MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma penetrans HF-2

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004432	AATTTT	2	12	8008	8019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004432	TAAATT	2	12	10356	10367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004432	AAATAA	2	12	32628	32639	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004432	TTATTT	2	12	65950	65961	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004432	ATTTTT	2	12	86388	86399	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004432	TAAAAA	2	12	88014	88025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004432	TTATAA	2	12	103757	103768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004432	TTTTTA	2	12	124323	124334	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004432	TAAACA	2	12	129129	129140	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_004432	TCAATT	2	12	143409	143420	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_004432	ATGATA	2	12	145115	145126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004432	ATTAAA	2	12	164257	164268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004432	ATATTA	2	12	172398	172409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004432	ATTTTT	2	12	212894	212905	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004432	ATTTTT	2	12	214545	214556	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004432	ATGTTA	2	12	223372	223383	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004432	AAAATA	2	12	223540	223551	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004432	TAATAT	2	12	228523	228534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004432	TTCAAA	2	12	259319	259330	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_004432	TGTAAT	2	12	270367	270378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004432	TTGAAT	2	12	276371	276382	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004432	TTTGAT	2	12	295375	295386	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004432	GAAAAA	2	12	304024	304035	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004432	ATAGAA	2	12	318543	318554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004432	CTTTTT	2	12	352488	352499	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_004432	AAATAA	2	12	384747	384758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004432	TAAAAA	2	12	386620	386631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004432	TAACTA	2	12	406081	406092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_004432	TTTTCT	2	12	410262	410273	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_004432	TTTAAT	2	12	411906	411917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004432	ATATAA	2	12	416224	416235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004432	TTTTAT	2	12	417609	417620	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004432	TTATAT	2	12	421353	421364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004432	TTTTAT	2	12	448662	448673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004432	ATTAAA	2	12	451494	451505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004432	ATTAAA	2	12	455917	455928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004432	AATTTA	2	12	467659	467670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004432	TTGAAA	2	12	470431	470442	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004432	AATTTT	2	12	490646	490657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004432	TTTTAT	2	12	507105	507116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004432	TTTAAA	2	12	508450	508461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004432	TTTGTT	2	12	532737	532748	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004432	TTATTT	2	12	532755	532766	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004432	CAAAAA	2	12	555515	555526	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_004432	ATTAAA	2	12	557158	557169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004432	TAAAAA	2	12	561704	561715	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004432	TTTTTA	2	12	562974	562985	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004432	AAAAAT	2	12	571830	571841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004432	TATAAA	2	12	581902	581913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004432	ATTTAA	2	12	603443	603454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004432	ATTTTT	2	12	604656	604667	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004432	GAATAT	2	12	609884	609895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004432	TTATTT	2	12	611937	611948	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004432	TTAAAT	2	12	624609	624620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004432	TATAAG	2	12	642505	642516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004432	TATTTA	2	12	642858	642869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004432	ACAAAA	2	12	646821	646832	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_004432	TTATTT	2	12	652740	652751	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004432	TAAGAA	2	12	652920	652931	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004432	AATTAA	2	12	664629	664640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004432	CAGATA	2	12	685094	685105	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_004432	AAATCC	2	12	685131	685142	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_004432	AAATAA	2	12	688147	688158	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004432	ATTTAT	2	12	696057	696068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004432	TTATTT	2	12	699234	699245	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004432	AAAAGA	2	12	699604	699615	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004432	TTTAAT	2	12	723938	723949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004432	TTAAAA	2	12	749950	749961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004432	TAACAA	2	12	768265	768276	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_004432	AAAATA	2	12	776668	776679	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004432	ACTCTA	2	12	784012	784023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004432	AAAATA	2	12	784305	784316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004432	ACTGAA	2	12	790441	790452	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_004432	TTAAAA	2	12	793469	793480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004432	TTAAAT	2	12	794308	794319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004432	TAAAAA	2	12	797756	797767	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004432	AATTTT	2	12	802904	802915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004432	TAAAAT	2	12	816882	816893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004432	TTACTA	2	12	818891	818902	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_004432	AAAAGT	2	12	830359	830370	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004432	ATAAAA	2	12	832415	832426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004432	ATAAAA	2	12	835357	835368	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004432	AACAAA	2	12	841196	841207	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_004432	TAAAAA	2	12	845578	845589	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004432	AATTAA	2	12	846847	846858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004432	CAAATT	2	12	850743	850754	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_004432	ATAAAA	2	12	857275	857286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004432	ATAAAA	2	12	858706	858717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004432	AACAAA	2	12	861607	861618	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_004432	ATAAAA	2	12	865286	865297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004432	AACAAA	2	12	866729	866740	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_004432	AATTTA	2	12	869887	869898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004432	GAATTT	2	12	874568	874579	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004432	ATAAAA	2	12	878761	878772	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004432	TTCAAT	2	12	884971	884982	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_004432	TAAGTC	2	12	918667	918678	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_004432	AAAATA	2	12	923527	923538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004432	TTATTT	2	12	934612	934623	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004432	AATGCA	2	12	944299	944310	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_004432	CTAATG	2	12	946151	946162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_004432	AATAAA	2	12	962755	962766	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004432	ATAAAA	2	12	975227	975238	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004432	TTTTAT	2	12	980830	980841	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004432	TTTGTT	2	12	1005755	1005766	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004432	TAAAAA	2	12	1024830	1024841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004432	ATTTTT	2	12	1042256	1042267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004432	AGTTTT	2	12	1051408	1051419	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004432	TAAAAA	2	12	1059271	1059282	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004432	AAAATA	2	12	1062932	1062943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004432	TAAAAA	2	12	1093524	1093535	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004432	TTTAAT	2	12	1104044	1104055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004432	ATAAAA	2	12	1105489	1105500	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004432	ATTTTA	2	12	1113573	1113584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004432	AATTTT	2	12	1115065	1115076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004432	AAAATA	2	12	1115521	1115532	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004432	AAATTT	2	12	1115572	1115583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004432	TTGTTT	2	12	1121832	1121843	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004432	ACAATA	2	12	1121894	1121905	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_004432	TAAAAA	2	12	1134915	1134926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004432	ACAAAT	2	12	1144025	1144036	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_004432	AATAAA	2	12	1162102	1162113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004432	ATTTTT	2	12	1165215	1165226	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004432	TAAAAA	2	12	1188595	1188606	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004432	GTTTTG	2	12	1191248	1191259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004432	ATTTAA	2	12	1201973	1201984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004432	TCATTA	2	12	1203714	1203725	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_004432	TTAATT	2	12	1206080	1206091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004432	ATAACT	2	12	1206750	1206761	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_004432	ATTTAT	2	12	1206877	1206888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004432	ATCTAT	2	12	1218443	1218454	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_004432	TTTAAT	2	12	1218455	1218466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004432	ATAAAC	2	12	1219247	1219258	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_004432	TAAAAA	2	12	1226304	1226315	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004432	ATATAA	2	12	1227506	1227517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004432	TCGCCT	2	12	1237278	1237289	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_004432	TAAATT	2	12	1238155	1238166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004432	ATTTAA	2	12	1269922	1269933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004432	ATAATT	2	12	1275390	1275401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_004432	TTTAAA	2	12	1357952	1357963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.