MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 46413

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004342	CTT	2	6	126	131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004342	GGA	2	6	242	247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24212701
3	NC_004342	GAA	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212701
4	NC_004342	TAT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212701
5	NC_004342	AGC	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212701
6	NC_004342	TCT	2	6	762	767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
7	NC_004342	GAT	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212701
8	NC_004342	TCA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212701
9	NC_004342	GAA	2	6	1143	1148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212701
10	NC_004342	CTT	2	6	1158	1163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
11	NC_004342	TCT	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
12	NC_004342	CTT	2	6	1497	1502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
13	NC_004342	CAA	2	6	1505	1510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212701
14	NC_004342	TAT	2	6	1630	1635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004342	TAA	2	6	1730	1735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004342	AGT	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004342	TCA	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_004342	TCA	2	6	1953	1958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_004342	AGA	2	6	2005	2010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004342	CGA	2	6	2025	2030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004342	ATT	2	6	2047	2052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004342	AGT	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004342	AAG	2	6	2276	2281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004342	CAA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004342	TGA	2	6	2373	2378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004342	ATG	2	6	2439	2444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004342	AAT	2	6	2506	2511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004342	TCA	2	6	2620	2625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004342	GTA	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004342	TAC	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_004342	GTT	2	6	2685	2690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004342	TAT	2	6	2791	2796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004342	ATT	2	6	2857	2862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004342	TAA	2	6	2967	2972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004342	ATT	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004342	TAC	2	6	3156	3161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_004342	AAT	2	6	3176	3181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004342	TAC	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212702
39	NC_004342	TAT	2	6	3306	3311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212702
40	NC_004342	CTG	2	6	3393	3398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212702
41	NC_004342	AAG	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
42	NC_004342	AAC	2	6	3435	3440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212702
43	NC_004342	AGA	2	6	3490	3495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
44	NC_004342	TTC	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
45	NC_004342	TGA	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212702
46	NC_004342	TTC	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
47	NC_004342	TCT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
48	NC_004342	CTT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
49	NC_004342	TTG	2	6	3747	3752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212702
50	NC_004342	GAA	2	6	3762	3767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
51	NC_004342	TAT	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212702
52	NC_004342	ACA	2	6	3924	3929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212702
53	NC_004342	TAT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212702
54	NC_004342	AGA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
55	NC_004342	AGA	2	6	4063	4068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
56	NC_004342	GAC	2	6	4235	4240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212702
57	NC_004342	TAT	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004342	TAT	2	6	4357	4362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004342	ATA	2	6	4363	4368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004342	TAT	2	6	4509	4514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004342	TTA	2	6	4692	4697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004342	AGA	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004342	GAA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
64	NC_004342	TAT	2	6	5137	5142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
65	NC_004342	ATT	2	6	5203	5208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
66	NC_004342	AAG	2	6	5305	5310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
67	NC_004342	TAT	2	6	5353	5358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
68	NC_004342	GGT	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212703
69	NC_004342	CGG	2	6	5395	5400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212703
70	NC_004342	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
71	NC_004342	TTC	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212703
72	NC_004342	ATA	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212703
73	NC_004342	CAA	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212703
74	NC_004342	AAG	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
75	NC_004342	GTT	2	6	5595	5600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212703
76	NC_004342	GGA	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24212703
77	NC_004342	GAT	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212703
78	NC_004342	GGC	2	6	5861	5866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212703
79	NC_004342	ATT	2	6	5875	5880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
80	NC_004342	TGA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212703
81	NC_004342	AGA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
82	NC_004342	ACG	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212703
83	NC_004342	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212704
84	NC_004342	TTG	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212704
85	NC_004342	ATC	2	6	6350	6355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212704
86	NC_004342	CTT	2	6	6426	6431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212704
87	NC_004342	TTC	2	6	6546	6551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212704
88	NC_004342	AAG	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
89	NC_004342	GTT	2	6	6908	6913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212705
90	NC_004342	GGT	2	6	6932	6937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212705
91	NC_004342	ATG	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212705
92	NC_004342	TTC	2	6	7084	7089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212705
93	NC_004342	TTC	2	6	7108	7113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212705
94	NC_004342	CCA	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24212705
95	NC_004342	GAC	2	6	7379	7384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212705
96	NC_004342	AAG	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
97	NC_004342	GAA	2	6	7818	7823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
98	NC_004342	GGT	3	9	7838	7846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212705
99	NC_004342	GGT	2	6	7925	7930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212705
100	NC_004342	TTC	2	6	7968	7973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212705
101	NC_004342	GAA	2	6	8033	8038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
102	NC_004342	CTT	2	6	8168	8173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212705
103	NC_004342	CCT	2	6	8234	8239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24212705
104	NC_004342	ATT	2	6	8302	8307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212705
105	NC_004342	AGA	2	6	8449	8454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
106	NC_004342	AAG	2	6	8688	8693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
107	NC_004342	AGA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
108	NC_004342	TTG	2	6	8841	8846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212706
109	NC_004342	ATC	2	6	8865	8870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212706
