MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 9654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004342	AGAA	2	8	404	411	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
2	NC_004342	ATGA	2	8	771	778	50 %	25 %	25 %	0 %	24212701
3	NC_004342	GAAA	2	8	933	940	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
4	NC_004342	ATTT	2	8	1182	1189	25 %	75 %	0 %	0 %	24212701
5	NC_004342	GAAA	2	8	1235	1242	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
6	NC_004342	AGAA	3	12	1356	1367	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
7	NC_004342	TTTA	2	8	1393	1400	25 %	75 %	0 %	0 %	24212701
8	NC_004342	TCAA	2	8	3374	3381	50 %	25 %	0 %	25 %	24212702
9	NC_004342	CTTC	2	8	3791	3798	0 %	50 %	0 %	50 %	24212702
10	NC_004342	ATTG	2	8	3946	3953	25 %	50 %	25 %	0 %	24212702
11	NC_004342	ATTT	2	8	4309	4316	25 %	75 %	0 %	0 %	24212702
12	NC_004342	GAAA	2	8	6226	6233	75 %	0 %	25 %	0 %	24212704
13	NC_004342	TCGT	2	8	6387	6394	0 %	50 %	25 %	25 %	24212704
14	NC_004342	TTCT	2	8	7185	7192	0 %	75 %	0 %	25 %	24212705
15	NC_004342	TTTC	2	8	7308	7315	0 %	75 %	0 %	25 %	24212705
16	NC_004342	AAAC	2	8	7333	7340	75 %	0 %	0 %	25 %	24212705
17	NC_004342	ACAA	2	8	7445	7452	75 %	0 %	0 %	25 %	24212705
18	NC_004342	TTAA	2	8	8246	8253	50 %	50 %	0 %	0 %	24212705
19	NC_004342	GAAC	2	8	8791	8798	50 %	0 %	25 %	25 %	24212706
20	NC_004342	TGAT	2	8	8940	8947	25 %	50 %	25 %	0 %	24212706
21	NC_004342	ACTT	2	8	9129	9136	25 %	50 %	0 %	25 %	24212706
22	NC_004342	TAAA	2	8	9435	9442	75 %	25 %	0 %	0 %	24212706
23	NC_004342	ACTT	2	8	9925	9932	25 %	50 %	0 %	25 %	24212706
24	NC_004342	TTGT	2	8	10032	10039	0 %	75 %	25 %	0 %	24212706
25	NC_004342	TTCT	2	8	12680	12687	0 %	75 %	0 %	25 %	24212709
26	NC_004342	TTTC	2	8	13747	13754	0 %	75 %	0 %	25 %	294827555
27	NC_004342	CATT	2	8	13997	14004	25 %	50 %	0 %	25 %	294827555
28	NC_004342	TCTT	2	8	14020	14027	0 %	75 %	0 %	25 %	294827555
29	NC_004342	AGTA	2	8	14034	14041	50 %	25 %	25 %	0 %	294827555
30	NC_004342	AGAT	2	8	14062	14069	50 %	25 %	25 %	0 %	294827555
31	NC_004342	TCCA	2	8	15608	15615	25 %	25 %	0 %	50 %	24212711
32	NC_004342	ATTT	2	8	15865	15872	25 %	75 %	0 %	0 %	294827556
33	NC_004342	ATGG	2	8	15936	15943	25 %	25 %	50 %	0 %	294827556
34	NC_004342	AGAA	2	8	15962	15969	75 %	0 %	25 %	0 %	294827556
35	NC_004342	ATTT	2	8	16798	16805	25 %	75 %	0 %	0 %	294827556
36	NC_004342	ATTT	2	8	16875	16882	25 %	75 %	0 %	0 %	294827556
37	NC_004342	AATC	3	12	16969	16980	50 %	25 %	0 %	25 %	294827556
38	NC_004342	ACAA	2	8	17045	17052	75 %	0 %	0 %	25 %	294827556
39	NC_004342	AGAA	2	8	17873	17880	75 %	0 %	25 %	0 %	24212713
40	NC_004342	TGAG	2	8	17956	17963	25 %	25 %	50 %	0 %	24212713
41	NC_004342	TTGC	2	8	20439	20446	0 %	50 %	25 %	25 %	24212717
42	NC_004342	ATCG	2	8	22021	22028	25 %	25 %	25 %	25 %	24212719
43	NC_004342	ATTT	2	8	22305	22312	25 %	75 %	0 %	0 %	24212720
44	NC_004342	AAAG	2	8	22678	22685	75 %	0 %	25 %	0 %	24212720
45	NC_004342	TTCT	2	8	23061	23068	0 %	75 %	0 %	25 %	24212721
46	NC_004342	AGAA	2	8	23397	23404	75 %	0 %	25 %	0 %	24212721
