MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 4502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004342	TATGT	2	10	745	754	20 %	60 %	20 %	0 %	24212701
2	NC_004342	AATTT	2	10	1318	1327	40 %	60 %	0 %	0 %	24212701
3	NC_004342	TATAA	2	10	2310	2319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004342	GAAAA	2	10	3074	3083	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004342	TTTAA	2	10	4423	4432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004342	GGTTT	2	10	7226	7235	0 %	60 %	40 %	0 %	24212705
7	NC_004342	GGAAA	2	10	7259	7268	60 %	0 %	40 %	0 %	24212705
8	NC_004342	ACGAA	2	10	7276	7285	60 %	0 %	20 %	20 %	24212705
9	NC_004342	AGTTA	2	10	8422	8431	40 %	40 %	20 %	0 %	24212705
10	NC_004342	GGAGG	2	10	9308	9317	20 %	0 %	80 %	0 %	24212706
11	NC_004342	GAGAT	2	10	9908	9917	40 %	20 %	40 %	0 %	24212706
12	NC_004342	AAGGA	2	10	10489	10498	60 %	0 %	40 %	0 %	24212706
13	NC_004342	GGTTT	2	10	11874	11883	0 %	60 %	40 %	0 %	24212707
14	NC_004342	GTTTT	2	10	12046	12055	0 %	80 %	20 %	0 %	24212707
15	NC_004342	ATGGA	2	10	12833	12842	40 %	20 %	40 %	0 %	24212709
16	NC_004342	TCAAG	2	10	13231	13240	40 %	20 %	20 %	20 %	24212709
17	NC_004342	GGATC	2	10	15268	15277	20 %	20 %	40 %	20 %	24212711
18	NC_004342	GTTTT	2	10	17761	17770	0 %	80 %	20 %	0 %	24212713
19	NC_004342	TTAGA	2	10	17848	17857	40 %	40 %	20 %	0 %	24212713
20	NC_004342	TAAAA	2	10	18315	18324	80 %	20 %	0 %	0 %	24212713
21	NC_004342	ATTTA	2	10	19462	19471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004342	ATAAA	2	10	19891	19900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004342	AGATT	2	10	19909	19918	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004342	GATTC	2	10	20612	20621	20 %	40 %	20 %	20 %	24212717
25	NC_004342	GCCTT	2	10	20709	20718	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_004342	ATATT	2	10	21237	21246	40 %	60 %	0 %	0 %	294827557
27	NC_004342	AAAAT	2	10	21410	21419	80 %	20 %	0 %	0 %	294827557
28	NC_004342	ATTTT	2	10	24274	24283	20 %	80 %	0 %	0 %	24212722
29	NC_004342	TTATT	2	10	25847	25856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004342	TAAAA	2	10	26312	26321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004342	ACTAA	2	10	27361	27370	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_004342	GAAGT	2	10	28128	28137	40 %	20 %	40 %	0 %	24212726
33	NC_004342	GAAAA	2	10	29596	29605	80 %	0 %	20 %	0 %	24212727
34	NC_004342	TATTT	2	10	30257	30266	20 %	80 %	0 %	0 %	24212727
35	NC_004342	CGATC	2	10	30865	30874	20 %	20 %	20 %	40 %	24212727
36	NC_004342	GAAAA	2	10	33464	33473	80 %	0 %	20 %	0 %	294827559
37	NC_004342	TATTT	2	10	34033	34042	20 %	80 %	0 %	0 %	24212731
38	NC_004342	GTTTG	2	10	34333	34342	0 %	60 %	40 %	0 %	24212731
39	NC_004342	TACTT	2	10	34446	34455	20 %	60 %	0 %	20 %	24212731
40	NC_004342	TTTCT	2	10	35375	35384	0 %	80 %	0 %	20 %	24212733
41	NC_004342	AGAAT	2	10	35668	35677	60 %	20 %	20 %	0 %	24212733
42	NC_004342	TACAT	2	10	36613	36622	40 %	40 %	0 %	20 %	24212734
43	NC_004342	TGTAA	2	10	37058	37067	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004342	ATTTC	2	10	37447	37456	20 %	60 %	0 %	20 %	24212735
45	NC_004342	GTTTG	2	10	38454	38463	0 %	60 %	40 %	0 %	24212735
46	NC_004342	TAAAA	2	10	39505	39514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004342	AAAAT	2	10	40324	40333	80 %	20 %	0 %	0 %	24212737
48	NC_004342	TGGAA	2	10	41429	41438	40 %	20 %	40 %	0 %	294827560
49	NC_004342	TTAAA	2	10	42426	42435	60 %	40 %	0 %	0 %	24212740
