MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 5781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004347	TA	3	6	22	27	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004347	TA	3	6	721	726	50 %	50 %	0 %	0 %	24371601
3	NC_004347	CT	3	6	783	788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_004347	GT	3	6	1150	1155	0 %	50 %	50 %	0 %	24371602
5	NC_004347	CT	3	6	2293	2298	0 %	50 %	0 %	50 %	24371602
6	NC_004347	GC	3	6	3088	3093	0 %	0 %	50 %	50 %	414561717
7	NC_004347	GC	3	6	3521	3526	0 %	0 %	50 %	50 %	414561717
8	NC_004347	TG	3	6	5401	5406	0 %	50 %	50 %	0 %	24371604
9	NC_004347	AT	3	6	5662	5667	50 %	50 %	0 %	0 %	24371604
10	NC_004347	AC	3	6	7386	7391	50 %	0 %	0 %	50 %	24371608
11	NC_004347	AG	3	6	7784	7789	50 %	0 %	50 %	0 %	24371608
12	NC_004347	GC	3	6	8061	8066	0 %	0 %	50 %	50 %	24371608
13	NC_004347	AG	3	6	8198	8203	50 %	0 %	50 %	0 %	24371608
14	NC_004347	CG	3	6	8945	8950	0 %	0 %	50 %	50 %	24371609
15	NC_004347	CG	3	6	9078	9083	0 %	0 %	50 %	50 %	24371609
16	NC_004347	AC	3	6	10561	10566	50 %	0 %	0 %	50 %	24371610
17	NC_004347	GA	3	6	10627	10632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004347	GC	3	6	12352	12357	0 %	0 %	50 %	50 %	24371611
19	NC_004347	GC	3	6	12423	12428	0 %	0 %	50 %	50 %	24371611
20	NC_004347	AT	3	6	13574	13579	50 %	50 %	0 %	0 %	24371612
21	NC_004347	GC	3	6	14970	14975	0 %	0 %	50 %	50 %	414561718
22	NC_004347	CA	3	6	19416	19421	50 %	0 %	0 %	50 %	414561719
23	NC_004347	TA	3	6	21832	21837	50 %	50 %	0 %	0 %	414561719
24	NC_004347	TA	3	6	22097	22102	50 %	50 %	0 %	0 %	414561719
25	NC_004347	CA	3	6	22701	22706	50 %	0 %	0 %	50 %	24371618
26	NC_004347	CG	3	6	23419	23424	0 %	0 %	50 %	50 %	24371620
27	NC_004347	CA	3	6	23514	23519	50 %	0 %	0 %	50 %	24371620
28	NC_004347	CA	3	6	24297	24302	50 %	0 %	0 %	50 %	24371620
29	NC_004347	AC	3	6	24630	24635	50 %	0 %	0 %	50 %	24371621
30	NC_004347	GC	3	6	26120	26125	0 %	0 %	50 %	50 %	24371621
31	NC_004347	AG	3	6	26386	26391	50 %	0 %	50 %	0 %	24371621
32	NC_004347	CT	3	6	26703	26708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_004347	TG	3	6	26743	26748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004347	CA	3	6	27181	27186	50 %	0 %	0 %	50 %	24371622
35	NC_004347	GC	3	6	27774	27779	0 %	0 %	50 %	50 %	24371622
36	NC_004347	TG	3	6	29819	29824	0 %	50 %	50 %	0 %	24371624
37	NC_004347	AG	3	6	32327	32332	50 %	0 %	50 %	0 %	24371628
38	NC_004347	AT	3	6	32499	32504	50 %	50 %	0 %	0 %	24371628
39	NC_004347	GA	3	6	33048	33053	50 %	0 %	50 %	0 %	24371628
40	NC_004347	AT	3	6	33133	33138	50 %	50 %	0 %	0 %	24371628
41	NC_004347	TG	3	6	33168	33173	0 %	50 %	50 %	0 %	24371628
42	NC_004347	AG	3	6	34270	34275	50 %	0 %	50 %	0 %	24371629
43	NC_004347	GC	3	6	35003	35008	0 %	0 %	50 %	50 %	24371629
44	NC_004347	GC	3	6	36998	37003	0 %	0 %	50 %	50 %	24371631
45	NC_004347	GT	3	6	38562	38567	0 %	50 %	50 %	0 %	24371633
46	NC_004347	AC	3	6	39238	39243	50 %	0 %	0 %	50 %	414561720
47	NC_004347	TG	3	6	39448	39453	0 %	50 %	50 %	0 %	414561720
48	NC_004347	GA	4	8	39558	39565	50 %	0 %	50 %	0 %	414561720
49	NC_004347	TG	3	6	40804	40809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004347	GT	3	6	41894	41899	0 %	50 %	50 %	0 %	24371637
