MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae NEM316

Total Repeats: 31667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004368	TTG	2	6	83	88	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004368	TTC	2	6	95	100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004368	AAT	2	6	143	148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004368	GAA	2	6	167	172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004368	AAC	2	6	189	194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010076
6	NC_004368	CAG	2	6	240	245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25010076
7	NC_004368	CTC	2	6	275	280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	25010076
8	NC_004368	TTA	2	6	303	308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010076
9	NC_004368	CTA	2	6	662	667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010076
10	NC_004368	CTG	2	6	726	731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010076
11	NC_004368	TTA	2	6	738	743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010076
12	NC_004368	GAA	2	6	779	784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010076
13	NC_004368	TTC	2	6	875	880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010076
14	NC_004368	AGA	2	6	961	966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010076
15	NC_004368	CAC	2	6	1011	1016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	25010076
16	NC_004368	ATG	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010076
17	NC_004368	AGA	2	6	1264	1269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010076
18	NC_004368	TAA	2	6	1459	1464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010076
19	NC_004368	CTA	2	6	1648	1653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004368	TAC	2	6	1655	1660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004368	TCT	2	6	1720	1725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010077
22	NC_004368	ATT	2	6	1944	1949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010077
23	NC_004368	AAC	2	6	1990	1995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010077
24	NC_004368	ACA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010077
25	NC_004368	ATT	2	6	2124	2129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010077
26	NC_004368	TGC	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010077
27	NC_004368	CAA	2	6	2154	2159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010077
28	NC_004368	TAA	2	6	2279	2284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010077
29	NC_004368	GTT	2	6	2295	2300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010077
30	NC_004368	GAT	2	6	2340	2345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010077
31	NC_004368	TCT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010077
32	NC_004368	CCT	2	6	2453	2458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	25010077
33	NC_004368	TAA	2	6	2803	2808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010077
34	NC_004368	ATG	2	6	2886	2891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004368	TAA	2	6	2933	2938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010078
36	NC_004368	TTG	2	6	2953	2958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010078
37	NC_004368	GAT	2	6	3018	3023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010078
38	NC_004368	ATC	2	6	3070	3075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010078
39	NC_004368	AGG	2	6	3086	3091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	25010078
40	NC_004368	TTA	2	6	3146	3151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010078
41	NC_004368	ATT	2	6	3404	3409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010078
42	NC_004368	TTC	2	6	3413	3418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010078
43	NC_004368	CAG	2	6	3453	3458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25010078
44	NC_004368	TAT	2	6	3610	3615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010078
45	NC_004368	TAC	2	6	3635	3640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010078
46	NC_004368	TTG	2	6	3808	3813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010079
47	NC_004368	ATG	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010079
48	NC_004368	AAT	2	6	4002	4007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004368	AAT	2	6	4039	4044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004368	AGA	2	6	4088	4093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004368	GGT	2	6	4096	4101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004368	ATT	2	6	4344	4349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010080
53	NC_004368	CTA	2	6	4356	4361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010080
54	NC_004368	ATT	2	6	4362	4367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010080
55	NC_004368	TCT	2	6	4475	4480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_004368	TCT	2	6	4496	4501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_004368	ATA	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004368	CAG	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25010081
59	NC_004368	GCT	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010081
60	NC_004368	TAA	2	6	4811	4816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010081
61	NC_004368	TGA	3	9	4871	4879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010081
62	NC_004368	AGA	2	6	5117	5122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010081
63	NC_004368	GTT	2	6	5133	5138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010081
64	NC_004368	AAC	2	6	5156	5161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010081
65	NC_004368	TGA	2	6	5189	5194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010081
66	NC_004368	TGA	2	6	5213	5218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010081
67	NC_004368	AGT	2	6	5270	5275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010081
68	NC_004368	GAA	3	9	5295	5303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010081
69	NC_004368	TGA	3	9	5315	5323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010081
70	NC_004368	GCT	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010081
71	NC_004368	ATC	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010081
72	NC_004368	CTG	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010081
73	NC_004368	GCT	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010081
74	NC_004368	TAT	2	6	5492	5497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010081
75	NC_004368	ATG	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010081
76	NC_004368	AAG	2	6	5584	5589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010081
77	NC_004368	GAA	2	6	5604	5609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010081
78	NC_004368	TAA	2	6	5667	5672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004368	TTA	2	6	5709	5714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004368	TTG	2	6	5763	5768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010082
81	NC_004368	ATA	2	6	5808	5813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010082
82	NC_004368	AGA	2	6	5866	5871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010082
83	NC_004368	ACT	2	6	5939	5944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010082
84	NC_004368	ACA	2	6	5991	5996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010082
85	NC_004368	GAT	2	6	6026	6031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010082
86	NC_004368	CTG	2	6	6075	6080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010082
87	NC_004368	TAT	2	6	6103	6108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010082
88	NC_004368	TTA	2	6	6180	6185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010082
89	NC_004368	ATG	2	6	6213	6218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010082
90	NC_004368	ATT	3	9	6264	6272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010082
91	NC_004368	ATT	2	6	6336	6341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010083
92	NC_004368	GTG	2	6	6355	6360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	25010083
93	NC_004368	TGA	2	6	6567	6572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010083
94	NC_004368	GCA	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25010083
95	NC_004368	TTC	2	6	6904	6909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010083
