MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 3217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004342	TATGT	2	10	745	754	20 %	60 %	20 %	0 %	24212701
2	NC_004342	AATTT	2	10	1318	1327	40 %	60 %	0 %	0 %	24212701
3	NC_004342	GGTTT	2	10	7226	7235	0 %	60 %	40 %	0 %	24212705
4	NC_004342	GGAAA	2	10	7259	7268	60 %	0 %	40 %	0 %	24212705
5	NC_004342	ACGAA	2	10	7276	7285	60 %	0 %	20 %	20 %	24212705
6	NC_004342	AGTTA	2	10	8422	8431	40 %	40 %	20 %	0 %	24212705
7	NC_004342	GGAGG	2	10	9308	9317	20 %	0 %	80 %	0 %	24212706
8	NC_004342	GAGAT	2	10	9908	9917	40 %	20 %	40 %	0 %	24212706
9	NC_004342	AAGGA	2	10	10489	10498	60 %	0 %	40 %	0 %	24212706
10	NC_004342	GGTTT	2	10	11874	11883	0 %	60 %	40 %	0 %	24212707
11	NC_004342	GTTTT	2	10	12046	12055	0 %	80 %	20 %	0 %	24212707
12	NC_004342	ATGGA	2	10	12833	12842	40 %	20 %	40 %	0 %	24212709
13	NC_004342	TCAAG	2	10	13231	13240	40 %	20 %	20 %	20 %	24212709
14	NC_004342	GGATC	2	10	15268	15277	20 %	20 %	40 %	20 %	24212711
15	NC_004342	GTTTT	2	10	17761	17770	0 %	80 %	20 %	0 %	24212713
16	NC_004342	TTAGA	2	10	17848	17857	40 %	40 %	20 %	0 %	24212713
17	NC_004342	TAAAA	2	10	18315	18324	80 %	20 %	0 %	0 %	24212713
18	NC_004342	GATTC	2	10	20612	20621	20 %	40 %	20 %	20 %	24212717
19	NC_004342	ATATT	2	10	21237	21246	40 %	60 %	0 %	0 %	294827557
20	NC_004342	AAAAT	2	10	21410	21419	80 %	20 %	0 %	0 %	294827557
21	NC_004342	ATTTT	2	10	24274	24283	20 %	80 %	0 %	0 %	24212722
22	NC_004342	GAAGT	2	10	28128	28137	40 %	20 %	40 %	0 %	24212726
23	NC_004342	GAAAA	2	10	29596	29605	80 %	0 %	20 %	0 %	24212727
24	NC_004342	TATTT	2	10	30257	30266	20 %	80 %	0 %	0 %	24212727
25	NC_004342	CGATC	2	10	30865	30874	20 %	20 %	20 %	40 %	24212727
26	NC_004342	GAAAA	2	10	33464	33473	80 %	0 %	20 %	0 %	294827559
27	NC_004342	TATTT	2	10	34033	34042	20 %	80 %	0 %	0 %	24212731
28	NC_004342	GTTTG	2	10	34333	34342	0 %	60 %	40 %	0 %	24212731
29	NC_004342	TACTT	2	10	34446	34455	20 %	60 %	0 %	20 %	24212731
30	NC_004342	TTTCT	2	10	35375	35384	0 %	80 %	0 %	20 %	24212733
31	NC_004342	AGAAT	2	10	35668	35677	60 %	20 %	20 %	0 %	24212733
32	NC_004342	TACAT	2	10	36613	36622	40 %	40 %	0 %	20 %	24212734
33	NC_004342	ATTTC	2	10	37447	37456	20 %	60 %	0 %	20 %	24212735
34	NC_004342	GTTTG	2	10	38454	38463	0 %	60 %	40 %	0 %	24212735
35	NC_004342	AAAAT	2	10	40324	40333	80 %	20 %	0 %	0 %	24212737
36	NC_004342	TGGAA	2	10	41429	41438	40 %	20 %	40 %	0 %	294827560
37	NC_004342	TTAAA	2	10	42426	42435	60 %	40 %	0 %	0 %	24212740
38	NC_004342	GGAAA	2	10	42924	42933	60 %	0 %	40 %	0 %	24212740
39	NC_004342	ATCGA	2	10	43914	43923	40 %	20 %	20 %	20 %	24212740
40	NC_004342	GAATT	2	10	44747	44756	40 %	40 %	20 %	0 %	24212742
41	NC_004342	AAAAT	2	10	47121	47130	80 %	20 %	0 %	0 %	24212743
42	NC_004342	TAAAG	2	10	49738	49747	60 %	20 %	20 %	0 %	24212746
43	NC_004342	AGATC	2	10	52231	52240	40 %	20 %	20 %	20 %	24212749
44	NC_004342	AAAAG	2	10	52927	52936	80 %	0 %	20 %	0 %	24212749
45	NC_004342	AACAT	2	10	55650	55659	60 %	20 %	0 %	20 %	24212751
46	NC_004342	TTTGA	2	10	58539	58548	20 %	60 %	20 %	0 %	24212754
