MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma penetrans HF-2

Total Repeats: 248

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004432	TTAAT	2	10	7875	7884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004432	GATAT	2	10	9675	9684	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004432	ATTTT	2	10	10959	10968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004432	TGTTT	2	10	38984	38993	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004432	ATTTT	2	10	39087	39096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004432	ATTGG	2	10	52096	52105	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004432	TTTAA	2	10	57859	57868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004432	ATATT	2	10	59170	59179	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004432	TAATA	2	10	65987	65996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004432	TTAAG	2	10	67696	67705	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004432	TAGAT	2	10	98724	98733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004432	AATAA	2	10	99692	99701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004432	ATTTT	2	10	99736	99745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004432	CTAAT	2	10	120946	120955	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_004432	ATAAA	2	10	124436	124445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004432	TCTTA	2	10	126478	126487	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_004432	TTATT	2	10	133541	133550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004432	ATTAT	2	10	146498	146507	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004432	TGAAA	2	10	146587	146596	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004432	TAATA	2	10	146653	146662	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004432	ATTAA	2	10	159356	159365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004432	AAACT	2	10	162335	162344	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_004432	TATTT	2	10	165521	165530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004432	ATTAT	2	10	215834	215843	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004432	GATTT	2	10	216903	216912	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004432	TTTTA	2	10	220126	220135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004432	TTTAT	2	10	220252	220261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004432	ATTTT	2	10	223342	223351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004432	TATTT	2	10	234156	234165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004432	TTTAT	2	10	234175	234184	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004432	GTTTT	2	10	234192	234201	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004432	ATTAA	2	10	235178	235187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004432	TATTT	2	10	235505	235514	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004432	ACTAA	2	10	235576	235585	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_004432	TAAAT	2	10	237391	237400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004432	TTTTG	2	10	242266	242275	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004432	TTTTA	2	10	245510	245519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004432	ATAAA	2	10	257803	257812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004432	TTTGT	2	10	270413	270422	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004432	TTAAT	2	10	270540	270549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004432	TAAAT	2	10	272616	272625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004432	TTAAT	2	10	272641	272650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004432	ATGTA	2	10	285864	285873	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004432	ACTTG	2	10	291373	291382	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_004432	ATTTT	2	10	292443	292452	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004432	TTTGT	2	10	294495	294504	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004432	GGTGT	2	10	294595	294604	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004432	AACTA	2	10	297557	297566	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_004432	AGTTT	2	10	297633	297642	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004432	TTAGT	2	10	301320	301329	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004432	ATATT	2	10	302763	302772	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004432	ATTCT	2	10	308383	308392	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_004432	TTTAA	2	10	308540	308549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004432	AAAAT	2	10	322100	322109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004432	AGTTA	2	10	335808	335817	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004432	TTAAT	2	10	339393	339402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004432	AAATA	2	10	353979	353988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004432	TAATC	2	10	384022	384031	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_004432	TAATT	2	10	384389	384398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004432	TAATG	2	10	384576	384585	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004432	TAAAA	2	10	390306	390315	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004432	AATAA	2	10	394376	394385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004432	TTTAT	2	10	395908	395917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004432	AATAA	2	10	406569	406578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004432	AAACA	2	10	410317	410326	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_004432	AATAA	2	10	412801	412810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004432	ATTAA	2	10	412816	412825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004432	ATTTT	2	10	416125	416134	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004432	TAATC	2	10	416185	416194	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_004432	TTATT	2	10	417599	417608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004432	ATATT	2	10	417662	417671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004432	AATTT	2	10	417717	417726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004432	TTAAA	2	10	420709	420718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004432	AGGTA	2	10	421460	421469	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004432	CTTTA	2	10	437663	437672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_004432	AATTA	2	10	444259	444268	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004432	TTTTA	2	10	445372	445381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004432	TAGCT	2	10	451534	451543	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_004432	TTAAA	2	10	452184	452193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004432	TTTAA	2	10	455023	455032	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004432	AAACC	2	10	473200	473209	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_004432	GGTTT	2	10	473220	473229	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004432	TAATA	2	10	475062	475071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004432	ATTTA	2	10	478533	478542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004432	ATATA	2	10	479104	479113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004432	CCAGC	2	10	479312	479321	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_004432	TAAAT	2	10	481016	481025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004432	TTAGA	2	10	485770	485779	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004432	ATAAA	2	10	490665	490674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004432	AAGGT	2	10	508921	508930	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004432	ACTAA	2	10	526445	526454	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_004432	TATTT	2	10	528412	528421	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004432	TAATA	2	10	528773	528782	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004432	ATTTT	2	10	532482	532491	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004432	TTTAA	2	10	536244	536253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004432	TAAAA	2	10	548777	548786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004432	ATTTT	2	10	555466	555475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004432	TTTAT	2	10	567740	567749	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004432	TAATT	2	10	569657	569666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004432	CAAAT	2	10	571814	571823	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_004432	AATTA	2	10	575448	575457	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004432	TTATC	2	10	578346	578355	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_004432	TAAAT	2	10	578421	578430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004432	TTTTA	2	10	602523	602532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004432	TAAAA	2	10	609922	609931	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004432	AAAAT	2	10	612386	612395	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004432	TTTTA	2	10	623434	623443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004432	TAAAA	2	10	624682	624691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004432	ATTAA	2	10	627523	627532	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004432	TTAAT	2	10	637728	637737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004432	ATTAA	2	10	640777	640786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004432	ATTAT	2	10	644557	644566	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004432	TTTTA	2	10	654187	654196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004432	ATTTT	2	10	671683	671692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004432	TTCTT	2	10	676968	676977	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_004432	ATTTA	2	10	678371	678380	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004432	TAAAT	2	10	678424	678433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004432	TTAAA	2	10	680477	680486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004432	TTAAA	2	10	682967	682976	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004432	AAATT	2	10	685773	685782	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004432	ATTAT	2	10	686647	686656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004432	ATAAA	2	10	688562	688571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004432	TATTT	2	10	691684	691693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004432	AATTA	2	10	691764	691773	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004432	ATTCT	2	10	699300	699309	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_004432	TTTTA	2	10	700194	700203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004432	TTTAA	2	10	709362	709371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004432	ATTTT	2	10	710767	710776	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004432	TTAAA	2	10	715791	715800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004432	ATAAA	2	10	719765	719774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004432	ATTTC	2	10	722495	722504	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_004432	AATTT	2	10	731616	731625	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004432	TATTT	2	10	740557	740566	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004432	TTTAA	2	10	768188	768197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004432	AAGAT	2	10	776621	776630	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004432	TAAAT	2	10	789861	789870	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004432	ATTTT	2	10	790519	790528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004432	ATTTA	2	10	791183	791192	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004432	AAATT	2	10	791218	791227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004432	ATTAA	2	10	793427	793436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004432	TTATT	2	10	793448	793457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004432	ATTTT	2	10	795758	795767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004432	ACCAA	2	10	797972	797981	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_004432	TTAAA	2	10	801286	801295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004432	ATTTT	2	10	804004	804013	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004432	TAAAT	2	10	819561	819570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004432	AATTT	2	10	835422	835431	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004432	AAATT	2	10	843966	843975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004432	TTTTA	2	10	844001	844010	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.