MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 11468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004337	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_004337	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	56479580
3	NC_004337	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	56479580
4	NC_004337	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	56479580
5	NC_004337	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	56479580
6	NC_004337	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	56479580
7	NC_004337	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	56479580
8	NC_004337	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	24111453
9	NC_004337	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	24111453
10	NC_004337	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	24111453
11	NC_004337	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	24111453
12	NC_004337	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	24111453
13	NC_004337	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	24111453
14	NC_004337	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	24111454
15	NC_004337	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	24111456
16	NC_004337	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	24111456
17	NC_004337	GCCA	2	8	7226	7233	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_004337	GCAT	2	8	7955	7962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_004337	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	24111457
20	NC_004337	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	56479582
21	NC_004337	CGAC	2	8	8454	8461	25 %	0 %	25 %	50 %	56479582
22	NC_004337	GGCG	2	8	8743	8750	0 %	0 %	75 %	25 %	56479582
23	NC_004337	AAGA	2	8	8810	8817	75 %	0 %	25 %	0 %	56479582
24	NC_004337	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_004337	AGAT	2	8	9994	10001	50 %	25 %	25 %	0 %	24111460
26	NC_004337	AGAA	2	8	10268	10275	75 %	0 %	25 %	0 %	24111460
27	NC_004337	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004337	GCAG	2	8	10671	10678	25 %	0 %	50 %	25 %	24111461
29	NC_004337	CATT	2	8	11349	11356	25 %	50 %	0 %	25 %	24111461
30	NC_004337	CAGT	2	8	11496	11503	25 %	25 %	25 %	25 %	24111462
31	NC_004337	ATTC	2	8	11911	11918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_004337	AGTG	2	8	12053	12060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004337	ATGG	2	8	12216	12223	25 %	25 %	50 %	0 %	24111463
34	NC_004337	TGGT	2	8	12307	12314	0 %	50 %	50 %	0 %	24111463
35	NC_004337	ACCG	2	8	12674	12681	25 %	0 %	25 %	50 %	24111463
36	NC_004337	CAAC	2	8	12820	12827	50 %	0 %	0 %	50 %	24111463
37	NC_004337	AAGA	2	8	12894	12901	75 %	0 %	25 %	0 %	24111463
38	NC_004337	CCAT	2	8	13471	13478	25 %	25 %	0 %	50 %	24111463
39	NC_004337	GACA	2	8	15683	15690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_004337	AATT	2	8	15897	15904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004337	TAAT	2	8	15916	15923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004337	GGTT	2	8	16286	16293	0 %	50 %	50 %	0 %	24111465
43	NC_004337	GTGG	2	8	16910	16917	0 %	25 %	75 %	0 %	24111465
44	NC_004337	CGTT	2	8	17282	17289	0 %	50 %	25 %	25 %	24111465
45	NC_004337	TTTA	2	8	17454	17461	25 %	75 %	0 %	0 %	56479585
