MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 11815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004347	AATC	2	8	111	118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_004347	GTGG	2	8	604	611	0 %	25 %	75 %	0 %	24371601
3	NC_004347	TACA	2	8	1557	1564	50 %	25 %	0 %	25 %	24371602
4	NC_004347	TTAC	2	8	2193	2200	25 %	50 %	0 %	25 %	24371602
5	NC_004347	CGGT	2	8	2305	2312	0 %	25 %	50 %	25 %	24371602
6	NC_004347	TTGC	2	8	2325	2332	0 %	50 %	25 %	25 %	24371602
7	NC_004347	TTAC	2	8	2589	2596	25 %	50 %	0 %	25 %	414561717
8	NC_004347	ATAA	2	8	3049	3056	75 %	25 %	0 %	0 %	414561717
9	NC_004347	CTTG	2	8	3326	3333	0 %	50 %	25 %	25 %	414561717
10	NC_004347	ATAA	2	8	4088	4095	75 %	25 %	0 %	0 %	24371604
11	NC_004347	TGAT	2	8	4640	4647	25 %	50 %	25 %	0 %	24371604
12	NC_004347	TTGA	2	8	4949	4956	25 %	50 %	25 %	0 %	24371604
13	NC_004347	ACGC	2	8	4997	5004	25 %	0 %	25 %	50 %	24371604
14	NC_004347	TTGC	2	8	5262	5269	0 %	50 %	25 %	25 %	24371604
15	NC_004347	CTAT	2	8	5298	5305	25 %	50 %	0 %	25 %	24371604
16	NC_004347	TATT	2	8	5688	5695	25 %	75 %	0 %	0 %	24371605
17	NC_004347	TTGA	2	8	6034	6041	25 %	50 %	25 %	0 %	24371606
18	NC_004347	CAGT	2	8	6114	6121	25 %	25 %	25 %	25 %	24371606
19	NC_004347	GCAA	2	8	6155	6162	50 %	0 %	25 %	25 %	24371606
20	NC_004347	TTAA	2	8	6277	6284	50 %	50 %	0 %	0 %	24371607
21	NC_004347	ATGG	2	8	6969	6976	25 %	25 %	50 %	0 %	24371608
22	NC_004347	TTGG	2	8	7708	7715	0 %	50 %	50 %	0 %	24371608
23	NC_004347	GATT	2	8	7916	7923	25 %	50 %	25 %	0 %	24371608
24	NC_004347	TAAC	2	8	8101	8108	50 %	25 %	0 %	25 %	24371608
25	NC_004347	TCAC	2	8	8392	8399	25 %	25 %	0 %	50 %	24371609
26	NC_004347	TGAT	2	8	8688	8695	25 %	50 %	25 %	0 %	24371609
27	NC_004347	ACGT	2	8	8724	8731	25 %	25 %	25 %	25 %	24371609
28	NC_004347	ATGT	2	8	9347	9354	25 %	50 %	25 %	0 %	24371609
29	NC_004347	ATTT	2	8	9665	9672	25 %	75 %	0 %	0 %	24371610
30	NC_004347	CGTT	2	8	9686	9693	0 %	50 %	25 %	25 %	24371610
31	NC_004347	CGTG	2	8	11207	11214	0 %	25 %	50 %	25 %	24371611
32	NC_004347	TTTA	2	8	12239	12246	25 %	75 %	0 %	0 %	24371611
33	NC_004347	CAAT	2	8	12687	12694	50 %	25 %	0 %	25 %	24371611
34	NC_004347	TTGA	2	8	12738	12745	25 %	50 %	25 %	0 %	24371611
35	NC_004347	CTTG	2	8	12973	12980	0 %	50 %	25 %	25 %	24371611
36	NC_004347	GATA	2	8	13066	13073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004347	TTTG	2	8	13113	13120	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004347	TGGC	2	8	13207	13214	0 %	25 %	50 %	25 %	24371612
39	NC_004347	TAGG	2	8	13455	13462	25 %	25 %	50 %	0 %	24371612
40	NC_004347	GAGC	2	8	13508	13515	25 %	0 %	50 %	25 %	24371612
41	NC_004347	TCAG	2	8	14138	14145	25 %	25 %	25 %	25 %	414561718
42	NC_004347	ATTG	2	8	14346	14353	25 %	50 %	25 %	0 %	414561718
43	NC_004347	ATTT	2	8	14623	14630	25 %	75 %	0 %	0 %	414561718
44	NC_004347	TCAC	2	8	14848	14855	25 %	25 %	0 %	50 %	414561718
45	NC_004347	TTGG	2	8	15052	15059	0 %	50 %	50 %	0 %	414561718
46	NC_004347	TGCT	2	8	15411	15418	0 %	50 %	25 %	25 %	24371614
47	NC_004347	GGCG	2	8	15995	16002	0 %	0 %	75 %	25 %	24371614
48	NC_004347	ATGC	2	8	16005	16012	25 %	25 %	25 %	25 %	24371614
49	NC_004347	AAGA	2	8	17164	17171	75 %	0 %	25 %	0 %	24371614
