MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae NEM316

Total Repeats: 1763

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004368	TGAAA	2	10	322	331	60 %	20 %	20 %	0 %	25010076
2	NC_004368	AAAAG	2	10	787	796	80 %	0 %	20 %	0 %	25010076
3	NC_004368	AAAAT	2	10	1521	1530	80 %	20 %	0 %	0 %	25010076
4	NC_004368	AAACT	2	10	2104	2113	60 %	20 %	0 %	20 %	25010077
5	NC_004368	CGATT	2	10	2731	2740	20 %	40 %	20 %	20 %	25010077
6	NC_004368	ACAGA	2	10	3006	3015	60 %	0 %	20 %	20 %	25010078
7	NC_004368	TAAAA	2	10	3335	3344	80 %	20 %	0 %	0 %	25010078
8	NC_004368	TGGTA	2	10	4673	4682	20 %	40 %	40 %	0 %	25010081
9	NC_004368	TTTAT	2	10	5922	5931	20 %	80 %	0 %	0 %	25010082
10	NC_004368	TGGGT	2	10	10472	10481	0 %	40 %	60 %	0 %	25010085
11	NC_004368	ACTAT	2	10	12997	13006	40 %	40 %	0 %	20 %	25010088
12	NC_004368	GGATA	2	10	13226	13235	40 %	20 %	40 %	0 %	25010088
13	NC_004368	TCGTG	2	10	17552	17561	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_004368	GTTAA	2	10	18307	18316	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004368	GGGAG	2	10	18826	18835	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004368	AGGGA	2	10	21037	21046	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004368	TCGTG	2	10	23384	23393	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_004368	GTTAA	2	10	24139	24148	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004368	GGGAG	2	10	24658	24667	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004368	AGGGA	2	10	26869	26878	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004368	ATTTT	2	10	32849	32858	20 %	80 %	0 %	0 %	25010094
22	NC_004368	TCAAT	2	10	33277	33286	40 %	40 %	0 %	20 %	25010094
23	NC_004368	CTTTT	2	10	33896	33905	0 %	80 %	0 %	20 %	25010095
24	NC_004368	AACGG	2	10	34994	35003	40 %	0 %	40 %	20 %	25010096
25	NC_004368	TGGTG	2	10	36017	36026	0 %	40 %	60 %	0 %	25010098
26	NC_004368	AAACC	2	10	38405	38414	60 %	0 %	0 %	40 %	25010099
27	NC_004368	AGCGA	2	10	40421	40430	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_004368	AGCAG	2	10	43337	43346	40 %	0 %	40 %	20 %	25010102
29	NC_004368	GGTCA	2	10	43701	43710	20 %	20 %	40 %	20 %	25010102
30	NC_004368	TTGGG	2	10	44702	44711	0 %	40 %	60 %	0 %	25010104
31	NC_004368	CTTTT	2	10	46236	46245	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_004368	AATGC	2	10	48649	48658	40 %	20 %	20 %	20 %	25010106
33	NC_004368	GAAAA	2	10	49913	49922	80 %	0 %	20 %	0 %	25010108
34	NC_004368	GTCAT	2	10	51543	51552	20 %	40 %	20 %	20 %	25010109
35	NC_004368	AATCA	2	10	53004	53013	60 %	20 %	0 %	20 %	25010111
36	NC_004368	AGTCT	2	10	53848	53857	20 %	40 %	20 %	20 %	25010112
37	NC_004368	GATGG	2	10	55486	55495	20 %	20 %	60 %	0 %	25010114
38	NC_004368	TCCTC	2	10	57614	57623	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_004368	GCAGG	2	10	59058	59067	20 %	0 %	60 %	20 %	25010117
40	NC_004368	CTCTA	2	10	59728	59737	20 %	40 %	0 %	40 %	25010118
41	NC_004368	TTGAC	2	10	60303	60312	20 %	40 %	20 %	20 %	25010119
42	NC_004368	TTAAA	2	10	61252	61261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004368	GTTAT	2	10	62126	62135	20 %	60 %	20 %	0 %	25010121
44	NC_004368	GACAC	2	10	62641	62650	40 %	0 %	20 %	40 %	25010121
45	NC_004368	TGAAA	2	10	66037	66046	60 %	20 %	20 %	0 %	25010124
46	NC_004368	TGTTT	2	10	66609	66618	0 %	80 %	20 %	0 %	25010125
47	NC_004368	TTTAC	2	10	67468	67477	20 %	60 %	0 %	20 %	25010127
48	NC_004368	GTTTT	2	10	68214	68223	0 %	80 %	20 %	0 %	25010127
49	NC_004368	TTTTA	2	10	68461	68470	20 %	80 %	0 %	0 %	25010127
50	NC_004368	GGTAT	2	10	70215	70224	20 %	40 %	40 %	0 %	25010128
51	NC_004368	AAATA	2	10	76887	76896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004368	GAAAA	2	10	79511	79520	80 %	0 %	20 %	0 %	25010137
53	NC_004368	TTTGG	2	10	79925	79934	0 %	60 %	40 %	0 %	25010138
54	NC_004368	TTCAC	2	10	80281	80290	20 %	40 %	0 %	40 %	25010139
