MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus CMCP6 chromosome II

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004460	TTTAAA	2	12	10751	10762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004460	GATAAC	2	12	47159	47170	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_004460	ATTCTC	2	12	259533	259544	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004460	TTAGCG	2	12	272773	272784	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_004460	TTTTGT	2	12	304690	304701	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004460	ACTAAA	2	12	324372	324383	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_004460	AGGTAA	2	12	326635	326646	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004460	AAGAGA	2	12	354532	354543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004460	TTAAAA	2	12	383495	383506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004460	CGTTAT	2	12	420431	420442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_004460	TTATTT	2	12	454876	454887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004460	CAAGAA	2	12	498266	498277	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_004460	GTTTAC	2	12	511275	511286	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_004460	ACGTAA	2	12	549423	549434	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_004460	TTATAT	2	12	589324	589335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004460	CATCAC	2	12	628675	628686	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004460	TTTAAA	2	12	632810	632821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004460	ACAAAA	2	12	632825	632836	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_004460	GAATAA	2	12	649654	649665	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004460	ATGCGA	2	12	661235	661246	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_004460	TAATGG	2	12	671466	671477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004460	TTGTTT	2	12	731623	731634	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004460	GAAAAA	2	12	734691	734702	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004460	AGGTAA	2	12	744713	744724	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004460	TAAAAC	2	12	745023	745034	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_004460	ACTAAA	2	12	746789	746800	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_004460	TCGAAA	2	12	748777	748788	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_004460	CAATAT	2	12	774421	774432	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_004460	AAAGAC	2	12	779189	779200	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_004460	TATTTT	2	12	786497	786508	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004460	TCATAT	2	12	818878	818889	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_004460	GCAATT	2	12	836496	836507	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_004460	AAAAAG	2	12	864979	864990	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004460	TTTTTC	2	12	907441	907452	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_004460	CAAATG	2	12	909208	909219	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_004460	CATTTG	2	12	912971	912982	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_004460	GGATGC	2	12	914550	914561	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_004460	GGAACA	2	12	915193	915204	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_004460	AAAAAC	2	12	925798	925809	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_004460	ATCCTA	2	12	943552	943563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_004460	AGAAAA	2	12	982275	982286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004460	AGGATA	2	12	994069	994080	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004460	CTTTTT	2	12	1049132	1049143	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_004460	TGAAAG	2	12	1106682	1106693	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004460	AAGAAC	2	12	1138032	1138043	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_004460	CATTCA	2	12	1153620	1153631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004460	TACAAA	2	12	1159981	1159992	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_004460	TTTATA	2	12	1202176	1202187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004460	AAAGCT	2	12	1251401	1251412	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_004460	TCGATT	2	12	1277700	1277711	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_004460	CTTATT	2	12	1296270	1296281	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_004460	GAAAGA	2	12	1319360	1319371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004460	TCAGGC	2	12	1319480	1319491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_004460	AGAAGG	2	12	1346243	1346254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004460	TTCTAT	2	12	1347556	1347567	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_004460	TAGTTT	2	12	1353991	1354002	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004460	AATGAA	2	12	1379383	1379394	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004460	AAGCCA	2	12	1398370	1398381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_004460	CAAAAA	2	12	1442004	1442015	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_004460	AGCGCC	2	12	1446328	1446339	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_004460	AATGTT	2	12	1459381	1459392	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004460	TAGCAT	2	12	1468187	1468198	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_004460	TTAGAT	2	12	1470414	1470425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004460	CTTCTA	2	12	1470609	1470620	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_004460	AAAATG	2	12	1470662	1470673	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004460	AATAAG	2	12	1482068	1482079	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004460	TTGATG	2	12	1521424	1521435	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004460	TAAAAA	2	12	1527978	1527989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004460	ACGATG	2	12	1576252	1576263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_004460	TGAAAT	2	12	1583480	1583491	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004460	GAAAAA	2	12	1613206	1613217	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004460	TAAAAA	2	12	1631450	1631461	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004460	TTTGTG	2	12	1695431	1695442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004460	TTTTAT	2	12	1708071	1708082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004460	AAAGTG	2	12	1730006	1730017	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004460	ACAGTA	2	12	1741459	1741470	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_004460	ATAAGA	2	12	1745824	1745835	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004460	ATTGAG	2	12	1757536	1757547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004460	AGTGGT	2	12	1785795	1785806	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004460	ATGCAA	2	12	1798746	1798757	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_004460	GTATTG	2	12	1829064	1829075	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004460	TTTTGT	2	12	1839779	1839790	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.