110	NC_004342	CGG	2	6	8985	8990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212706
111	NC_004342	GAA	2	6	9029	9034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
112	NC_004342	TTA	2	6	9035	9040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212706
113	NC_004342	ATG	2	6	9081	9086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212706
114	NC_004342	AAC	2	6	9096	9101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212706
115	NC_004342	TTC	2	6	9145	9150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212706
116	NC_004342	TCC	2	6	9181	9186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24212706
117	NC_004342	ATT	2	6	9299	9304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212706
118	NC_004342	AGA	2	6	9379	9384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
119	NC_004342	AGA	2	6	9802	9807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
120	NC_004342	TCC	2	6	9838	9843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24212706
121	NC_004342	ACA	2	6	9853	9858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212706
122	NC_004342	TGA	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212706
123	NC_004342	AGA	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
124	NC_004342	GAA	2	6	9965	9970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
125	NC_004342	ATC	2	6	9983	9988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212706
126	NC_004342	AAG	2	6	10050	10055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
127	NC_004342	TTC	2	6	10114	10119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212706
128	NC_004342	GAA	2	6	10148	10153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
129	NC_004342	GGT	2	6	10226	10231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212706
130	NC_004342	GAT	2	6	10262	10267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212706
131	NC_004342	ATA	2	6	10302	10307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212706
132	NC_004342	AAG	2	6	10374	10379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
133	NC_004342	ATC	2	6	10403	10408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212706
134	NC_004342	TCT	2	6	10474	10479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212706
135	NC_004342	TTA	2	6	10500	10505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212706
136	NC_004342	ATT	2	6	10550	10555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212706
137	NC_004342	CAT	2	6	10666	10671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212706
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142	NC_004342	GAA	2	6	10814	10819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
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259	NC_004342	TAT	2	6	21690	21695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_004342	AGA	2	6	21761	21766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_004342	CTT	2	6	21863	21868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212719
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393	NC_004342	CAT	2	6	32987	32992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294827559
394	NC_004342	TTC	2	6	33012	33017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827559
395	NC_004342	CTT	2	6	33125	33130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827559
396	NC_004342	TTC	2	6	33330	33335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827559
397	NC_004342	ATT	2	6	33349	33354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294827559
398	NC_004342	TTC	2	6	33415	33420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827559
399	NC_004342	GAA	2	6	33539	33544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294827559
400	NC_004342	CTT	2	6	33566	33571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827559
401	NC_004342	AGG	2	6	33592	33597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294827559
402	NC_004342	TAA	2	6	33598	33603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294827559
403	NC_004342	TTC	2	6	33697	33702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827559
404	NC_004342	TGA	2	6	33703	33708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294827559
405	NC_004342	CTT	2	6	33723	33728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827559
406	NC_004342	ATT	2	6	33825	33830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_004342	AAG	2	6	33860	33865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
408	NC_004342	CAA	2	6	34159	34164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212731
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410	NC_004342	CGG	2	6	34296	34301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212731
411	NC_004342	GTG	2	6	34363	34368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212731
412	NC_004342	CTC	2	6	34406	34411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24212731
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414	NC_004342	CTT	2	6	34693	34698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212731
415	NC_004342	AGA	2	6	34788	34793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212732
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417	NC_004342	TCC	2	6	34962	34967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24212732
418	NC_004342	ACG	2	6	35018	35023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212732
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427	NC_004342	TTG	2	6	36197	36202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212734
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429	NC_004342	TGT	2	6	36275	36280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212734
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431	NC_004342	TCT	2	6	36337	36342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212734
432	NC_004342	GAA	2	6	36393	36398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212734
433	NC_004342	GCC	2	6	36434	36439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24212734
434	NC_004342	GTT	2	6	36456	36461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212734
435	NC_004342	ATC	2	6	36467	36472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212734
436	NC_004342	TAC	2	6	36511	36516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212734
437	NC_004342	TTC	2	6	36541	36546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212734
438	NC_004342	GTT	2	6	36645	36650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212734
439	NC_004342	GAA	2	6	36711	36716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212734
440	NC_004342	TTC	2	6	36724	36729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212734
441	NC_004342	TTC	2	6	36817	36822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212734
442	NC_004342	GTT	2	6	37166	37171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
443	NC_004342	TAA	2	6	37530	37535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212735
444	NC_004342	TTC	2	6	37554	37559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212735
445	NC_004342	CTT	2	6	37614	37619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212735
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448	NC_004342	ATT	2	6	37699	37704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212735
449	NC_004342	TTC	2	6	37990	37995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212735
450	NC_004342	TAT	2	6	38041	38046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212735
451	NC_004342	TTC	2	6	38263	38268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212735
452	NC_004342	TCC	2	6	38276	38281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24212735
453	NC_004342	TAA	2	6	38321	38326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212735
454	NC_004342	GTT	2	6	38370	38375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212735
455	NC_004342	TTG	2	6	38560	38565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212735
456	NC_004342	CTT	2	6	38598	38603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212735
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462	NC_004342	GAT	2	6	39036	39041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212735
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469	NC_004342	TCT	2	6	39368	39373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212735
470	NC_004342	TTC	2	6	39490	39495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_004342	GTT	2	6	39499	39504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_004342	ATT	2	6	39940	39945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212737
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495	NC_004342	ACA	2	6	41753	41758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212740
496	NC_004342	AGA	2	6	41929	41934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212740
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