MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 59528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004347	TCT	2	6	30	35	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004347	TAT	2	6	36	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004347	ATG	2	6	201	206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004347	ATA	2	6	236	241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004347	GTT	2	6	304	309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004347	AGA	2	6	326	331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004347	TCT	2	6	377	382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371601
8	NC_004347	TTG	2	6	394	399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371601
9	NC_004347	GCT	2	6	730	735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371601
10	NC_004347	GGT	2	6	742	747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371601
11	NC_004347	TGT	2	6	841	846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004347	TAT	2	6	1001	1006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371602
13	NC_004347	GAG	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371602
14	NC_004347	TGG	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371602
15	NC_004347	CTT	2	6	1436	1441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371602
16	NC_004347	CAT	2	6	1444	1449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371602
17	NC_004347	TGC	2	6	1481	1486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371602
18	NC_004347	GCC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371602
19	NC_004347	TGT	2	6	1737	1742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371602
20	NC_004347	TTG	2	6	1765	1770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371602
21	NC_004347	TGC	2	6	1820	1825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371602
22	NC_004347	TTC	2	6	1846	1851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371602
23	NC_004347	GAT	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371602
24	NC_004347	TGT	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371602
25	NC_004347	TAA	2	6	2015	2020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371602
26	NC_004347	TGG	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371602
27	NC_004347	TGA	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371602
28	NC_004347	TGG	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371602
29	NC_004347	TCT	2	6	2167	2172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371602
30	NC_004347	TAT	2	6	2276	2281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371602
31	NC_004347	TTC	2	6	2688	2693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561717
32	NC_004347	TTC	2	6	2907	2912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561717
33	NC_004347	TTA	2	6	2947	2952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561717
34	NC_004347	TGG	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561717
35	NC_004347	GTT	2	6	3031	3036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561717
36	NC_004347	ATA	2	6	3148	3153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561717
37	NC_004347	GAC	2	6	3281	3286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561717
38	NC_004347	CAC	2	6	3294	3299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561717
39	NC_004347	GAT	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561717
40	NC_004347	CTT	2	6	3413	3418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561717
41	NC_004347	GGC	2	6	3435	3440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561717
42	NC_004347	CCA	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561717
43	NC_004347	CCG	2	6	3697	3702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561717
44	NC_004347	AAT	2	6	3809	3814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561717
45	NC_004347	TCG	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561717
46	NC_004347	ATC	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004347	GGC	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_004347	GCC	2	6	4006	4011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_004347	TCT	2	6	4096	4101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371604
50	NC_004347	GAT	2	6	4106	4111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371604
51	NC_004347	GAA	2	6	4166	4171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371604
52	NC_004347	CAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371604
53	NC_004347	TCT	2	6	4246	4251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371604
54	NC_004347	ATG	2	6	4254	4259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371604
55	NC_004347	CAG	2	6	4277	4282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371604
56	NC_004347	GTA	2	6	4292	4297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371604
57	NC_004347	CTT	2	6	4445	4450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371604
58	NC_004347	CAT	2	6	4460	4465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371604
59	NC_004347	TCA	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371604
60	NC_004347	ACC	2	6	4681	4686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371604
61	NC_004347	ACT	2	6	4704	4709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371604
62	NC_004347	CAC	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371604
63	NC_004347	TGG	2	6	4886	4891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371604
64	NC_004347	ACC	2	6	4934	4939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371604
65	NC_004347	GCG	2	6	5019	5024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371604
66	NC_004347	CAT	3	9	5039	5047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371604
67	NC_004347	GCT	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371604
68	NC_004347	GTT	2	6	5120	5125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371604
69	NC_004347	GCA	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371604
70	NC_004347	CAC	2	6	5431	5436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371604
71	NC_004347	CTG	3	9	5503	5511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371604
72	NC_004347	AGT	2	6	5646	5651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371604
73	NC_004347	CCG	2	6	5730	5735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371605
74	NC_004347	CAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371605
