MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium efficiens YS-314 chromosome

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004369	CACTCA	2	12	65298	65309	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004369	TGCCGG	2	12	94225	94236	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004369	GTCCCC	2	12	100465	100476	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_004369	CCCGCG	2	12	101942	101953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_004369	CCCCCG	2	12	119027	119038	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
6	NC_004369	CCGCCC	2	12	162314	162325	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
7	NC_004369	CTATAC	2	12	266039	266050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_004369	GGCGCT	2	12	289943	289954	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004369	TTCCCG	2	12	301037	301048	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_004369	GCCGGG	2	12	315732	315743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_004369	GAGGTG	2	12	426370	426381	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004369	GCCCAC	2	12	426423	426434	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_004369	TCATTT	2	12	443962	443973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_004369	GGTATT	2	12	449873	449884	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004369	CGGGGT	2	12	502020	502031	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_004369	GCCGGG	2	12	521752	521763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004369	GCCGGG	2	12	521913	521924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_004369	TGCGGG	2	12	525969	525980	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_004369	TCAGGC	2	12	531272	531283	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004369	ATGTAT	2	12	545224	545235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004369	CACCCG	2	12	558133	558144	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_004369	CGGGGG	2	12	561676	561687	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_004369	CCTGCG	2	12	656843	656854	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_004369	CGTTTC	2	12	686101	686112	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004369	CGCCCC	2	12	709385	709396	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
26	NC_004369	GCGTTG	2	12	770609	770620	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_004369	GGCCGT	2	12	878890	878901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004369	TTGTGG	2	12	936151	936162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004369	TTCACA	2	12	958401	958412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_004369	TAACAA	2	12	962479	962490	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_004369	CCCGTC	2	12	975127	975138	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_004369	ACTGCG	2	12	1059760	1059771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_004369	ACTTCT	2	12	1084422	1084433	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_004369	GGGGGA	2	12	1148556	1148567	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004369	GTGGGG	2	12	1227596	1227607	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004369	GTCTTT	2	12	1290678	1290689	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_004369	GGGGGA	2	12	1374881	1374892	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004369	TCGGGG	2	12	1407946	1407957	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_004369	CAGGGC	2	12	1425645	1425656	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_004369	GACCAC	2	12	1441483	1441494	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_004369	TCCTCA	2	12	1441574	1441585	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_004369	CTTAAA	2	12	1486375	1486386	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_004369	GACCCC	2	12	1497761	1497772	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_004369	TTCCCG	2	12	1594252	1594263	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_004369	TTGTGG	2	12	1615627	1615638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004369	CGGTGG	2	12	1680473	1680484	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_004369	CAGCCC	2	12	1707972	1707983	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_004369	CACCGT	2	12	1713172	1713183	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_004369	CCCGCC	2	12	1778728	1778739	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
50	NC_004369	GTAGAA	2	12	1795119	1795130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004369	TCCCCC	2	12	1798903	1798914	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
52	NC_004369	CGGCCA	2	12	1851291	1851302	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_004369	CCCCCG	2	12	1870583	1870594	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
54	NC_004369	TCCCCG	2	12	1910060	1910071	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_004369	GGTGCA	2	12	2004074	2004085	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_004369	CCCCGG	2	12	2011638	2011649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_004369	ACACCG	2	12	2039470	2039481	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_004369	GAATCA	2	12	2041074	2041085	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_004369	CCCGCC	2	12	2042019	2042030	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
60	NC_004369	GTCAAG	2	12	2120398	2120409	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_004369	ACCGGG	2	12	2130877	2130888	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_004369	CGGTGG	2	12	2186818	2186829	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_004369	CACCCT	2	12	2215189	2215200	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_004369	TCCGCG	2	12	2232932	2232943	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_004369	CCGGGG	2	12	2239814	2239825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_004369	CCCCCG	2	12	2244942	2244953	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
67	NC_004369	ATGGGG	2	12	2245204	2245215	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004369	AACCCC	2	12	2290146	2290157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_004369	CCCCTG	2	12	2291470	2291481	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_004369	ACAGGC	2	12	2324530	2324541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004369	GAACCT	2	12	2327650	2327661	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004369	CAGAAA	2	12	2387372	2387383	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_004369	CATGGT	2	12	2462498	2462509	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_004369	GCAATG	2	12	2505228	2505239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_004369	GGGGAT	2	12	2575437	2575448	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004369	ACCACA	2	12	2595597	2595608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_004369	CCAACA	2	12	2598519	2598530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_004369	AATCCC	2	12	2623180	2623191	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_004369	GCGCTT	2	12	2690761	2690772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_004369	CGGGCC	2	12	2712712	2712723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_004369	CCCACC	2	12	2794367	2794378	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
82	NC_004369	CCCCGA	2	12	2828916	2828927	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_004369	GGCAGG	2	12	2884293	2884304	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_004369	CCCCTG	2	12	2944526	2944537	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_004369	GACACG	2	12	2971248	2971259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_004369	ACCACA	2	12	2978113	2978124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_004369	ACCACA	2	12	2986988	2986999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_004369	ACACCC	2	12	3107706	3107717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_004369	CGAGGT	2	12	3120697	3120708	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_004369	ACTGCC	2	12	3137596	3137607	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.