MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 6214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004342	TA	3	6	206	211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004342	AG	4	8	222	229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004342	TA	4	8	655	662	50 %	50 %	0 %	0 %	24212701
4	NC_004342	TC	3	6	872	877	0 %	50 %	0 %	50 %	24212701
5	NC_004342	AT	3	6	1114	1119	50 %	50 %	0 %	0 %	24212701
6	NC_004342	AT	3	6	1384	1389	50 %	50 %	0 %	0 %	24212701
7	NC_004342	AC	3	6	1457	1462	50 %	0 %	0 %	50 %	24212701
8	NC_004342	TA	3	6	2549	2554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004342	TA	3	6	2955	2960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004342	AG	3	6	3290	3295	50 %	0 %	50 %	0 %	24212702
11	NC_004342	TC	3	6	3349	3354	0 %	50 %	0 %	50 %	24212702
12	NC_004342	TA	3	6	4602	4607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004342	TA	3	6	4993	4998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004342	AG	3	6	10108	10113	50 %	0 %	50 %	0 %	24212706
15	NC_004342	TC	3	6	10391	10396	0 %	50 %	0 %	50 %	24212706
16	NC_004342	GA	3	6	10414	10419	50 %	0 %	50 %	0 %	24212706
17	NC_004342	AT	3	6	10426	10431	50 %	50 %	0 %	0 %	24212706
18	NC_004342	AT	3	6	10767	10772	50 %	50 %	0 %	0 %	24212706
19	NC_004342	AC	3	6	13355	13360	50 %	0 %	0 %	50 %	24212709
20	NC_004342	CA	3	6	13622	13627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004342	AC	3	6	14116	14121	50 %	0 %	0 %	50 %	294827555
22	NC_004342	AT	3	6	14289	14294	50 %	50 %	0 %	0 %	294827555
23	NC_004342	AT	3	6	15128	15133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004342	AC	3	6	15226	15231	50 %	0 %	0 %	50 %	24212711
25	NC_004342	AT	3	6	16998	17003	50 %	50 %	0 %	0 %	294827556
26	NC_004342	TC	3	6	17823	17828	0 %	50 %	0 %	50 %	24212713
27	NC_004342	GA	3	6	18149	18154	50 %	0 %	50 %	0 %	24212713
28	NC_004342	AT	3	6	20199	20204	50 %	50 %	0 %	0 %	24212717
29	NC_004342	TC	3	6	20422	20427	0 %	50 %	0 %	50 %	24212717
30	NC_004342	AT	4	8	20787	20794	50 %	50 %	0 %	0 %	294827557
31	NC_004342	AT	3	6	21751	21756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004342	TA	3	6	23138	23143	50 %	50 %	0 %	0 %	24212721
33	NC_004342	CT	4	8	23241	23248	0 %	50 %	0 %	50 %	24212721
34	NC_004342	TA	3	6	23282	23287	50 %	50 %	0 %	0 %	24212721
35	NC_004342	TA	3	6	23708	23713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004342	TG	3	6	24178	24183	0 %	50 %	50 %	0 %	24212722
37	NC_004342	GA	3	6	24536	24541	50 %	0 %	50 %	0 %	24212722
38	NC_004342	TA	3	6	25743	25748	50 %	50 %	0 %	0 %	24212722
39	NC_004342	GA	3	6	26788	26793	50 %	0 %	50 %	0 %	294827558
40	NC_004342	CA	3	6	27758	27763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_004342	AT	4	8	29721	29728	50 %	50 %	0 %	0 %	24212727
42	NC_004342	TC	3	6	30109	30114	0 %	50 %	0 %	50 %	24212727
43	NC_004342	AT	3	6	30752	30757	50 %	50 %	0 %	0 %	24212727
44	NC_004342	TG	3	6	32633	32638	0 %	50 %	50 %	0 %	294827559
45	NC_004342	GA	3	6	32668	32673	50 %	0 %	50 %	0 %	294827559
46	NC_004342	AT	3	6	33735	33740	50 %	50 %	0 %	0 %	294827559
47	NC_004342	GA	3	6	36379	36384	50 %	0 %	50 %	0 %	24212734
48	NC_004342	GA	3	6	36800	36805	50 %	0 %	50 %	0 %	24212734
49	NC_004342	CG	3	6	38387	38392	0 %	0 %	50 %	50 %	24212735
50	NC_004342	AT	3	6	43234	43239	50 %	50 %	0 %	0 %	24212740
51	NC_004342	TA	3	6	43263	43268	50 %	50 %	0 %	0 %	24212740
52	NC_004342	TA	4	8	44378	44385	50 %	50 %	0 %	0 %	294827561
53	NC_004342	AG	3	6	44513	44518	50 %	0 %	50 %	0 %	294827561
54	NC_004342	AT	3	6	44650	44655	50 %	50 %	0 %	0 %	294827561
55	NC_004342	AT	3	6	46320	46325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004342	TC	3	6	46958	46963	0 %	50 %	0 %	50 %	24212743
57	NC_004342	AT	3	6	50326	50331	50 %	50 %	0 %	0 %	24212747
58	NC_004342	TA	3	6	51008	51013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004342	TA	3	6	51170	51175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004342	TA	3	6	51376	51381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004342	TA	3	6	51764	51769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004342	GA	3	6	52071	52076	50 %	0 %	50 %	0 %	24212749
63	NC_004342	TC	3	6	52260	52265	0 %	50 %	0 %	50 %	24212749
64	NC_004342	TA	3	6	53270	53275	50 %	50 %	0 %	0 %	24212749
65	NC_004342	TG	3	6	55105	55110	0 %	50 %	50 %	0 %	24212751
66	NC_004342	AG	3	6	55498	55503	50 %	0 %	50 %	0 %	24212751
67	NC_004342	AG	3	6	57688	57693	50 %	0 %	50 %	0 %	24212753
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69	NC_004342	AG	3	6	58923	58928	50 %	0 %	50 %	0 %	24212754
70	NC_004342	AT	3	6	59294	59299	50 %	50 %	0 %	0 %	24212755
71	NC_004342	AG	3	6	59888	59893	50 %	0 %	50 %	0 %	24212755
72	NC_004342	AT	3	6	60103	60108	50 %	50 %	0 %	0 %	24212755
