MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 1281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004349	ATT	2	6	628	633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376232
2	NC_004349	AGC	2	6	683	688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376232
3	NC_004349	ATG	2	6	762	767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376232
4	NC_004349	GTG	2	6	883	888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376232
5	NC_004349	GAA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376232
6	NC_004349	TTG	2	6	1131	1136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376232
7	NC_004349	GCC	2	6	1463	1468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376232
8	NC_004349	TAA	2	6	2689	2694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376233
9	NC_004349	GAT	2	6	2867	2872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376233
10	NC_004349	ATA	2	6	2921	2926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376234
11	NC_004349	CAA	2	6	2974	2979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376234
12	NC_004349	GAA	2	6	2995	3000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376234
13	NC_004349	CAT	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376234
14	NC_004349	AAC	2	6	3184	3189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376234
15	NC_004349	GAA	2	6	3205	3210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376234
16	NC_004349	TAA	2	6	3233	3238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376234
17	NC_004349	TAC	2	6	3476	3481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376234
18	NC_004349	AGA	2	6	3499	3504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376234
19	NC_004349	CTT	2	6	3652	3657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376234
20	NC_004349	CAA	2	6	3680	3685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376234
21	NC_004349	GCA	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376234
22	NC_004349	ATT	2	6	3933	3938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376234
23	NC_004349	ATC	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376235
24	NC_004349	TTA	2	6	4128	4133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376235
25	NC_004349	TTA	2	6	4143	4148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376235
26	NC_004349	AGA	2	6	4212	4217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376235
27	NC_004349	TCT	2	6	4224	4229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376235
28	NC_004349	ATG	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376235
29	NC_004349	TAA	2	6	4582	4587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376235
30	NC_004349	TCA	2	6	4608	4613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376235
31	NC_004349	CAT	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376235
32	NC_004349	TGA	2	6	4766	4771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376235
33	NC_004349	AAG	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376235
34	NC_004349	ACA	2	6	4827	4832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376235
35	NC_004349	CAG	2	6	4969	4974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376235
36	NC_004349	AAC	2	6	4980	4985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376235
37	NC_004349	GTT	2	6	5064	5069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376235
38	NC_004349	TGG	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376235
39	NC_004349	AAT	2	6	5243	5248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376235
40	NC_004349	AAT	2	6	5302	5307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376235
41	NC_004349	AAT	2	6	5311	5316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376235
42	NC_004349	TAT	2	6	5522	5527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376235
43	NC_004349	TCA	2	6	5647	5652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376235
44	NC_004349	CAT	2	6	5722	5727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376236
45	NC_004349	AAC	2	6	5787	5792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376236
46	NC_004349	GGT	2	6	5900	5905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376236
47	NC_004349	CGG	2	6	5913	5918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376236
48	NC_004349	CTT	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118725020
49	NC_004349	GCT	2	6	6097	6102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725020
50	NC_004349	TCG	3	9	6168	6176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725020
51	NC_004349	GTT	2	6	6220	6225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725020
52	NC_004349	TTA	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725020
53	NC_004349	CTT	2	6	6294	6299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118725020
54	NC_004349	CCA	2	6	6344	6349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118725020
55	NC_004349	CAT	2	6	6379	6384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118725020
56	NC_004349	GCT	2	6	6462	6467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725020
57	NC_004349	TGG	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118725020
58	NC_004349	TCG	2	6	7180	7185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725021
59	NC_004349	CCG	2	6	7193	7198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118725021
60	NC_004349	GAA	2	6	7344	7349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118725021
61	NC_004349	TGG	2	6	7413	7418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118725021
62	NC_004349	AGC	2	6	7445	7450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118725021
63	NC_004349	CCG	2	6	7458	7463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118725021
64	NC_004349	GCT	2	6	7535	7540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725021
65	NC_004349	TTG	2	6	7669	7674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725021
66	NC_004349	CAC	2	6	7684	7689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118725021
67	NC_004349	CTA	2	6	7726	7731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118725021
68	NC_004349	TTG	2	6	7753	7758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725021
69	NC_004349	TGG	2	6	7799	7804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118725021
70	NC_004349	GCC	2	6	7833	7838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118725021
71	NC_004349	TTA	2	6	7885	7890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376239
72	NC_004349	GAA	2	6	8071	8076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376239
73	NC_004349	GTA	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376239
74	NC_004349	ATG	2	6	8401	8406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376239
75	NC_004349	ATT	2	6	8476	8481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376239
76	NC_004349	CGA	2	6	8490	8495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376239
77	NC_004349	ATT	2	6	8519	8524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376239
78	NC_004349	ATT	2	6	8600	8605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725022
79	NC_004349	GAA	2	6	8777	8782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118725022
80	NC_004349	GCA	2	6	8836	8841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376241
81	NC_004349	GCC	2	6	8932	8937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376241