50	NC_004342	GGAAA	2	10	42924	42933	60 %	0 %	40 %	0 %	24212740
51	NC_004342	ATCGA	2	10	43914	43923	40 %	20 %	20 %	20 %	24212740
52	NC_004342	GAATT	2	10	44747	44756	40 %	40 %	20 %	0 %	24212742
53	NC_004342	AAAAT	2	10	47121	47130	80 %	20 %	0 %	0 %	24212743
54	NC_004342	TTCAA	2	10	47983	47992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_004342	TAAAG	2	10	49738	49747	60 %	20 %	20 %	0 %	24212746
56	NC_004342	AGATC	2	10	52231	52240	40 %	20 %	20 %	20 %	24212749
57	NC_004342	AAAAG	2	10	52927	52936	80 %	0 %	20 %	0 %	24212749
58	NC_004342	AACAT	2	10	55650	55659	60 %	20 %	0 %	20 %	24212751
59	NC_004342	TTTGA	2	10	58539	58548	20 %	60 %	20 %	0 %	24212754
60	NC_004342	TCGAT	2	10	59417	59426	20 %	40 %	20 %	20 %	24212755
61	NC_004342	AGGAT	2	10	59470	59479	40 %	20 %	40 %	0 %	24212755
62	NC_004342	TTTGT	2	10	60770	60779	0 %	80 %	20 %	0 %	24212756
63	NC_004342	GAAGA	2	10	61675	61684	60 %	0 %	40 %	0 %	24212756
64	NC_004342	TTTAT	2	10	63953	63962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004342	GAAAA	2	10	64961	64970	80 %	0 %	20 %	0 %	294827562
66	NC_004342	AAAAC	2	10	66616	66625	80 %	0 %	0 %	20 %	24212761
67	NC_004342	AATCT	2	10	67040	67049	40 %	40 %	0 %	20 %	24212761
68	NC_004342	GGGTT	2	10	69351	69360	0 %	40 %	60 %	0 %	294827563
69	NC_004342	ATACC	2	10	70795	70804	40 %	20 %	0 %	40 %	24212764
70	NC_004342	AGATA	2	10	71417	71426	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004342	AAAAT	2	10	72234	72243	80 %	20 %	0 %	0 %	294827564
72	NC_004342	GAGAA	2	10	72539	72548	60 %	0 %	40 %	0 %	294827564
73	NC_004342	TTGAA	2	10	73686	73695	40 %	40 %	20 %	0 %	294827565
74	NC_004342	AAAGA	2	10	75262	75271	80 %	0 %	20 %	0 %	24212767
75	NC_004342	GGATT	2	10	75688	75697	20 %	40 %	40 %	0 %	24212767
76	NC_004342	GGAAA	2	10	76061	76070	60 %	0 %	40 %	0 %	24212767
77	NC_004342	ATTTG	2	10	77817	77826	20 %	60 %	20 %	0 %	24212767
78	NC_004342	GGTTT	2	10	78368	78377	0 %	60 %	40 %	0 %	24212768
79	NC_004342	TTTTG	2	10	78388	78397	0 %	80 %	20 %	0 %	24212768
80	NC_004342	TCACT	2	10	80077	80086	20 %	40 %	0 %	40 %	294827566
81	NC_004342	AAGAA	2	10	81439	81448	80 %	0 %	20 %	0 %	294827566
82	NC_004342	AGAAT	2	10	82322	82331	60 %	20 %	20 %	0 %	294827566
83	NC_004342	CTAAA	2	10	83242	83251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_004342	AATCA	2	10	85078	85087	60 %	20 %	0 %	20 %	24212773
85	NC_004342	AATAC	2	10	85416	85425	60 %	20 %	0 %	20 %	24212773
86	NC_004342	TTCTT	2	10	85564	85573	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004342	ATTAA	2	10	86553	86562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004342	ATTTT	2	10	87569	87578	20 %	80 %	0 %	0 %	294827570
89	NC_004342	GGATT	2	10	87990	87999	20 %	40 %	40 %	0 %	24212777
90	NC_004342	ATATT	2	10	88932	88941	40 %	60 %	0 %	0 %	24212777
91	NC_004342	AAGGA	2	10	90309	90318	60 %	0 %	40 %	0 %	294827571
92	NC_004342	AGGAA	2	10	91245	91254	60 %	0 %	40 %	0 %	24212781
93	NC_004342	CGGAA	2	10	94233	94242	40 %	0 %	40 %	20 %	24212785
94	NC_004342	TTGAG	2	10	94658	94667	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004342	CCCAC	2	10	94825	94834	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
96	NC_004342	TGGTT	2	10	95861	95870	0 %	60 %	40 %	0 %	294827573
97	NC_004342	ATTTT	2	10	96711	96720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004342	TCAGA	2	10	97479	97488	40 %	20 %	20 %	20 %	24212791
