MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus mutans UA159 chromosome

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004350	TTTTGT	2	12	1	12	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004350	GGAATA	2	12	14685	14696	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004350	TTACGT	2	12	19431	19442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_004350	GGTAAA	2	12	40561	40572	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004350	TTTTAG	2	12	43048	43059	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004350	TGGATT	2	12	71355	71366	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004350	AATAAG	2	12	92030	92041	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004350	ATGAGA	2	12	131122	131133	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004350	TATGAT	2	12	145091	145102	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004350	TCTTTT	2	12	156978	156989	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_004350	ATCGTT	2	12	162611	162622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_004350	TTTAAG	2	12	185407	185418	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004350	TTACGT	2	12	188303	188314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_004350	TTCGGG	2	12	191564	191575	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_004350	CAAAAA	2	12	202444	202455	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_004350	TAATCT	2	12	228358	228369	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_004350	CGATTT	2	12	249818	249829	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_004350	AAATTT	2	12	268630	268641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004350	AATGTT	2	12	276273	276284	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004350	TCTTTT	2	12	301042	301053	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_004350	AATTTT	2	12	302176	302187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004350	CTTTTG	2	12	307380	307391	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_004350	AAGTCA	2	12	313100	313111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_004350	TGAAAT	2	12	333850	333861	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004350	TTACTA	2	12	349126	349137	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_004350	GCTTAG	2	12	349936	349947	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_004350	TTAATT	2	12	384431	384442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004350	TCCATC	2	12	396253	396264	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_004350	TTTAAT	2	12	401832	401843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004350	ATTTTT	2	12	401999	402010	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004350	ACTTTT	2	12	426303	426314	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_004350	GATGAC	2	12	435840	435851	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_004350	AGAAAC	2	12	445859	445870	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_004350	AGGAGA	2	12	460781	460792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004350	CTGATA	2	12	484434	484445	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_004350	AATTTT	2	12	494938	494949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004350	ACATTT	2	12	496570	496581	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_004350	AACTAT	2	12	497492	497503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_004350	TAATAG	2	12	514253	514264	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004350	AATTTT	2	12	523763	523774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004350	AAAAGC	2	12	576852	576863	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_004350	GAGATC	2	12	578693	578704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_004350	CTTTTT	2	12	596188	596199	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_004350	TATTTT	2	12	601142	601153	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004350	AATTTT	2	12	636018	636029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004350	GTTTTT	2	12	660602	660613	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004350	TCTTTT	2	12	681948	681959	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_004350	TGATTT	2	12	684706	684717	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004350	AAGTCC	2	12	692716	692727	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_004350	GGTTAC	2	12	703167	703178	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_004350	AGAATG	2	12	703714	703725	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004350	TCTTTT	2	12	707016	707027	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_004350	GATTTT	2	12	722219	722230	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004350	GTCTTC	2	12	723952	723963	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_004350	CTAAGG	2	12	738443	738454	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_004350	TTTGTT	2	12	763518	763529	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004350	GAGGTG	2	12	765753	765764	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004350	GTAATA	2	12	769302	769313	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004350	CTTTTT	2	12	798124	798135	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_004350	ATTAAT	2	12	821397	821408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004350	TATACA	2	12	821556	821567	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_004350	AGTTAT	2	12	821643	821654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004350	GGAGAT	2	12	899292	899303	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004350	TTCACT	2	12	931454	931465	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_004350	ATGTAG	2	12	932300	932311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004350	ATTACT	2	12	937756	937767	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_004350	CTAACT	2	12	955711	955722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_004350	GTAAAA	2	12	979556	979567	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004350	TTCACC	2	12	1015949	1015960	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_004350	TTAAAA	2	12	1021541	1021552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004350	AAATTA	2	12	1044151	1044162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004350	TAAAAA	2	12	1130705	1130716	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004350	ACTTAA	2	12	1130742	1130753	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_004350	CCCGAA	2	12	1142466	1142477	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_004350	GAAAGA	2	12	1149685	1149696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004350	CTTTCT	2	12	1196258	1196269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_004350	CCATAT	2	12	1250732	1250743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_004350	TTGTTA	2	12	1251998	1252009	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004350	CGATTT	2	12	1252061	1252072	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_004350	CAATAA	2	12	1254675	1254686	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_004350	TATTTA	2	12	1291459	1291470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004350	ACTTGA	2	12	1295246	1295257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_004350	ATATTT	3	18	1301013	1301030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004350	TAAAGC	2	12	1314567	1314578	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_004350	TCTTTA	2	12	1314579	1314590	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_004350	TTATAA	2	12	1338735	1338746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004350	TTAAAA	2	12	1341463	1341474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004350	AAAATT	2	12	1384281	1384292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004350	GCTAAA	2	12	1385424	1385435	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_004350	AATCTA	2	12	1387480	1387491	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_004350	CGTTTT	2	12	1420649	1420660	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_004350	ATTATC	2	12	1435145	1435156	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_004350	TGCCAT	2	12	1470273	1470284	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_004350	AAAAGA	2	12	1478963	1478974	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004350	CAATCA	2	12	1483018	1483029	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_004350	AATCAA	2	12	1533096	1533107	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_004350	TCTTTT	2	12	1552085	1552096	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_004350	TATTTT	2	12	1553541	1553552	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004350	TTTGAG	2	12	1563792	1563803	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004350	AAAAAG	2	12	1606147	1606158	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004350	ACTTTC	2	12	1606578	1606589	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_004350	AATTTC	2	12	1610818	1610829	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_004350	CTTTTT	2	12	1613619	1613630	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_004350	TGAAAA	2	12	1627533	1627544	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004350	TCTACG	2	12	1632590	1632601	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_004350	AAAAAT	2	12	1652272	1652283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004350	ACGTAA	2	12	1658193	1658204	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_004350	TCAGCC	2	12	1661891	1661902	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_004350	TTTTCT	2	12	1678495	1678506	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_004350	ACGTAA	2	12	1686495	1686506	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_004350	TTTCGC	2	12	1769846	1769857	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_004350	TAATGA	2	12	1781499	1781510	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004350	TTTACT	2	12	1793688	1793699	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_004350	AGCATT	2	12	1797779	1797790	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_004350	AGTAAG	2	12	1868276	1868287	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004350	ACGTAA	2	12	1875772	1875783	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_004350	ACGGAT	2	12	1895306	1895317	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_004350	AAAAGA	2	12	1915153	1915164	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004350	AAAAAG	2	12	1921242	1921253	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004350	CTTTTT	2	12	1930252	1930263	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_004350	AAAAAG	2	12	1952811	1952822	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004350	GTTTTA	2	12	1954981	1954992	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004350	TATAGT	2	12	1955277	1955288	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004350	CAATAA	2	12	1967345	1967356	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_004350	GCTGCC	2	12	1974184	1974195	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_004350	TAAAAA	2	12	1990731	1990742	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004350	TTAAAG	2	12	2005463	2005474	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004350	CATCTG	2	12	2005664	2005675	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_004350	AGCTCA	2	12	2010272	2010283	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_004350	TTTTTA	2	12	2025380	2025391	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.