MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae NEM316

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004368	TCGTG	2	10	17552	17561	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_004368	GTTAA	2	10	18307	18316	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004368	GGGAG	2	10	18826	18835	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004368	AGGGA	2	10	21037	21046	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004368	TCGTG	2	10	23384	23393	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_004368	GTTAA	2	10	24139	24148	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004368	GGGAG	2	10	24658	24667	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004368	AGGGA	2	10	26869	26878	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004368	AGCGA	2	10	40421	40430	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_004368	CTTTT	2	10	46236	46245	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_004368	TCCTC	2	10	57614	57623	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_004368	TTAAA	2	10	61252	61261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004368	AAATA	2	10	76887	76896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004368	AAGGA	2	10	82443	82452	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004368	TCGTG	2	10	92503	92512	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_004368	GTTAA	2	10	93258	93267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004368	GGGAG	2	10	93777	93786	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004368	AGGGA	2	10	95988	95997	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004368	CTTTA	2	10	96500	96509	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_004368	ATCAA	2	10	98187	98196	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_004368	ATTTT	2	10	98756	98765	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004368	TTTAA	2	10	98848	98857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004368	TATAA	2	10	101387	101396	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004368	CTCTG	2	10	112604	112613	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_004368	TAAAC	2	10	113589	113598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_004368	ATTTA	2	10	115931	115940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004368	ATTTT	2	10	117585	117594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004368	CTTTT	2	10	117629	117638	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_004368	ATAAA	2	10	141376	141385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004368	GTTAA	2	10	142957	142966	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004368	AATAT	2	10	150792	150801	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004368	TCGTG	2	10	166219	166228	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_004368	GTTAA	2	10	166974	166983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004368	GGGAG	2	10	167493	167502	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004368	AGGGA	2	10	169704	169713	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004368	TGTTA	2	10	170238	170247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004368	TTATT	2	10	174615	174624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004368	ATTTT	2	10	187151	187160	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004368	ACTAT	2	10	193264	193273	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_004368	AGAAC	2	10	196921	196930	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_004368	TAAAA	2	10	214135	214144	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004368	AAAAT	2	10	229564	229573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004368	TCTAA	2	10	229762	229771	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_004368	ATAAA	2	10	231750	231759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004368	AAGAA	2	10	236806	236815	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004368	TTTAT	2	10	241373	241382	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004368	AAAGT	2	10	241664	241673	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004368	TTTAT	2	10	245172	245181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004368	AGATG	2	10	245547	245556	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004368	TGATA	2	10	245692	245701	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004368	TCGTG	2	10	252856	252865	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_004368	GTTAA	2	10	253611	253620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004368	GGGAG	2	10	254130	254139	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004368	AGGGA	2	10	256341	256350	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004368	CTTTA	2	10	256853	256862	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_004368	TTTTG	2	10	257780	257789	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004368	CCGCT	2	10	260899	260908	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_004368	ATATT	2	10	263500	263509	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004368	TAGAG	2	10	268644	268653	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004368	GTAGA	2	10	268679	268688	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004368	AAGTG	2	10	273497	273506	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004368	ATAAA	2	10	292041	292050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004368	ATTTA	2	10	313179	313188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004368	ATCAT	2	10	317478	317487	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_004368	ATTCT	2	10	341346	341355	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_004368	TCGTG	2	10	351590	351599	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_004368	GTTAA	2	10	352345	352354	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004368	GGGAG	2	10	352864	352873	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004368	AGGGA	2	10	355075	355084	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004368	TTTCA	2	10	375733	375742	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_004368	TTAAT	2	10	377482	377491	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004368	AGCAC	2	10	395423	395432	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_004368	TTTGT	2	10	417038	417047	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004368	TTTTA	2	10	434541	434550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004368	TAGAA	2	10	444602	444611	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004368	TTCAT	2	10	454194	454203	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_004368	ATTTT	2	10	459764	459773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004368	TCGTG	2	10	467811	467820	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_004368	GTTAA	2	10	468566	468575	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004368	GGGAG	2	10	469085	469094	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004368	AGGGA	2	10	471296	471305	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004368	AAAAT	2	10	476791	476800	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004368	AGTTG	2	10	481725	481734	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004368	TCAAG	2	10	492861	492870	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_004368	TTACC	2	10	493351	493360	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_004368	TCAAG	2	10	493833	493842	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004368	AGATT	2	10	496915	496924	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004368	AATTA	2	10	506768	506777	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004368	ATTTA	2	10	510206	510215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004368	TAGTA	2	10	515690	515699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004368	TGTTA	2	10	517156	517165	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004368	TTAGT	2	10	519294	519303	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004368	GAATG	2	10	535792	535801	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004368	TTTTG	2	10	542526	542535	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004368	TAGAA	2	10	546431	546440	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004368	ATATT	2	10	552286	552295	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004368	ATATA	2	10	562902	562911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004368	ATAGG	2	10	570208	570217	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004368	TAGAA	2	10	580340	580349	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004368	ATAAA	2	10	588020	588029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004368	AAGCC	2	10	592317	592326	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_004368	TTATC	2	10	593231	593240	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_004368	TTAGG	2	10	611613	611622	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004368	TAATA	2	10	615212	615221	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004368	TTATT	2	10	621263	621272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004368	AATAA	2	10	622559	622568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004368	CTTTT	2	10	622789	622798	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_004368	TTGAT	2	10	631899	631908	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004368	AATAC	2	10	639327	639336	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_004368	TACAA	2	10	640621	640630	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_004368	TTATT	2	10	641200	641209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004368	AAAAT	2	10	644810	644819	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004368	TTCTA	2	10	655287	655296	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_004368	ACTAT	2	10	655551	655560	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_004368	ATTTT	2	10	661456	661465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004368	TATTC	2	10	673582	673591	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_004368	TAAAT	2	10	677347	677356	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004368	ATTAA	2	10	677367	677376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004368	ATATG	2	10	677418	677427	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004368	TAGCT	2	10	699583	699592	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_004368	GGAGA	2	10	706875	706884	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004368	AGCAC	2	10	721490	721499	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_004368	TTTGT	2	10	743105	743114	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004368	CATAT	2	10	779212	779221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_004368	GAAAA	2	10	779364	779373	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004368	GTTCA	2	10	783200	783209	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_004368	ATACT	2	10	784578	784587	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_004368	TTTTA	2	10	785279	785288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004368	GAAAT	2	10	794438	794447	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004368	TACTT	2	10	800299	800308	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_004368	TTAGA	2	10	807891	807900	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004368	CTTCT	2	10	814451	814460	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_004368	ATATC	2	10	837148	837157	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_004368	ATATA	2	10	843418	843427	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004368	TAAAA	2	10	859539	859548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004368	CTTAA	2	10	863723	863732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_004368	TAAAA	2	10	864108	864117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004368	AATTT	2	10	870603	870612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004368	TAGTA	2	10	874705	874714	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004368	TAATT	2	10	876497	876506	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004368	TAAAT	2	10	879261	879270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004368	TTAGT	2	10	882580	882589	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004368	ATTTG	2	10	897350	897359	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004368	GAAAG	2	10	899411	899420	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004368	ATTAA	2	10	903284	903293	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004368	AATAA	2	10	903405	903414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004368	ATTTT	2	10	909868	909877	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004368	TGAAT	2	10	917503	917512	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_004368	ATAAA	2	10	2202749	2202758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_004368	TAGGT	2	10	2208347	2208356	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.