99	NC_004342	GTTTT	2	10	98200	98209	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004342	ATTTT	2	10	100496	100505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004342	GTAGA	2	10	101154	101163	40 %	20 %	40 %	0 %	24212796
102	NC_004342	CTTTC	2	10	102476	102485	0 %	60 %	0 %	40 %	24212798
103	NC_004342	GATTG	2	10	102842	102851	20 %	40 %	40 %	0 %	24212798
104	NC_004342	TAAAA	2	10	104105	104114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004342	ATATT	2	10	104729	104738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004342	TTGTA	2	10	105232	105241	20 %	60 %	20 %	0 %	294827576
107	NC_004342	TGTAC	2	10	105551	105560	20 %	40 %	20 %	20 %	294827576
108	NC_004342	CTTTT	2	10	105689	105698	0 %	80 %	0 %	20 %	294827576
109	NC_004342	ATTTT	2	10	109811	109820	20 %	80 %	0 %	0 %	24212804
110	NC_004342	CAAAT	2	10	110318	110327	60 %	20 %	0 %	20 %	24212804
111	NC_004342	TTATT	2	10	110463	110472	20 %	80 %	0 %	0 %	24212804
112	NC_004342	TATAA	2	10	111380	111389	60 %	40 %	0 %	0 %	24212805
113	NC_004342	ATTTT	2	10	112538	112547	20 %	80 %	0 %	0 %	294827577
114	NC_004342	TTTAT	2	10	113366	113375	20 %	80 %	0 %	0 %	294827577
115	NC_004342	AAAAT	2	10	116295	116304	80 %	20 %	0 %	0 %	24212810
116	NC_004342	TTTGT	2	10	116363	116372	0 %	80 %	20 %	0 %	24212810
117	NC_004342	AAAAT	2	10	116626	116635	80 %	20 %	0 %	0 %	24212810
118	NC_004342	TGGTT	2	10	116831	116840	0 %	60 %	40 %	0 %	24212810
119	NC_004342	AATTT	2	10	117826	117835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004342	ACTTT	2	10	118004	118013	20 %	60 %	0 %	20 %	294827578
121	NC_004342	AAGAA	2	10	118842	118851	80 %	0 %	20 %	0 %	294827578
122	NC_004342	AAATC	2	10	119328	119337	60 %	20 %	0 %	20 %	294827578
123	NC_004342	ATACA	2	10	120677	120686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_004342	CCTTT	2	10	123941	123950	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_004342	TTTCT	2	10	124485	124494	0 %	80 %	0 %	20 %	24212815
126	NC_004342	AAAAT	2	10	124696	124705	80 %	20 %	0 %	0 %	294827579
127	NC_004342	AATCG	2	10	127810	127819	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_004342	ATTAA	2	10	128232	128241	60 %	40 %	0 %	0 %	24212820
129	NC_004342	TCCAA	2	10	128690	128699	40 %	20 %	0 %	40 %	24212820
130	NC_004342	ATTTT	2	10	129003	129012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004342	ACAAT	2	10	129202	129211	60 %	20 %	0 %	20 %	24212821
132	NC_004342	CTTTT	2	10	129329	129338	0 %	80 %	0 %	20 %	24212821
133	NC_004342	AAAAT	2	10	132852	132861	80 %	20 %	0 %	0 %	24212827
134	NC_004342	AGATC	2	10	133903	133912	40 %	20 %	20 %	20 %	24212827
135	NC_004342	TTTTA	2	10	134059	134068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004342	GAAAA	2	10	135292	135301	80 %	0 %	20 %	0 %	294827581
137	NC_004342	ATTTT	2	10	135574	135583	20 %	80 %	0 %	0 %	294827581
138	NC_004342	GAAAA	2	10	135657	135666	80 %	0 %	20 %	0 %	294827581
139	NC_004342	AAAGA	2	10	136164	136173	80 %	0 %	20 %	0 %	294827581
140	NC_004342	ATTCG	2	10	137389	137398	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_004342	TAGGT	2	10	138209	138218	20 %	40 %	40 %	0 %	24212830
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400	NC_004342	TCAAT	2	10	376921	376930	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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405	NC_004342	CAAAA	2	10	378122	378131	80 %	0 %	0 %	20 %	24213084
406	NC_004342	CTTAT	2	10	379965	379974	20 %	60 %	0 %	20 %	294827637
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