47	NC_004342	ATTT	2	8	23435	23442	25 %	75 %	0 %	0 %	24212721
48	NC_004342	TACA	2	8	24550	24557	50 %	25 %	0 %	25 %	24212722
49	NC_004342	ATTG	2	8	24662	24669	25 %	50 %	25 %	0 %	24212722
50	NC_004342	TATT	2	8	24851	24858	25 %	75 %	0 %	0 %	24212722
51	NC_004342	ATTA	2	8	24891	24898	50 %	50 %	0 %	0 %	24212722
52	NC_004342	CGGT	2	8	25168	25175	0 %	25 %	50 %	25 %	24212722
53	NC_004342	TTAT	2	8	25198	25205	25 %	75 %	0 %	0 %	24212722
54	NC_004342	AATG	2	8	25266	25273	50 %	25 %	25 %	0 %	24212722
55	NC_004342	GGAT	2	8	25310	25317	25 %	25 %	50 %	0 %	24212722
56	NC_004342	ATTT	2	8	25324	25331	25 %	75 %	0 %	0 %	24212722
57	NC_004342	TTGG	2	8	25431	25438	0 %	50 %	50 %	0 %	24212722
58	NC_004342	AAAC	2	8	28077	28084	75 %	0 %	0 %	25 %	24212726
59	NC_004342	GATT	2	8	28294	28301	25 %	50 %	25 %	0 %	24212726
60	NC_004342	ACTT	2	8	28363	28370	25 %	50 %	0 %	25 %	24212726
61	NC_004342	TTCT	2	8	28470	28477	0 %	75 %	0 %	25 %	24212726
62	NC_004342	TTCT	2	8	28506	28513	0 %	75 %	0 %	25 %	24212726
63	NC_004342	AGTC	2	8	28570	28577	25 %	25 %	25 %	25 %	24212726
64	NC_004342	GAAA	2	8	28610	28617	75 %	0 %	25 %	0 %	24212726
65	NC_004342	ACTT	2	8	28926	28933	25 %	50 %	0 %	25 %	24212726
66	NC_004342	CATA	2	8	29167	29174	50 %	25 %	0 %	25 %	24212727
67	NC_004342	AGAT	2	8	29282	29289	50 %	25 %	25 %	0 %	24212727
68	NC_004342	ATTA	2	8	29396	29403	50 %	50 %	0 %	0 %	24212727
69	NC_004342	ATTC	2	8	29490	29497	25 %	50 %	0 %	25 %	24212727
70	NC_004342	ATTT	2	8	29538	29545	25 %	75 %	0 %	0 %	24212727
71	NC_004342	AAAC	2	8	29613	29620	75 %	0 %	0 %	25 %	24212727
72	NC_004342	ATTT	2	8	29892	29899	25 %	75 %	0 %	0 %	24212727
73	NC_004342	TGTA	2	8	30329	30336	25 %	50 %	25 %	0 %	24212727
74	NC_004342	TTTA	2	8	30412	30419	25 %	75 %	0 %	0 %	24212727
75	NC_004342	TAAA	2	8	30490	30497	75 %	25 %	0 %	0 %	24212727
76	NC_004342	AGAA	2	8	30511	30518	75 %	0 %	25 %	0 %	24212727
77	NC_004342	TAGA	2	8	30559	30566	50 %	25 %	25 %	0 %	24212727
78	NC_004342	AAAG	2	8	31143	31150	75 %	0 %	25 %	0 %	24212727
79	NC_004342	AATC	2	8	31195	31202	50 %	25 %	0 %	25 %	24212727
80	NC_004342	ATTT	2	8	31335	31342	25 %	75 %	0 %	0 %	24212727
81	NC_004342	TCAA	2	8	33195	33202	50 %	25 %	0 %	25 %	294827559
82	NC_004342	TTCT	2	8	34113	34120	0 %	75 %	0 %	25 %	24212731
83	NC_004342	TCAT	2	8	34235	34242	25 %	50 %	0 %	25 %	24212731
84	NC_004342	GAAA	2	8	35155	35162	75 %	0 %	25 %	0 %	24212733
85	NC_004342	GCTG	2	8	35217	35224	0 %	25 %	50 %	25 %	24212733
86	NC_004342	ATCG	2	8	35604	35611	25 %	25 %	25 %	25 %	24212733
87	NC_004342	GGAA	2	8	35679	35686	50 %	0 %	50 %	0 %	24212733
88	NC_004342	TCTT	2	8	35751	35758	0 %	75 %	0 %	25 %	24212733
89	NC_004342	ATCA	2	8	36067	36074	50 %	25 %	0 %	25 %	24212734
90	NC_004342	TTCT	2	8	36105	36112	0 %	75 %	0 %	25 %	24212734
91	NC_004342	ATCG	2	8	36157	36164	25 %	25 %	25 %	25 %	24212734
92	NC_004342	TGAA	2	8	36214	36221	50 %	25 %	25 %	0 %	24212734
93	NC_004342	AGAA	2	8	37462	37469	75 %	0 %	25 %	0 %	24212735
94	NC_004342	TTTC	2	8	37513	37520	0 %	75 %	0 %	25 %	24212735