50	NC_004347	GTCG	2	8	17958	17965	0 %	25 %	50 %	25 %	24371615
51	NC_004347	GCAG	2	8	18782	18789	25 %	0 %	50 %	25 %	24371616
52	NC_004347	TACA	2	8	19388	19395	50 %	25 %	0 %	25 %	414561719
53	NC_004347	GTTG	2	8	19684	19691	0 %	50 %	50 %	0 %	414561719
54	NC_004347	TTGA	2	8	20535	20542	25 %	50 %	25 %	0 %	414561719
55	NC_004347	AGCT	2	8	20543	20550	25 %	25 %	25 %	25 %	414561719
56	NC_004347	TTTG	2	8	20644	20651	0 %	75 %	25 %	0 %	414561719
57	NC_004347	CGTG	2	8	21740	21747	0 %	25 %	50 %	25 %	414561719
58	NC_004347	GAGG	2	8	22257	22264	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004347	GTGG	2	8	23438	23445	0 %	25 %	75 %	0 %	24371620
60	NC_004347	TGCG	2	8	23672	23679	0 %	25 %	50 %	25 %	24371620
61	NC_004347	TTAA	2	8	23863	23870	50 %	50 %	0 %	0 %	24371620
62	NC_004347	GCAC	2	8	24391	24398	25 %	0 %	25 %	50 %	24371620
63	NC_004347	TCTT	2	8	24836	24843	0 %	75 %	0 %	25 %	24371621
64	NC_004347	GCTG	2	8	25601	25608	0 %	25 %	50 %	25 %	24371621
65	NC_004347	TTGC	2	8	26643	26650	0 %	50 %	25 %	25 %	24371621
66	NC_004347	ATTT	2	8	26935	26942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004347	TCAT	2	8	27046	27053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_004347	ATTA	2	8	27204	27211	50 %	50 %	0 %	0 %	24371622
69	NC_004347	CCAA	2	8	27580	27587	50 %	0 %	0 %	50 %	24371622
70	NC_004347	GCGA	2	8	27636	27643	25 %	0 %	50 %	25 %	24371622
71	NC_004347	TGAT	2	8	27910	27917	25 %	50 %	25 %	0 %	24371622
72	NC_004347	TACT	2	8	28519	28526	25 %	50 %	0 %	25 %	24371623
73	NC_004347	GCCA	2	8	28551	28558	25 %	0 %	25 %	50 %	24371623
74	NC_004347	GTGC	2	8	28746	28753	0 %	25 %	50 %	25 %	24371623
75	NC_004347	TTAT	2	8	29234	29241	25 %	75 %	0 %	0 %	24371624
76	NC_004347	GGAC	2	8	29388	29395	25 %	0 %	50 %	25 %	24371624
77	NC_004347	ATCT	2	8	29657	29664	25 %	50 %	0 %	25 %	24371624
78	NC_004347	TTGG	2	8	29695	29702	0 %	50 %	50 %	0 %	24371624
79	NC_004347	GCTT	2	8	30395	30402	0 %	50 %	25 %	25 %	24371624
80	NC_004347	GCGG	2	8	30635	30642	0 %	0 %	75 %	25 %	24371625
81	NC_004347	ATTG	2	8	30710	30717	25 %	50 %	25 %	0 %	24371625
82	NC_004347	GATT	2	8	30932	30939	25 %	50 %	25 %	0 %	24371625
83	NC_004347	GACT	2	8	31292	31299	25 %	25 %	25 %	25 %	24371626
84	NC_004347	TCAC	2	8	31460	31467	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_004347	AATA	2	8	31968	31975	75 %	25 %	0 %	0 %	24371627
86	NC_004347	TGCT	2	8	32238	32245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_004347	AGCG	2	8	32523	32530	25 %	0 %	50 %	25 %	24371628
88	NC_004347	AAAC	2	8	32857	32864	75 %	0 %	0 %	25 %	24371628
89	NC_004347	AACG	2	8	33300	33307	50 %	0 %	25 %	25 %	24371628
90	NC_004347	ATAA	2	8	33666	33673	75 %	25 %	0 %	0 %	24371628
91	NC_004347	AATA	2	8	34177	34184	75 %	25 %	0 %	0 %	24371629
92	NC_004347	AGCC	2	8	34339	34346	25 %	0 %	25 %	50 %	24371629
93	NC_004347	CACC	2	8	35052	35059	25 %	0 %	0 %	75 %	24371629
94	NC_004347	CAGC	2	8	35385	35392	25 %	0 %	25 %	50 %	24371630
95	NC_004347	ATCT	2	8	35839	35846	25 %	50 %	0 %	25 %	24371630
96	NC_004347	AACC	2	8	35987	35994	50 %	0 %	0 %	50 %	24371630
97	NC_004347	TTTG	2	8	36204	36211	0 %	75 %	25 %	0 %	24371630
98	NC_004347	CAGC	2	8	36291	36298	25 %	0 %	25 %	50 %	24371630