51	NC_004347	GC	4	8	43365	43372	0 %	0 %	50 %	50 %	24371639
52	NC_004347	GT	3	6	43493	43498	0 %	50 %	50 %	0 %	24371639
53	NC_004347	GC	3	6	43561	43566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_004347	GC	3	6	43673	43678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_004347	TA	3	6	44963	44968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004347	TG	3	6	45894	45899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004347	GT	3	6	46510	46515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004347	AC	3	6	47332	47337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_004347	AC	3	6	47501	47506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_004347	CA	3	6	47683	47688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_004347	AC	3	6	47836	47841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_004347	GA	3	6	49372	49377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004347	GA	3	6	49600	49605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004347	CT	3	6	49681	49686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_004347	GT	3	6	50793	50798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004347	TG	3	6	51824	51829	0 %	50 %	50 %	0 %	24371644
67	NC_004347	CG	3	6	54708	54713	0 %	0 %	50 %	50 %	414561722
68	NC_004347	GC	3	6	55448	55453	0 %	0 %	50 %	50 %	414561722
69	NC_004347	TG	3	6	55921	55926	0 %	50 %	50 %	0 %	24371649
70	NC_004347	AT	3	6	57417	57422	50 %	50 %	0 %	0 %	24371650
71	NC_004347	TG	3	6	58337	58342	0 %	50 %	50 %	0 %	24371652
72	NC_004347	AG	3	6	59567	59572	50 %	0 %	50 %	0 %	24371653
73	NC_004347	TG	3	6	60004	60009	0 %	50 %	50 %	0 %	414561723
74	NC_004347	GC	3	6	60893	60898	0 %	0 %	50 %	50 %	414561723
75	NC_004347	TA	3	6	61298	61303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004347	CT	5	10	62148	62157	0 %	50 %	0 %	50 %	414561724
77	NC_004347	GT	3	6	62525	62530	0 %	50 %	50 %	0 %	414561724
78	NC_004347	AT	3	6	62758	62763	50 %	50 %	0 %	0 %	414561724
79	NC_004347	CT	3	6	63023	63028	0 %	50 %	0 %	50 %	414561724
80	NC_004347	AT	3	6	63040	63045	50 %	50 %	0 %	0 %	414561724
81	NC_004347	CG	3	6	63216	63221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_004347	AG	3	6	66385	66390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004347	TG	3	6	67361	67366	0 %	50 %	50 %	0 %	24371660
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85	NC_004347	AT	3	6	68333	68338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004347	GC	3	6	68459	68464	0 %	0 %	50 %	50 %	24371661
87	NC_004347	TG	3	6	68505	68510	0 %	50 %	50 %	0 %	24371661
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90	NC_004347	AT	3	6	72159	72164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004347	GC	3	6	72868	72873	0 %	0 %	50 %	50 %	24371666
92	NC_004347	AT	3	6	74018	74023	50 %	50 %	0 %	0 %	24371666
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94	NC_004347	GC	3	6	75689	75694	0 %	0 %	50 %	50 %	24371666
95	NC_004347	GA	3	6	76448	76453	50 %	0 %	50 %	0 %	24371666
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98	NC_004347	CA	3	6	78837	78842	50 %	0 %	0 %	50 %	24371667
