MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 297

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004349	T	6	6	163	168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004349	A	6	6	373	378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004349	A	6	6	1331	1336	100 %	0 %	0 %	0 %	24376232
4	NC_004349	A	7	7	1552	1558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004349	A	6	6	1674	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004349	A	7	7	1766	1772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004349	A	6	6	1958	1963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004349	A	6	6	2666	2671	100 %	0 %	0 %	0 %	24376233
9	NC_004349	A	6	6	3404	3409	100 %	0 %	0 %	0 %	24376234
10	NC_004349	T	6	6	3782	3787	0 %	100 %	0 %	0 %	24376234
11	NC_004349	T	7	7	3849	3855	0 %	100 %	0 %	0 %	24376234
12	NC_004349	A	7	7	3892	3898	100 %	0 %	0 %	0 %	24376234
13	NC_004349	T	7	7	3921	3927	0 %	100 %	0 %	0 %	24376234
14	NC_004349	T	6	6	4229	4234	0 %	100 %	0 %	0 %	24376235
15	NC_004349	T	7	7	5365	5371	0 %	100 %	0 %	0 %	24376235
16	NC_004349	A	6	6	5445	5450	100 %	0 %	0 %	0 %	24376235
17	NC_004349	T	6	6	5504	5509	0 %	100 %	0 %	0 %	24376235
18	NC_004349	T	7	7	6878	6884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004349	T	7	7	6979	6985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004349	T	6	6	7025	7030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004349	C	6	6	7033	7038	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_004349	A	7	7	7243	7249	100 %	0 %	0 %	0 %	118725021
23	NC_004349	T	6	6	9484	9489	0 %	100 %	0 %	0 %	24376242
24	NC_004349	T	6	6	9736	9741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004349	T	7	7	10866	10872	0 %	100 %	0 %	0 %	24376243
26	NC_004349	T	6	6	11140	11145	0 %	100 %	0 %	0 %	24376243
27	NC_004349	A	6	6	11615	11620	100 %	0 %	0 %	0 %	24376244
28	NC_004349	A	6	6	11854	11859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004349	A	7	7	11926	11932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004349	T	6	6	12033	12038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004349	C	6	6	12189	12194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_004349	T	6	6	12498	12503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004349	A	6	6	12932	12937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004349	T	6	6	17042	17047	0 %	100 %	0 %	0 %	24376250
35	NC_004349	C	7	7	17209	17215	0 %	0 %	0 %	100 %	24376250
36	NC_004349	T	6	6	17298	17303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004349	A	6	6	17567	17572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004349	A	6	6	17622	17627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004349	A	8	8	18943	18950	100 %	0 %	0 %	0 %	24376251
40	NC_004349	A	7	7	19476	19482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004349	T	7	7	19497	19503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004349	T	6	6	20426	20431	0 %	100 %	0 %	0 %	118725023
43	NC_004349	T	6	6	20668	20673	0 %	100 %	0 %	0 %	118725023
44	NC_004349	A	6	6	21147	21152	100 %	0 %	0 %	0 %	118725024
45	NC_004349	A	6	6	21389	21394	100 %	0 %	0 %	0 %	118725024
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49	NC_004349	A	6	6	27655	27660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004349	G	6	6	27759	27764	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004349	T	6	6	29249	29254	0 %	100 %	0 %	0 %	118725026
52	NC_004349	T	6	6	29491	29496	0 %	100 %	0 %	0 %	118725026
53	NC_004349	A	6	6	30090	30095	100 %	0 %	0 %	0 %	118725027
54	NC_004349	A	6	6	30557	30562	100 %	0 %	0 %	0 %	118725027
55	NC_004349	G	6	6	30679	30684	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004349	T	6	6	30699	30704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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72	NC_004349	T	6	6	33340	33345	0 %	100 %	0 %	0 %	24376272
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113	NC_004349	A	8	8	48647	48654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004349	A	6	6	48709	48714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.