99	NC_004347	TTTC	2	8	36501	36508	0 %	75 %	0 %	25 %	24371631
100	NC_004347	CATC	2	8	36950	36957	25 %	25 %	0 %	50 %	24371631
101	NC_004347	CGCC	2	8	36986	36993	0 %	0 %	25 %	75 %	24371631
102	NC_004347	ACAA	2	8	37468	37475	75 %	0 %	0 %	25 %	24371632
103	NC_004347	ACAG	2	8	37618	37625	50 %	0 %	25 %	25 %	24371632
104	NC_004347	AAAG	2	8	38137	38144	75 %	0 %	25 %	0 %	24371633
105	NC_004347	TCGC	2	8	39004	39011	0 %	25 %	25 %	50 %	24371633
106	NC_004347	GTTT	2	8	39391	39398	0 %	75 %	25 %	0 %	414561720
107	NC_004347	TTGT	2	8	39454	39461	0 %	75 %	25 %	0 %	414561720
108	NC_004347	TCTT	2	8	39816	39823	0 %	75 %	0 %	25 %	414561720
109	NC_004347	ACTC	2	8	40349	40356	25 %	25 %	0 %	50 %	24371635
110	NC_004347	TTGG	2	8	40397	40404	0 %	50 %	50 %	0 %	24371635
111	NC_004347	CATT	2	8	40461	40468	25 %	50 %	0 %	25 %	24371635
112	NC_004347	TGAT	2	8	40576	40583	25 %	50 %	25 %	0 %	24371635
113	NC_004347	GCAC	2	8	40893	40900	25 %	0 %	25 %	50 %	414561721
114	NC_004347	GAGT	2	8	41730	41737	25 %	25 %	50 %	0 %	24371637
115	NC_004347	TTAT	2	8	41859	41866	25 %	75 %	0 %	0 %	24371637
116	NC_004347	TAAT	2	8	42125	42132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004347	GCAA	2	8	42238	42245	50 %	0 %	25 %	25 %	24371638
118	NC_004347	AATC	2	8	42942	42949	50 %	25 %	0 %	25 %	24371638
119	NC_004347	ATTG	2	8	43092	43099	25 %	50 %	25 %	0 %	24371639
120	NC_004347	ATAG	2	8	43132	43139	50 %	25 %	25 %	0 %	24371639
121	NC_004347	AGCC	2	8	43295	43302	25 %	0 %	25 %	50 %	24371639
122	NC_004347	AGCT	2	8	43869	43876	25 %	25 %	25 %	25 %	24371640
123	NC_004347	CAAT	2	8	44356	44363	50 %	25 %	0 %	25 %	24371640
124	NC_004347	TGAT	2	8	44456	44463	25 %	50 %	25 %	0 %	24371640
125	NC_004347	GAAT	2	8	44688	44695	50 %	25 %	25 %	0 %	24371641
126	NC_004347	CCAG	2	8	44745	44752	25 %	0 %	25 %	50 %	24371641
127	NC_004347	GGCA	2	8	45677	45684	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_004347	TGTT	2	8	47668	47675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004347	GCGA	2	8	48206	48213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_004347	CTGA	2	8	48385	48392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_004347	CGTC	2	8	48910	48917	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_004347	AAAG	2	8	49033	49040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004347	GGTG	2	8	49428	49435	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004347	ATTG	2	8	49803	49810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004347	GACA	2	8	50302	50309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_004347	GAAC	2	8	50622	50629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_004347	GTTT	2	8	51574	51581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004347	ATGT	2	8	51912	51919	25 %	50 %	25 %	0 %	24371644
139	NC_004347	CGAT	2	8	52272	52279	25 %	25 %	25 %	25 %	24371645
140	NC_004347	CGAC	2	8	53840	53847	25 %	0 %	25 %	50 %	24371647
141	NC_004347	TGCT	2	8	55057	55064	0 %	50 %	25 %	25 %	414561722
142	NC_004347	TTGT	2	8	55100	55107	0 %	75 %	25 %	0 %	414561722
143	NC_004347	TGGA	2	8	55477	55484	25 %	25 %	50 %	0 %	414561722
144	NC_004347	AACT	2	8	55993	56000	50 %	25 %	0 %	25 %	24371649
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