95	NC_004342	AATG	2	8	37597	37604	50 %	25 %	25 %	0 %	24212735
96	NC_004342	CATC	2	8	37921	37928	25 %	25 %	0 %	50 %	24212735
97	NC_004342	TGAA	2	8	38779	38786	50 %	25 %	25 %	0 %	24212735
98	NC_004342	TATT	2	8	38927	38934	25 %	75 %	0 %	0 %	24212735
99	NC_004342	CCAA	2	8	39019	39026	50 %	0 %	0 %	50 %	24212735
100	NC_004342	TTTC	2	8	39348	39355	0 %	75 %	0 %	25 %	24212735
101	NC_004342	AAGT	2	8	39802	39809	50 %	25 %	25 %	0 %	24212737
102	NC_004342	TATC	2	8	39986	39993	25 %	50 %	0 %	25 %	24212737
103	NC_004342	GAAG	2	8	40151	40158	50 %	0 %	50 %	0 %	24212737
104	NC_004342	AATT	2	8	40339	40346	50 %	50 %	0 %	0 %	24212737
105	NC_004342	TTCT	2	8	40547	40554	0 %	75 %	0 %	25 %	24212738
106	NC_004342	AGGA	2	8	40562	40569	50 %	0 %	50 %	0 %	24212738
107	NC_004342	AAAT	2	8	41761	41768	75 %	25 %	0 %	0 %	24212740
108	NC_004342	AAAG	2	8	42974	42981	75 %	0 %	25 %	0 %	24212740
109	NC_004342	GAAT	3	12	43044	43055	50 %	25 %	25 %	0 %	24212740
110	NC_004342	GAAA	2	8	43111	43118	75 %	0 %	25 %	0 %	24212740
111	NC_004342	ATGA	2	8	43283	43290	50 %	25 %	25 %	0 %	24212740
112	NC_004342	TTCG	2	8	43371	43378	0 %	50 %	25 %	25 %	24212740
113	NC_004342	AAAG	2	8	43966	43973	75 %	0 %	25 %	0 %	24212740
114	NC_004342	GAAA	2	8	44281	44288	75 %	0 %	25 %	0 %	294827561
115	NC_004342	AGAC	2	8	44582	44589	50 %	0 %	25 %	25 %	294827561
116	NC_004342	TTGG	2	8	45664	45671	0 %	50 %	50 %	0 %	24212742
117	NC_004342	TTCT	2	8	46447	46454	0 %	75 %	0 %	25 %	24212743
118	NC_004342	AGAT	2	8	47640	47647	50 %	25 %	25 %	0 %	24212743
119	NC_004342	TATT	2	8	47696	47703	25 %	75 %	0 %	0 %	24212743
120	NC_004342	ATAC	2	8	47749	47756	50 %	25 %	0 %	25 %	24212743
121	NC_004342	GAAA	2	8	48324	48331	75 %	0 %	25 %	0 %	24212745
122	NC_004342	TAAA	2	8	48413	48420	75 %	25 %	0 %	0 %	24212745
123	NC_004342	TGGA	2	8	48861	48868	25 %	25 %	50 %	0 %	24212746
124	NC_004342	AGCT	2	8	49352	49359	25 %	25 %	25 %	25 %	24212746
125	NC_004342	ATTC	2	8	49857	49864	25 %	50 %	0 %	25 %	24212747
126	NC_004342	TTCC	2	8	52053	52060	0 %	50 %	0 %	50 %	24212749
127	NC_004342	AACA	2	8	52752	52759	75 %	0 %	0 %	25 %	24212749
128	NC_004342	TCTT	2	8	52903	52910	0 %	75 %	0 %	25 %	24212749
129	NC_004342	AGAA	2	8	53348	53355	75 %	0 %	25 %	0 %	24212749
130	NC_004342	TCAA	2	8	53367	53374	50 %	25 %	0 %	25 %	24212749
131	NC_004342	AATC	2	8	54618	54625	50 %	25 %	0 %	25 %	24212750
132	NC_004342	ATCA	2	8	55297	55304	50 %	25 %	0 %	25 %	24212751
133	NC_004342	AAAC	2	8	55324	55331	75 %	0 %	0 %	25 %	24212751
134	NC_004342	GGAA	2	8	55940	55947	50 %	0 %	50 %	0 %	24212751
135	NC_004342	CATT	2	8	56274	56281	25 %	50 %	0 %	25 %	24212752
136	NC_004342	ATTT	2	8	56323	56330	25 %	75 %	0 %	0 %	24212752
137	NC_004342	CGAT	2	8	56783	56790	25 %	25 %	25 %	25 %	24212752
138	NC_004342	TTCT	2	8	57116	57123	0 %	75 %	0 %	25 %	24212752
139	NC_004342	TTAC	2	8	57134	57141	25 %	50 %	0 %	25 %	24212752
140	NC_004342	GGAA	2	8	57409	57416	50 %	0 %	50 %	0 %	24212753
141	NC_004342	AGGA	2	8	57595	57602	50 %	0 %	50 %	0 %	24212753
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