MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 13302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004342	GTTT	2	8	111	118	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004342	AGAA	2	8	404	411	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
3	NC_004342	ATGA	2	8	771	778	50 %	25 %	25 %	0 %	24212701
4	NC_004342	GAAA	2	8	933	940	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
5	NC_004342	ATTT	2	8	1182	1189	25 %	75 %	0 %	0 %	24212701
6	NC_004342	GAAA	2	8	1235	1242	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
7	NC_004342	AGAA	3	12	1356	1367	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
8	NC_004342	TTTA	2	8	1393	1400	25 %	75 %	0 %	0 %	24212701
9	NC_004342	ATTC	2	8	1567	1574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_004342	GGTT	2	8	2058	2065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004342	TTTA	2	8	2384	2391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004342	TAAA	2	8	2533	2540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004342	AATT	2	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004342	AAAT	2	8	2999	3006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004342	TTAA	2	8	3192	3199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004342	TCAA	2	8	3374	3381	50 %	25 %	0 %	25 %	24212702
17	NC_004342	CTTC	2	8	3791	3798	0 %	50 %	0 %	50 %	24212702
18	NC_004342	ATTG	2	8	3946	3953	25 %	50 %	25 %	0 %	24212702
19	NC_004342	ATTT	2	8	4309	4316	25 %	75 %	0 %	0 %	24212702
20	NC_004342	GAAA	2	8	6226	6233	75 %	0 %	25 %	0 %	24212704
21	NC_004342	TCGT	2	8	6387	6394	0 %	50 %	25 %	25 %	24212704
22	NC_004342	TTCT	2	8	7185	7192	0 %	75 %	0 %	25 %	24212705
23	NC_004342	TTTC	2	8	7308	7315	0 %	75 %	0 %	25 %	24212705
24	NC_004342	AAAC	2	8	7333	7340	75 %	0 %	0 %	25 %	24212705
25	NC_004342	ACAA	2	8	7445	7452	75 %	0 %	0 %	25 %	24212705
26	NC_004342	TTAA	2	8	8246	8253	50 %	50 %	0 %	0 %	24212705
27	NC_004342	GAAC	2	8	8791	8798	50 %	0 %	25 %	25 %	24212706
28	NC_004342	TGAT	2	8	8940	8947	25 %	50 %	25 %	0 %	24212706
29	NC_004342	ACTT	2	8	9129	9136	25 %	50 %	0 %	25 %	24212706
30	NC_004342	TAAA	2	8	9435	9442	75 %	25 %	0 %	0 %	24212706
31	NC_004342	ACTT	2	8	9925	9932	25 %	50 %	0 %	25 %	24212706
32	NC_004342	TTGT	2	8	10032	10039	0 %	75 %	25 %	0 %	24212706
33	NC_004342	TTCT	2	8	12680	12687	0 %	75 %	0 %	25 %	24212709
34	NC_004342	GATT	2	8	13535	13542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004342	TTCT	2	8	13721	13728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_004342	TTTC	2	8	13747	13754	0 %	75 %	0 %	25 %	294827555
37	NC_004342	CATT	2	8	13997	14004	25 %	50 %	0 %	25 %	294827555
38	NC_004342	TCTT	2	8	14020	14027	0 %	75 %	0 %	25 %	294827555
39	NC_004342	AGTA	2	8	14034	14041	50 %	25 %	25 %	0 %	294827555
40	NC_004342	AGAT	2	8	14062	14069	50 %	25 %	25 %	0 %	294827555
41	NC_004342	TGTA	2	8	14811	14818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004342	ACTT	2	8	14962	14969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_004342	TCCA	2	8	15608	15615	25 %	25 %	0 %	50 %	24212711
44	NC_004342	ATTT	2	8	15865	15872	25 %	75 %	0 %	0 %	294827556
45	NC_004342	ATGG	2	8	15936	15943	25 %	25 %	50 %	0 %	294827556
46	NC_004342	AGAA	2	8	15962	15969	75 %	0 %	25 %	0 %	294827556
47	NC_004342	ATTT	2	8	16798	16805	25 %	75 %	0 %	0 %	294827556
