MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae NEM316

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004368	ATGAAG	2	12	16063	16074	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004368	TAAGGA	2	12	18026	18037	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004368	ACTAAT	2	12	21178	21189	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_004368	TAAGGA	2	12	23858	23869	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004368	ACTAAT	2	12	27010	27021	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_004368	ATTAAT	2	12	28638	28649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004368	ATCAAA	2	12	49681	49692	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_004368	TAAGGA	2	12	92977	92988	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004368	ACTAAT	2	12	96129	96140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_004368	TTCGGG	2	12	97014	97025	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_004368	TTAAAA	2	12	143289	143300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004368	TTAAAT	2	12	154686	154697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004368	TAAGGA	2	12	166693	166704	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004368	ACTAAT	2	12	169845	169856	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_004368	TATTAG	2	12	193642	193653	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004368	TGAAAA	2	12	203301	203312	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004368	AAATAA	2	12	228570	228581	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004368	AAAATG	2	12	236696	236707	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004368	AGCTAA	2	12	243861	243872	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_004368	AGGATT	2	12	247899	247910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004368	TAAGGA	2	12	253330	253341	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004368	ACTAAT	2	12	256482	256493	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_004368	TTCGGG	2	12	257367	257378	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_004368	TAAAAA	2	12	264132	264143	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004368	TAAGGA	2	12	352064	352075	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004368	ACTAAT	2	12	355216	355227	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_004368	ATAGTT	2	12	368624	368635	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004368	CTGATA	2	12	388916	388927	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_004368	AAGTTT	2	12	449902	449913	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004368	TAAGGA	2	12	468285	468296	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004368	ACTAAT	2	12	471437	471448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_004368	CAAAGT	2	12	493015	493026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_004368	TGGAAG	2	12	508239	508250	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004368	CTTTGA	2	12	519352	519363	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_004368	AGAATC	2	12	535056	535067	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_004368	TTTATA	2	12	538426	538437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004368	ATAATG	2	12	574275	574286	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004368	TATCGT	2	12	642630	642641	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_004368	ATTACC	2	12	654492	654503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_004368	CAAGCT	2	12	655003	655014	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_004368	TTTAAA	2	12	661285	661296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004368	ATCTTA	2	12	680713	680724	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_004368	AGATAA	2	12	690264	690275	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004368	CTGATA	2	12	714983	714994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_004368	AGGACT	2	12	831785	831796	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_004368	TTTTTA	2	12	870527	870538	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004368	TTTAGT	2	12	871298	871309	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004368	AAAACA	2	12	876477	876488	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_004368	AAAGAT	2	12	945707	945718	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004368	TAAGAT	2	12	975058	975069	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004368	ACAATA	2	12	987449	987460	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_004368	TTAAAA	2	12	988936	988947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004368	AAAAAT	2	12	1012993	1013004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004368	TATCAG	2	12	1056923	1056934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_004368	ATTTCT	2	12	1102567	1102578	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_004368	GTTTTG	2	12	1103981	1103992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004368	GCAATG	2	12	1104144	1104155	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_004368	TCATTT	2	12	1130690	1130701	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_004368	AAAAAT	2	12	1181351	1181362	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004368	AATTAA	2	12	1200048	1200059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004368	ATTTTA	2	12	1224679	1224690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004368	GAATTT	2	12	1257412	1257423	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004368	CCCGAA	2	12	1262836	1262847	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004368	ATACCA	2	12	1355983	1355994	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_004368	TTCTTT	2	12	1356612	1356623	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_004368	ACAGAA	2	12	1364137	1364148	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_004368	CGCTAT	2	12	1410154	1410165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_004368	ATCATT	2	12	1473448	1473459	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_004368	TTGCAA	2	12	1523047	1523058	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_004368	TTTCTC	2	12	1581364	1581375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004368	ACTCCA	2	12	1625877	1625888	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_004368	TTTTCT	2	12	1630089	1630100	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_004368	AAAAAT	2	12	1674032	1674043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004368	ATTTCA	2	12	1725300	1725311	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_004368	TTTTAT	2	12	1787745	1787756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004368	ATTTTT	2	12	1818623	1818634	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004368	CTTTAT	2	12	1819400	1819411	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_004368	TTTCAT	2	12	1840115	1840126	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_004368	AAAAGT	2	12	1877022	1877033	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004368	TTCAAT	2	12	1924178	1924189	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_004368	TTTTTG	2	12	1990113	1990124	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004368	AACTTG	2	12	1996557	1996568	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_004368	AGAAAC	2	12	2045758	2045769	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_004368	TATCAA	2	12	2046684	2046695	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_004368	GTTTTC	2	12	2054136	2054147	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_004368	TATTCT	2	12	2065281	2065292	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_004368	ATAGTT	2	12	2119258	2119269	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004368	TTCAAG	2	12	2119420	2119431	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_004368	TAAAAA	2	12	2137455	2137466	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004368	CCAAAA	2	12	2150282	2150293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_004368	TTTTTA	2	12	2151124	2151135	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004368	TAAATT	2	12	2195344	2195355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004368	AATGTA	2	12	2195432	2195443	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004368	CTATAA	2	12	2209245	2209256	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.