55	NC_004368	GAAAT	2	10	81362	81371	60 %	20 %	20 %	0 %	25010141
56	NC_004368	AAGGA	2	10	82443	82452	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004368	TAAAT	2	10	85476	85485	60 %	40 %	0 %	0 %	25010151
58	NC_004368	TTCCA	2	10	86724	86733	20 %	40 %	0 %	40 %	25010153
59	NC_004368	TCCAA	2	10	86883	86892	40 %	20 %	0 %	40 %	25010153
60	NC_004368	GAATA	2	10	87454	87463	60 %	20 %	20 %	0 %	25010153
61	NC_004368	TCGTG	2	10	92503	92512	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_004368	GTTAA	2	10	93258	93267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004368	GGGAG	2	10	93777	93786	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004368	AGGGA	2	10	95988	95997	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004368	CTTTA	2	10	96500	96509	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_004368	ATCAA	2	10	98187	98196	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_004368	ATTTT	2	10	98756	98765	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004368	TTTAA	2	10	98848	98857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004368	TAAAG	2	10	100845	100854	60 %	20 %	20 %	0 %	25010165
70	NC_004368	TATAA	2	10	101387	101396	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004368	ATTTG	2	10	101796	101805	20 %	60 %	20 %	0 %	25010166
72	NC_004368	GTTTG	2	10	103130	103139	0 %	60 %	40 %	0 %	25010168
73	NC_004368	ATCAA	2	10	105564	105573	60 %	20 %	0 %	20 %	25010171
74	NC_004368	TATGG	2	10	105822	105831	20 %	40 %	40 %	0 %	25010171
75	NC_004368	CATTA	2	10	109525	109534	40 %	40 %	0 %	20 %	25010173
76	NC_004368	TATTG	2	10	111622	111631	20 %	60 %	20 %	0 %	25010176
77	NC_004368	CTCTG	2	10	112604	112613	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_004368	AATAG	2	10	113223	113232	60 %	20 %	20 %	0 %	25010178
79	NC_004368	TAAAC	2	10	113589	113598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_004368	ATTTA	2	10	115931	115940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004368	AAAAC	2	10	116513	116522	80 %	0 %	0 %	20 %	25010181
82	NC_004368	ATTTT	2	10	117585	117594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004368	CTTTT	2	10	117629	117638	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_004368	AAAAT	2	10	119226	119235	80 %	20 %	0 %	0 %	25010183
85	NC_004368	CAAGT	2	10	120220	120229	40 %	20 %	20 %	20 %	25010184
86	NC_004368	TGCCA	2	10	122633	122642	20 %	20 %	20 %	40 %	25010186
87	NC_004368	TGGAT	2	10	124043	124052	20 %	40 %	40 %	0 %	25010187
88	NC_004368	TATAA	2	10	124523	124532	60 %	40 %	0 %	0 %	25010187
89	NC_004368	GTGAT	2	10	125839	125848	20 %	40 %	40 %	0 %	25010189
90	NC_004368	TTTGG	2	10	128721	128730	0 %	60 %	40 %	0 %	25010192
91	NC_004368	GAAAA	2	10	130773	130782	80 %	0 %	20 %	0 %	25010194
92	NC_004368	AGTCA	2	10	131334	131343	40 %	20 %	20 %	20 %	25010194
93	NC_004368	GGGTA	2	10	132918	132927	20 %	20 %	60 %	0 %	25010196
94	NC_004368	CTAAG	2	10	132943	132952	40 %	20 %	20 %	20 %	25010196
95	NC_004368	GAAAA	2	10	134167	134176	80 %	0 %	20 %	0 %	25010198
96	NC_004368	GATTT	2	10	134871	134880	20 %	60 %	20 %	0 %	25010198
97	NC_004368	AGTTA	2	10	135176	135185	40 %	40 %	20 %	0 %	25010198
98	NC_004368	TATGA	2	10	135477	135486	40 %	40 %	20 %	0 %	25010199
99	NC_004368	AAACC	2	10	139110	139119	60 %	0 %	0 %	40 %	25010202
100	NC_004368	ATAAA	2	10	141376	141385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004368	GATTC	2	10	142207	142216	20 %	40 %	20 %	20 %	25010205
102	NC_004368	GTTAA	2	10	142957	142966	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004368	ATTTT	2	10	143483	143492	20 %	80 %	0 %	0 %	25010206
104	NC_004368	TTGAT	2	10	145290	145299	20 %	60 %	20 %	0 %	25010207
105	NC_004368	TTTTG	2	10	145532	145541	0 %	80 %	20 %	0 %	25010207
106	NC_004368	AAGCA	2	10	145748	145757	60 %	0 %	20 %	20 %	25010207
107	NC_004368	ACTTT	2	10	148416	148425	20 %	60 %	0 %	20 %	25010209