48	NC_004342	ATTT	2	8	16875	16882	25 %	75 %	0 %	0 %	294827556
49	NC_004342	AATC	3	12	16969	16980	50 %	25 %	0 %	25 %	294827556
50	NC_004342	ACAA	2	8	17045	17052	75 %	0 %	0 %	25 %	294827556
51	NC_004342	AGAA	2	8	17873	17880	75 %	0 %	25 %	0 %	24212713
52	NC_004342	TGAG	2	8	17956	17963	25 %	25 %	50 %	0 %	24212713
53	NC_004342	TAAA	2	8	19846	19853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004342	TTGC	2	8	20439	20446	0 %	50 %	25 %	25 %	24212717
55	NC_004342	AAAG	2	8	21723	21730	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004342	ATCG	2	8	22021	22028	25 %	25 %	25 %	25 %	24212719
57	NC_004342	ATTT	2	8	22305	22312	25 %	75 %	0 %	0 %	24212720
58	NC_004342	AAAG	2	8	22678	22685	75 %	0 %	25 %	0 %	24212720
59	NC_004342	TTCT	2	8	23061	23068	0 %	75 %	0 %	25 %	24212721
60	NC_004342	AGAA	2	8	23397	23404	75 %	0 %	25 %	0 %	24212721
61	NC_004342	ATTT	2	8	23435	23442	25 %	75 %	0 %	0 %	24212721
62	NC_004342	TGTT	2	8	23993	24000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004342	TACA	2	8	24550	24557	50 %	25 %	0 %	25 %	24212722
64	NC_004342	ATTG	2	8	24662	24669	25 %	50 %	25 %	0 %	24212722
65	NC_004342	TATT	2	8	24851	24858	25 %	75 %	0 %	0 %	24212722
66	NC_004342	ATTA	2	8	24891	24898	50 %	50 %	0 %	0 %	24212722
67	NC_004342	CGGT	2	8	25168	25175	0 %	25 %	50 %	25 %	24212722
68	NC_004342	TTAT	2	8	25198	25205	25 %	75 %	0 %	0 %	24212722
69	NC_004342	AATG	2	8	25266	25273	50 %	25 %	25 %	0 %	24212722
70	NC_004342	GGAT	2	8	25310	25317	25 %	25 %	50 %	0 %	24212722
71	NC_004342	ATTT	2	8	25324	25331	25 %	75 %	0 %	0 %	24212722
72	NC_004342	TTGG	2	8	25431	25438	0 %	50 %	50 %	0 %	24212722
73	NC_004342	AATT	2	8	25860	25867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004342	TAGT	2	8	26382	26389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004342	ATAA	2	8	26604	26611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004342	TTCA	2	8	27078	27085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_004342	AGAC	2	8	27220	27227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_004342	TTAA	2	8	27372	27379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004342	TAAT	2	8	27814	27821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004342	GAAT	2	8	27845	27852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004342	TTTC	2	8	27986	27993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_004342	ATGA	2	8	28020	28027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004342	AAAC	2	8	28077	28084	75 %	0 %	0 %	25 %	24212726
84	NC_004342	GATT	2	8	28294	28301	25 %	50 %	25 %	0 %	24212726
85	NC_004342	ACTT	2	8	28363	28370	25 %	50 %	0 %	25 %	24212726
86	NC_004342	TTCT	2	8	28470	28477	0 %	75 %	0 %	25 %	24212726
87	NC_004342	TTCT	2	8	28506	28513	0 %	75 %	0 %	25 %	24212726
88	NC_004342	AGTC	2	8	28570	28577	25 %	25 %	25 %	25 %	24212726
89	NC_004342	GAAA	2	8	28610	28617	75 %	0 %	25 %	0 %	24212726
90	NC_004342	ACTT	2	8	28926	28933	25 %	50 %	0 %	25 %	24212726
91	NC_004342	CATA	2	8	29167	29174	50 %	25 %	0 %	25 %	24212727
92	NC_004342	AGAT	2	8	29282	29289	50 %	25 %	25 %	0 %	24212727
93	NC_004342	ATTA	2	8	29396	29403	50 %	50 %	0 %	0 %	24212727
94	NC_004342	ATTC	2	8	29490	29497	25 %	50 %	0 %	25 %	24212727
95	NC_004342	ATTT	2	8	29538	29545	25 %	75 %	0 %	0 %	24212727
96	NC_004342	AAAC	2	8	29613	29620	75 %	0 %	0 %	25 %	24212727