75	NC_004347	TGA	2	6	5872	5877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371605
76	NC_004347	GCG	2	6	5920	5925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371605
77	NC_004347	TTG	2	6	5957	5962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371606
78	NC_004347	CAA	2	6	6006	6011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371606
79	NC_004347	TGT	2	6	6027	6032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371606
80	NC_004347	CAG	2	6	6171	6176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371606
81	NC_004347	ACG	3	9	6311	6319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371607
82	NC_004347	GCC	2	6	6335	6340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371607
83	NC_004347	ATG	2	6	6417	6422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371607
84	NC_004347	TTA	2	6	6437	6442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004347	CAA	2	6	6521	6526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_004347	CAC	2	6	6585	6590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_004347	TAG	2	6	6626	6631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004347	TAA	2	6	6689	6694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004347	TTG	2	6	6712	6717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004347	TGA	2	6	6742	6747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004347	TGA	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004347	TTG	2	6	6783	6788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004347	ATT	2	6	6795	6800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004347	TGA	2	6	6849	6854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004347	CAA	2	6	6891	6896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371608
96	NC_004347	GAC	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371608
97	NC_004347	CAG	2	6	6930	6935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371608
98	NC_004347	ATG	2	6	7078	7083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371608
99	NC_004347	GTC	2	6	7111	7116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371608
100	NC_004347	TAC	2	6	7205	7210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371608
101	NC_004347	ATC	2	6	7231	7236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371608
102	NC_004347	GCA	2	6	7237	7242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371608
103	NC_004347	TTG	2	6	7273	7278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371608
104	NC_004347	TGG	2	6	7364	7369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371608
105	NC_004347	AAC	2	6	7425	7430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371608
106	NC_004347	GAA	2	6	7509	7514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371608
107	NC_004347	GTT	2	6	7544	7549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371608
108	NC_004347	GAT	2	6	7554	7559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371608
109	NC_004347	GAA	2	6	7593	7598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371608
110	NC_004347	GCT	2	6	7619	7624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371608
111	NC_004347	ATC	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371608
112	NC_004347	ATC	2	6	7641	7646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371608
113	NC_004347	GCC	2	6	7736	7741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371608
114	NC_004347	CTT	2	6	7817	7822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371608
115	NC_004347	GCC	2	6	7903	7908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371608
116	NC_004347	TAC	2	6	8007	8012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371608
117	NC_004347	TGT	2	6	8032	8037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371608
118	NC_004347	CGT	2	6	8043	8048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371608
119	NC_004347	TGG	2	6	8138	8143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371608
120	NC_004347	CAC	2	6	8153	8158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371608
121	NC_004347	AGA	2	6	8216	8221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371608
122	NC_004347	TCT	2	6	8247	8252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371608
123	NC_004347	TAG	2	6	8433	8438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371609
124	NC_004347	GAA	2	6	8465	8470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371609
125	NC_004347	AAG	2	6	8492	8497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371609
126	NC_004347	CAA	2	6	8549	8554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371609
127	NC_004347	GTT	2	6	8566	8571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371609
128	NC_004347	TAC	2	6	8732	8737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371609
129	NC_004347	ATT	2	6	8746	8751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371609
130	NC_004347	TTG	2	6	8891	8896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371609
131	NC_004347	TGA	2	6	8902	8907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371609
132	NC_004347	ACC	2	6	8951	8956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371609
133	NC_004347	CAC	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371609
134	NC_004347	CGC	2	6	9008	9013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371609
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136	NC_004347	GAA	2	6	9182	9187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371609
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198	NC_004347	ATA	2	6	13973	13978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_004347	GCT	2	6	13988	13993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_004347	CTT	2	6	18248	18253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_004347	GAA	2	6	18282	18287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371616
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261	NC_004347	GAG	2	6	18513	18518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371616
262	NC_004347	ATT	2	6	18567	18572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371616
263	NC_004347	TTG	2	6	18640	18645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371616
264	NC_004347	TTG	2	6	18751	18756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371616
265	NC_004347	CGA	2	6	18760	18765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371616
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