108	NC_004368	GCTTT	2	10	150518	150527	0 %	60 %	20 %	20 %	25010211
109	NC_004368	AATAT	2	10	150792	150801	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004368	ATTAC	2	10	151508	151517	40 %	40 %	0 %	20 %	25010212
111	NC_004368	AAATT	2	10	152321	152330	60 %	40 %	0 %	0 %	25010213
112	NC_004368	ATCCT	2	10	152723	152732	20 %	40 %	0 %	40 %	25010213
113	NC_004368	AGTTT	2	10	153869	153878	20 %	60 %	20 %	0 %	25010214
114	NC_004368	ATACC	2	10	155896	155905	40 %	20 %	0 %	40 %	25010216
115	NC_004368	AGGTT	2	10	157892	157901	20 %	40 %	40 %	0 %	25010218
116	NC_004368	ATTTT	2	10	158234	158243	20 %	80 %	0 %	0 %	25010218
117	NC_004368	AATAG	2	10	158753	158762	60 %	20 %	20 %	0 %	25010218
118	NC_004368	AAAAC	2	10	160339	160348	80 %	0 %	0 %	20 %	25010219
119	NC_004368	TGGGG	2	10	160370	160379	0 %	20 %	80 %	0 %	25010219
120	NC_004368	AATTA	2	10	160677	160686	60 %	40 %	0 %	0 %	25010219
121	NC_004368	ATGAT	2	10	160792	160801	40 %	40 %	20 %	0 %	25010220
122	NC_004368	CAATC	2	10	164539	164548	40 %	20 %	0 %	40 %	25010223
123	NC_004368	TCGTG	2	10	166219	166228	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_004368	GTTAA	2	10	166974	166983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004368	GGGAG	2	10	167493	167502	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004368	AGGGA	2	10	169704	169713	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004368	TGTTA	2	10	170238	170247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004368	ATTGT	2	10	170429	170438	20 %	60 %	20 %	0 %	25010224
129	NC_004368	ATTAG	2	10	170542	170551	40 %	40 %	20 %	0 %	25010224
130	NC_004368	TTTTA	2	10	172798	172807	20 %	80 %	0 %	0 %	25010227
131	NC_004368	ATCTA	2	10	173937	173946	40 %	40 %	0 %	20 %	25010228
132	NC_004368	TTATT	2	10	174615	174624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004368	GATTG	2	10	178235	178244	20 %	40 %	40 %	0 %	25010230
134	NC_004368	GTCCT	2	10	186243	186252	0 %	40 %	20 %	40 %	25010232
135	NC_004368	ATTTT	2	10	187151	187160	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004368	AGCAA	2	10	187201	187210	60 %	0 %	20 %	20 %	25010234
137	NC_004368	CAAAA	2	10	189210	189219	80 %	0 %	0 %	20 %	25010236
138	NC_004368	AAAAT	2	10	190016	190025	80 %	20 %	0 %	0 %	25010238
139	NC_004368	AAGAT	2	10	190296	190305	60 %	20 %	20 %	0 %	25010239
140	NC_004368	TATTG	2	10	190517	190526	20 %	60 %	20 %	0 %	25010240
141	NC_004368	ATAGA	2	10	191925	191934	60 %	20 %	20 %	0 %	25010241
142	NC_004368	CTCCA	2	10	192317	192326	20 %	20 %	0 %	60 %	25010242
143	NC_004368	ACTAT	2	10	193264	193273	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_004368	AGGAT	2	10	193509	193518	40 %	20 %	40 %	0 %	25010243
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161	NC_004368	TAAAA	2	10	214135	214144	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_004368	GAGAT	2	10	214609	214618	40 %	20 %	40 %	0 %	25010266
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171	NC_004368	TCTAA	2	10	229762	229771	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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176	NC_004368	CTTTT	2	10	233229	233238	0 %	80 %	0 %	20 %	25010286
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180	NC_004368	TTGAT	2	10	237849	237858	20 %	60 %	20 %	0 %	25010293
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185	NC_004368	AAAGT	2	10	241664	241673	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_004368	ATATT	2	10	317592	317601	40 %	60 %	0 %	0 %	25010369
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261	NC_004368	CTATC	2	10	329019	329028	20 %	40 %	0 %	40 %	25010379
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271	NC_004368	TTTTA	2	10	341013	341022	20 %	80 %	0 %	0 %	25010392
272	NC_004368	ATTCT	2	10	341346	341355	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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