82	NC_004349	TGC	2	6	8984	8989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376241
83	NC_004349	CAA	2	6	8995	9000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376241
84	NC_004349	GTT	2	6	9183	9188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376241
85	NC_004349	GCT	2	6	9212	9217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376241
86	NC_004349	ATT	2	6	9276	9281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376241
87	NC_004349	AGC	2	6	9500	9505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376242
88	NC_004349	CAC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24376242
89	NC_004349	CAG	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376242
90	NC_004349	GAT	2	6	9554	9559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376242
91	NC_004349	CCA	2	6	9861	9866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118725044
92	NC_004349	ACA	2	6	9898	9903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118725044
93	NC_004349	CAC	2	6	9907	9912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118725044
94	NC_004349	TAG	2	6	10110	10115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376243
95	NC_004349	GCC	2	6	10172	10177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376243
96	NC_004349	TAA	2	6	10319	10324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376243
97	NC_004349	CAC	2	6	10411	10416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24376243
98	NC_004349	TCA	2	6	10439	10444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376243
99	NC_004349	TTG	2	6	10492	10497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376243
100	NC_004349	GGC	2	6	10703	10708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376243
101	NC_004349	GCC	2	6	10712	10717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376243
102	NC_004349	GCC	2	6	10724	10729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376243
103	NC_004349	GTA	2	6	10730	10735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376243
104	NC_004349	GCC	2	6	10767	10772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376243
105	NC_004349	TTG	2	6	10801	10806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376243
106	NC_004349	CGG	2	6	10958	10963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376243
107	NC_004349	AGC	2	6	11004	11009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376243
108	NC_004349	GAT	2	6	11071	11076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376243
109	NC_004349	CAT	2	6	11080	11085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376243
110	NC_004349	CTT	2	6	11196	11201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376243
111	NC_004349	CGA	2	6	11220	11225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376243
112	NC_004349	TTA	2	6	11237	11242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376243
113	NC_004349	CAC	3	9	11248	11256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24376243
114	NC_004349	CAA	2	6	11319	11324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376243
115	NC_004349	ATC	2	6	11404	11409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376244
116	NC_004349	ACA	2	6	11451	11456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376244
117	NC_004349	GAT	2	6	11476	11481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376244
118	NC_004349	CAT	2	6	11568	11573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376244
119	NC_004349	TCA	2	6	11648	11653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376244
120	NC_004349	GCT	2	6	12358	12363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376245
121	NC_004349	TGC	2	6	12789	12794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376246
122	NC_004349	AGC	2	6	12860	12865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376246
123	NC_004349	GCT	2	6	12999	13004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376247
124	NC_004349	GCG	2	6	13049	13054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376247
125	NC_004349	GGC	2	6	13149	13154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376247
126	NC_004349	CGG	3	9	13291	13299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376247
127	NC_004349	ACC	2	6	13741	13746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24376247
128	NC_004349	ACT	2	6	13803	13808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376247
129	NC_004349	TTG	2	6	13846	13851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376247
130	NC_004349	AGG	2	6	13877	13882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24376247
131	NC_004349	GTC	2	6	14074	14079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376247
132	NC_004349	AGC	2	6	14202	14207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376247
133	NC_004349	TAC	2	6	14238	14243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376247
134	NC_004349	GCG	2	6	14252	14257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376247
135	NC_004349	TGA	2	6	14279	14284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376247
136	NC_004349	GGT	2	6	14437	14442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376247
137	NC_004349	GTA	2	6	14541	14546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376247
138	NC_004349	TGA	2	6	14597	14602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376247
139	NC_004349	TGC	2	6	14651	14656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376247
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143	NC_004349	CAT	2	6	14990	14995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376247
144	NC_004349	ATG	2	6	15010	15015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376247
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146	NC_004349	GCG	2	6	15090	15095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376247
147	NC_004349	CGG	2	6	15119	15124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376247
148	NC_004349	TGG	2	6	15169	15174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376247
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152	NC_004349	ATG	2	6	15448	15453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376247
153	NC_004349	TGT	2	6	15667	15672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376247
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156	NC_004349	GCA	2	6	15737	15742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376247
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160	NC_004349	GCG	2	6	15900	15905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376247
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164	NC_004349	TTG	2	6	16429	16434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376249
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253	NC_004349	CAA	2	6	28534	28539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118725026
254	NC_004349	AGC	2	6	28599	28604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118725026
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256	NC_004349	CAC	2	6	28772	28777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118725026
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383	NC_004349	TCA	2	6	41408	41413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376278
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411	NC_004349	TCA	2	6	45361	45366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118725030
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