MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004349	AG	3	6	1304	1309	50 %	0 %	50 %	0 %	24376232
2	NC_004349	AT	3	6	2767	2772	50 %	50 %	0 %	0 %	24376233
3	NC_004349	CA	3	6	3264	3269	50 %	0 %	0 %	50 %	24376234
4	NC_004349	AT	3	6	4518	4523	50 %	50 %	0 %	0 %	24376235
5	NC_004349	TA	4	8	5011	5018	50 %	50 %	0 %	0 %	24376235
6	NC_004349	AT	4	8	5147	5154	50 %	50 %	0 %	0 %	24376235
7	NC_004349	CA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	0 %	50 %	24376235
8	NC_004349	AG	3	6	5436	5441	50 %	0 %	50 %	0 %	24376235
9	NC_004349	AC	3	6	7979	7984	50 %	0 %	0 %	50 %	24376239
10	NC_004349	AC	4	8	10922	10929	50 %	0 %	0 %	50 %	24376243
11	NC_004349	CA	3	6	10949	10954	50 %	0 %	0 %	50 %	24376243
12	NC_004349	AG	3	6	11017	11022	50 %	0 %	50 %	0 %	24376243
13	NC_004349	CA	3	6	11340	11345	50 %	0 %	0 %	50 %	24376244
14	NC_004349	GC	3	6	14528	14533	0 %	0 %	50 %	50 %	24376247
15	NC_004349	TC	3	6	20402	20407	0 %	50 %	0 %	50 %	118725023
16	NC_004349	GA	3	6	21413	21418	50 %	0 %	50 %	0 %	118725024
17	NC_004349	CG	3	6	23248	23253	0 %	0 %	50 %	50 %	24376259
18	NC_004349	TC	3	6	29225	29230	0 %	50 %	0 %	50 %	118725026
19	NC_004349	AG	3	6	30964	30969	50 %	0 %	50 %	0 %	24376268
20	NC_004349	TG	3	6	31152	31157	0 %	50 %	50 %	0 %	24376269
21	NC_004349	AC	4	8	33547	33554	50 %	0 %	0 %	50 %	24376272
22	NC_004349	AC	3	6	33871	33876	50 %	0 %	0 %	50 %	118725028
23	NC_004349	AG	3	6	35754	35759	50 %	0 %	50 %	0 %	118725029
24	NC_004349	TA	3	6	36242	36247	50 %	50 %	0 %	0 %	24376276
25	NC_004349	GC	3	6	36735	36740	0 %	0 %	50 %	50 %	24376276
26	NC_004349	AT	4	8	37305	37312	50 %	50 %	0 %	0 %	24376276
27	NC_004349	TA	3	6	42272	42277	50 %	50 %	0 %	0 %	24376278
28	NC_004349	AT	3	6	42297	42302	50 %	50 %	0 %	0 %	24376278
29	NC_004349	GA	3	6	45336	45341	50 %	0 %	50 %	0 %	118725030
30	NC_004349	TG	3	6	46823	46828	0 %	50 %	50 %	0 %	24376285
31	NC_004349	GT	3	6	46926	46931	0 %	50 %	50 %	0 %	24376285
32	NC_004349	GC	3	6	48788	48793	0 %	0 %	50 %	50 %	24376287
33	NC_004349	GA	3	6	48891	48896	50 %	0 %	50 %	0 %	24376287
34	NC_004349	GA	3	6	53104	53109	50 %	0 %	50 %	0 %	118725032
35	NC_004349	CT	3	6	55812	55817	0 %	50 %	0 %	50 %	24376296
36	NC_004349	GA	3	6	56725	56730	50 %	0 %	50 %	0 %	24376297
37	NC_004349	GT	3	6	59046	59051	0 %	50 %	50 %	0 %	24376300
38	NC_004349	GA	3	6	60657	60662	50 %	0 %	50 %	0 %	24376303
39	NC_004349	TG	3	6	66566	66571	0 %	50 %	50 %	0 %	24376309
40	NC_004349	TC	3	6	66757	66762	0 %	50 %	0 %	50 %	24376309
41	NC_004349	AT	3	6	67030	67035	50 %	50 %	0 %	0 %	24376309
42	NC_004349	GA	3	6	69589	69594	50 %	0 %	50 %	0 %	118725035
43	NC_004349	CT	3	6	74098	74103	0 %	50 %	0 %	50 %	24376315
44	NC_004349	GT	3	6	76049	76054	0 %	50 %	50 %	0 %	24376317
45	NC_004349	AC	3	6	78272	78277	50 %	0 %	0 %	50 %	24376319
46	NC_004349	CG	3	6	79075	79080	0 %	0 %	50 %	50 %	24376319
47	NC_004349	CT	3	6	79909	79914	0 %	50 %	0 %	50 %	24376320
48	NC_004349	CT	3	6	80100	80105	0 %	50 %	0 %	50 %	24376320
49	NC_004349	AT	3	6	80295	80300	50 %	50 %	0 %	0 %	24376320
50	NC_004349	AT	3	6	80398	80403	50 %	50 %	0 %	0 %	24376320
51	NC_004349	TC	3	6	82927	82932	0 %	50 %	0 %	50 %	118725036
52	NC_004349	CA	3	6	83304	83309	50 %	0 %	0 %	50 %	118725036
