MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus CMCP6 chromosome II

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004460	AATAA	2	10	26658	26667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004460	GTTTT	2	10	34550	34559	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004460	GCCTT	2	10	35778	35787	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_004460	CGCTT	2	10	36310	36319	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_004460	GTGTT	2	10	38646	38655	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004460	TTCAT	2	10	40351	40360	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_004460	GTTAA	2	10	52013	52022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004460	GCATA	2	10	60675	60684	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_004460	TCAGT	2	10	70730	70739	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_004460	AAGAT	2	10	71879	71888	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004460	AAAAT	2	10	89108	89117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004460	TTCTC	2	10	104401	104410	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_004460	GAATT	2	10	135771	135780	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004460	ACTCA	2	10	150806	150815	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_004460	GAATG	2	10	153050	153059	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004460	TTTGA	2	10	153446	153455	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004460	TGCCG	2	10	167266	167275	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_004460	TTTGT	2	10	168318	168327	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004460	TTGTG	2	10	197525	197534	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004460	AAATT	2	10	201608	201617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004460	TGCTT	2	10	225186	225195	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_004460	CTTAA	2	10	225288	225297	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_004460	ATTTG	2	10	230049	230058	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004460	TAAAT	2	10	239693	239702	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004460	AAAAG	2	10	247776	247785	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004460	CTTAC	2	10	249775	249784	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_004460	ATGGT	2	10	249879	249888	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004460	TAAGC	2	10	264251	264260	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_004460	TTGAG	2	10	277385	277394	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004460	TTAAT	2	10	277422	277431	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004460	CACTT	2	10	297554	297563	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_004460	CAAAT	2	10	297677	297686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_004460	AATTT	2	10	304503	304512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004460	ATAAA	2	10	318941	318950	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004460	AAATT	2	10	320208	320217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004460	TGTTT	2	10	325843	325852	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004460	TCGCT	2	10	326190	326199	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_004460	ATTCA	2	10	326260	326269	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_004460	ACTCA	2	10	326280	326289	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_004460	TAATT	2	10	326504	326513	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004460	AAGAA	2	10	326576	326585	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004460	TATCA	2	10	338673	338682	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_004460	TACTT	2	10	339775	339784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_004460	CTTCA	2	10	366839	366848	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_004460	CCAAA	2	10	427032	427041	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_004460	TTAAA	2	10	433824	433833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004460	CAAAA	2	10	433885	433894	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_004460	TAAAT	2	10	433942	433951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004460	CAGAT	2	10	433991	434000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_004460	TTTTA	2	10	434040	434049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004460	GACGA	2	10	451779	451788	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_004460	GCTAT	2	10	495151	495160	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_004460	AAAAT	2	10	498010	498019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004460	ATGTG	2	10	505855	505864	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004460	AATAG	2	10	554703	554712	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004460	AACAG	2	10	557717	557726	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_004460	AAATA	2	10	558049	558058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004460	CAAAG	2	10	559509	559518	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_004460	CTATT	2	10	559655	559664	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_004460	GAAAA	2	10	559677	559686	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004460	TTAGC	2	10	569255	569264	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_004460	AAAAG	2	10	569420	569429	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004460	CCAAC	2	10	572745	572754	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_004460	AAACA	2	10	572813	572822	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_004460	AAATC	3	15	604111	604125	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_004460	AAAAG	2	10	613805	613814	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004460	AACCC	2	10	619953	619962	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_004460	ATTTA	2	10	624563	624572	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004460	TGCTT	2	10	626842	626851	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_004460	CTCTC	2	10	640821	640830	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