46	NC_004337	CCAC	2	8	17757	17764	25 %	0 %	0 %	75 %	56479585
47	NC_004337	AATA	2	8	18387	18394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004337	CTTC	2	8	18409	18416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_004337	GCCA	2	8	18878	18885	25 %	0 %	25 %	50 %	24111467
50	NC_004337	CAGC	2	8	19011	19018	25 %	0 %	25 %	50 %	24111467
51	NC_004337	AGGA	2	8	19351	19358	50 %	0 %	50 %	0 %	24111468
52	NC_004337	CATA	2	8	20379	20386	50 %	25 %	0 %	25 %	24111470
53	NC_004337	TGCG	2	8	20635	20642	0 %	25 %	50 %	25 %	24111470
54	NC_004337	GCTG	2	8	20877	20884	0 %	25 %	50 %	25 %	24111470
55	NC_004337	CCGC	2	8	21266	21273	0 %	0 %	25 %	75 %	24111470
56	NC_004337	CTGG	2	8	21623	21630	0 %	25 %	50 %	25 %	24111471
57	NC_004337	CTGC	2	8	22084	22091	0 %	25 %	25 %	50 %	24111471
58	NC_004337	TGCG	2	8	22634	22641	0 %	25 %	50 %	25 %	24111471
59	NC_004337	TGGT	2	8	23046	23053	0 %	50 %	50 %	0 %	24111471
60	NC_004337	GTGG	2	8	23839	23846	0 %	25 %	75 %	0 %	24111471
61	NC_004337	GCTG	2	8	24193	24200	0 %	25 %	50 %	25 %	24111472
62	NC_004337	CCAT	2	8	24882	24889	25 %	25 %	0 %	50 %	24111473
63	NC_004337	ATGG	2	8	25565	25572	25 %	25 %	50 %	0 %	24111474
64	NC_004337	TTGA	2	8	26436	26443	25 %	50 %	25 %	0 %	56479587
65	NC_004337	TGGC	2	8	26979	26986	0 %	25 %	50 %	25 %	24111476
66	NC_004337	CTGG	2	8	27439	27446	0 %	25 %	50 %	25 %	24111476
67	NC_004337	GTGG	2	8	27604	27611	0 %	25 %	75 %	0 %	24111476
68	NC_004337	TCAT	2	8	27663	27670	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_004337	TCCC	2	8	27693	27700	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_004337	TGGC	2	8	27734	27741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_004337	GCTG	2	8	27956	27963	0 %	25 %	50 %	25 %	24111477
72	NC_004337	CGTG	2	8	28433	28440	0 %	25 %	50 %	25 %	24111477
73	NC_004337	CATG	2	8	28903	28910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_004337	AGTG	2	8	29053	29060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004337	TCCT	2	8	29215	29222	0 %	50 %	0 %	50 %	56479588
76	NC_004337	CTTA	2	8	29243	29250	25 %	50 %	0 %	25 %	56479588
77	NC_004337	AGCC	2	8	30145	30152	25 %	0 %	25 %	50 %	56479588
78	NC_004337	GACC	2	8	30411	30418	25 %	0 %	25 %	50 %	24111479
79	NC_004337	GCTG	2	8	30711	30718	0 %	25 %	50 %	25 %	24111479
80	NC_004337	TGAT	2	8	30860	30867	25 %	50 %	25 %	0 %	24111479
81	NC_004337	CGCA	2	8	31411	31418	25 %	0 %	25 %	50 %	24111479
82	NC_004337	CTGT	2	8	31585	31592	0 %	50 %	25 %	25 %	24111479
83	NC_004337	GGCG	2	8	31761	31768	0 %	0 %	75 %	25 %	24111479
84	NC_004337	ACCG	2	8	31915	31922	25 %	0 %	25 %	50 %	24111479
85	NC_004337	CGTC	2	8	32389	32396	0 %	25 %	25 %	50 %	24111479
86	NC_004337	TGGC	2	8	32852	32859	0 %	25 %	50 %	25 %	24111479
87	NC_004337	GCTG	2	8	32865	32872	0 %	25 %	50 %	25 %	24111479
88	NC_004337	GCAC	2	8	33450	33457	25 %	0 %	25 %	50 %	24111479
89	NC_004337	GGTG	2	8	33797	33804	0 %	25 %	75 %	0 %	532141204
90	NC_004337	AAGA	2	8	34032	34039	75 %	0 %	25 %	0 %	532141204
91	NC_004337	CCAT	2	8	34485	34492	25 %	25 %	0 %	50 %	24111481
92	NC_004337	ATTT	2	8	35699	35706	25 %	75 %	0 %	0 %	24111482
93	NC_004337	TTCT	2	8	35711	35718	0 %	75 %	0 %	25 %	24111483
94	NC_004337	TTCA	2	8	35842	35849	25 %	50 %	0 %	25 %	24111483
95	NC_004337	AGCC	2	8	36056	36063	25 %	0 %	25 %	50 %	24111483