73	NC_004342	AT	3	6	60625	60630	50 %	50 %	0 %	0 %	24212756
74	NC_004342	GA	3	6	62207	62212	50 %	0 %	50 %	0 %	24212756
75	NC_004342	GA	3	6	62737	62742	50 %	0 %	50 %	0 %	24212757
76	NC_004342	AT	3	6	63137	63142	50 %	50 %	0 %	0 %	24212757
77	NC_004342	GA	3	6	65414	65419	50 %	0 %	50 %	0 %	24212760
78	NC_004342	AT	3	6	67646	67651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004342	TC	3	6	68165	68170	0 %	50 %	0 %	50 %	24212762
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82	NC_004342	TA	3	6	71311	71316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004342	AG	3	6	71409	71414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004342	TA	3	6	71425	71430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004342	TC	3	6	71853	71858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_004342	TA	3	6	72348	72353	50 %	50 %	0 %	0 %	294827564
87	NC_004342	GA	3	6	73251	73256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_004342	AT	3	6	75133	75138	50 %	50 %	0 %	0 %	24212767
90	NC_004342	AG	3	6	75594	75599	50 %	0 %	50 %	0 %	24212767
91	NC_004342	AG	3	6	76249	76254	50 %	0 %	50 %	0 %	24212767
92	NC_004342	GA	3	6	76431	76436	50 %	0 %	50 %	0 %	24212767
93	NC_004342	AG	3	6	76542	76547	50 %	0 %	50 %	0 %	24212767
94	NC_004342	TA	3	6	76952	76957	50 %	50 %	0 %	0 %	24212767
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98	NC_004342	AT	3	6	80499	80504	50 %	50 %	0 %	0 %	294827566
99	NC_004342	TA	3	6	80564	80569	50 %	50 %	0 %	0 %	294827566
100	NC_004342	TA	3	6	81122	81127	50 %	50 %	0 %	0 %	294827566
101	NC_004342	TA	3	6	82568	82573	50 %	50 %	0 %	0 %	294827566
102	NC_004342	TA	3	6	83426	83431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004342	TA	3	6	83493	83498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004342	TA	3	6	84156	84161	50 %	50 %	0 %	0 %	24212772
105	NC_004342	TA	3	6	86396	86401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004342	TA	3	6	86410	86415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004342	AT	3	6	86955	86960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004342	AT	3	6	87759	87764	50 %	50 %	0 %	0 %	294827570
109	NC_004342	AT	4	8	88442	88449	50 %	50 %	0 %	0 %	24212777
110	NC_004342	AT	3	6	88520	88525	50 %	50 %	0 %	0 %	24212777
111	NC_004342	GT	3	6	89413	89418	0 %	50 %	50 %	0 %	294827571
112	NC_004342	AT	3	6	89573	89578	50 %	50 %	0 %	0 %	294827571
113	NC_004342	AT	3	6	89948	89953	50 %	50 %	0 %	0 %	294827571
114	NC_004342	TC	3	6	91330	91335	0 %	50 %	0 %	50 %	24212781
115	NC_004342	AT	3	6	92749	92754	50 %	50 %	0 %	0 %	24212783
116	NC_004342	AT	3	6	93867	93872	50 %	50 %	0 %	0 %	294827572
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119	NC_004342	TA	3	6	94501	94506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004342	CT	3	6	94935	94940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_004342	CT	3	6	95390	95395	0 %	50 %	0 %	50 %	294827573
122	NC_004342	AT	3	6	96130	96135	50 %	50 %	0 %	0 %	294827573
123	NC_004342	TC	3	6	97369	97374	0 %	50 %	0 %	50 %	24212791
124	NC_004342	GA	3	6	97967	97972	50 %	0 %	50 %	0 %	24212792
125	NC_004342	TA	3	6	99338	99343	50 %	50 %	0 %	0 %	24212794
126	NC_004342	AT	3	6	99976	99981	50 %	50 %	0 %	0 %	24212794
127	NC_004342	AT	3	6	100245	100250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004342	GC	3	6	100642	100647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_004342	GA	3	6	102095	102100	50 %	0 %	50 %	0 %	24212798
130	NC_004342	TA	3	6	103327	103332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004342	TA	3	6	104060	104065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004342	TA	3	6	104451	104456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004342	GA	3	6	105796	105801	50 %	0 %	50 %	0 %	294827576
134	NC_004342	AT	3	6	106249	106254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004342	TA	3	6	106271	106276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004342	TA	3	6	106322	106327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004342	AT	3	6	106498	106503	50 %	50 %	0 %	0 %	24212801
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139	NC_004342	TA	3	6	106906	106911	50 %	50 %	0 %	0 %	24212801
140	NC_004342	AG	4	8	107196	107203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004342	TC	4	8	108678	108685	0 %	50 %	0 %	50 %	24212802
142	NC_004342	GA	3	6	109454	109459	50 %	0 %	50 %	0 %	24212803
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144	NC_004342	AT	3	6	113529	113534	50 %	50 %	0 %	0 %	294827577
145	NC_004342	AT	3	6	113930	113935	50 %	50 %	0 %	0 %	294827577
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147	NC_004342	AG	3	6	116666	116671	50 %	0 %	50 %	0 %	24212810
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