53	NC_004349	AG	3	6	86085	86090	50 %	0 %	50 %	0 %	24376324
54	NC_004349	AT	3	6	88799	88804	50 %	50 %	0 %	0 %	24376326
55	NC_004349	GA	3	6	89536	89541	50 %	0 %	50 %	0 %	24376327
56	NC_004349	TA	3	6	90100	90105	50 %	50 %	0 %	0 %	24376328
57	NC_004349	CT	3	6	90108	90113	0 %	50 %	0 %	50 %	24376328
58	NC_004349	AC	3	6	91364	91369	50 %	0 %	0 %	50 %	24376328
59	NC_004349	CT	3	6	91735	91740	0 %	50 %	0 %	50 %	24376328
60	NC_004349	GC	3	6	92480	92485	0 %	0 %	50 %	50 %	24376328
61	NC_004349	AC	3	6	95881	95886	50 %	0 %	0 %	50 %	24376329
62	NC_004349	CT	3	6	96252	96257	0 %	50 %	0 %	50 %	24376329
63	NC_004349	GC	3	6	96997	97002	0 %	0 %	50 %	50 %	24376329
64	NC_004349	TC	3	6	99829	99834	0 %	50 %	0 %	50 %	24376330
65	NC_004349	CG	3	6	100257	100262	0 %	0 %	50 %	50 %	24376330
66	NC_004349	AC	3	6	101804	101809	50 %	0 %	0 %	50 %	24376331
67	NC_004349	CT	3	6	102175	102180	0 %	50 %	0 %	50 %	24376331
68	NC_004349	GC	3	6	102920	102925	0 %	0 %	50 %	50 %	24376331
69	NC_004349	GT	3	6	106651	106656	0 %	50 %	50 %	0 %	24376334
70	NC_004349	CG	3	6	108513	108518	0 %	0 %	50 %	50 %	24376335
71	NC_004349	AT	3	6	109302	109307	50 %	50 %	0 %	0 %	24376337
72	NC_004349	TA	3	6	109333	109338	50 %	50 %	0 %	0 %	24376337
73	NC_004349	AC	3	6	113014	113019	50 %	0 %	0 %	50 %	24376339
74	NC_004349	AG	3	6	114078	114083	50 %	0 %	50 %	0 %	24376340
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80	NC_004349	CA	3	6	128042	128047	50 %	0 %	0 %	50 %	24376349
81	NC_004349	AG	3	6	128123	128128	50 %	0 %	50 %	0 %	24376349
82	NC_004349	GT	3	6	128652	128657	0 %	50 %	50 %	0 %	24376349
83	NC_004349	GT	3	6	130981	130986	0 %	50 %	50 %	0 %	24376351
84	NC_004349	AT	3	6	134976	134981	50 %	50 %	0 %	0 %	118725049
85	NC_004349	AT	3	6	135643	135648	50 %	50 %	0 %	0 %	118725050
86	NC_004349	CT	3	6	136636	136641	0 %	50 %	0 %	50 %	24376357
87	NC_004349	AT	3	6	136825	136830	50 %	50 %	0 %	0 %	24376357
88	NC_004349	AC	3	6	139228	139233	50 %	0 %	0 %	50 %	24376359
89	NC_004349	CT	3	6	140096	140101	0 %	50 %	0 %	50 %	24376360
90	NC_004349	TG	3	6	140256	140261	0 %	50 %	50 %	0 %	24376360
91	NC_004349	AT	3	6	141032	141037	50 %	50 %	0 %	0 %	24376361
92	NC_004349	GC	3	6	141195	141200	0 %	0 %	50 %	50 %	24376361
93	NC_004349	GT	3	6	141497	141502	0 %	50 %	50 %	0 %	24376361
94	NC_004349	GC	3	6	142540	142545	0 %	0 %	50 %	50 %	24376361
95	NC_004349	AG	3	6	144127	144132	50 %	0 %	50 %	0 %	118725042
96	NC_004349	GT	3	6	144561	144566	0 %	50 %	50 %	0 %	118725042
97	NC_004349	TG	3	6	145067	145072	0 %	50 %	50 %	0 %	118725042
98	NC_004349	GT	3	6	146072	146077	0 %	50 %	50 %	0 %	24376364
99	NC_004349	GT	3	6	146160	146165	0 %	50 %	50 %	0 %	24376364
100	NC_004349	GC	3	6	146402	146407	0 %	0 %	50 %	50 %	24376365
101	NC_004349	AG	3	6	146570	146575	50 %	0 %	50 %	0 %	24376365
102	NC_004349	TG	3	6	146856	146861	0 %	50 %	50 %	0 %	118725043
103	NC_004349	GT	3	6	149833	149838	0 %	50 %	50 %	0 %	24376369
104	NC_004349	GT	3	6	150684	150689	0 %	50 %	50 %	0 %	24376370
105	NC_004349	GC	3	6	154332	154337	0 %	0 %	50 %	50 %	24376372
106	NC_004349	GC	3	6	156885	156890	0 %	0 %	50 %	50 %	24376373
107	NC_004349	GA	3	6	160698	160703	50 %	0 %	50 %	0 %	24376378

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.