MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004337	TCTTT	2	10	11867	11876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_004337	ATTTA	2	10	28660	28669	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004337	TCGCG	2	10	65978	65987	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_004337	TAGTG	2	10	73456	73465	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004337	ATTTT	2	10	75172	75181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004337	AATGC	2	10	115237	115246	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_004337	AGGCG	2	10	128001	128010	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_004337	GGTTG	2	10	128754	128763	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004337	GCGCG	2	10	139129	139138	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_004337	GGCAT	2	10	140087	140096	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_004337	GTAAG	2	10	140851	140860	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004337	TCCTC	2	10	142571	142580	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_004337	ACCGC	2	10	147769	147778	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_004337	GCGGT	2	10	147788	147797	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_004337	TTATC	2	10	159196	159205	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_004337	ACGGG	2	10	171377	171386	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_004337	TACGT	2	10	174076	174085	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_004337	AAATA	2	10	183692	183701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004337	GTCTG	2	10	183777	183786	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_004337	TGCGC	2	10	206961	206970	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_004337	CGGTT	2	10	214420	214429	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_004337	ACCGG	2	10	234392	234401	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_004337	GCCCA	2	10	237867	237876	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_004337	ATTTT	2	10	274181	274190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004337	GGGAA	2	10	274923	274932	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004337	AGCCC	2	10	287549	287558	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_004337	GATGC	2	10	292344	292353	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_004337	CCTTT	2	10	295009	295018	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_004337	CTGGT	2	10	322293	322302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_004337	GTTTC	2	10	361625	361634	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_004337	CTTTT	2	10	365100	365109	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_004337	GGAGT	2	10	367672	367681	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004337	GCCCG	2	10	384621	384630	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_004337	GAAGA	2	10	396541	396550	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004337	TCAGG	2	10	403945	403954	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_004337	TGAGT	2	10	410294	410303	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004337	CAGGT	2	10	413019	413028	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_004337	TCAGG	2	10	441316	441325	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_004337	CAGGC	2	10	455934	455943	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_004337	GCTGG	2	10	457994	458003	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_004337	TATTT	2	10	458592	458601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004337	GTTTC	2	10	476328	476337	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_004337	GCGCG	2	10	482944	482953	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_004337	TGGCA	2	10	492318	492327	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_004337	TAATG	2	10	494284	494293	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004337	AGCGT	2	10	503031	503040	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_004337	CTTAA	2	10	504606	504615	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_004337	GTCAG	2	10	511595	511604	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_004337	GTCAG	2	10	512098	512107	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_004337	GCAGT	2	10	515323	515332	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_004337	TAATC	2	10	521807	521816	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_004337	GTTAA	2	10	533139	533148	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004337	CATCC	2	10	538231	538240	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_004337	TGGGT	2	10	538474	538483	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004337	AAACG	2	10	549279	549288	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_004337	ATGCC	2	10	552318	552327	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_004337	CACGA	2	10	576821	576830	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_004337	AAAAT	2	10	603953	603962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004337	GATGG	2	10	608503	608512	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004337	AATTT	2	10	608796	608805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004337	CGCCT	2	10	608989	608998	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_004337	GCGCA	2	10	612719	612728	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_004337	ATCTA	2	10	618791	618800	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_004337	AATTA	2	10	624459	624468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004337	GCCGC	2	10	629077	629086	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_004337	CCCTG	2	10	629888	629897	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_004337	GTACC	2	10	630804	630813	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_004337	GCCAG	2	10	631487	631496	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_004337	CCGGC	2	10	632329	632338	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_004337	GCTTT	2	10	632995	633004	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_004337	GTTCC	2	10	633539	633548	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_004337	CAGTG	2	10	638866	638875	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_004337	CGCGA	2	10	643617	643626	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_004337	AAGCG	2	10	643981	643990	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_004337	TCGCA	2	10	648021	648030	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_004337	CCCTG	2	10	649032	649041	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_004337	AGCCC	2	10	652035	652044	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_004337	GGTGC	2	10	662599	662608	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_004337	ACGCC	2	10	667680	667689	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_004337	ATATA	2	10	673935	673944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004337	TTGCT	2	10	675556	675565	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_004337	GCTAT	2	10	675661	675670	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_004337	TTACG	2	10	687858	687867	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_004337	CGTTC	2	10	689065	689074	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_004337	ATTGA	2	10	690255	690264	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004337	CAAAT	2	10	692560	692569	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004337	GGTTT	2	10	697243	697252	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004337	AAATC	2	10	714288	714297	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_004337	CCTGG	2	10	746579	746588	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_004337	ACATA	2	10	778952	778961	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_004337	CGCCC	2	10	783119	783128	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
92	NC_004337	TGCGC	2	10	783662	783671	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_004337	GATGC	2	10	785656	785665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_004337	CAAAA	2	10	792398	792407	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_004337	TATAT	2	10	797130	797139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004337	TGATG	2	10	803211	803220	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004337	ATTTT	2	10	817175	817184	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004337	CAGGG	2	10	822224	822233	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_004337	AGTAA	2	10	835345	835354	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004337	AGCGC	2	10	846533	846542	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_004337	TAAAT	2	10	851731	851740	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004337	GGATT	2	10	864204	864213	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004337	GGGAT	2	10	905899	905908	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004337	AACAA	2	10	909570	909579	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_004337	GATGC	2	10	928696	928705	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_004337	AAAAT	2	10	930199	930208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004337	GTAAC	2	10	931053	931062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_004337	GCGTG	2	10	939530	939539	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_004337	GCAAC	2	10	939982	939991	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_004337	AGCAA	2	10	948298	948307	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_004337	TTAAG	2	10	948990	948999	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004337	AGTGG	2	10	949008	949017	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004337	TTCAC	2	10	955385	955394	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_004337	GATGC	2	10	978590	978599	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_004337	GTGAT	2	10	984948	984957	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004337	AGCGA	2	10	992964	992973	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_004337	ATGAC	2	10	994704	994713	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_004337	TATTT	2	10	994767	994776	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004337	TTTTC	2	10	1002742	1002751	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_004337	TTATT	2	10	1003553	1003562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004337	TTCTT	2	10	1005485	1005494	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_004337	TTATG	2	10	1008186	1008195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004337	CTTAT	2	10	1019537	1019546	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_004337	GCATC	2	10	1028991	1029000	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_004337	AATGT	2	10	1034235	1034244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004337	TAAAA	2	10	1038894	1038903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004337	GGCGG	2	10	1076446	1076455	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
128	NC_004337	CTTAA	2	10	1078044	1078053	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_004337	TGACT	2	10	1081949	1081958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_004337	GATCG	2	10	1086577	1086586	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_004337	ACCAC	2	10	1099046	1099055	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_004337	CATTA	2	10	1099081	1099090	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_004337	GTTTC	2	10	1103204	1103213	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_004337	GTCAT	2	10	1108448	1108457	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_004337	GCGAT	2	10	1115471	1115480	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_004337	TGCAG	2	10	1117151	1117160	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_004337	CGTTG	2	10	1121798	1121807	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_004337	AGGCG	2	10	1121920	1121929	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_004337	TCTGC	2	10	1122413	1122422	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_004337	GATCA	2	10	1126598	1126607	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_004337	ACCAG	2	10	1147772	1147781	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_004337	TGAAC	2	10	1148023	1148032	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_004337	TTGTT	2	10	1148035	1148044	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004337	GATGC	2	10	1153508	1153517	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_004337	GAGCA	2	10	1174946	1174955	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_004337	ACATC	2	10	3012797	3012806	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

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