MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004349	AT	3	6	1784	1789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004349	AC	3	6	1986	1991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_004349	TA	3	6	2628	2633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004349	TA	3	6	9392	9397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004349	CA	3	6	9996	10001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_004349	TG	3	6	10013	10018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004349	AC	3	6	11741	11746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_004349	AC	3	6	11894	11899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_004349	AT	3	6	12510	12515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004349	TA	3	6	19487	19492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004349	GC	3	6	22694	22699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004349	TG	3	6	24727	24732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004349	GT	3	6	24738	24743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004349	CG	3	6	35089	35094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_004349	TA	3	6	38301	38306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004349	TA	3	6	42460	42465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004349	AT	3	6	42676	42681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004349	AT	3	6	42773	42778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004349	GT	3	6	44178	44183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004349	TG	3	6	44909	44914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004349	TA	3	6	49683	49688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004349	TA	3	6	50789	50794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004349	GC	3	6	54127	54132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_004349	CA	3	6	56380	56385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_004349	AG	3	6	58575	58580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004349	CA	3	6	60173	60178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_004349	AT	3	6	61044	61049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004349	AT	3	6	61137	61142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004349	CA	3	6	61162	61167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_004349	CT	3	6	61761	61766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004349	TG	3	6	61944	61949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004349	AC	3	6	68935	68940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_004349	AC	3	6	71206	71211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_004349	AT	3	6	71755	71760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004349	TA	3	6	76669	76674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004349	CT	3	6	77569	77574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_004349	GT	3	6	87474	87479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004349	AT	3	6	87617	87622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004349	TA	3	6	87809	87814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004349	CT	3	6	87952	87957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_004349	TG	3	6	88492	88497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004349	AT	3	6	88644	88649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004349	TA	4	8	88691	88698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004349	AT	3	6	89154	89159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004349	CT	3	6	110390	110395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_004349	TG	3	6	110423	110428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004349	TG	3	6	110814	110819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004349	AT	3	6	111294	111299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004349	AT	3	6	111348	111353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004349	GA	3	6	111774	111779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004349	GA	3	6	112200	112205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004349	CT	3	6	117430	117435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_004349	GC	3	6	117653	117658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_004349	AT	3	6	118490	118495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004349	GC	4	8	120002	120009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_004349	AT	3	6	120483	120488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004349	TA	3	6	122024	122029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004349	GT	3	6	124827	124832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004349	TC	3	6	134250	134255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_004349	GT	4	8	140368	140375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004349	TA	3	6	151871	151876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004349	AC	3	6	155034	155039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_004349	TC	3	6	161312	161317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.