47	NC_004342	TCGAT	2	10	59417	59426	20 %	40 %	20 %	20 %	24212755
48	NC_004342	AGGAT	2	10	59470	59479	40 %	20 %	40 %	0 %	24212755
49	NC_004342	TTTGT	2	10	60770	60779	0 %	80 %	20 %	0 %	24212756
50	NC_004342	GAAGA	2	10	61675	61684	60 %	0 %	40 %	0 %	24212756
51	NC_004342	GAAAA	2	10	64961	64970	80 %	0 %	20 %	0 %	294827562
52	NC_004342	AAAAC	2	10	66616	66625	80 %	0 %	0 %	20 %	24212761
53	NC_004342	AATCT	2	10	67040	67049	40 %	40 %	0 %	20 %	24212761
54	NC_004342	GGGTT	2	10	69351	69360	0 %	40 %	60 %	0 %	294827563
55	NC_004342	ATACC	2	10	70795	70804	40 %	20 %	0 %	40 %	24212764
56	NC_004342	AAAAT	2	10	72234	72243	80 %	20 %	0 %	0 %	294827564
57	NC_004342	GAGAA	2	10	72539	72548	60 %	0 %	40 %	0 %	294827564
58	NC_004342	TTGAA	2	10	73686	73695	40 %	40 %	20 %	0 %	294827565
59	NC_004342	AAAGA	2	10	75262	75271	80 %	0 %	20 %	0 %	24212767
60	NC_004342	GGATT	2	10	75688	75697	20 %	40 %	40 %	0 %	24212767
61	NC_004342	GGAAA	2	10	76061	76070	60 %	0 %	40 %	0 %	24212767
62	NC_004342	ATTTG	2	10	77817	77826	20 %	60 %	20 %	0 %	24212767
63	NC_004342	GGTTT	2	10	78368	78377	0 %	60 %	40 %	0 %	24212768
64	NC_004342	TTTTG	2	10	78388	78397	0 %	80 %	20 %	0 %	24212768
65	NC_004342	TCACT	2	10	80077	80086	20 %	40 %	0 %	40 %	294827566
66	NC_004342	AAGAA	2	10	81439	81448	80 %	0 %	20 %	0 %	294827566
67	NC_004342	AGAAT	2	10	82322	82331	60 %	20 %	20 %	0 %	294827566
68	NC_004342	AATCA	2	10	85078	85087	60 %	20 %	0 %	20 %	24212773
69	NC_004342	AATAC	2	10	85416	85425	60 %	20 %	0 %	20 %	24212773
70	NC_004342	ATTTT	2	10	87569	87578	20 %	80 %	0 %	0 %	294827570
71	NC_004342	GGATT	2	10	87990	87999	20 %	40 %	40 %	0 %	24212777
72	NC_004342	ATATT	2	10	88932	88941	40 %	60 %	0 %	0 %	24212777
73	NC_004342	AAGGA	2	10	90309	90318	60 %	0 %	40 %	0 %	294827571
74	NC_004342	AGGAA	2	10	91245	91254	60 %	0 %	40 %	0 %	24212781
75	NC_004342	CGGAA	2	10	94233	94242	40 %	0 %	40 %	20 %	24212785
76	NC_004342	TGGTT	2	10	95861	95870	0 %	60 %	40 %	0 %	294827573
77	NC_004342	TCAGA	2	10	97479	97488	40 %	20 %	20 %	20 %	24212791
78	NC_004342	GTAGA	2	10	101154	101163	40 %	20 %	40 %	0 %	24212796
79	NC_004342	CTTTC	2	10	102476	102485	0 %	60 %	0 %	40 %	24212798
80	NC_004342	GATTG	2	10	102842	102851	20 %	40 %	40 %	0 %	24212798
81	NC_004342	TTGTA	2	10	105232	105241	20 %	60 %	20 %	0 %	294827576
82	NC_004342	TGTAC	2	10	105551	105560	20 %	40 %	20 %	20 %	294827576
83	NC_004342	CTTTT	2	10	105689	105698	0 %	80 %	0 %	20 %	294827576
84	NC_004342	ATTTT	2	10	109811	109820	20 %	80 %	0 %	0 %	24212804
85	NC_004342	CAAAT	2	10	110318	110327	60 %	20 %	0 %	20 %	24212804
86	NC_004342	TTATT	2	10	110463	110472	20 %	80 %	0 %	0 %	24212804
87	NC_004342	TATAA	2	10	111380	111389	60 %	40 %	0 %	0 %	24212805
88	NC_004342	ATTTT	2	10	112538	112547	20 %	80 %	0 %	0 %	294827577
89	NC_004342	TTTAT	2	10	113366	113375	20 %	80 %	0 %	0 %	294827577
90	NC_004342	AAAAT	2	10	116295	116304	80 %	20 %	0 %	0 %	24212810
91	NC_004342	TTTGT	2	10	116363	116372	0 %	80 %	20 %	0 %	24212810
92	NC_004342	AAAAT	2	10	116626	116635	80 %	20 %	0 %	0 %	24212810
93	NC_004342	TGGTT	2	10	116831	116840	0 %	60 %	40 %	0 %	24212810