99	NC_004347	AT	3	6	82355	82360	50 %	50 %	0 %	0 %	24371670
100	NC_004347	CA	3	6	83020	83025	50 %	0 %	0 %	50 %	24371671
101	NC_004347	GC	3	6	83245	83250	0 %	0 %	50 %	50 %	24371671
102	NC_004347	GC	3	6	83632	83637	0 %	0 %	50 %	50 %	24371671
103	NC_004347	TC	3	6	84253	84258	0 %	50 %	0 %	50 %	24371671
104	NC_004347	GT	3	6	84291	84296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004347	GT	3	6	84339	84344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004347	GC	3	6	85076	85081	0 %	0 %	50 %	50 %	24371673
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108	NC_004347	GC	3	6	86225	86230	0 %	0 %	50 %	50 %	24371674
109	NC_004347	GT	3	6	86232	86237	0 %	50 %	50 %	0 %	24371674
110	NC_004347	TG	3	6	86456	86461	0 %	50 %	50 %	0 %	24371674
111	NC_004347	CG	3	6	86502	86507	0 %	0 %	50 %	50 %	24371674
112	NC_004347	GT	3	6	86610	86615	0 %	50 %	50 %	0 %	24371674
113	NC_004347	TC	3	6	88588	88593	0 %	50 %	0 %	50 %	414561725
114	NC_004347	TG	3	6	89017	89022	0 %	50 %	50 %	0 %	24371676
115	NC_004347	TA	3	6	90334	90339	50 %	50 %	0 %	0 %	24371676
116	NC_004347	GT	3	6	90715	90720	0 %	50 %	50 %	0 %	24371676
117	NC_004347	TC	3	6	90937	90942	0 %	50 %	0 %	50 %	24371676
118	NC_004347	TC	3	6	90968	90973	0 %	50 %	0 %	50 %	24371676
119	NC_004347	GT	3	6	91351	91356	0 %	50 %	50 %	0 %	24371676
120	NC_004347	GC	3	6	93410	93415	0 %	0 %	50 %	50 %	24371680
121	NC_004347	TA	3	6	95986	95991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004347	CT	3	6	96384	96389	0 %	50 %	0 %	50 %	414561727
123	NC_004347	CG	3	6	99355	99360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_004347	TA	3	6	99950	99955	50 %	50 %	0 %	0 %	24371691
125	NC_004347	AT	3	6	101611	101616	50 %	50 %	0 %	0 %	24371693
126	NC_004347	AT	3	6	101638	101643	50 %	50 %	0 %	0 %	24371693
127	NC_004347	AG	3	6	101817	101822	50 %	0 %	50 %	0 %	24371693
128	NC_004347	TA	3	6	103843	103848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004347	CG	3	6	104966	104971	0 %	0 %	50 %	50 %	24371697
130	NC_004347	GC	3	6	105986	105991	0 %	0 %	50 %	50 %	24371697
131	NC_004347	GT	3	6	106316	106321	0 %	50 %	50 %	0 %	24371697
132	NC_004347	GC	3	6	106660	106665	0 %	0 %	50 %	50 %	24371698
133	NC_004347	AT	3	6	106814	106819	50 %	50 %	0 %	0 %	24371698
134	NC_004347	GA	3	6	108203	108208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004347	TA	3	6	108488	108493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004347	GA	3	6	108692	108697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004347	TG	3	6	108728	108733	0 %	50 %	50 %	0 %	24371701
138	NC_004347	TG	4	8	109771	109778	0 %	50 %	50 %	0 %	24371701
139	NC_004347	AC	3	6	110150	110155	50 %	0 %	0 %	50 %	24371701
140	NC_004347	AC	3	6	111564	111569	50 %	0 %	0 %	50 %	24371701
141	NC_004347	CG	3	6	112279	112284	0 %	0 %	50 %	50 %	24371702
142	NC_004347	GC	3	6	113707	113712	0 %	0 %	50 %	50 %	24371704
143	NC_004347	TG	3	6	113897	113902	0 %	50 %	50 %	0 %	24371704
144	NC_004347	CG	3	6	114277	114282	0 %	0 %	50 %	50 %	24371705
145	NC_004347	TG	3	6	116238	116243	0 %	50 %	50 %	0 %	414561729
146	NC_004347	GT	5	10	116269	116278	0 %	50 %	50 %	0 %	414561729
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