97	NC_004342	ATTT	2	8	29892	29899	25 %	75 %	0 %	0 %	24212727
98	NC_004342	TGTA	2	8	30329	30336	25 %	50 %	25 %	0 %	24212727
99	NC_004342	TTTA	2	8	30412	30419	25 %	75 %	0 %	0 %	24212727
100	NC_004342	TAAA	2	8	30490	30497	75 %	25 %	0 %	0 %	24212727
101	NC_004342	AGAA	2	8	30511	30518	75 %	0 %	25 %	0 %	24212727
102	NC_004342	TAGA	2	8	30559	30566	50 %	25 %	25 %	0 %	24212727
103	NC_004342	AAAG	2	8	31143	31150	75 %	0 %	25 %	0 %	24212727
104	NC_004342	AATC	2	8	31195	31202	50 %	25 %	0 %	25 %	24212727
105	NC_004342	ATTT	2	8	31335	31342	25 %	75 %	0 %	0 %	24212727
106	NC_004342	GTTT	2	8	31424	31431	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004342	ACAG	2	8	31832	31839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_004342	AATT	2	8	32010	32017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004342	TCAA	2	8	33195	33202	50 %	25 %	0 %	25 %	294827559
110	NC_004342	GTTT	2	8	33792	33799	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004342	TTCT	2	8	34113	34120	0 %	75 %	0 %	25 %	24212731
112	NC_004342	TCAT	2	8	34235	34242	25 %	50 %	0 %	25 %	24212731
113	NC_004342	GAAA	2	8	35155	35162	75 %	0 %	25 %	0 %	24212733
114	NC_004342	GCTG	2	8	35217	35224	0 %	25 %	50 %	25 %	24212733
115	NC_004342	ATCG	2	8	35604	35611	25 %	25 %	25 %	25 %	24212733
116	NC_004342	GGAA	2	8	35679	35686	50 %	0 %	50 %	0 %	24212733
117	NC_004342	TCTT	2	8	35751	35758	0 %	75 %	0 %	25 %	24212733
118	NC_004342	ATCA	2	8	36067	36074	50 %	25 %	0 %	25 %	24212734
119	NC_004342	TTCT	2	8	36105	36112	0 %	75 %	0 %	25 %	24212734
120	NC_004342	ATCG	2	8	36157	36164	25 %	25 %	25 %	25 %	24212734
121	NC_004342	TGAA	2	8	36214	36221	50 %	25 %	25 %	0 %	24212734
122	NC_004342	ATGT	2	8	36929	36936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004342	AATT	2	8	37176	37183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004342	TCTT	2	8	37308	37315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_004342	AGAA	2	8	37462	37469	75 %	0 %	25 %	0 %	24212735
126	NC_004342	TTTC	2	8	37513	37520	0 %	75 %	0 %	25 %	24212735
127	NC_004342	AATG	2	8	37597	37604	50 %	25 %	25 %	0 %	24212735
128	NC_004342	CATC	2	8	37921	37928	25 %	25 %	0 %	50 %	24212735
129	NC_004342	TGAA	2	8	38779	38786	50 %	25 %	25 %	0 %	24212735
130	NC_004342	TATT	2	8	38927	38934	25 %	75 %	0 %	0 %	24212735
131	NC_004342	CCAA	2	8	39019	39026	50 %	0 %	0 %	50 %	24212735
132	NC_004342	TTTC	2	8	39348	39355	0 %	75 %	0 %	25 %	24212735
133	NC_004342	CTTT	2	8	39436	39443	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_004342	GAAA	2	8	39445	39452	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004342	TTAA	2	8	39454	39461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004342	AAGT	2	8	39802	39809	50 %	25 %	25 %	0 %	24212737
137	NC_004342	TATC	2	8	39986	39993	25 %	50 %	0 %	25 %	24212737
138	NC_004342	GAAG	2	8	40151	40158	50 %	0 %	50 %	0 %	24212737
139	NC_004342	AATT	2	8	40339	40346	50 %	50 %	0 %	0 %	24212737
140	NC_004342	TTCT	2	8	40547	40554	0 %	75 %	0 %	25 %	24212738
141	NC_004342	AGGA	2	8	40562	40569	50 %	0 %	50 %	0 %	24212738
142	NC_004342	AAAT	2	8	41761	41768	75 %	25 %	0 %	0 %	24212740
143	NC_004342	AAAG	2	8	42974	42981	75 %	0 %	25 %	0 %	24212740
144	NC_004342	GAAT	3	12	43044	43055	50 %	25 %	25 %	0 %	24212740
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