71	NC_004460	TTAAT	2	10	650167	650176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004460	CTCTT	2	10	665423	665432	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_004460	GCCAT	2	10	667605	667614	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_004460	CTAAC	2	10	667796	667805	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_004460	TCACA	2	10	672711	672720	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_004460	AATCT	2	10	673994	674003	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_004460	TAACC	2	10	682166	682175	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_004460	GATTC	2	10	704027	704036	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_004460	TGCGA	2	10	707923	707932	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_004460	TCCTT	2	10	715881	715890	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_004460	TTAAA	2	10	722245	722254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004460	CAAAA	2	10	723055	723064	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_004460	GAAAA	2	10	734280	734289	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004460	CATTT	2	10	735124	735133	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_004460	CATCT	2	10	737712	737721	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_004460	CAAGA	2	10	738820	738829	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004460	CAAAT	2	10	739943	739952	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_004460	AACAA	2	10	740730	740739	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_004460	GGTTT	2	10	745650	745659	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004460	CAGTT	2	10	764406	764415	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_004460	AAAAG	2	10	791429	791438	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004460	ATAAA	2	10	796300	796309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004460	AAAAT	2	10	799183	799192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004460	CAAAA	2	10	822089	822098	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_004460	AAACC	2	10	831097	831106	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_004460	CCATT	2	10	831322	831331	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_004460	TTTAT	2	10	834825	834834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004460	CTTTC	2	10	836750	836759	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_004460	CTATT	2	10	837997	838006	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_004460	TTCTT	2	10	860096	860105	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_004460	CAAAA	2	10	862778	862787	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_004460	CATTG	2	10	863925	863934	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_004460	TCTTT	2	10	870222	870231	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_004460	GAATT	2	10	870243	870252	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004460	ATCAA	2	10	872223	872232	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_004460	TAATT	2	10	880693	880702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004460	TTTTG	2	10	891000	891009	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004460	TCTCT	2	10	918294	918303	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_004460	AATTA	2	10	926014	926023	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004460	AAAAG	2	10	950500	950509	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004460	ATATT	2	10	973458	973467	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004460	TTTTG	2	10	991550	991559	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004460	TTAAA	2	10	991712	991721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004460	CATTA	2	10	1001434	1001443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_004460	TTCGA	2	10	1006467	1006476	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_004460	AAGTT	2	10	1013683	1013692	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004460	CTTCT	2	10	1019188	1019197	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_004460	CACTG	2	10	1028116	1028125	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_004460	AATTT	2	10	1049084	1049093	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004460	GAGGT	2	10	1079278	1079287	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004460	TTAGA	2	10	1080456	1080465	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004460	CTTTC	2	10	1083505	1083514	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_004460	TTTAT	2	10	1123756	1123765	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004460	AAGCG	2	10	1123897	1123906	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_004460	AGGCA	2	10	1136986	1136995	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_004460	CACTA	2	10	1138057	1138066	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_004460	TTTTA	2	10	1145833	1145842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004460	CAAAA	2	10	1146954	1146963	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_004460	ATTCA	2	10	1159638	1159647	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_004460	ATCAA	2	10	1169385	1169394	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_004460	CCTTT	2	10	1175925	1175934	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_004460	AAACA	2	10	1180113	1180122	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_004460	TTTAC	2	10	1180587	1180596	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_004460	AAACA	2	10	1180769	1180778	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_004460	TATGA	2	10	1193469	1193478	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004460	ACGGA	2	10	1202022	1202031	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_004460	TGAAT	2	10	1202231	1202240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004460	CTCTG	2	10	1204386	1204395	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_004460	AACAA	2	10	1210332	1210341	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_004460	ACCTC	2	10	1211245	1211254	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_004460	AATCC	2	10	1213357	1213366	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_004460	AACCC	2	10	1238616	1238625	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
143	NC_004460	TTTCA	2	10	1241646	1241655	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_004460	AAATT	2	10	1245446	1245455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004460	TCGAA	2	10	1247849	1247858	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_004460	CATTT	2	10	1247887	1247896	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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148	NC_004460	CAATA	2	10	1252748	1252757	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_004460	TGTTA	2	10	1416407	1416416	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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206	NC_004460	GGACC	2	10	1791610	1791619	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
207	NC_004460	GAAAA	2	10	1802760	1802769	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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209	NC_004460	CAAGG	2	10	1818583	1818592	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
210	NC_004460	TATCG	2	10	1831744	1831753	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
211	NC_004460	TTCCA	2	10	1837551	1837560	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
212	NC_004460	TTTAA	2	10	1839916	1839925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
213	NC_004460	AACAA	2	10	1844769	1844778	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.