9	NC_004461	TAGAAA	2	12	18705	18716	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27466931
10	NC_004461	ACTGAA	2	12	18782	18793	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	27466931
11	NC_004461	GGTGGC	2	12	20156	20167	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	27466931
12	NC_004461	TAAAGG	2	12	20298	20309	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27466932
13	NC_004461	AATTAG	2	12	21286	21297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27466933
14	NC_004461	TGCCTT	2	12	21539	21550	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	27466933
15	NC_004461	TGATTG	2	12	21838	21849	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27466933
16	NC_004461	TGAAAT	2	12	22169	22180	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27466933
17	NC_004461	AAGGTA	2	12	22607	22618	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27466934
18	NC_004461	AAGATA	2	12	25808	25819	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27466937
19	NC_004461	GAACGT	2	12	26737	26748	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	27466937
20	NC_004461	CACGTA	2	12	27281	27292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27466937
21	NC_004461	AAAGAA	2	12	32196	32207	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	27466941
22	NC_004461	ATGTGT	2	12	37098	37109	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27466946
23	NC_004461	TCACTT	2	12	37805	37816	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	27466948
24	NC_004461	ATAAAG	2	12	49533	49544	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27466959
25	NC_004461	ATTTTA	2	12	53218	53229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466963
26	NC_004461	ATGTGT	2	12	54738	54749	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27466966
27	NC_004461	TGAGAA	2	12	57153	57164	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27466970
28	NC_004461	TATCAA	2	12	60861	60872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	27466975
29	NC_004461	TCATGA	2	12	64128	64139	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27466980
30	NC_004461	GTTTTT	2	12	67363	67374	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	27466982
31	NC_004461	CTATTT	2	12	68679	68690	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27466986
32	NC_004461	TTAAAC	2	12	70842	70853	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	27466989
33	NC_004461	TCATTT	2	12	72617	72628	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27466992
34	NC_004461	ATGAAA	2	12	74930	74941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27466993
35	NC_004461	GTTTTT	2	12	76068	76079	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	27466994
36	NC_004461	AAAAAT	2	12	78241	78252	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27466995
37	NC_004461	GTTTAA	2	12	80898	80909	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27466997
38	NC_004461	GTTTAA	2	12	89388	89399	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27467008
39	NC_004461	ATCATT	2	12	94289	94300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27467014
40	NC_004461	TTTATC	2	12	98310	98321	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27467020
41	NC_004461	AACTTG	2	12	98604	98615	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467020
42	NC_004461	AAAGGA	2	12	98728	98739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27467020
43	NC_004461	ATCTTT	2	12	102869	102880	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27467024
44	NC_004461	TTCCAT	2	12	108828	108839	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	27467030
45	NC_004461	GATTTT	2	12	112295	112306	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27467035
46	NC_004461	TAAAAA	2	12	112426	112437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27467035
47	NC_004461	GAGTAA	2	12	113360	113371	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27467036
48	NC_004461	ATTTGG	2	12	117725	117736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27467041
49	NC_004461	TTAATT	2	12	120640	120651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27467044
50	NC_004461	ATAAAC	2	12	121598	121609	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	27467044
51	NC_004461	ATTAAA	2	12	122241	122252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27467044
52	NC_004461	CACCCC	2	12	122799	122810	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	27467045
53	NC_004461	TGATAA	2	12	123257	123268	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27467045
54	NC_004461	TTTGTA	2	12	125192	125203	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27467047
55	NC_004461	TTTTTC	2	12	126209	126220	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	27467048
56	NC_004461	TATTTT	2	12	126513	126524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27467048
57	NC_004461	GCCCAT	2	12	129037	129048	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	27467053
58	NC_004461	GAAAAA	2	12	130207	130218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	27467054
59	NC_004461	TTGTTC	2	12	133668	133679	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	27467058
60	NC_004461	ATGCAA	2	12	143282	143293	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	27467070
61	NC_004461	TTATTG	2	12	143308	143319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27467070
62	NC_004461	ATACTT	2	12	144771	144782	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27467074
63	NC_004461	GTATTG	2	12	152366	152377	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27467082
64	NC_004461	GTTTGA	2	12	155152	155163	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27467084
65	NC_004461	TCATTT	2	12	158301	158312	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27467086
66	NC_004461	CATTTA	2	12	158581	158592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27467086
67	NC_004461	TTTTAA	2	12	160921	160932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27467088
68	NC_004461	TTAAAT	2	12	161307	161318	50 %	50 %	0 %	0 %	27467088
69	NC_004461	ACACAA	2	12	164407	164418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27467093
70	NC_004461	AGCACA	2	12	172202	172213	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	27467099
71	NC_004461	TTCTAC	2	12	173380	173391	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	27467101
72	NC_004461	CAGCCA	2	12	173651	173662	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	27467102
