MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus CMCP6 chromosome I

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004459	TTTCGA	2	12	6088	6099	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_004459	GTGTGG	2	12	190569	190580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004459	AGAAAA	2	12	206524	206535	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004459	CATCTC	2	12	221350	221361	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_004459	CATTCC	2	12	281518	281529	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_004459	TCTGTC	2	12	283190	283201	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_004459	ACGTAA	2	12	330954	330965	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_004459	AACCAT	2	12	349520	349531	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004459	GTTTGT	4	24	362918	362941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004459	AAGATA	2	12	380431	380442	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004459	TTTCAA	2	12	386069	386080	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_004459	TACAAA	2	12	386916	386927	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_004459	ATTATA	2	12	389984	389995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004459	ATTTCA	2	12	473271	473282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_004459	TTTCTA	2	12	491491	491502	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_004459	TTATTT	2	12	512625	512636	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004459	TTATTG	2	12	585361	585372	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004459	CGAAAA	2	12	611787	611798	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_004459	CTTGTT	2	12	630336	630347	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_004459	ATTTTT	2	12	660734	660745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004459	ATTTGA	2	12	672402	672413	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004459	GCCTAT	2	12	693275	693286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_004459	TGAAAC	2	12	755015	755026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_004459	GCAACT	2	12	767067	767078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004459	TTTTTA	2	12	861336	861347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004459	GCTTCA	2	12	871451	871462	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_004459	ATTTTT	2	12	910309	910320	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004459	ATTTCA	2	12	929443	929454	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_004459	ATTTCA	2	12	935181	935192	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_004459	AAAATG	2	12	949276	949287	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004459	ATTTCA	2	12	975884	975895	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_004459	GGGGAC	2	12	998820	998831	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_004459	TGGTTA	2	12	1005458	1005469	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004459	TTAAAG	2	12	1050150	1050161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004459	TGAAAT	2	12	1064908	1064919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004459	GGCAAT	2	12	1075513	1075524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_004459	GGATTC	2	12	1081951	1081962	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_004459	GCAAAA	2	12	1115948	1115959	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_004459	TTTGTG	2	12	1125914	1125925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004459	ATTGAA	2	12	1160738	1160749	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004459	TGAAAT	2	12	1174417	1174428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004459	ATTGTT	2	12	1210349	1210360	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004459	TATTGA	2	12	1225950	1225961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004459	AGTAAG	2	12	1226086	1226097	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004459	TTTTCA	2	12	1226594	1226605	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_004459	GTTTTT	2	12	1247654	1247665	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004459	CTTTTT	2	12	1251535	1251546	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_004459	CGCCAT	2	12	1305075	1305086	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_004459	CAAGCG	2	12	1315318	1315329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_004459	TAATGA	2	12	1325258	1325269	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004459	ATGGTG	2	12	1348490	1348501	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004459	GATGAA	2	12	1358715	1358726	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004459	ATTTGA	2	12	1383331	1383342	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004459	TGAAAT	2	12	1393695	1393706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004459	TGAAAT	2	12	1482363	1482374	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004459	AAGAAT	2	12	1526224	1526235	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004459	ATTAGC	2	12	1555935	1555946	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_004459	ATTGTT	2	12	1571463	1571474	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004459	TTCCAT	2	12	1628742	1628753	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_004459	ATTTTT	2	12	1630538	1630549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004459	ATCACC	2	12	1685398	1685409	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_004459	CAATAA	2	12	1728668	1728679	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_004459	TAAGCA	2	12	1769246	1769257	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_004459	TGCCTC	2	12	1778149	1778160	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_004459	AAAAGA	2	12	1857342	1857353	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004459	AAATAA	2	12	1965046	1965057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004459	AATGAT	2	12	1971785	1971796	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004459	ATTGAG	2	12	2062821	2062832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004459	CACAAG	2	12	2067748	2067759	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_004459	AAAAGC	2	12	2095144	2095155	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_004459	GATACT	2	12	2118875	2118886	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_004459	AATAAC	2	12	2140292	2140303	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_004459	AGAGCA	2	12	2175449	2175460	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_004459	TCAAAG	2	12	2324134	2324145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_004459	TTTAAC	2	12	2461486	2461497	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_004459	GTTTTC	2	12	2463692	2463703	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_004459	ATATAA	2	12	2480597	2480608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004459	GGCAAG	2	12	2495602	2495613	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_004459	TGGTTT	2	12	2496230	2496241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004459	TACACA	2	12	2509088	2509099	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_004459	GTGTAA	2	12	2509240	2509251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004459	TTTGGC	2	12	2511211	2511222	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_004459	TGGTTT	2	12	2515830	2515841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004459	GTAAAC	2	12	2524015	2524026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_004459	TGGTTT	2	12	2528563	2528574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004459	TGGTTT	2	12	2532725	2532736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004459	TGATTT	2	12	2535321	2535332	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004459	TGGTTT	2	12	2535422	2535433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004459	TGGTTT	2	12	2548512	2548523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004459	TGGTTT	2	12	2550123	2550134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004459	TGGTTT	2	12	2561062	2561073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004459	GTTTTC	2	12	2574744	2574755	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_004459	AAGTTA	2	12	2584679	2584690	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004459	TCCTAA	2	12	2591857	2591868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_004459	CTTTTT	2	12	2639668	2639679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_004459	TAGTTT	2	12	2662569	2662580	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004459	ATTTTT	2	12	2693534	2693545	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004459	AACAAA	2	12	2758439	2758450	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_004459	ATTTAC	2	12	2771554	2771565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_004459	TTCAAT	2	12	2771659	2771670	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_004459	TTTTCA	2	12	2778014	2778025	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_004459	TGTCGA	2	12	2836963	2836974	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_004459	TCACCG	2	12	2846785	2846796	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_004459	CCTTTC	2	12	2886061	2886072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_004459	ACCTTG	2	12	2979888	2979899	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_004459	TAGTGA	2	12	3061393	3061404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004459	ACATTA	2	12	3063763	3063774	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_004459	TAAAAA	2	12	3068094	3068105	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004459	AGCATC	2	12	3073089	3073100	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_004459	ATTCTG	2	12	3095359	3095370	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_004459	TGAAAC	2	12	3095432	3095443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_004459	AACAAA	2	12	3111488	3111499	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_004459	GTCTTA	2	12	3132136	3132147	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_004459	CAAAAA	2	12	3174109	3174120	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_004459	CTTTGA	2	12	3215290	3215301	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_004459	ACAAAG	2	12	3267130	3267141	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.