96	NC_004368	CAG	2	6	6992	6997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25010083
97	NC_004368	ATT	2	6	7003	7008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010083
98	NC_004368	TCG	2	6	7140	7145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010083
99	NC_004368	TGA	2	6	7218	7223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010083
100	NC_004368	ACA	2	6	7293	7298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010083
101	NC_004368	CTT	2	6	7371	7376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010083
102	NC_004368	TCA	2	6	7422	7427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010083
103	NC_004368	TTG	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010083
104	NC_004368	TTG	2	6	7637	7642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010083
105	NC_004368	TGT	2	6	7800	7805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010083
106	NC_004368	ATG	2	6	7991	7996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010083
107	NC_004368	AGA	2	6	8037	8042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010083
108	NC_004368	TGA	2	6	8049	8054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010083
109	NC_004368	TTG	2	6	8056	8061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010083
110	NC_004368	ATA	2	6	8114	8119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010083
111	NC_004368	ATT	2	6	8226	8231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010083
112	NC_004368	GTT	3	9	8308	8316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010083
113	NC_004368	CAA	2	6	8324	8329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010083
114	NC_004368	CAG	2	6	8341	8346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25010083
115	NC_004368	ATT	3	9	8470	8478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010083
116	NC_004368	TGT	2	6	8505	8510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010083
117	NC_004368	TGA	2	6	8538	8543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010083
118	NC_004368	TAT	2	6	8757	8762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010083
119	NC_004368	AGG	2	6	8778	8783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	25010083
120	NC_004368	AAT	2	6	8961	8966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010083
121	NC_004368	TTG	2	6	9005	9010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010083
122	NC_004368	GTG	2	6	9212	9217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	25010083
123	NC_004368	CCA	2	6	9305	9310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	25010083
124	NC_004368	CAG	2	6	9380	9385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25010083
125	NC_004368	TAG	2	6	9572	9577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010083
126	NC_004368	ATT	2	6	9644	9649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010083
127	NC_004368	GTT	2	6	9712	9717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010083
128	NC_004368	ATT	2	6	9748	9753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010083
129	NC_004368	GAA	2	6	9754	9759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010083
130	NC_004368	AGA	2	6	9810	9815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010083
131	NC_004368	AAG	2	6	9874	9879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004368	TTA	2	6	9950	9955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004368	TAG	2	6	10073	10078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004368	ATC	2	6	10103	10108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_004368	CGT	2	6	10152	10157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010084
136	NC_004368	AAG	2	6	10168	10173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010084
137	NC_004368	TCA	2	6	10218	10223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010084
138	NC_004368	TAA	2	6	10265	10270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010084
139	NC_004368	TTG	2	6	10272	10277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010084
140	NC_004368	ATT	2	6	10341	10346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010084
141	NC_004368	TGT	2	6	10383	10388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010085
142	NC_004368	GAG	2	6	10444	10449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	25010085
143	NC_004368	CGT	2	6	10555	10560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010085
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145	NC_004368	TAT	2	6	10681	10686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010085
146	NC_004368	AAT	2	6	10736	10741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010085
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150	NC_004368	CTT	2	6	10894	10899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010087
151	NC_004368	GAG	2	6	10943	10948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	25010087
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154	NC_004368	CTT	2	6	11265	11270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010087
155	NC_004368	AAT	2	6	11318	11323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010087
156	NC_004368	TAG	2	6	11349	11354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010087
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158	NC_004368	AAG	2	6	11457	11462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010087
159	NC_004368	TAT	2	6	11463	11468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010087
160	NC_004368	ATA	2	6	11478	11483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010087
161	NC_004368	CAA	2	6	11784	11789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010087
162	NC_004368	TTA	2	6	11800	11805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010087
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164	NC_004368	ATG	2	6	11912	11917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010087
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166	NC_004368	ATA	2	6	11976	11981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010087
167	NC_004368	ATG	2	6	12048	12053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010087
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169	NC_004368	TAT	2	6	12082	12087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010087
170	NC_004368	ATC	2	6	12106	12111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010087
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173	NC_004368	ATA	2	6	12160	12165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010087
174	NC_004368	TCA	2	6	12215	12220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010088
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188	NC_004368	ATT	2	6	13200	13205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010088
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243	NC_004368	TAA	2	6	15775	15780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010090
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247	NC_004368	TCA	2	6	15987	15992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_004368	AAG	2	6	16091	16096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_004368	CAA	2	6	16137	16142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_004368	ATA	2	6	16166	16171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_004368	AAC	2	6	16285	16290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_004368	GGC	2	6	16513	16518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_004368	TGA	2	6	16569	16574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_004368	CGA	2	6	16758	16763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_004368	GCA	2	6	16832	16837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_004368	CGC	2	6	16879	16884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
257	NC_004368	TGT	2	6	16918	16923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_004368	AGA	2	6	16927	16932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_004368	CAG	2	6	17001	17006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_004368	GGA	2	6	17126	17131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
261	NC_004368	GGA	2	6	17191	17196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_004368	GGT	2	6	17529	17534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_004368	ATG	2	6	30152	30157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010091
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