73	NC_004461	GAGATA	2	12	175778	175789	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27467103
74	NC_004461	GATAAA	2	12	182092	182103	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467111
75	NC_004461	GAACAT	2	12	182218	182229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	27467111
76	NC_004461	AACATC	2	12	183220	183231	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	27467112
77	NC_004461	GTTATG	2	12	183382	183393	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27467112
78	NC_004461	TTTAAA	2	12	184192	184203	50 %	50 %	0 %	0 %	27467113
79	NC_004461	CTTTAT	2	12	188299	188310	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27467114
80	NC_004461	TAGGAT	2	12	188316	188327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27467114
81	NC_004461	TATAGA	2	12	192277	192288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27467120
82	NC_004461	TAGCAT	2	12	197880	197891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467127
83	NC_004461	AGTGGA	2	12	198330	198341	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	27467128
84	NC_004461	TATGAT	2	12	199612	199623	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27467129
85	NC_004461	AGACAA	2	12	200120	200131	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	27467129
86	NC_004461	AATCGC	2	12	201259	201270	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27467130
87	NC_004461	CAGAAA	2	12	203191	203202	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	27467132
88	NC_004461	GGACGT	2	12	203316	203327	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	27467132
89	NC_004461	TGATAA	2	12	205481	205492	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27467133
90	NC_004461	ATAAGA	2	12	217752	217763	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467145
91	NC_004461	ATTTTT	2	12	220584	220595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27467147
92	NC_004461	TTTTAA	2	12	226580	226591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27467154
93	NC_004461	AAAGAA	2	12	226691	226702	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	27467155
94	NC_004461	AGTCAT	2	12	227240	227251	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467156
95	NC_004461	AGAAAT	2	12	228212	228223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467157
96	NC_004461	TCTAAT	2	12	228652	228663	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27467157
97	NC_004461	GAAAGC	2	12	238005	238016	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	27467161
98	NC_004461	TGAAAA	2	12	242707	242718	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467163
99	NC_004461	ATGTTG	2	12	243438	243449	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27467163
100	NC_004461	GGGTAT	2	12	246481	246492	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	27467166
101	NC_004461	ATGAAG	2	12	247560	247571	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27467167
102	NC_004461	TAAAAC	2	12	250755	250766	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	27467170
103	NC_004461	GAGTTA	2	12	252751	252762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27467171
104	NC_004461	AGATGA	2	12	255906	255917	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27467174
105	NC_004461	TTATGC	2	12	260488	260499	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	27467178
106	NC_004461	TACTGA	2	12	265878	265889	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467184
107	NC_004461	TAACTT	2	12	266531	266542	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27467184
108	NC_004461	TGAAAA	2	12	272167	272178	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467190
109	NC_004461	TCCAGT	2	12	274662	274673	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	27467194
110	NC_004461	TGTATT	2	12	274970	274981	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27467194
111	NC_004461	TTAAAG	2	12	276207	276218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27467196
112	NC_004461	ATTTTT	2	12	277102	277113	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27467197
113	NC_004461	AATCTG	2	12	277613	277624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467199
114	NC_004461	AGATAA	2	12	278055	278066	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467199
115	NC_004461	CGGTCA	2	12	284942	284953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	27467205
116	NC_004461	GATAAA	2	12	290800	290811	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27467208
117	NC_004461	ACAAAA	2	12	295083	295094	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	27467212
118	NC_004461	AAAGAA	2	12	295803	295814	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	27467213
119	NC_004461	AGAATT	2	12	296025	296036	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27467213
120	NC_004461	TGCAGG	2	12	297557	297568	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	27467217
121	NC_004461	CTGAAG	2	12	299038	299049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	27467219
122	NC_004461	TATGCT	2	12	306770	306781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	27467225
123	NC_004461	CAGCTA	2	12	308710	308721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27467225
124	NC_004461	TTAATG	2	12	309529	309540	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27467226
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127	NC_004461	TTCGAA	2	12	312300	312311	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467229
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132	NC_004461	GTAATC	2	12	328903	328914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27467244
133	NC_004461	TACAAC	2	12	334362	334373	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	27467249
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139	NC_004461	TCAGAC	2	12	334855	334866	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27467249
140	NC_004461	TCAGAC	2	12	334891	334902	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27467249
141	NC_004461	TCAGAC	2	12	334927	334938	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27467249
142	NC_004461	TCAGAC	2	12	335017	335028	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27467249
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237	NC_004461	ACATTT	2	12	541288	541299	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27467462
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