94	NC_004342	ACTTT	2	10	118004	118013	20 %	60 %	0 %	20 %	294827578
95	NC_004342	AAGAA	2	10	118842	118851	80 %	0 %	20 %	0 %	294827578
96	NC_004342	AAATC	2	10	119328	119337	60 %	20 %	0 %	20 %	294827578
97	NC_004342	TTTCT	2	10	124485	124494	0 %	80 %	0 %	20 %	24212815
98	NC_004342	AAAAT	2	10	124696	124705	80 %	20 %	0 %	0 %	294827579
99	NC_004342	ATTAA	2	10	128232	128241	60 %	40 %	0 %	0 %	24212820
100	NC_004342	TCCAA	2	10	128690	128699	40 %	20 %	0 %	40 %	24212820
101	NC_004342	ACAAT	2	10	129202	129211	60 %	20 %	0 %	20 %	24212821
102	NC_004342	CTTTT	2	10	129329	129338	0 %	80 %	0 %	20 %	24212821
103	NC_004342	AAAAT	2	10	132852	132861	80 %	20 %	0 %	0 %	24212827
104	NC_004342	AGATC	2	10	133903	133912	40 %	20 %	20 %	20 %	24212827
105	NC_004342	GAAAA	2	10	135292	135301	80 %	0 %	20 %	0 %	294827581
106	NC_004342	ATTTT	2	10	135574	135583	20 %	80 %	0 %	0 %	294827581
107	NC_004342	GAAAA	2	10	135657	135666	80 %	0 %	20 %	0 %	294827581
108	NC_004342	AAAGA	2	10	136164	136173	80 %	0 %	20 %	0 %	294827581
109	NC_004342	TAGGT	2	10	138209	138218	20 %	40 %	40 %	0 %	24212830
110	NC_004342	GTCCC	2	10	140953	140962	0 %	20 %	20 %	60 %	294827582
111	NC_004342	ATTCA	2	10	141149	141158	40 %	40 %	0 %	20 %	294827582
112	NC_004342	TATTT	2	10	141216	141225	20 %	80 %	0 %	0 %	294827582
113	NC_004342	AAATT	2	10	143809	143818	60 %	40 %	0 %	0 %	24212835
114	NC_004342	GAAAT	2	10	144654	144663	60 %	20 %	20 %	0 %	24212835
115	NC_004342	TTCCT	2	10	147475	147484	0 %	60 %	0 %	40 %	294827584
116	NC_004342	CGATT	2	10	147579	147588	20 %	40 %	20 %	20 %	294827584
117	NC_004342	AAGAA	2	10	148905	148914	80 %	0 %	20 %	0 %	24212838
118	NC_004342	CATTT	2	10	149101	149110	20 %	60 %	0 %	20 %	24212838
119	NC_004342	CAACA	2	10	150035	150044	60 %	0 %	0 %	40 %	24212838
120	NC_004342	TTGAA	2	10	150785	150794	40 %	40 %	20 %	0 %	24212838
121	NC_004342	TATCG	2	10	151114	151123	20 %	40 %	20 %	20 %	24212838
122	NC_004342	CGTAT	2	10	152451	152460	20 %	40 %	20 %	20 %	24212840
123	NC_004342	TTATA	2	10	152978	152987	40 %	60 %	0 %	0 %	24212841
124	NC_004342	TTCTA	2	10	153147	153156	20 %	60 %	0 %	20 %	24212841
125	NC_004342	CGAAA	2	10	154715	154724	60 %	0 %	20 %	20 %	24212843
126	NC_004342	GATTC	2	10	154744	154753	20 %	40 %	20 %	20 %	24212843
127	NC_004342	CTTTC	2	10	155924	155933	0 %	60 %	0 %	40 %	24212845
128	NC_004342	TTAAG	2	10	156674	156683	40 %	40 %	20 %	0 %	24212845
129	NC_004342	GATTT	2	10	158002	158011	20 %	60 %	20 %	0 %	24212846
130	NC_004342	ATTTT	2	10	161006	161015	20 %	80 %	0 %	0 %	24212848
131	NC_004342	TAGTC	2	10	161981	161990	20 %	40 %	20 %	20 %	24212849
132	NC_004342	GATTC	2	10	163074	163083	20 %	40 %	20 %	20 %	24212850
133	NC_004342	GGAAG	2	10	168184	168193	40 %	0 %	60 %	0 %	294827586
134	NC_004342	TTTCT	2	10	168987	168996	0 %	80 %	0 %	20 %	294827586
135	NC_004342	CAGAC	2	10	169159	169168	40 %	0 %	20 %	40 %	294827586
136	NC_004342	TCTAA	2	10	171820	171829	40 %	40 %	0 %	20 %	24212860
137	NC_004342	GAAAA	2	10	173003	173012	80 %	0 %	20 %	0 %	24212861
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