96	NC_004337	CCCG	2	8	36218	36225	0 %	0 %	25 %	75 %	24111483
97	NC_004337	TCGG	2	8	36690	36697	0 %	25 %	50 %	25 %	24111483
98	NC_004337	ACTC	2	8	36802	36809	25 %	25 %	0 %	50 %	24111483
99	NC_004337	GGCG	2	8	36969	36976	0 %	0 %	75 %	25 %	24111483
100	NC_004337	GGGC	2	8	37288	37295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_004337	CCAT	2	8	37503	37510	25 %	25 %	0 %	50 %	24111484
102	NC_004337	TGAT	2	8	37525	37532	25 %	50 %	25 %	0 %	24111484
103	NC_004337	AGGC	2	8	38056	38063	25 %	0 %	50 %	25 %	24111484
104	NC_004337	CCGA	2	8	39142	39149	25 %	0 %	25 %	50 %	24111485
105	NC_004337	CCCG	2	8	39538	39545	0 %	0 %	25 %	75 %	24111485
106	NC_004337	TCCA	2	8	39590	39597	25 %	25 %	0 %	50 %	24111485
107	NC_004337	TTAA	2	8	39843	39850	50 %	50 %	0 %	0 %	24111486
108	NC_004337	CACC	2	8	40387	40394	25 %	0 %	0 %	75 %	24111486
109	NC_004337	AGCC	2	8	40954	40961	25 %	0 %	25 %	50 %	24111486
110	NC_004337	CCAG	2	8	41154	41161	25 %	0 %	25 %	50 %	24111486
111	NC_004337	AACC	2	8	41162	41169	50 %	0 %	0 %	50 %	24111486
112	NC_004337	GAAA	2	8	41313	41320	75 %	0 %	25 %	0 %	24111486
113	NC_004337	ATTT	2	8	41388	41395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004337	GTTT	2	8	41405	41412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004337	GTGC	2	8	41740	41747	0 %	25 %	50 %	25 %	344915205
116	NC_004337	TGAT	2	8	41976	41983	25 %	50 %	25 %	0 %	344915205
117	NC_004337	CTGC	2	8	42236	42243	0 %	25 %	25 %	50 %	344915205
118	NC_004337	GTCG	2	8	43102	43109	0 %	25 %	50 %	25 %	24111488
119	NC_004337	ATGG	2	8	43209	43216	25 %	25 %	50 %	0 %	24111488
120	NC_004337	GTTA	2	8	43586	43593	25 %	50 %	25 %	0 %	24111489
121	NC_004337	GGCG	2	8	43632	43639	0 %	0 %	75 %	25 %	24111489
122	NC_004337	CACC	2	8	44137	44144	25 %	0 %	0 %	75 %	24111489
123	NC_004337	ATTG	2	8	44384	44391	25 %	50 %	25 %	0 %	24111489
124	NC_004337	TTGT	2	8	45668	45675	0 %	75 %	25 %	0 %	24111491
125	NC_004337	TGTT	2	8	45859	45866	0 %	75 %	25 %	0 %	24111491
126	NC_004337	CTGG	2	8	46124	46131	0 %	25 %	50 %	25 %	24111491
127	NC_004337	TGCG	2	8	47332	47339	0 %	25 %	50 %	25 %	24111493
128	NC_004337	ATGA	2	8	47487	47494	50 %	25 %	25 %	0 %	24111493
129	NC_004337	GGCG	2	8	47828	47835	0 %	0 %	75 %	25 %	24111493
130	NC_004337	GGAT	2	8	48442	48449	25 %	25 %	50 %	0 %	24111493
131	NC_004337	AACC	2	8	48512	48519	50 %	0 %	0 %	50 %	24111493
132	NC_004337	CAGG	2	8	48609	48616	25 %	0 %	50 %	25 %	24111493
133	NC_004337	TGGC	2	8	48875	48882	0 %	25 %	50 %	25 %	24111493
134	NC_004337	TGTT	2	8	48985	48992	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004337	CCTG	2	8	49209	49216	0 %	25 %	25 %	50 %	56479590
136	NC_004337	TAAA	2	8	49247	49254	75 %	25 %	0 %	0 %	56479590
137	NC_004337	AATC	2	8	49283	49290	50 %	25 %	0 %	25 %	56479590
138	NC_004337	GCAG	2	8	49772	49779	25 %	0 %	50 %	25 %	24111495
139	NC_004337	ACCC	2	8	49787	49794	25 %	0 %	0 %	75 %	24111495
140	NC_004337	AAGA	2	8	50085	50092	75 %	0 %	25 %	0 %	24111495
141	NC_004337	AATG	2	8	50549	50556	50 %	25 %	25 %	0 %	24111496
142	NC_004337	GGCA	2	8	51997	52004	25 %	0 %	50 %	25 %	24111498
143	NC_004337	CGGT	2	8	52598	52605	0 %	25 %	50 %	25 %	24111498
144	NC_004337	GTCA	2	8	53121	53128	25 %	25 %	25 %	25 %	24111499
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